Estimation des valeurs d élevage

Estimation des valeurs d élevage

Table des matières 1. Le principe de l estimation des VE... 3 2. Estimation valeurs d élevage lait... 6 3. Estimation VE cellules somatiques... 11 4. Estimation valeurs d élevage persistance... 12 5. Estimation valeurs d élevage extérieur... 13 6. Estimation des VE aptitude à la traite... 16 7. Estimation VE durée d utilisation... 17 8. Estimation VE fécondité femelle... 19 9. Estimation VE déroulement vêlages... 21 10. La valeur d élevage globale... 23 11. Sélection génomique... 29 Légende: Alibaba *TM, CH 120.0330.4050.6, distributeur: Swissgenetics. 2 Braunvieh Schweiz 2010

1. Le principe de l estimation des valeurs d élevage Faire l élevage, c est produire des descendants dont la moyenne est supérieure à celle de leurs parents. Etant donné que les parents ne transmettent que le patrimoine héréditaire, leur choix devrait s effectuer selon la disposition génétique et non selon les performances/qualités observées. La plupart des caractères importants dans l élevage du bétail laitier sont influencés par des gènes très nombreux. Tout descendant obtient un échantillon aléatoire de la moitié des gènes paternels respectivement maternels. Un parent ne transmet pas les mêmes échantillons de gènes à tous ses descendants. Du coup, les demi-frères et demi-sœurs respectivement les vrais frères et sœurs affichent des différences relativement importantes. A l aide de l estimation des valeurs d élevage on essaie de distinguer les deux composantes génétique et milieu entre les informations phénotypiques observées: Phénotype = génétique + milieu La valeur d élevage est une valeur estimée de la disposition génétique de l animal concernant un caractère déterminé. Sur le plan mathématique, conformément à la théorie de la génétique de population, la vraie valeur d élevage (VE) d un animal se fait exprimer comme suit: VE = 2 * (MD - MP) MP représente la moyenne de la population de référence, alors que MD indique la moyenne des rendements des descendants d un animal. La multiplication par 2 tient compte du fait qu un animal donné ne détermine que la moitié du patrimoine génétique de ses descendants, tandis que l autre moitié descend des partenaires d accouplement correspondants. Cette vraie valeur d élevage d un animal ne se fait calculer de cette manière que si les conditions suivantes sont remplies: 1. Le nombre des descendants est infiniment grand. 2. Les partenaires d accouplement de cet animal représentent la population de référence. Braunvieh Schweiz 2010 3

3. Le milieu dans lequel les descendants de cet animal accomplissent les performances doit corresponde à celui de la population de référence. Vu cette définition théorique il est évident que la vraie valeur d élevage ne se fait jamais recenser puisque les conditions susmentionnées n interviennent jamais dans la pratique. De bons modèles statistiques, des ordinateurs performants et des informations assez volumineuses sur l animal et sur sa parenté permettent pourtant que la valeur d élevage se fait estimer avec plus ou moins de précision. Plus les conditions 1 3 susmentionnées sont remplies, plus l estimation s approche de la vraie valeur d élevage. L exactitude d une valeur d élevage est fonction de l héritabilité (transmission génétique) d un caractère et des informations disponibles. L héritabilité exprime dans quelle mesure les différences des performances des animaux sont dues à la disposition génétique. Il s agit d un nombre proportionnel qui peut se situer entre 0 et 1 resp. entre 0 et 100%. Une héritabilité de 1 signifierait que la manifestation d un caractère ne serait fonction que des gènes. Dans une population qui ne regroupe que des animaux clonés identiques, l héritabilité serait de 0 puisqu il n y aurait aucune variance génétique. Du coup, il ne serait pas non plus possible de sélectionner avec une population de ce genre. L héritabilité de la productivité laitière se situe à 0.3 environ. On peut donc dire que dans la population en question environ 1/3 des différences au niveau de la productivité laitière est dû à la génétique, alors que les autres 2/3 sont déterminés par l alimentation, la détention, le management etc. Le tableau suivant comporte des héritabilités de quelques caractères importants: Caractère Héritabilité Quantités lait, matière 0.34-0.36 grasse et protéines Cellules somatiques 0.25 Caractères vêlage 0.01-0.05 Caractères fécondité 0.01-0.05 Durée d utilisation 0.10 Caractères format 0.35-0.40 Caractères membres 0.20-0.25 Caractères pis 0.25 4 Braunvieh Schweiz 2010

L exactitude est indiquée par le taux de sécurité (B%). Quant aux caractères de productivité laitière, les valeurs suivantes sont atteintes: Jeune animal avec valeur d élevage ascendance 30-40 B% Vache avec propre performance 40-60 B% Taureau avec 30 descendants env. 65 B% Taureau avec 100 descendants env. 90 B% Dans les caractères laitiers par exemple, l importance du taux de sécurité est fonction des facteurs suivants: Nombre des filles Répartition des filles sur les exploitations Nombre d animaux de comparaison dans les exploitations Nombre des pesages et des lactations Héritabilité Exactitude des VE des ascendants A l aide du taux de sécurité, une valeur d élevage de +800 kg de lait se fait interpréter comme suit: Avec une probabilité d erreur de 5% (dans 95 cas sur 100, la déclaration faite est correcte), la vraie valeur d élevage se situe dans la plage indiquée du taux de sécurité donné. Il est pourtant le plus probable qu elle se situe exactement au milieu (+800 kg). B% limite inférieure limite supérieure 65 +220 +1380 75 +310 +1290 85 +420 +1180 95 +581 +1019 L estimation des valeurs d élevage permet de classer les animaux et de prévoir les différences entre les individus, mais pas de prévoir leurs performances précises. Du coup, en effectuant des estimations des valeurs d élevage, il faut toujours définir la base. La définition de la base n a pourtant aucune influence sur le classement et sur les différences entre les animaux. Avec l interprétation correcte des VE, la définition de la base n est pas significative. Braunvieh Schweiz 2010 5

