Projet d observatoire des chauves souris de Bretagne

Projet d observatoire des chauves souris de Bretagne 2013 2016 Murins de Natterer Thomas Dubos Juillet 2012

Projet d observatoire des Chauves souris de Bretagne 2013 2016 Josselin BOIREAU 1 & Arnaud Le HOUÉDEC 2 Avec la collaboration de : Thomas DUBOS 3 & Eric PETIT 4 Juillet 2012 1 Chargé de mission «chauves souris» au GMB. 2 Chargé d'étude à Bretagne Vivante, coordinateur du Plan d'actions pour les Chiroptères en Bretagne 3 Chargé de mission «études et médiation pour les mammifères sauvages» au GMB 4 Membre du Groupe Chiroptères de Bretagne Vivante, chercheur CNRS/Université de Rennes 1 Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 1

Sommaire LES STRUCTURES PORTEUSES DU PROJET 3 CONCEPTION DU PROJET 3 1. INTRODUCTION 4 2. LES DIFFERENTS INDICATEURS EN PLACE EN BRETAGNE 6 3. LES AXES DE L OBSERVATOIRE 7 DES CHAUVES SOURIS DE BRETAGNE 7 3.1. Suivi des populations anthropiques de l Annexe II de la Directive Habitats 7 Objectif 1 : Suivi hivernal 8 Objectif 2 : Suivi estival 9 3.2. Suivi des espèces «communes» de chauves souris 10 Objectif 3 : Suivi des colonies estivales 10 Objectif 4 : Vigie Nature 11 3.3. Suivi des espèces de chauves souris forestières 13 Objectif 5 : Suivi des chauves souris forestières 13 3.4. Poursuite des inventaires des gîtes de mise bas 14 Objectif 6 : Recherche des gîtes de mise bas pour assurer leur suivi et leur protection 14 3.5. Traitement et diffusion des indicateurs 15 Objectif 7 : Mise à jour de la hiérarchisation des sites 15 Objectif 8 : Mise à jour de l état des lieux des sites connus 16 Objectif 9 : Diffusion des résultats 17 4. PORTAGE ET ARTICULATION DE L OBSERVATOIRE 18 5. ORGANIGRAMME 19 6. ANNEXES 20 7. BUDGETS 27 Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 2

Les structures porteuses du projet Depuis plusieurs années, deux structures travaillent particulièrement à l étude et la protection des chiroptères en Bretagne : Bretagne Vivante et le Groupe Mammalogique Breton. Au sein de l association régionale de protection de la nature Bretagne Vivante s est développé un groupe chiroptères dès 1986. Cette équipe qui réalise des études, expertises et gère des réserves, est animée par deux chargés de mission «chauvessouris». L'un d'eux est en charge du Plan Régional d'action pour les Chiroptères en Bretagne. De 2003 à 2006, Bretagne Vivante SEPNB a mis en œuvre un Contrat Nature sur le Petit rhinolophe et de 2008 à 2011, l association était en charge d un part importante des actions du Contrat Nature Chauves souris de Bretagne. Le Groupe Mammalogique Breton (GMB) est une association d étude et de protection des mammifères qui travaille sur les chauves souris depuis sa création en 1988. Le GMB réalise des expertises et études et gère des réserves à chauves souris. De 2001 à 2004, le GMB a mis en œuvre un Contrat Nature Grand rhinolophe et de 2008 à 2011, il a coordonné le Contrat Nature Chauves souris de Bretagne. Au sein de l association, un salarié est chargé de mission «chauves souris» et plusieurs salariés sont aussi spécialisés dans les chiroptères. Dans le cadre du suivi des chauves souris forestières (Objectif 5), nous proposons de mener conjointement le travail avec l Office National des Forêts (ONF) et le Centre Régional de la Propriété Forestière Bretagne (CRPFB). Ces acteurs seraient parties prenantes dans le choix des sites observés et l interprétation des données, ceci afin d avoir un diagnostic partagé entre les associations et les professionnels de la forêt. Les salariés du Conseil Général d Ille et Vilaine participeront aussi à la mise en œuvre de ce volet sur les ENS. Conception du projet Le projet présenté ci après est issu d une réflexion globale menée au cours des 4 dernières années dans les groupes chiroptères de Bretagne Vivante et du GMB. Une première version du projet, réalisée en janvier 2012 par Arnaud Le Houédec, a servi de base à une discussion en février permettant d affiner le projet. Le présent document issu de cette réflexion a été présenté, complété et soumis à validation par les chiroptérologues bretons le 21 avril, lors d une rencontre régionale à Vannes. L ensemble des actions présenté est conforme à la fiche «Eléments d orientation pour une meilleure connaissance du Patrimoine Naturel en Bretagne Les chiroptères» validée le 28 juin par le Conseil Scientifique Régional du Patrimoine de Bretagne (Voir Annexes). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 3

