Maîtriser la grippe récurrente en élevage porcin : apport d un outil de modélisation orienté pour l aide à la décision

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1 Maîtriser la grippe récurrente en élevage porcin : apport d un outil de modélisation orienté pour l aide à la décision CHARLIE CADOR, MATHIEU ANDRAUD, NICOLAS ROSE Conférence Anses, SPACE 13 Septembre 2017 [email protected]

2 La grippe porcine Orthomyxovirus de type A Symptomatologie Syndrome fébrile (hyperthermie, apathie, anorexie, ) Troubles respiratoires (toux, dyspnée, polypnée, ) Intensité fonction de l âge Syndrome grippal «classique» Maladie à caractère épizootique Propagation rapide à tous les animaux de l élevage Syndrome grippal récurrent Maladie à caractère enzootique Souvent en post-sevrage, avec répétition à âge fixe sur chaque bande Persistance à l échelle de l élevage 2

3 Persistance enzootique des virus influenza en élevage (Rose et al., 2013) Bande 1 ELEV#A Bande 2 Bande 3 Bande 1 ELEV#B Bande 2 Bande 3 Bande 1 ELEV#C Bande 2 Bande 3 3

4 Objectifs 1. Evaluer les capacités de persistance des virus Influenza 2. Comprendre les déterminismes de la persistance de la grippe au sein des élevages Modélisation pour décrire les interactions multiples 3. Evaluer l efficacité de mesures de maitrise visant à rompre les cycles d infections 4

5 Principe général du projet Modèle de dynamique de population Modèle épidémiologique

6 Expérimentation pour estimer le taux de transmission C1 AOM + Témoins AOM - B1 F1 Inoculation H1 av N1 B2 F2 Inoculation H1 av N1 Parc d infection Parc d infection B4 B3 F3 F4 6 [Cador et al., 2016a]

7 Différence de transmission avec et sans immunité passive Porcelets sans anticorps maternels R = 14,8 Epidémie de plus courte durée Porcelets avec anticorps maternels R = 5,8 Epidémie prolongée 7

8 Couplage des deux modèles population/virus Verraterie (32 jours) Salle gestante (82 j.) Transmission : contact physique + AEROSOLS Renouvellement - réforme Salles de maternité (26 j.) X X Mouvements des truies Mouvements des porcs charcutiers Modèle épidémiologique des truies Modèle épidémiologique des porcelets Salles de postsevrage (51 j.) Salles d engraissement(105 j.) Abattoir 8

9 Les résultats

10 Adéquation modèle/données 3 bandes successives dans 3 élevages Sorties du modèle Suivi longitudinal (Rose et al., 2013)

11 Persistance des virus influenza: la transmission par voie aéroportée Exemple d une simulation en conduite 10 bandes. Nombre de truies infectées Temps (j.) Nombre de porcs infectés Sous-type 1 Sous-type 2 Co-infections Temps (j.) 11

12 Mesures de maîtrise représentées dans le modèle Reproducteurs : Vaccination Bande-à-bande Vaccination de masse à 3 ou 4 mois d intervalle Objectifs : Induire une protection via l immunité maternelle chez les porcelets Diminution de la pression d infection chez les truies Porcs en croissance : Externalisation de bandes au sevrage 2 bandes successives 2 bandes avec un intervalle de 24 semaines Objectifs : Rompre la dynamique d infection en supprimant une fraction de la partie sensible.

13 Persistance des virus influenza : la conduite

14 Mesures de maîtrise : vaccination Exemple de la conduite en 5 bandes Peu ou pas d impact sur la dynamique globale des virus Réduction de la prévalence chez les truies mais persistance chez les porcs en croissance maintenue

15 Mesures de maîtrise: vaccination + externalisation

16 Conclusions Représentation explicite de ce phénomène enzootique Compréhension des déterminismes de la persistance L immunité maternelle Moindre sensibilité des porcelets Effet pervers La transmission par voie aéroportée La conduite en bandes Mesures réalistes Raisonnement plus global de la conception, l organisation et de l évolution de la structure des Export de bandes efficace élevages porcins Performances de la vaccination contrastées Evaluation de l efficacité de mesures de maitrise Vaccination Export Impact Truies BaB / (Truies +) Truies BaB + Porcs ( 3 b.) / Truies Masse (3 mois) / Truies Masse (4 mois) / Truies BaB 1 bande à 24 sem. d intervalle + Truies Masse (3 mois) 1 bande à 24 sem. d intervalle ++ Truies Masse (4 mois) 1 bande à 24 sem. d intervalle ++ Truies BaB 2 bandes consécutives +++ Truies Masse (3 mois) 2 bandes consécutives +++ Truies Masse (4 mois) 2 bande consécutives

17 Et maintenant? Mieux connaitre l efficacité de la vaccination sur la transmission Conduire une expérimentation pour estimer le taux de transmission chez des porcs vaccinés / non vaccinés avec Respiporc Flu 3 Intégration ultérieure de modèles spécifiques à d autres pathogènes d importance économique (eg. SDRP) Proposer aux vétérinaires / éleveurs une application permettant d identifier les meilleurs mesures de gestion à appliquer à leur élevage Aide à la décision en élevage 17

18 Projet de démarche à suivre pour le praticien (1/2) Etape 1 : Renseignement des caractéristiques de l élevage par l intermédiaire d un menu déroulant Conduite, nombre d animaux, organisation des bâtiments, Niveau de biosécurité via un audit Biosécurité Sous-types circulants via la détection et caractérisation virale sur un échantillon de porc en hyperthermie Proportion de truies immunisées via le profil sérologique d un échantillon de truies (parités différentes) Adaptation des paramètres du modèle au cas spécifique de l élevage Etape 2 : Simulation de la persistance des virus dans cette configuration et pour cet élevage précis Sortie graphique illustrant la fréquence attendue des épisodes grippaux sans mesure de contrôle Sortie graphique illustrant la fréquence attendue des épisodes grippaux avec les mesures actuelles Confrontation des simulations réalisées avec les données observées

19 Projet de démarche à suivre pour le praticien (2/2) Etape 3 : Test des différentes options et combinaisons Niveaux de biosécurité Protocoles de vaccinations Externalisation de bandes au sevrage Représentation du niveau de réduction de la persistance (ou du délai nécessaire pour observer une éradication) avec une probabilité de réussite associée Etape 4 : Analyse des différentes combinaisons testées Proposition d un plan d intervention global sous l éclairage des résultats des simulations du modèle

20 Remerciements Travaux de Thèse de Charlie Cador ( ) encadrés par Mathieu Andraud et Nicolas Rose (unité Epidémiologie et bien-être du Porc) Unité Virologie, Immunologie Porcines Séverine Hervé Céline Deblanc Nicolas Barbier Stéphane Gorin Stéphane Quéguiner Gaëlle Simon Service expérimental SPPAE André Kéranflech Jean Marie Guionnet Gérald Lediguerher Yann Bailly Nadège Morin Frédéric Paboeuf Financements 20