2. Estimation valeurs d élevage lait Depuis mai 2005, les valeurs d élevage pour le lait, la matière grasse, les protéines et pour les cellules somatiques sont estimées ensemble moyennant le dit modèle du jour de contrôle random regression. Sont utilisés les pesées de toutes les lactations. La méthode tient compte du déroulement individuel des lactations des vaches et fournit encore, pour les vaches et pour les taureaux, des valeurs d élevage pour la persistance. Les valeurs d élevage pour les teneurs en les matières grasse et azotée sont ensuite calculées d après les valeurs d élevage des caractères quantitatifs. Le modèle du jour de contrôle Depuis mai 2000, Braunvieh Schweiz utilise, pour l estimation des valeurs d élevage (EVE) lait, matière grasse, protéines et cellules somatiques le dit modèle du jour de contrôle (conformément à la désignation anglaise «test day» pour jour du contrôle). Dans ce modèle, l EVE tient directement compte des résultats des pesées individuelles; les conditions du milieu (alimentation, température) qui ont influencé le troupeau le jour du contrôle sont ainsi considérées et corrigées au mieux. De plus, l accroissement beaucoup plus continuel des informations pour l estimation des valeurs d élevage est ainsi assuré. En 2005, après cinq ans de pratique, le moment est venu pour remplacer le modèle du jour de contrôle appliqué jusqu à présent par un modèle amélioré. Le modèle du jour de contrôle dit «Random regression» a été développé au Canada, par mandat de la CTEBS (Communauté de travail des éleveurs bovins suisses) avant d avoir été introduit en 2005 dans les races Brune, Tachetée rouge et Holstein. En même temps, la base pour la représentation des valeurs d élevage a été adaptée dans toutes les trois races. Base de données Dans le modèle du jour de contrôle amélioré, les pesées de toutes les lactations, effectuées entre le 5 e et le 365 e jour de la lactation en question (jusqu à présent, seulement jusqu au 330 e jour), sont prises en considération. Grâce à l extension des trois premières lactations à toutes les lactations, la particularité du premier modèle du jour contrôle que les éleveurs ont souvent critiquée puisqu une bonne partie des rendements des vaches avec de bonnes longévités, donc des vaches économiques, n avait pas d influence sur leurs valeurs d élevage relatives à la productivité laitière, est ainsi corrigée. 6 Braunvieh Schweiz 2010

Dans l estimation des valeurs d élevage, la première, la deuxième et la troisième lactations sont toujours considérées comme caractères différents. Dès la troisième lactation, en ce qui concerne leur potentiel de productivité génétique, les vaches passent pour adultes. Les différences entre les rendements accomplis en la troisième et la quatrième et toutes les lactations suivantes se font expliquer par les influences du milieu. Seuls les rendements des vaches qui ont vêlé pour la première fois après le 1 er janvier 1989 sont intégrées dans la nouvelle estimation des valeurs d élevage. Toutes les pesées des primipares qui ont vêlé avant cette date ne sont pas enregistrées complètement dans la banque des données de Braunvieh Schweiz. La raison en est que jusqu au début des années quatre-vingt-dix, seules les pesées des deux lactations dernières ont été enregistrés en plus des clôtures de lactation des vaches. Ce sont notamment de bonnes vaches, avec au moins trois lactations, qui sont concernées par l absence de ces données (pesées non enregistrées). Pour éviter toute influence de ses données sélectionnées sur l estimation des valeurs d élevage, la limite de recensement des dates des premiers vêlages a été relevée de quatre ans. Par conséquent, depuis mai 2005, les vaches qui ont vêlé pour la première fois entre début 1985 et fin 1988 n obtiennent plus de nouvelles VE. Considération du milieu du troupeau dans le modèle du jour de contrôle On a déjà mentionné que le modèle du jour de contrôle comporte l avantage essentiel que les oscillations de la productivité laitière dues au milieu, qui sont limitées au jour de contrôle individuel, se font beaucoup mieux considérer. Dans les modèles de lactation conventionnels, on a toujours dû partir du fait qu un effet constant se répercute sur tous les résultats des contrôles individuels considérés dans un rendement de 305 jours. Dans le modèle du jour de contrôle par contre, ce sont les vaches du même troupeau, contrôlées à un jour déterminé, qui représentent la base de référence. La supériorité ou l infériorité d une vache par rapport à ses congénères se fait évaluer parfaitement à tout moment de recensement. La considération optimale du milieu du troupeau dans le modèle du jour de contrôle était aussi la raison pour laquelle ce modèle a d abord été appliqué au niveau des cellules somatiques puisqu il s agit-là d un critère dont les valeurs peuvent afficher des différences considérables d un jour à l autre. Braunvieh Schweiz 2010 7

Considération des courbes de lactation dans le modèle du jour de contrôle La considération du jour de contrôle du troupeau dans l estimation des valeurs d élevage amène pourtant un problème supplémentaire à résoudre puisque au jour de contrôle, toutes les vaches ne se sont pas au même stade de lactation, et elles ont vêlé en des saisons différentes. Etant donné que le stade de lactation joue un rôle important pour tous les caractères de la productivité laitière, il est à considérer directement dans la méthode d estimation du modèle du jour de contrôle. Dans la méthode appliquée, les courbes de lactation typiques sont estimées selon le numéro de lactation, l âge au vêlage, l année de vêlage et la région (zone, alpage). Les résultats des pesées individuelles sont corrigés selon le stade de lactation et en même temps selon les autres facteurs mentionnés dus au milieu. Au lieu des courbes de lactation selon la durée inter-vêlages, on fait une correction préliminaire pour le «nombre de jours en gestation». Influence de l alpage L effet de l alpage illustre également très bien le privilège du modèle du jour de contrôle qui considère et qui corrige toutes les influences du milieu directement à l information de productivité recensée (pesée). Jusqu à présent, dans les lactations accomplies partiellement en plaine et partiellement à l alpage, il fallait intégrer un effet d alpage général. Il n était pas possible de différencier entre le nombre des pesages effectués à l alpage et de déterminer la phase de lactation de la vache en question. Dans le modèle du jour de contrôle, l effet d alpage est considéré spécialement et seulement pour les contrôles effectués à l alpage. Cela se fait d une part moyennant la définition du jour de contrôle du troupeau, qui représente le groupe de référence pour toutes les vaches qui ont été contrôlées en ce jour et à cet alpage, et d autre part moyennant les propres courbes de lactation des rendements en question. 24% de toutes les vaches Brunes sont alpées en été. 8 Braunvieh Schweiz 2010