1. Introduction Les chauves souris sont des mammifères rares et menacés. Les différents travaux d inventaire réalisés en Bretagne ces dernières années ont permis d identifier les espèces présentes et les principaux enjeux de conservation. De part leur place dans les écosystèmes et leur statut réglementaire, les chauves souris et notamment les espèces inscrites à l Annexe II de la Directives Européenne «Habitats Faune Flore» constituent un point fort pour l argumentaire en faveur de l amélioration des trames et des connectivités à maintenir ou restaurer. Ces espèces s inscrivent systématiquement dans les programmes de maintien de la biodiversité (plan national et régional d action), dans les politiques de conservation (SCAP, TVB, Natura 2000 ) et sont reconnus comme des indicateurs importants de la responsabilité nationale et régionale contre l érosion de la biodiversité. Depuis 20 ans, les naturalistes du Groupe Mammalogique Breton (GMB) et de Bretagne Vivante, réalisent des actions de suivi et de protection des populations de chauves souris. Dans le cadre de cette dynamique, ces structures ont réalisé, avec le soutien de l Europe, de la Région et des Conseils Généraux quatre Contrats Nature liés aux chauves souris: Espaces naturels régionaux prioritaires pour les mammifères d intérêt européen (1996 1999), piloté par le GMB, Etude et sauvegarde des populations de Grand rhinolophe du bassin versant de la Rade de Brest, piloté par le GMB, Plan d action régional en faveur du Petit rhinolophe, piloté par Bretagne Vivante et Contrat Nature Chauves souris de Bretagne piloté par le GMB. Ces Contrats Nature ont permis de faire énormément progresser les connaissances sur les chauvessouris bretonnes et de mettre en place de nombreuses actions conservatoires. Dans le même temps, les salariés et bénévoles de ces structures ont pu développer des actions en dehors des Contrats Nature, mais qui découlaient directement des résultats de ceux ci : études des terrains de chasse par la techniques du radiopistage, étude du régime alimentaire, découvertes de nouvelles espèces de chauves souris lors d opération de capture Toutes ces actions ont abouti à plusieurs avancées dans le domaine de la chiroptérologie et de l appréciation des espèces comme indicateurs biologiques : Suivi des colonies de mise bas et des populations hivernantes selon des protocoles permettant d apprécier les tendances démographiques des espèces en bâtiments de l Annexe II de la Directive Habitats, Mise en place d actions conservatoire sur des sites majeurs à chauves souris (conventions communales, conventions privées, APPB, Réserves associatives, Opération Refuges pour les chauves souris ), Meilleur connaissance de l écologie des espèces (zones de chasse, comportement, régime alimentaires ) grâce à des techniques nouvelles (radiopistage, écoutes, captures sur zones de chasse ), Collecte de données centralisées par les associations depuis la fin des années 1980, réunies grâce aux projets communs (Contrats Nature et Atlas) et qui permet leur exploitation, Communication par l édition d articles grand public ou scientifique, de plaquettes, d affiches ou la réalisation d animations, la tenue de stand Enfin, formation d un vaste réseau d observateurs en Bretagne, capable de mettre en place des protocoles de suivi strictes avec parfois l usage de techniques pointues (usage de détecteurs d ultrasons, par exemple). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 4

L aboutissement du Contrat Nature Chauves souris de Bretagne (2008 2011) permet à son échéance de disposer d une base solide, fournie et indicatrice sur les espèces. Les protocoles de suivis des populations et de recherche d informations ainsi que les modes de hiérarchisation des enjeux de conservation se sont révélés valides et reproductibles annuellement pour construire un observatoire permanent des chauves souris de Bretagne. En plus des actions de suivi déjà engagée, il s avère nécessaire d intégrer à cet observatoire les chauves souris anthropiques communes et les espèces forestières afin de disposer d une vue globale de l évolution des espèces dans tous les habitats. Au delà du suivi des espèces, l Observatoire des Chauves souris de Bretagne a comme ambition d apporter des informations permettant d observer les impacts des modifications des paysages et des changements globaux (notamment le changement climatique). En effet, les chauves souris sont particulièrement sensibles à ces éléments (changement des pratiques agricoles, urbanisme ). Nous savons que pour observer des évolutions d espèces, il faut disposer de données sur le long terme. Une partie du projet concerne donc la poursuite du suivi d espèces déjà engagé de longue date ou plus récemment. La connaissance de l évolution des effectifs de certaine espèce depuis près de 15 ans sur certain site est un véritable trésor scientifique qui permet déjà de tirer des enseignements. Il est impératif de poursuivre ce travail. Toutes les chauves souris exploitent les milieux forestiers. Nous présentons que les modifications importantes des boisements prévues dans le futur (recours au bois énergie, augmentation de la demande en bois d œuvre, modification des peuplements lié au changement climatique...), auront des répercutions sur la biodiversité. C est pourquoi, dans le cadre ce projet, nous proposons une action spécifique autour des chauves souris forestières. Ce suivi est tout à fait novateur et unique en France. Si le suivi occupe une part importante du projet, nous avons souhaité poursuivre la recherche de nouvelles colonies. Cette connaissance est la base de la mise en protection de ces sites et bien évidemment ces colonies seront intégrées aux suivis. Enfin, toutes les données qui seront collectées serviront à alimenter l ensemble des stratégies et réflexions d aménagement du territoire : SCAP, TVB, PLU Ce travail d analyse et de diffusion des connaissances sera réalisé en lien étroit avec le GIP Bretagne Environnement. Le présent projet est complémentaire, ou assure la continuité, d autres actions de suivi réalisées dans le cadre de l Atlas des mammifères sauvages de Bretagne (2011 2014). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 5

2. Les différents indicateurs en place en Bretagne Actuellement, trois méthodes permettent de suivre l évolution des populations de chauves souris ; suivis estivaux et hivernaux des espèces de l Annexe II de la Directive Habitats, circuits Vigie Nature et suivi des espèces communes (Tableau 2.1.). Ces deux derniers programme sont mis en place jusqu en 2014 dans le cadre de l Atlas des Mammifères sauvages de Bretagne. Tableau 2.1. Bilan des indicateurs chauves souris actuellement en place en Bretagne Action Méthode Intérêt Limite Action actuellement mise en œuvre Cadre de la mise en œuvre Suivi des colonies d espèce d annexe II Circuits Vigie Nature Comptage des colonies de reproduction d espèces communes Comptage en hiver et en été Ecoute d ultrasons répétée Comptages estivaux. Possibilité d impliquer le grand public. Information sur l évolution des populations d espèces rares. Données depuis 1999. Informations sur l évolution d espèces communes Information sur les espèces communes. Absence d information pour les espèces communes Nécessite un nombre importants de circuits (25) pour obtenir une information quelque soit l échelle. Actuellement, ce programme est mis en place au niveau régional par le GMB. Aucun recul (premières données de 2011) Action mise en œuvre bénévolement par les associations en 2012, sauf dans le Finistère où le GMB bénéficie d un soutien du Conseil Général. Oui Oui Plan Régional d'actions pour les Chiroptères en Bretagne Observatoire des chauvessouris en Finistère (annuel). Atlas des Mammifères de Bretagne (Fin en 2014). Atlas des Mammifères de Bretagne (Fin en 2014). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 6

3. Les axes de l Observatoire des chauves souris de Bretagne Les 9 objectifs présentés ci après correspondent à des actions qu il est nécessaire de poursuivre ou de mettre en œuvre pour évaluer l évolution des populations de chauves souris en Bretagne, identifier les enjeux de conservation et diffuser ces connaissances. L ensemble de ces travaux constitue un projet associatif d Observatoire des chauves souris de Bretagne. 3.1. Suivi des populations anthropiques de l Annexe II de la Directive Habitats Les objectifs sont de suivre l évolution des populations et leur dynamique démographique en hiver (Objectif 1) et en été (Objectif 2) et de connaître, sur les sites protégés, la pertinence du mode de gestion et son impact. Ce travail correspond à la poursuite des actions de suivi engagées depuis le début des années 2000. Ainsi, cours du Contrat Nature Chauves souris de Bretagne, environ 350 sites hivernaux et 140 colonies de mise bas ont été suivies annuellement (Figure 3.1. et Figure 3.2.). Ce travail a permis de définir des tendances d évolution des populations ciblées (Tableau 3.1.). Figure 3.1. Nombre de sites à chauves souris contrôlés en hiver depuis 1999 2000. Figure 3.2. Nombre de colonies de mise bas de Petit rhinolophe, Grand rhinolophe, Grand murin et Murin à oreilles échancrées contrôlées depuis 450 400 350 300 250 200 150 100 50 0 1999-2000 2000-2001 2001-2002 2002-2003 2003-2004 2004-2005 2005-2006 2006-2007 2007-2008 2008-2009 2009-2010 2010-2011 160 140 120 100 80 60 40 20 0 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 Murin à oreilles échancrées Grand murin Grand rhinolophe Petit rhinolophe Tableau 3.1. Evolution des populations de chauves souris bretonnes entre 2000 et 2011 Effectifs Evolution 2000 2011 2011 Espèce Hivernants Adultes reproducteurs Hivernants Adultes reproducteurs Petit rhinolophe 350 2550 Grand rhinolophe 6000 5300 Grand murin 850 1100 Murin à oreilles échancrées 200 2300 Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 7

Objectif 1 : Suivi hivernal Laurent Arthur Murin à moustaches Les sites d hibernation (caves, grottes, mines ) accueillent en hiver une ou plusieurs unités de populations de chauves souris. Ils peuvent être de typologie variable : caves, tunnels, greniers La quantité et la diversité des chauves souris présentes sont conditionnées par divers éléments : type de gîte, environnement proche, conditions météorologiques, dérangement L existence de site d hivernage est vitale pour les chauves souris. Résultats attendus : Un suivi des sites hivernaux à chiroptères est nécessaire pour : connaître l évolution des populations à long terme, connaître sur les sites protégés la pertinence du mode de gestion et son impact, définir des politiques de protection, assurer la pérennité des gîtes. Choix des espèces : Le suivi concerne les espèces suivantes listées à l Annexe II de la Directive Habitats, dont deux inscrites à la liste des espèces guides de la Trame Verte et Bleue en Bretagne (*) : Petit rhinolophe*, Grand rhinolophe*, Grand murin, Murin à oreilles échancrées. Ces espèces ont été sélectionnées car elles recherchent et se regroupent au sein de vastes complexes souterrains en hiver, facilitant leur dénombrement. A l occasion des suivis, toutes les espèces présentes sont dénombrées. Choix des gîtes : Tous les gîtes accueillant des chauves souris mais en priorité les sites occupés par les espèces citées. Au final, le suivi des sites d hivernage concerne près de 150 sites. Xavier Rozec Grand murin Protocole : Pour être pertinent, le travail de suivi doit respecter deux recommandations : Il faut contrôler le maximum de sites avec une action prioritaire sur les sites majeurs, Il faut réaliser des comptages simultanés (au cours de la même journée) pour des gîtes proches pour éviter des doubles comptages dus aux déplacements possibles des animaux. Au delà de l action scientifique, une présence régulière sur les sites protégés permet d assurer une surveillance de l évolution des aménagements et de maintenir un contact et une information auprès des propriétaires et des riverains. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 8