Standardisation des variances «troupeau» différentes Grâce à la standardisation des différences relatives aux écarts des rendements à l intérieur du même troupeau, les effets connus de traitements spéciaux d animaux d élevage individuels ou de groupes gérés spécialement, qui dépassent la mesure «normale» (alimentation conforme à la productivité), se font corriger. Une forte hétérogénéité au niveau des variances des troupeaux entraîne la sous- ou la surestimation des valeurs d élevage des animaux individuels. Les effets zootechniques découlant de l absence de la standardisation sont en premier lieu le mauvais choix de mères à taureau et deuxièmement des valeurs d élevage ascendance trop élevées des fils dont les premières valeurs d élevage estimées sont fausses lorsque les informations des filles sont encore peu nombreuses. De plus, sans standardisation, les premières valeurs d élevage de taureaux importés peuvent elles aussi être surestimées pour le traitement spécial des filles. Caractères considérés dans l estimation des valeurs d élevage Avec le modèle d estimation proprement dit, on estime des valeurs d élevage pour les caractères quantités de lait, de matière grasse et de protéines ainsi que pour les teneurs en cellules somatiques. Les valeurs d élevage pour les teneurs en les matières grasse et azotée sont calculées indirectement sur la base des valeurs d élevage des caractères quantitatifs et des moyennes de la population concernant la quantité de lait et les teneurs en les matières grasse et azotée. Pour tous les caractères, on calcule des valeurs d élevage pour la première, la deuxième et pour la troisième lactation. Ces valeurs d élevage lactation sont combinées, avec des pondérations identiques, en la valeur d élevage moyenne de toutes les lactations. Base Avec l introduction du modèle du jour de contrôle amélioré pour l estimation des valeurs d élevage lait, matière grasse, protéines et cellules somatiques on a en même temps passé de la base fixe (définie par les vaches nées en 1995) à la base mobile (vaches de six à huit ans). Grâce à la base mobile, l interprétation des valeurs d élevage est plus simple. On n a plus besoin de considérer une valeur de référence, et les éleveurs peuvent toujours travailler avec les mêmes limites de sélection sans que cette sélection ne perde de rigueur. Braunvieh Schweiz 2010 9

Estimation des valeurs d élevage Publication Pour les taureaux qui ont réalisé 300 inséminations enregistrées pendant le testage, les valeurs d élevage lait sont publiées si la mise en valeur comporte au moins 10 filles stationnées dans 10 exploitations (respectivement des filles de 10 exploitations pour taureaux dont la 1ère insémination a été effectuée après le 1.1.2007) avec au moins 3 pesées chacune. Les taureaux avec moins de 300 inséminations effectuées pendant le testage doivent avoir au moins 20 filles stationnées dans 20 exploitations (resp. filles de 20 exploitations) avec au moins 3 pesées chacune. Les valeurs d élevage lait pour les vaches sont publiées si la mise en valeur comporte au moins une pesée. Pour calculer les valeurs d'élevage lait, matière grasse et cellules somatiques, ont tient compte des pesées de toutes les lactations. 10 Braunvieh Schweiz 2010

3. Estimation valeurs d élevage cellules somatiques Les mammites sont l une des maladies les plus fréquentes des vaches laitières qui provoquent de grandes pertes économiques dans la détention du bétail laitier. Sans mesures zootechniques, on doit s attendre à une autre augmentation de la réceptivité aux mammites à cause de la corrélation génétique positive, indésirable dans l élevage, qui existe entre les caractères de la productivité laitière qui dominent la sélection et la réceptivité aux mammites. Etant donné que la sélection directe contre la réceptivité aux mammites nécessiterait le recensement très coûteux de toutes les maladies du pis et que l héritabilité des mammites est très basse, on prend une mesure zootechnique alternative en se référant aux cellules somatiques comme caractère secondaire. Méthode et données L estimation des valeurs d élevage cellules somatiques s effectue, comme celle pour le lait, moyennant le modèle animal du jour de contrôle. L estimation se base sur toutes le données du contrôle laitier. Pour des raisons méthodiques, il faut transformer les teneurs en cellules avant l estimation de la valeur d élevage. Conformément à la norme internationale, on effectué une transformation logarithmique en la dite valeur cellules somatiques (somatic cell score). Les données dépouillées regroupent les vaches qui ont pour la première fois vêlé en 1990 ainsi que leurs ascendances. Représentation La VE cellules somatiques est représentée, comme les autres caractères fonctionnels, comme indice avec une moyenne de 100 et l écart-standard génétique de 12. On souhaite des valeurs supérieures à 100. On y utilise également la base mobile, définie par les vaches de six à huit ans. La base est adaptée chaque année au printemps. Comme cité plus haut, les cellules somatiques sont transformées en des valeurs SCS avant la mise en valeur. Les VE sont également publiées sous cette forme transformée. Publication La valeur d élevage cellules somatiques des taureaux est publiée lorsque la valeur d élevage lait est publiée et que le B% des teneurs en cellules atteint au moins les 65%. Depuis août 2007, les valeurs d élevage cellules somatiques sont aussi publiées pour les vaches - à condition qu au moins 5 propres pesées avec détermination des cellules somatiques de la bête en question puissent être prises en considération dans le calcul. Braunvieh Schweiz 2010 11