Objectif 2 : Suivi estival Josselin Boireau L été les femelles s installent dans des sites chauds, sombres et calmes comme des combles, mais aussi des arbres creux ou dans des micros gîtes sous des ponts. La colonie de mise bas est l unité de base de population chez les chiroptères européens, elle comprend les femelles (adultes et immatures) regroupées au sein d un gîte ou de plusieurs gîtes dans le cas d une méta colonie. Résultats attendus : Suivre l évolution dans le temps des populations et leur dynamique démographique. Choix des espèces : Le suivi concerne les espèces suivantes listées à l Annexe II de la Directive Habitats, dont deux inscrites à la liste des espèces guides de la Trame Verte et Bleue en Bretagne (*) : - Petit rhinolophe* (86 sites), - Grand rhinolophe* (37 sites), - Grand murin (13 sites), - Murin à oreilles échancrées (15 sites). Le choix de ces espèces réside dans la connaissance déjà avancée que l on peut avoir de la présence de leurs colonies de parturition situées exclusivement dans des édifices ou des gîtes accessibles à l homme. Cette situation facilite donc leur contrôle et autorise des interprétations quant à leur évolution dans le temps. Choix des sites : Toutes les colonies connues, auxquelles s ajouteront les colonies qui seront découvertes. Protocole : En fonction des gîtes, des espèces ou encore du nombre d individus, différents types de comptages peuvent être envisagés : Directement au gîte en journée en présence des adultes et des jeunes : valable sur les colonies à faible effectif ( de 50 individus adultes et immatures) et sur les colonies de petits rhinolophes, moins susceptibles que les autres espèces au dérangement, En sortie de gîte après le départ des adultes et immatures : offre la possibilité de compter les individus sortant puis les jeunes restés seuls dans le gîte. Pour les grands rhinolophes, les grands murins et les murins à oreilles échancrées un premier comptage sera réalisé mi juin et un autre à la mi juillet afin d avoir une idée juste du nombre de jeunes de l année. Programmation des Objectif 1 et 2 : Année Actions 2013 à 2016 poursuite des suivis, mise à jour des données, réalisation de synthèses annuelles. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 9

3.2. Suivi des espèces «communes» de chauves souris Depuis 20 ans, un travail très important a été réalisé autour des espèces prioritaires. Ceci correspondait à une urgence devant le déclin dramatique de ces espèces. Les chauves souris les plus «communes», comme la Pipistrelle commune, l Oreillard gris ou la Sérotine commune, n'ont dès lors pas fait l'objet d'actions aussi attentives et pointues. On peut pourtant supposer que ces espèces qui vivent proches des hommes sont les plus impactées par les modifications environnementales. Dans le même temps, nous sommes actuellement incapables de définir les évolutions de ces populations. Nous proposons donc de mettre en place un suivi des colonies estivales d espèces communes (Objectif 3) et de poursuivre et renforcer le protocole de surveillance Vigie Nature (Objectif 4). Objectif 3 : Suivi des colonies estivales Les chauves souris d espèces communes sont aujourd hui très peu suivies au niveau national. Le programme de suivi des chauves souris communes (Vigie nature) relayé dans le cadre de l Atlas des Mammifères de Bretagne et porté par le Muséum National d Histoire Naturelle se base sur la détection des chauves souris en chasse ou en transit par écoute d ultra sons. Toujours dans le cadre de l Atlas, il est proposé d aller plus loin en mettant en place un suivi des colonies d espèces «communes» par la méthode du comptage en sortie de gîte. Résultats attendus : L objectif est d établir à minima un suivi pérenne de 10 colonies de mise bas de Pipistrelle commune par département et du plus grand nombre possible de colonies de mise bas de Sérotine commune et d Oreillard gris. Le but final est de déceler sur plusieurs années les tendances d évolution d effectifs chez ces espèces. Choix des espèces : Le suivi concerne des espèces communes et anthropiques : Pipistrelle commune, Oreillard gris, Sérotine commune. Choix des gîtes : Tous les gîtes accueillant ces espèces en reproduction Josselin Boireau Protocole : Les comptages sont réalisés la première quinzaine de juin. Cette période garantit une certaine fidélité des chauves souris au gîte car les premières naissances ont eu lieu ou ne tarderont pas. Ces dénombrements consistent en un comptage, en sortie de gîte, des chauves souris qui quittent leur gîte diurne pour partir en chasse. Nous souhaitons que ce travail prenne une forme participative en invitant le grand public à réaliser ces comptages (science participative). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 10

Premiers résultats réalisés dans le cadre de l Atlas des mammifères sauvages de Bretagne : L année 2011 a été la première année test du protocole et de son application. Une trentaine de naturalistes ont dénombré les effectifs de 15 colonies de chauves souris. Evidemment, nous ne pouvons pour le moment rien interpréter à partir de ces premières informations. Tableau 3.2. Bilan 2011 du suivi des espèces «communes» de chauves souris Espèce Département Nb colonies Nb individus Totaux colonies Totaux individus Moyenne par colonie Côtes d Armor 6 409 Finistère 2 46 Pipistrelle Ille et Vilaine commune Morbihan 3 119 Côtes d Armor Finistère 1 12 Sérotine Ille et Vilaine commune Morbihan Côtes d Armor 3 46 Finistère Oreillard Ille et Vilaine gris Morbihan 11 574 52,2 1 12 12 3 46 15,3 Totaux 15 632 42,1 Programmation de l Objectif 3 : Année Actions 2015 à 2016 poursuite des suivis engagés dans l Atlas, augmentation de la pression d observation, réalisation de synthèses annuelles. Objectif 4 : Vigie Nature Pour permette l évaluation des densités de population des chauves souris communes et celle, à long terme, de l évolution des effectifs, un programme de suivi a été lancé au niveau national en 2006. Cette opération, pilotée par le Muséum National d Histoire Naturelle (MNHN), est engagée dans le cadre de Vigie Nature, un programme national de suivi de la biodiversité (http://www2.mnhn.fr/vigie nature/). Depuis 2009, cette opération est relayée en Bretagne par le GMB. Elle est actuellement développée dans le cadre de l Atlas des Mammifères sauvages de Bretagne. Résultats attendus : Suivre l évolution dans le temps des populations et leur dynamique démographique. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 11