4. Estimation valeurs d élevage persistance La persistance définit la persévérance au niveau des caractères de productivité laitière au cours de la lactation. En cas de rendements de lactation identiques, on préfère une pointe basse de la productivité suivie par avec une courbe de productivité plate. Grâce à la productivité plus équilibrée au cours de la lactation, le bilan énergétique négatif est moins important au début de la lactation, et il en résulte des effets positifs sur la fécondité et sur la santé des animaux. De plus, des courbes de lactation plates permettent de produire davantage de lait à partir des aliments de base peu coûteux. Méthode et données Dans l estimation actuelle des valeurs d élevage lait, effectuée moyennant le modèle du jour de contrôle random regression, on estime pour tous les animaux des valeurs d élevage pour le déroulement individuel des lactations. On obtient ainsi encore, quasiment comme produit secondaire, la valeur d élevage persistance. La persistance définie représente la comparaison entre la productivité laitière à la fin de la lactation (moyenne de la quantité journalière de lait entre le 255 e et le 305 e jour de la lactation) et celle de la pointe de la lactation (moyenne jour 50 à 70). L estimation se base comme celle du lait sur toutes les données recensées au contrôle laitier. Représentation La valeur d élevage persistance est représentée comme indice avec une moyenne de 100 et l écart-standard génétique de 12. On souhaite des valeurs supérieures à 100. On utilise également la base mobile définie par les vaches de six à huit ans. La base est adaptée chaque année au printemps. Publication Pour les taureaux, la valeur d élevage persistance est publiée une fois que la valeur d élevage lait a été publiée et qu au moins 10 filles disposent des lactations standard (d au moins 270 jours). Depuis août 2007, les valeurs d élevage persistance sont aussi publiées pour les vaches à condition que les valeurs d élevage lait aient été publiées et que des lactations d au moins 270 jours soient disponibles. 12 Braunvieh Schweiz 2010

5. Estimation valeurs d élevage extérieur Etant donné que seuls des animaux sains et robustes peuvent accomplir des performances importantes, on décrit et mesure plusieurs caractères morphologiques qui permettent de faire une sélection ciblée en vue d une constitution saine et performante. Aujourd hui, près de 45'000 vaches Brunes sont chaque année décrites linéairement et classifiées au niveau des blocs gabarit, bassin, membres et pis. Modèle L estimation des valeurs d élevage extérieur actuelle tient compte des facteurs environnementaux suivants: Expert De petites différences systématiques entre les experts sont inévitables malgré leur perfectionnement continuel et leurs grandes expériences pratiques. Grâce à la DLC exécutée par un seul homme, les différences de ce genre se font calculer et corriger dans l estimation des valeurs d élevage. Pour tenir compte de l évolution au niveau des appréciations, l influence des experts est relevée tous les six mois. Année d appréciation, saison d appréciation et âge à l appréciation dans la lactation en question C était notamment au niveau des caractères des membres où l on a constaté certaines influences saisonnières. L âge à l appréciation est notamment important concernant les caractères d extérieur influencés par la croissance. Grâce à l intégration des numéros de lactation, on peut aussi utiliser les données DLC des lactations ultérieures. Depuis janvier 2003, les facteurs «saison d appréciation - année» et «âge au moment de l appréciation - lactation» sont combinés en un seul facteur. L intégration de cet effet (interaction) année-saison-âge s est imposée pour tenir compte de l influence changeante du numéro de lactation sur les notes de classification après qu en automne 2002 de nouvelles notes maximales ont été introduites pour les primipares et les vaches en deuxième lactation. Stade de lactation Le stade de lactation exerce une influence considérable sur les caractères des mamelles et par exemple sur la musculature. Braunvieh Schweiz 2010 13

Heure du jour Pour des raisons financières, il est indispensable de commencer à décrire les animaux déjà à 8.30 heures. La prise en considération de l heure du jour permet de recenser les facteurs qui ont une influence négative sur les caractères du pis. Stabulation Près de 30% (état 2009) des vaches Brunes sont détenues dans des étables à stabulation libre. Le système de stabulation influence notamment les caractères des membres. Exploitation L effet de l exploitation n est non seulement important pour les caractères de la productivité laitière, mais aussi pour les caractères d extérieur. Pour obtenir un nombre suffisant d observations de chaque exploitation, on regroupe au moins trois ans. L effet de l exploitation, combiné avec l effet du milieu permanent, est intégré en tant qu effet dit aléatoire. Le calcul s effectue moyennant le modèle animal multicaractère. Cela signifie que les valeurs d élevage des vaches et des taureaux sont estimées directement et en tenant compte des relations de parenté. Les caractères des blocs gabarit, bassin, membres, pis (y compris les trayons) et les notes sont mis en valeur séparément. Dans l'estimation des valeurs d'élevage, l'influence de l'expert est corrigée. 14 Braunvieh Schweiz 2010

Données Toutes les données DLC recensées depuis 1994 sont prises en considération. On utilise aussi les donnes des descriptions effectuées en des lactations ultérieures. Pour toutefois éviter la surestimation de ces vaches, il faut absolument qu elles aient déjà été décrites comme primipares. Base génétique En mai 2005, on a passé à la base mobile, définie par les vaches de six à huit ans avec DLC (trois années de naissance). La base mobile est adaptée chaque année en avril. Pour les animaux de la race Brune originale, les vaches OB des années de naissance correspondantes représentent une base à part. Les valeurs d élevage des animaux OB ne se font pas comparer avec les valeurs d élevage des autres animaux de la race Brune! Représentation et interprétation des valeurs d élevage Sur les plans national et international, il est usuel de représenter les valeurs d élevage extérieur sous forme d index. A l époque, les valeurs d élevage ont été indexées à la moyenne de 100 et à l écart-standard de 10, ce qui a amené des index d extérieur de 70 à 130. Etant donné que les valeurs d élevage extérieur sont aussi estimées pour les vaches, cette forme de représentation comporterait le risque de confusion avec les notes de classification. Du coup, on a décidé d indexer les valeurs d élevage à la moyenne de zéro et à l écart-standard de un. Au niveau national, la Fédération d élevage de la race Holstein utilise cette forme de représentation, et sur le plan international, ce sont l Italie et les USA qui l utilisent. Publication Pour les taureaux, les valeurs d élevage extérieur sont publiées dès qu au moins 10 filles, respectivement des filles stationnées dans au moins 10 exploitations (taureaux dont la première insémination a été faite après le 1.1.2007) disposent de descriptions effectuées en 1 ère lactation. Chez les vaches, on exige pour la publication une DLC effectuée en première lactation et dans un an après le premier vêlage. Braunvieh Schweiz 2010 15