Choix des espèces : Le suivi concerne l ensemble des espèces de chauves souris mais plus particulièrement les pipistrelles, Sérotine commune et noctules. Ceci est lié à la relative abondance de ces espèces et aux caractéristiques de leurs ultrasons qui les rendent plus facilement détectables. Choix des sites : Il faut au minium 25 circuits en Bretagne soit 6 par département plus 1. Actuellement, 13 sont en places, 6 le seront en 2012 : 5 en Côtes d Armor, 3 en Finistère, 5 en Morbihan, et 6 en Ille et Vilaine. Protocole : Le protocole développé repose sur l écoute et l enregistrement des ultrasons émis par les chauves souris. Il comporte deux versions : l une en voiture, l autre à pied. Deux passages d écoute sont réalisés (fin juin juillet et août septembre). Après l analyse des résultats, il est possible d identifier une part importante des espèces de chauves souris rencontrées et d obtenir un indice d activité des chauves souris. Les résultats des écoutes sont ensuite croisés avec les caractéristiques des habitats ou de l usage des sols pour affiner l interprétation. Les premiers résultats montrent que les informations collectées pour la Pipistrelle commune, la Sérotine commune, la Noctule de Leisler et le complexe Pipistrelle Kuhl/Nathusius permettent d évaluer les densités de population et leur tendance. Pour la Pipistrelle commune, il semble possible d identifier des variations de population à partir de 2% 5. Lors de ces prospections, d autres espèces peuvent être contactées comme le Murin de Daubenton, la Pipistrelle pygmée, la Noctule commune, la Barbastelle d Europe, le Petit rhinolophe, le Murin de Natterer et le Murin de Brandt. Premiers résultats réalisés dans le cadre de l Atlas des Sonogramme mammifères sauvages de Bretagne : Actuellement, le faible de nombre de circuits engagés et l absence de recul dans le temps ne permettent pas d apporter d informations. Programmation de l Objectifs 4 : Année Actions 2015 à 2016 poursuite des suivis engagés dans l Atlas, augmentation, si nécessaire de la pression d observation, formation en continue des bénévoles, réalisation de synthèses annuelles. 5 BLIER C., 2007. Suivi national des chiroptères communs : évaluation des biais et des potentialités d un protocole basé sur l enregistrement des émissions ultrasonore. Rapport, Master 1, Univ. Rennes 1, 15p. + ann. [ http://www2.mnhn.fr/vigienature/img/pdf/rapport_caroline.pdf] Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 12

3.3. Suivi des espèces de chauves souris forestières Les connaissances sur la biologie et le comportement des chauves souris arboricoles en Bretagne ont été particulièrement améliorées lors du précédent Contrat Nature Chauves souris. Il s avère que la forêt joue un rôle essentiel pour l ensemble des espèces. Toutes les chauves souris utilisent cet habitat en chasse et plusieurs espèces y trouvent aussi leurs gîtes. Les modifications drastiques des peuplements forestiers qui s annoncent dans les décennies à venir (recours important au bois énergie, modification des cycles d exploitation, augmentation de la demande en bois d œuvre ), nous invite à mettre en place dès aujourd hui des programmes de surveillance des chauves souris forestières. Le projet présenté ci après et détaillé en Annexe est totalement novateur et unique en France. Objectif 5 : Suivi des chauves souris forestières Après avoir consulté les spécialistes français des chauves souris forestières et étudié la bibliographie, il apparaît que le suivi de ces animaux d une manière directe (comptage des colonies en arbres gîte, suivi de nichoirs ) est particulièrement difficile à mettre en œuvres et apporte peu de résultat. Nous proposons donc de mettre en place un travail basé sur l enregistrement passif de l activité acoustique des chauves souris (voir détail la présentation détaillée de l opération en Annexe). Le choix de l écoute passive (plutôt qu active) est dicté par des contraintes humaines : le nombre d observateurs formés et compétents pour réaliser des écoutes actives, s il est relativement important en Bretagne, et en augmentation, demeure largement insuffisant au regard du nombre de sites à échantillonner. Résultats attendus : Etablir une surveillance de l activité des chiroptères dans les forêts bretonnes sur le long terme, en vue d évaluer l évolution de la qualité de ces milieux pour ces espèces et toutes celles dont elles dépendent. Choix des espèces : Ensemble des espèces de chauves souris fréquentant les boisements étudiés dont les cinq espèces inscrites à la liste des espèces guides de la Trame Verte et Bleue en Bretagne : Barbastelle d Europe, Murin de Bechstein, Murin de Daubenton, Petit rhinolophe et Grand rhinolophe. Choix des sites : Le projet consiste à réaliser un suivi annuel sur 12 forêts. Trois forêts seront suivies par département (une forêt sur un Espace naturel Sensible Départemental, une forêt domaniale et une forêt privée). Protocole : Le suivi sera réalisé à l aide d enregistreurs automatiques d ultrasons placés au niveau du sol et à hauteur de la canopée. Trois enregistreurs seront mis en place 3 jours de suite dans chaque forêt expertisée tous les ans. L analyse des enregistrements permettra de produire, pour chaque poste de suivi, au sol comme en canopée, un indice d activité correspondant à un nombre de contacts mesuré par heure. Le suivi de l évolution de cet indice servira d indicateur. Année 2013 2014 Programmation de l Objectif 5 : Actions acquisition du matériel, repérage des sites et description des milieux, conception des procédés d analyse Mise en œuvre de l action Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 13