6. Estimation des valeurs d élevage aptitude à la traite L aptitude à la traite désigne l aptitude d une vache à donner son lait rapidement, régulièrement et complètement lors de la traite correcte. On ne vise pas l extrême, mais l optimum. Méthode et données Lors des DLC, les experts interrogent les éleveurs sur le débit du lait des primipares selon l échelle allant de 1 = très lent jusqu à 6 = très rapide. Depuis août 2002, on estime pour cette note de l interrogation la valeur d élevage débit du lait. A cet effet, on utilise la même méthode que pour l estimation des valeurs d élevage extérieur. Par rapport à l épreuve d aptitude à la traite conventionnelle, l interrogation faite lors de la DLC, suivie de l estimation de la valeur d élevage, comporte l avantage qu il n y a pas de frais supplémentaires et que les résultats proviennent des filles très nombreuses et réparties de manière aléatoire. Les mises en valeur des résultats montrent que la valeur d élevage débit du lait est en étroite relation avec le débit moyen par minute. Représentation La valeur d élevage aptitude à la traite (débit du lait) est également représentée comme indice avec la moyenne de 100 et l écart-standard génétique de 12. On souhaite des valeurs supérieures à 100 avec l optimum de 110. On utilise également la base mobile, définie par les vaches de six à huit ans. Chaque année au printemps, la base est adaptée. Publication Pour les taureaux, les valeurs d élevage aptitude à la traite sont publiées dès qu au moins 10 filles, respectivement des filles stationnées dans au moins 10 exploitations (taureaux dont la première insémination a été faite après le 1.1.2007) disposent d une DLC effectuée en 1 ère lactation. Aucune valeur d élevage n est publiée pour les vaches. 16 Braunvieh Schweiz 2010

7. Estimation valeurs d élevage durée d utilisation Une durée d utilisation prolongée des vaches laitières amène des avantages économiques importantes. Les coûts de réforme se font réduire puisque les animaux à remplacer sont moins nombreux. De plus, ces coûts sont répartis sur davantage de lactations. Les moyennes des performances des exploitations augmentent grâce à la durée d utilisation prolongée puisque il y a davantage de vaches en des lactations ultérieures qui peuvent valoriser le maximum de leur productivité grâce à leur âge. Une durée d utilisation prolongée permet de réaliser des progrès de sélection plus importants puisque les vaches se font sélectionner selon des critères plus sévères. Dans les programmes de sélection, la durée d utilisation est rarement prise en considération malgré ses avantages économiques. L estimation de la valeur d élevage, et ainsi la sélection selon la durée d utilisation, comporte des problèmes puisqu une bonne partie des animaux est encore en vie au moment de l exécution de l estimation des valeurs d élevage. Des observations de ce genre, dont on ne connaît que la limite inférieure des durées d utilisation potentielles, sont nommées des observations censurées. Pour des raisons pratiques, il n est pas possible d effectuer l estimation des VE seulement au moment où toutes les filles d un taureau sont déjà parties. L application de méthodes statistiques spéciales, qui se basent sur l analyse de la durée de vie, permet d estimer à temps des valeurs d élevage. On y tient compte de la durée de vie des animaux encore en vie au moment de l estimation des VE. Depuis l introduction de l estimation des VE durée d utilisation en 2000, on a fait de nouvelles découvertes dans le domaine de l analyse de la durée de vie. Grâce à la banque de données sur le trafic des animaux (BDTA), on dispose encore des informations supplémentaires. Du coup, dans le cadre d un projet du Groupe de travail recherches et développement de la CTEBS, la méthode a été adaptée. La nouvelle estimation des valeurs d élevage a été introduite en 2008. Données et modèle Pour l EVE durée d utilisation, on tient compte des lactations qui ont commencé (date de vêlage) depuis 1980. Depuis 2008, les notifications de mouvement de la BDTA y sont intégrées, c est-à-dire que le statut des vaches qui vivent dans un troupeau sans contrôle laitier effectué par Braunvieh Schweiz après qu elles ont pour la dernière fois été soumises au contrôle laitier officiel ne sont plus considérées comme péries (observation censurée). Les lactations accomplies dans des exploitations avec moins de Braunvieh Schweiz 2010 17

quatre lactations par an ne sont plus prises en considération puisque les influences des exploitations ne se font estimer que de manière peu précise. De plus, les lactations accomplies dans des exploitations où l importance des troupeaux (nombre de lactations par an) a extrêmement changé par rapport à l année précédente sont exclues. Le modèle relatif à l analyse de la durée d utilisation et à l estimation des valeurs d élevage comporte les effets environnementaux suivants: Phase de lact. à l intérieur de la lact. (pour le modelage du risque de départ Age au premier vêlage Troupeau * an* saison de vêlage Rendement laitier relatif dans le troupeau et l année Teneurs relatives en les MG et azotée dans le troupeau et l année Alpage Modification de l importance du troupeau L objectif de la sélection selon la durée d utilisation est de réduire les départs non souhaités pour cause de maladie, de blessures ou de stérilité. La valeur d élevage durée d utilisation devrait représenter la capacité de survie d une vache indépendamment de sa productivité. Avec l intégration de la productivité laitière relative d une vache à l intérieur de l exploitation, le rendement laitier peu important l un des motifs de départs les plus importants est corrigée. La valeur d élevage lait convient mieux pour améliorer la productivité laitière. L effet des teneurs relatives en les matières grasse et azotée à l intérieur de l exploitation est considéré analogiquement à la productivité laitière. Représentation et publication Avant la publication, les nouvelles valeurs d élevage durée d utilisation sont comme jusqu à présent combinées (valeur d élevage durée d utilisation combinée) avec cinq caractères secondaires (cellules somatiques, profondeur pis, note membres, taux de non-retour des filles et délai de mise à la reproduction). La publication s effectue, comme celle des autres caractères fonctionnels, sous une forme standardisée comme index avec la base de 100 et l écart-standard de 12. On utilise dès maintenant, comme pour tous les autres caractères, la base mobile qui est adaptée chaque année au printemps. Etant donné que les valeurs d élevage durée d utilisation sont seulement disponibles à un moment avancé de la vie des taureaux, ce sont les taureaux de huit à douze ans qui représentent la base. Pour la race Brune originale, on constitue une base séparée définie par les taureaux OB des années de naissance correspondantes. Ne sont publié que les valeurs d élevage avec des taux de sécurité d au moins 50%. 18 Braunvieh Schweiz 2010

8. Estimation valeurs d élevage fécondité femelle En vertu des recommandations d un groupe international d experts, les deux caractères taux de non-retour après 56 jours (TNR) et délai de mise à la reproduction (intervalle entre le vêlage et la première insémination) sont exploités pour l évaluation de la fécondité femelle. Le taux de non retour représente un caractère secondaire pour évaluer la réussite de la première insémination, respectivement de la conception. Le délai de mise à la reproduction fournit des indications relatives au moment du départ du cycle des chaleurs respectivement à la chaleur à observer. Tous les deux caractères influencent aussi la longueur de l intervalle vêlage-saillie. Il est vrai que les héritabilités sont basses, mais ces valeurs d élevage permettent à l éleveur de renoncer aux géniteurs négatifs pour ainsi améliorer à long terme la fécondité de ses vaches. Méthode et données Pour estimer les valeurs d élevage fécondité femelle, on applique un modèle animal à deux caractères avec performances répétées. Depuis le 1.1.1994, pour toutes les premières inséminations et saillies des vaches, le délai de mise à la reproduction et le taux de non-retour (insémination répétée entre le 12 e et le 56 e jour après la première insémination oui/non?) sont intégrés dans l estimation des valeurs d élevage. En plus de l effet génétique (valeur d élevage de l animal), on tient pour tous les deux caractères compte des facteurs environnementaux suivants: Exploitation*an, milieu permanent de l animal inséminé, mois d insémination (TNR) respectivement mois du vêlage en l année (délai de mise à la reproduction) et numéro de lactation*catégorie d âge vêlage. Les caractères taureau d insémination, inséminateur et code d insémination (taureau de testage oui/non) ne sont considérés que dans le TNR. Représentation Depuis 2005, les valeurs d élevage pour la fécondité femelle sont représentées sous forme d indices avec la moyenne de 100 et l écart-standard génétique de 12. On souhaite des valeurs supérieures à 100 (TNR élevé, court délai de mise à la reproduction). On applique la base mobile, définie par les vaches de six à huit ans. La base est adaptée chaque année au printemps. Braunvieh Schweiz 2010 19

Estimation des valeurs d élevage Publication Il est vrai que la méthode appliquée pour estimer les valeurs d élevage fournit pour tous les deux caractères des valeurs d élevage pour taureaux et pour vaches, mais on ne publie que les valeurs d élevage pour taureaux à condition que le taux de sécurité du délai de mise à la reproduction s élève à 65% ou plus. Pour l héritabilité basse (TNR 1.3%, délai mise à la reproduction 3.9%), la fiabilité est très basse chez les vaches (observation peu nombreuses); du coup, on renonce à la publication des valeurs d élevage pour vaches. Veaux sains et bien développés au pâturage - la réforme est assurée. 20 Braunvieh Schweiz 2010

9. Estimation valeurs d élevage déroulement vêlages Le but de l estimation des valeurs d élevage déroulement des vêlages est en premier lieu le maintien du bon niveau et la découverte des géniteurs extrêmes pour pouvoir les éliminer de la reproduction, resp. de ne les utiliser que de manière ciblée. Depuis 2006, en plus du déroulement des vêlages direct (influence du veau), on estime aussi des valeurs d élevage relatives à l influence de la vache (déroulement maternel du vêlage). Méthodes et données Pour l EVE déroulement des vêlages, on tient compte de toutes les notifications de naissance disponibles depuis octobre 1993. Jusqu en 2001, elles ont été déclarées directement à Braunvieh Schweiz moyennant les dites cartes SMM. On a recensé toutes les déclarations de mise-bas (y compris les mort-nés) des descendants des taureaux de testage officiels ainsi que les notifications de naissance des veaux pour lesquels des certificats d ascendance ont été délivrés. Quant aux autres vêlages, on dispose des indications retenues sur les fiches d accompagnement des épreuves de productivité laitière. L instauration de la BDTA a remplacé le système des cartes SMM. Jusqu à l introduction de la possibilité correspondante des notifications adressées à la BDTA en avril 2005, les mort-nés, aussi ceux qui descendaient des taureaux de testage, n ont été recensés que par le biais de la fiche d accompagnement. En plus du taux des vêlages normaux et des veaux nés vivants, la mise en valeur tient aussi compte des deux caractères secondaires durée de la gestation et poids à la naissance. L estimation des valeurs d élevage s effectue moyennant le modèle père et considère les influences du milieu suivantes: exploitation* groupe de l année, numéro de lactation* âge au vêlage, année* saison * zone, sexe du veau et voie de communication. La différence essentielle par rapport à l ancienne méthode est l intégration des effets génétiques maternels, c està-dire de l influence génétique des mères (respectivement des pères) sur le déroulement des vêlages. Représentation Les VE déroulement des vêlages sont publiées, comme les autres caractères fonctionnels et les valeurs d élevage globales, sous forme d indices standardisés sur l échelle centésimale. Depuis 2006, en plus des VE directes pour les taux de vêlages normaux et de veaux nés vivants, on publie aussi des valeurs d élevage maternelles. Les désignations correspondan- Braunvieh Schweiz 2010 21