3.4. Poursuite des inventaires des gîtes de mise bas Le travail d inventaire déjà réalisé nous a permis d identifier les principaux gîtes d hivernage des espèces rares de chauves souris. Mais la localisation des gîtes de reproduction reste à affiner. En effet, de nombreuses colonies sont situées dans des bâtiments privés qui nous sont inconnus. Pourtant cette connaissance est nécessaire pour assurer la protection et le suivi de ces gîtes. Objectif 6 : Recherche des gîtes de mise bas pour assurer leur suivi et leur protection Josselin Boireau Josselin Boireau Petit rhinolophe avec jeune Radiopistage Résultats attendus : La colonie de reproduction est l élément clé du renouvellement des populations de chiroptères. Dans le cadre d actions conservatoires, il est donc nécessaire d identifier ces sites pour pouvoir assurer leur pérennisation. Choix des espèces : Les recherches concerneront principalement les espèces suivantes listées à l Annexe II de la Directive Habitats, dont deux inscrites à la liste des espèces guides de la Trame Verte et Bleue en Bretagne (*) : - Petit rhinolophe* (86 sites), - Grand rhinolophe* (37 sites), - Grand murin (13 sites), - Murin à oreilles échancrées (15 sites). Protocoles : pour localiser les colonies reproductions, plusieurs méthodes sont proposées : recherche de type «porte à porte» dans des secteurs peu prospectés et offrant des habitats favorables aux espèces visées, réalisation d opérations de radiopistage de femelles allaitantes capturées sur leurs zones de chasse dans des secteurs où aucune colonie de mise bas n est connue, poursuite du travail d inventaire et de protection des colonies dans le cadre du réseau «SVP chauves souris». Programmation de l Objectif 6 : Année Actions 2013 à 2016 Mise en œuvre continue Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 14

3.5. Traitement et diffusion des indicateurs L ensemble du travail de suivi et d inventaire doit permettre de créer des outils indiquant l évolution des populations mais aussi tout un ensemble d éléments d aide à la décision et de mise en avant des enjeux patrimoniaux. Pour cela, nous proposons de mettre à jour les outils créés durant le précédent Contra Nature Chauves souris de Bretagne permettant de définir les priorités d action et les possibilités de mise en œuvre d actions de protection. Objectif 7 : Mise à jour de la hiérarchisation des sites Pour continuer à assurer une coordination et une stratégie dans les actions de protection des gîtes, nous proposons de mettre à jour la hiérarchisation des sites en fonction de leur intérêt chiroptérologique. Xavier Rozec Ces sites prioritaire sont aussi inclus dans les «réservoirs de biodiversité» de la Trame Verte et Bleue bretonne. Pour mener ce travail, nous utiliserons le protocole défini au niveau national dans le cadre du Plan de Restauration National Chiroptères. Figure 3.3. Hiérarchisation des sites majeurs à chauves souris en Bretagne Programmation de l Objectif 7 : Année Actions 2013 à 2016 Mise en œuvre de l action Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 15

Objectif 8 : Mise à jour de l état des lieux des sites connus Josselin Boireau Au cours du Contrat Nature Chauves souris de Bretagne, nous avons identifiés les sites d intervention prioritaires en fonction des résultats de la hiérarchisation et de différents éléments liés à la sensibilité du site et aux possibilités d intervention. Actuellement, sur 124 sites, 12 nécessitent la mise en place d actions conservatoires de manière urgente (intervention prioritaire) et 37 de manière rapide (intervention secondaire) soit 49 sites. Nous souhaitons continuer à mettre à jour de travail qui correspond à un ensemble d objectif conservatoire à atteindre. Figure 5.4. Protection des sites majeurs à chauves souris en Bretagne. Programmation de l Objectif 8 : Année Actions 2013 à 2016 Mise en œuvre de l action Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 16

Objectif 9 : Diffusion des résultats A partir des objectifs réalisés au sein de l observatoire, les données seront exploitées pour produire : une synthèse annuelle comprenant les chiffres clés de l observatoire (nombre de colonies de misebas connues et suivies, nombre de gîtes d hibernation connus et suivis, évolution des populations des espèces inscrites à la liste des espèces guides de la Trame Verte et Bleue, bilan des découvertes annuelles ), des indicateurs de suivi des populations (présence et évolution) et d aide à la décision concernant l aménagement du territoire (responsabilités locales, départementales, régionale, réservoir de biodiversité de la Trame Verte et Bleue ). Pour mettre à disposition du plus grand nombre les résultats de nos travaux, nous proposons de diffuser nos résultats via L Observatoire de la Biodiversité et du Patrimoine Naturel en Bretagne (http://www.observatoire biodiversite bretagne.fr/) Plusieurs types d information pourront être diffusés: les bilans de l observatoire des chiroptères, présentation du Contrat Nature, protocoles, bibliographie Les résultats et indicateurs seront aussi transmis au GIP Bretagne Environnement pour l intégration des informations dans sa base de connaissance. Nous proposons également durant l année 4 du projet, d accueillir un étudiant en Master 2 afin de mener une analyse statistique globale des résultats collectés. Bien évidemment, les premiers objectifs seraient d identifier des tendances évolutives. Mais il serait aussi intéressant de juxtaposer nos observations aux informations géographiques disponibles, pour, par exemple, lier les indicateurs chauves souris à la fonctionnalité écologique du paysage, notamment dans le cadre de la Trame Verte et Bleue. Programmation de l Objectif 9 : Année Actions 2013 à 2016 Mise en œuvre 2016 Mise en œuvre Analyse globale des résultats Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 17

4. Portage et articulation de l observatoire Projet validé sur ses orientations par le Conseil Scientifique Régional de Protection de la Nature (CSRPN), l observatoire sera mis en œuvre par les associations chiroptérologiques bretonnes en collaboration avec le monde forestier. Pour atteindre les objectifs que l observatoire s est donné, les associations rassemblent plusieurs atouts majeurs : Les compétences de bénévoles et de salariés reconnus par les réseaux français de chiroptérologie, Un réseau d observateurs nécessaire pour assurer un bon suivi qualitatif (respect de la déontologique, précision des relevés ) et capable d être activé tant sur des missions réclamant une synchronisation que sur des suivis tout au long de l année, Une base d observations fournie qui permet d établir le référentiel pour la répartition et l évolution des populations, Un historique concernant des objectifs similaires lors du dernier Contrat Nature 2008 2011. Sur la base de la collaboration réussie lors du Contrat Nature 2008 2011, Bretagne Vivante et le Groupe Mammalogique Breton peuvent être reconduits comme les maîtres d œuvre des objectifs listés ci dessus. A l instar du même Contrat Nature cité, une coordination sera assurée par une seule structure, le Groupe Mammalogique Breton, pour assurer le rassemblement, le traitement et le rendu de l information. Dans la poursuite des collaborations déjà engagées, le coordinateur s engage à maintenir des liens étroits avec le GIP Bretagne Environnement afin que l exploitation et la valorisation des données soient optimales, notamment dans le cadre des politiques publiques structurantes (SRCE, PLU, SCOT ). Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 18

5. Organigramme Coordination du Contrat Nature Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau Objectifs Objectif 1 : suivi hivernal + bilan Objectif 2 : suivi estival + bilan Objectif 3 : suivi colonies d espèces «communes» Objectif 4 : Vigie Nature Objectif 5 : suivi des chauvessouris forestières Objectif 6 : inventaire des colonies de mise bas Objectif 7 : mise à jour de la hiérarchisation des sites Objectif 8 : mise à jour de l état des lieux des sites connus Objectif 9 : diffusion des résultats Mise en oeuvre Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Arnaud Le Houédec Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Arnaud Le Houédec Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Thomas Le Campion Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Thomas Dubos Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Thomas Dubos et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Eric Petit Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau pour le 29 et Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Thomas Dubos pour le 22 et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Arnaud Le Houédec Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Thomas Dubos et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Arnaud Le Houédec Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau et Structure : Bretagne Vivante Responsable : Arnaud Le Houédec Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Josselin Boireau Gestion comptable Structure : Groupe Mammalogique Breton Responsable : Marie Bernadette Inizan Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 19

6. Annexes Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 20

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Observatoire des chauves souris de Bretagne Suivi temporel de l activité chiroptérologique dans les forêts en Bretagne Protocole Contexte Sous l effet des activités humaines, les forêts et autres structures boisées connaissent une évolution dramatique (pris au sens des vitesses et de la profondeur des changements), notamment en Bretagne (on pense par exemple à la transformation du paysage par le remembrement). Les politiques publiques actuelles visent à concilier activités économiques et maintien des conditions de ces activités, ce qui, paradoxalement pour certains, nécessite absolument de préserver et renforcer la biodiversité. C est notamment vrai pour la production agricole et forestière : ce sont des activités liées au vivant, et donc à une complexité d interactions qui en sont une condition nécessaire. Pour évaluer l efficacité de ces politiques publiques, il est aujourd hui nécessaire de mettre en place des indicateurs non seulement économiques et sociaux mais aussi biologiques, pour évaluer les conséquences de mesures d aménagement, de choix de parcours techniques, ou de mode d exploitation, sur la biodiversité. Toutes les espèces de chauves souris bretonnes utilisent le milieu forestier ou, à minima, les structures linéaires verticales que représentent les haies ou les lisières des bosquets et autres bois, à un moment ou un autre de leur cycle de vie. Certaines en sont dépendantes pour leurs gîtes, la plupart s y alimentent, et toutes ou presque les utilisent comme guides pour leurs routes de vol : les espèces qui les utilisent pour ces trois ressources en sont totalement dépendantes. Par ailleurs, de par leur rôle dans bon nombre de services écosystémiques, les chiroptères représentent de bons marqueurs de la qualité des milieux terrestres producteurs d insectes (les espèces européennes sont insectivores) comme les forêts, qu elles protègent, comme elles protègent les cultures, contre les ravageurs. Les chauves souris sont toutes protégées en France et représentent un quart des espèces de Mammifères terrestres de la métropole. Objectif Il s agit d établir une surveillance de l activité des chiroptères dans les forêts bretonnes sur le long terme, en vue d évaluer l évolution de la qualité de ces milieux pour ces espèces et toutes celles dont elles dépendent. Choix de la technique de suivi Une difficulté du suivi forestier de chauves souris est liée au fait qu aucune technique active (captures, suivi de nichoirs, points d écoute ultrasonores ) n est représentative de l ensemble des espèces qui fréquentent ces milieux, sauf à exercer une pression d observation telle que les moyens matériels et humains à mobiliser seraient trop importants. Nous avons donc choisi de mettre en place un protocole passif basé sur l enregistrement de l activité acoustique. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 23