Estimation des valeurs d élevage tes des caractères sont complétées, comme c est le cas au niveau de la fécondité, par les indications supplémentaires «taureau» (comment les veaux du taureau en question viennent-ils au monde?) respectivement «filles» (comment les filles du taureau en question vêlent-elles?). On utilise la base mobile qui est adaptée chaque année au printemps. Etant donné que le modèle père appliqué ne fournit des valeurs d élevage que pour les taureaux, cette base est définie, comme la valeur d élevage globale, par les taureaux de huit à dix ans. Pour les taureaux de la race Brune originale, on constitue une base séparée, définie par les taureaux OB des années de naissance correspondantes. Publication Les VE pour les caractères des déroulements des vêlages directs et maternels (taux de vêlages faciles/vêlages normaux et taux de veaux nés vivants) sont publiées pour tous les taureaux de la race Brune qui répondent aux conditions suivantes: Déroulement vêlages taureau: 100 notifications de naissance (taureau père du veau). Déroulement vêlages filles: 100 notifications de naissance (taureau père de la vache) et VE déroulement du vêlage direct publiés. Ces indications se réfèrent au nombre des notifications de naissance considérées dans l EVE. Comme les autres caractères fonctionnels et les valeurs d'élevage globales, les valeurs d'élevage pour le déroulement des vêlages sont publiées comme index standardisés sur l'échelle centésimale. 22 Braunvieh Schweiz 2010

10. La valeur d élevage globale Formulé scientifiquement, la valeur d élevage globale (VEG) représente la définition mathématique du but d élevage. Il y a bientôt 60 ans, les scientifiques américains ont montré que la valeur d élevage globale représente la méthode de sélection la plus efficace pour sélectionner les animaux selon plusieurs caractères. Ceci concerne notamment la présélection de taureaux, alors que la considération des valeurs d élevage individuelles peut être plus raisonnable aux accouplements effectifs. Dans la valeur d élevage globale, les valeurs d élevage des caractères individuels, avec la considération de l importance économique, de l exactitude de l estimation des valeurs d élevage et des relations génétiques mutuelles, sont résumées de manière optimale en un chiffre. L importance économique des caractères individuels a été élaborée dans un projet de recherche du Groupe de travail R+D de la Communauté de travail des éleveurs bovins suisses, et elle est continuellement vérifiée. Les adaptations dernières ont été faites en 2008 suite à un nouveau projet R+D. Poldi Ronja CH 120.0172.9803.9 de Jenny Peider, Zillis, dispose de la VEG la plus élevée de toutes les vaches Brunes suisses. Braunvieh Schweiz 2010 23

Priorité: La rentabilité Au choix des caractères utilisés pour le calcul de la VE globale, on tient d une part compte de la présence de valeurs d élevage et d autre part de l importance économique des caractères individuels. A la déduction des poids économiques il s est révélé que l amélioration génétique des caractères vêlages normaux et veaux nés vivants n a pratiquement pas d importance économique grâce à la facilité de vêlage de la race Brune. Le projet le plus actuel a encore montré que la pondération de la durée d utilisation était plutôt trop élevée dans l indice actuel. Voici la pondération relative des caractères considérés dans les VE globales et partielles: Quantité lait Quantité MG Quantité prot. Teneur MG Teneur protéines Durée utilisation Persistance Cellules somat. TNR filles Délai mise repr. Aptitude traite Extérieur VEG taureaux VEG vaches VL VF 5% 11% 33% 0% 5% 10% 3% 8% 6% 3% 6% 10% 5.5% 11% 33% 0% 5.5% Bonus 5% 15% 25% 10% 20% 60% 0% 10% 28% 8% 22% 17% 8% 17% Caractères du fitness: Importants Les caractères du fitness durée d utilisation, persistance, cellules somatiques, fécondité femelle (TNR filles, délai de mise à la reproduction), aptitude à la traite et extérieur font 46% de la valeur d élevage globale. Dans la sélection selon la valeur d élevage globale, on ne vise pas uniquement des rendements laitiers plus élevés, mais on tient aussi compte des caractères du fitness qui font diminuer les coûts de la production de lait. Vu les prix de vente en baisse et la commercialisation limitée, la diminution des coûts de production est de plus en plus importante. En plus de la valeur d élevage globale pour les caractères susmentionnés, le calcul des valeurs d élevage partielles est également raisonnable. Les caractères de la productivité laitière sont résumés en la valeur laitière (VL), alors que les caractères durée d utilisation, persistance, cellules somatiques, TNR filles, délai de mise à la reproduction et aptitude à la traite sont 24 Braunvieh Schweiz 2010

résumés en la valeur du fitness (VF). Dans la VEG respectivement dans la VF, la fécondité femelle (TNR filles et délai de mise à la reproduction) est considérée depuis août 2003 et l aptitude à la traite depuis août 2004. Etant donné qu un débit du lait trop lent ou trop rapide est indésirable (santé des mamelles), on admet, dans la valeur d élevage aptitude à la traite, l optimum de l écart-standard génétique supérieur à la moyenne de la population (optimum = 110). Depuis 2008, la VEG des vaches comporte aussi les cellules somatiques et la persistance. Valeur laitière VL = 100 + 0.01 * [0.27*VE lait kg + 13 * VE MG kg + 53 * VE protéines kg + 0 * VE MG % + 1024 * VE protéines % ] La valeur laitière (VL) combine les valeurs d élevage lait, la quantité de matière grasse, la quantité de protéines, la teneur en matière grasse (pas de poids) et la teneur en protéines en une seule valeur pour les taureaux et les vaches. Valeur fitness VF = 103 + 0.01 * [56 * VE durée d utilisation + 14 * VE persistance + 45 * VE cell. som. + 33 * VE TNR filles +19 * VE délai mise repr. + 35 * VE aptitude traite ] La valeur du fitness (VF) n est calculée que pour les taureaux puisque pour les vaches, on ne dispose pas de valeurs d élevage pour tous les caractères du fitness. Valeur d élevage globale taureaux VEG = 94 + 0.01 * [0.2 * VE lait kg + 11 * VE MG kg + 49 * VE protéines kg + 0 * VE MG % + 1119 * VE protéines % + 22 * VE durée d utilisation + 6.2 * VE persistance + 19 * VE cell. som. + 8.2 * VE TNR filles + 2.5 * VE délai mise repr. +14 * VE aptitude traite + 348 * VE extérieur ] La valeur d élevage durée d utilisation pour les taureaux est disponible plus tard que les valeurs d élevage pour les caractères laitiers, la persistance, les cellules somatiques, la fécondité femelle, l aptitude à la traite et pour l extérieur. Pendant que la valeur d élevage durée d utilisation d un taureau n est pas disponible, l extérieur est pondéré davantage dans la valeur d élevage globale, à savoir à 20 %. Braunvieh Schweiz 2010 25