L identification acoustique des chiroptères dans des milieux fermés ou semi fermés est souvent plus compliquée qu en milieu ouvert pour plusieurs raisons : les espèces difficilement discriminables entre elles telles que Myotis spp. ou Plecotus spp. y sont en proportion, mieux représentées, les signaux émis par les différentes espèces de chauves souris tendent à converger vers un stéréotype à mesure que l espace devient encombré, ceci s accompagnant d une diminution de la portée (et donc de la distance de détection) de ces mêmes signaux qui diffèrent d une espèce à l autre Néanmoins ces difficultés peuvent être largement résolues lors de l analyse. En premier lieu, le niveau d investigation dans la détermination acoustique des enregistrements sera adapté à ce milieu forestier particulier, de manière à conserver un niveau de fiabilité des identifications suffisant tout en limitant le temps de traitement des signaux : par exemple identification au niveau du genre, ou du type acoustique D autre part, des coefficients correcteurs peuvent être appliqués sur les niveaux d activité mesurés pour chaque groupe d espèce en fonction de leur niveau de détectabilité tel que le présente Michel Barataud dans le tableau ci contre : Intensité d'émission Le choix de l écoute passive (plutôt qu active) est dicté par très forte des contraintes humaines : le nombre d observateurs formés et compétents pour réaliser des écoutes actives, s il est relativement important en Bretagne, et en augmentation, demeure largement insuffisant au regard du nombre de sites à échantillonner. faible moyenne forte sous-bois Espèces distance détection Rhinolophus hipposideros 5 5,00 Plecotus spp 5 5,00 Myotis emarginatus 8 3,10 Myotis nattereri 8 3,10 Rhinolophus ferr/eur/meh. 10 2,50 Myotis alcathoe 10 2,50 Myotis mystacinus 10 2,50 Myotis brandtii 10 2,50 Myotis daubentonii 10 2,50 Myotis bechsteinii 10 2,50 Barbastella barbastellus 15 1,70 Myotis oxygnathus 15 1,70 Myotis myotis 15 1,70 Pipistrellus pygmaeus 20 1,20 Miniopterus schreibersii 20 1,20 Pipistrellus pipistrellus 25 1,00 Pipistrellus kuhlii 25 1,00 Pipistrellus nathusii 25 1,00 Hypsugo savii 30 0,83 Eptesicus serotinus 30 0,83 Eptesicus nilssonii 50 0,50 Vespertilio murinus 50 0,50 Nyctalus leisleri 80 0,31 Nyctalus noctula 100 0,25 Tadarida teniotis 150 0,17 Nyctalus lasiopterus 150 0,17 coefficient détectabilité Protocole de suivi temporel Le protocole consiste en un suivi annuel de plusieurs massifs forestiers de la région par des enregistrements acoustiques de 3 nuits consécutives durant 3 heures. Chaque forêt suivie sera échantillonnée sur 3 postes choisis dans des peuplements âgés de feuillus et fortement structurés verticalement pour augmenter la probabilité d enregistrer l activité des espèces forestières spécialistes (oreillard roux, Barbastelle, murin à moustache, murin de Bechstein...) par des enregistrements au niveau du sol et à hauteur de la canopée (les systèmes d enregistrement passif SM2Bat+ permettent l utilisation simultanée de 2 micros déportés). Ces sites seront choisis en fonction de leur stabilité dans le temps (pas d exploitation prévue dans les 10 années à venir). Afin de limiter les besoin matériels, et donc l investissement, l ensemble des forêts suivies, ne le seront pas simultanément. Trois périodes de déploiement des enregistreurs passifs interviendront au cours de l été. Les groupes de forêts suivies simultanément seront suivies lors de périodes différentes d une année sur l autre : Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 24

Année N Juin Juillet Août Groupe de forêts 1 Groupe de forêts 2 Groupe de forêts 3 Année N+1 Juin Juillet Août Groupe de forêts 3 Groupe de forêts 1 Groupe de forêts 2 Année N+2 Juin Juillet Août Groupe de forêts 2 Groupe de forêts 3 Groupe de forêts 1 Année N+3 Juin Juillet Août Groupe de forêts 1 Groupe de forêts 2 Groupe de forêts 3... Les trois périodes de déploiement des enregistreurs seront ajustées au niveau de températures diurnes constatées, les heures d enregistrements seront, elles, ajustées en fonction de l heure du couché de soleil au sein de chaque période. Le nombre de forêts suivi est établi à 12 (soit des groupes de déploiement simultané de 12 enregistreurs dans 4 forêts). La répartition des 12 forêts suivies sera équilibrée tant en termes géographiques qu en termes de collaborations avec les propriétaires : 3 forêts suivies par département, que l on pourrait choisir comme cela : 1 forêt Espace naturel Sensible Départemental, 1 forêt domaniale, 1 forêt privée. L analyse des enregistrements permettra de produire, pour chaque poste de suivi, au sol comme en canopée, un indice d activité correspondant à un nombre de contacts mesuré par heure corrigé par le coefficient de détectabilité mentionné plus haut. Cet indice d activité pourra être apprécié par groupe d espèces discriminées, ou pour l ensemble des chiroptères, la diversité des groupes d espèces contactés sera également appréciée. C est l évolution dans le temps de cette activité acoustique des chauves souris, en fonction de variables explicatives (situationnelles, climatiques, de gestion ) qui devra nous permettre d apprécier, à long terme, l évolution de l intérêt chiroptérologique des forêts bretonnes. Calendrier Vu le caractère innovant du protocole, il est fait le choix de consacrer la première année du programme aux repérages des forêts suivies, à des tests du matériel (étalonnage, essais de déploiement ) et à la conception du procédé d analyse en série des enregistrements (formation à l analyse en série, conception des filtres ) de manière à ajuster le plus finement possible le protocole aux données recherchées. Nous n attendons pas de résultats de suivi pour l année 1, mais uniquement à partir de la seconde année qui verra le début du déploiement des enregistreurs sur l ensemble des 12 forêts suivies. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 25

Récapitulatif : Plan d échantillonnage : 2 strates (sol et canopée) pour 3 postes dans 12 forêts suivies 3h par soir, 3 soir de suite tous les ans. Quantité d information collectée : 54 heures d enregistrement par forêt et par an, soit, pour l ensemble de la région, 648 heures de suivi annuel pour 12 forêts. Variables réponse : diversité des groupes acoustiques, activité totale, activité/groupe acoustique Variables explicatives (relevées sur chaque postes) : composition (essences), structure (couverture des différentes strates ; effets de lisières intérieures : trouées, clairières sous bois, tunnels...), pourcentage de volume (par tranches) encombré (branches et feuilles vivantes) dans rayon de 10m, bois mort couché et sur pied. Matériel : 3 stations SM2BAT+ (Wildlife Acoustics) avec 2 micros/station par forêt. Déploiement simultané des enregistreurs dans 3 (ou 4) des 9 (ou 12) forêts suivies. total de 12 stations SM2Bat+ nécessaires pour le suivi de 12 forêts. Projet d Observatoire des Chauves souris de Bretagne Juillet 2012 26