L absence de la durée d utilisation dans la valeur d élevage globale a aussi des effets sur les facteurs des autres caractères: VEG = 94 + 0.01 * [0.23 * VE lait kg + 11 * VE MG kg + 47 * VE protéines kg + 24 * VE MG % + 1031 * VE protéines % + 0 *VE durée d utilisation + 6.4 * VE persistance + 15.4 * VE cellules somatiques + 7.2 * VE TNR filles + 2.1 * VE délai mise repr. +12.1 * VE aptitude traite + 529 * VE extérieur ] Valeur d élevage vaches VEG = 97 + 0.01 * [0.32* VE lait kg + 12 * VE MG kg + 44 * VE protéines kg + 82 * VE MG % + 794 * VE protéines % + 8 * VE persistance + 24 * VE cellules somatiques + 595 * VE extérieur La valeur d élevage globale pour vaches ne comporte pas tous les caractères du fitness puisque certaines valeurs d élevage fitness ne sont calculées que pour les taureaux. L extérieur est pourtant pondéré davantage. La valeur d élevage globale pour taureaux n est calculée que pour les taureaux disposant des résultats du testage par la descendance (suisses ou d Interbull) pour les caractères laitiers, les cellules somatiques, l aptitude à l traite et l extérieur. Quant aux vaches, il faut qu elles disposent, pour le calcul de la valeur d élevage globale, des valeurs d élevage pour les caractères laitiers ainsi que des valeurs d élevage pour l extérieur. Valeur d élevage écologique Grâce à sa bonne constitution et à son métabolisme stable, la race Brune convient parfaitement à la production de lait dans les conditions de l agriculture biologique. En étroite collaboration avec Bio Suisse et avec l Institut des recherches en agriculture biologique (FiBL), la Fédération suisse d élevage de la race Brune a introduit, pour la saison d élevage 2000/01, la valeur d élevage écologique (VEE). La VEE tient particulièrement compte des objectifs et des conditions de l agriculture écologique, respectivement biologique. Les caractères du fitness et de l extérieur sont pondérés davantage que dans la VEG. Etant donné que des valeurs d élevage vaches ne sont pas estimées pour tous les caractères du fitness suite à leurs héritabilités relativement basses, les VEE ne sont calculées que pour les taureaux. 26 Braunvieh Schweiz 2010

Les caractères de productivité lait, quantité matière grasse, quantité protéines, teneur en protéines, persistance et amélioration de la productivité représentent les 40% de la VEE, alors que les caractères de constitution tels que la durée d utilisation, le taux des veaux nés vivants, la fécondité femelle, les cellules somatiques et l extérieur font 60% de la VEE: VEE Quantité lait 8% Quantité matière grasse 7% Quantité protéines 6% Teneur protéines 3% Persistance 8% Amélioration productivité 8% Durée d utilisation 20% Taux veaux nés vivants 2% TNR filles 2% Délai mise à la reproduction 2% Cellules somatiques 9% Extérieur 25% Pour la VEE, contrairement au calcul usuel des valeurs d élevage lait, la première, la deuxième et la troisième lactation ne sont pas pondérées à 1 / 3 chacune. La première lactation est intégrée à 20%, la deuxième à 30% et la troisième à 50% dans le calcul. La troisième lactation est pondérée le plus pour mieux tenir compte des performances des lactations ultérieures et pour éviter le traitement défavorable des animaux tardifs. Le caractère amélioration de la productivité a été défini spécialement pour la VEE. Dans l agriculture biologique, au niveau de l alimentation du bétail laitier, on ne vise pas des rendements élevés en 1 ère lactation, mais on s intéresse de bons rendements accomplis aux lactations ultérieures. L objectif est la vache qui améliore nettement sa productivité d une lactation à l autre. Le calcul de l amélioration de la productivité s effectue moyennant la formule suivante: Amélioration productivité = 1 / 5 * (2 * VE lait 2 e lact. + 3 * VE lait 3 e lact. ) VE lait 1 ère lact. Dans la VEE, les caractères de la constitution durée d utilisation (pondération 20%), taux de veaux nés vivants, fécondité femelle (TNR filles, délai de mise à la reproduction), cellules somatiques et extérieur (pondération 25%) ont une grande importance. Pour calculer la VEE, on ne se sert pas de la note globale, mais d une valeur légèrement modifiée. Contrairement à la Braunvieh Schweiz 2010 27

note globale, les positions gabarit, bassin et pis sont pondérées un peu moins, alors que la position membres est pondérée davantage. La VEE est calculées uniquement pour les taureaux disposant des résultats suisses du testage par la descendance. Il faut que les taureaux aient des valeurs d élevage pour tous les caractères de la VEE, à l exception de la fécondité. Par conséquent, les jeunes taureaux testés par la descendance n obtiennent pas encore de VEE. Représentation et publication Les valeurs d élevage lait, fitness, écologiques et globales sont standardisées de façon à ce que la moyenne des animaux de base se situe à 100 et que l écart-standard génétique s élève à 12. Cela veut dire que la plupart des animaux ont des valeurs d élevage globales dans la plage de 70 à 130. Les vaches de six à huit ans représentent la base de la VEG vaches et de la VL, alors que les taureaux de huit à dix ans constituent la base de la VEG taureaux, de la VF et de la VEE. Perspectives La valeur d élevage globale combine les caractères importants au niveau économique et zootechnique en une seule valeur, et elle représente ainsi un instrument moderne pour réaliser le but de sélection. Le travail zootechnique se fait comparer avec un voyage en train. La valeur d élevage globale détermine la direction, et l intensité de sélection décide de la vitesse du voyage. C est seulement avec l application conséquente de la valeur d élevage globale, combinée avec une intensité de sélection importante, que l on voyage dans un train rapide qui arrive à la bonne destination. 28 Braunvieh Schweiz 2010