Bases de données biomédecine et santé
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- Jean André
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1 Bases de données biomédecine et santé -Bases de données pluridisciplinaires- HAL Archives ouvertes Contenu : articles scientifiques de niveau recherche, publiés ou non par ailleurs issus des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés thèses Diffuseur : CNRS-CCSD Accès : libre sur Internet SCOPUS Bases de données bibliographiques Contenu : 49 millions de références bibliographiques, citations et résumés, dont la moitié postérieures à 1996, extraites de revues à comité de lecture, 1200 revues en Open Access et 3,6 millions de compte-rendus de conférences Domaine : pluridisciplinaire (essentiellement Sciences et Santé) Diffuseur : Elsevier GOOGLE SCHOLAR Moteur de recherche spécialisé Contenu : moteur de recherche spécialisé dans la littérature de recherche universitaire, il constitue l'une des principales bases bibliographiques en accès libre, indexant une partie des articles de périodiques évalués par les pairs, des thèses, des livres, des rapports, des articles en pré-publication. Ce moteur peut donner accès au texte intégral, mais pas toujours. Langue d interrogation : multilingue Accès : libre...alors pourquoi passer par mon compte sur le site des bibliothèques pour y accéder? Via votre ENT ou un ordinateur du campus cliquez BU Paris Diderot (ou Findetext@BIUM) pour accéder au texte intégral sous abonnement de l établissement P a g e 1 10
2 -Bases de données Généralistes- (Classement alphabétique) BDSP : Banque de données en santé publique Bases de données bibliographiques Contenu : références, documents en texte intégral. Articles de revues, ouvrages de référence, thèse, mémoire, travaux académiques, actes de congrès, retours d expérience. Un effort pour recenser la littérature «grise». propose aussi un annuaire de sites, des offres d emploi, un blog et un glossaire. Domaine : Santé publique, Economie de la santé, Epidémiologie, Education à la santé, Ethique et bioéthique, Hygiène et infection nosocomiales, Prévention, Protection sociale Diffuseur : L école des Hautes Etudes en Santé Publique (EHESP) Rennes-Sorbonne-Paris Cité Accès : site institutionnel librement accessible sur Internet depuis 2006 Interface : avec un Thésaurus Astuce : le nuage de «Mots clés BDSP» après chaque affichage de résultats de recherche vous aidera à relancer une requête en utilisant le vocabulaire approprié. CLINICAL TRIALS Contenu : Base de données factuelle. Etudes (essais) cliniques en cours ou finalisées. Permet en outre d informer le grand public des possibilités de participation à de telles études études recensées en octobre Interface : Sans index Diffuseur : réalisée par les national Institutes of Health (NIH) des Etas Unis Accès : libre, gratuit et universel sur Internet COCHRANE LIBRARY Contenu : Collection de synthèses à haut niveau de preuve en médecine et odontologie. Base de premier recours dans le cadre de la démarche EBM (Evidence-Based Medicine) ayant pour but d'aider les professionnels de santé à prendre les meilleures décisions cliniques possibles en se basant sur l'état actuel des connaissances médicales. Domaine : Santé Interface : avec le thésaurus MeSH avec l usage de qualificatifs possible Diffuseur : Wiley Accès : libre pour les bibliographies/ Payant pour le texte intégral (accès gratuit via votre ENT et sur le campus de l Université) ECO-SANTE P a g e 2 10
3 Contenu : Base de données contenant plus de 7 millions de chiffres en accès gratuit et immédiat sur le fonctionnement des systèmes de santé en France et dans le monde depuis les années Domaine : Santé Diffuseur : Institut de recherche et de documentation en économie de la santé (IRDES) Accès : libre sur Internet : ELSEVIER MASSON Bases de données documentaire Contenu : validé par un comité de rédaction Intégralité des 45 traités de l'encyclopédie Médico-Chirurgicale (dont le traité de biologie) Articles publiés dans les revues Elsevier France de la Bibliothèque Médicale Française, depuis 1997 (en texte intégral depuis 2000). Livres numériques Domaine : médecine, psychologie (EMC - Psychiatrie et EMC - Pédopsychiatrie) (130 revues sont francophones et 80 anglophones) Diffuseur : Elsevier-Masson Mise à jour : trimestrielle mais pas pour l ensemble des fascicules INSB : Institut des sciences biologiques Domaine : Sciences du vivant Diffuseur : CNRS Accès : libre sur Internet : INSERM ( : Institut national de la santé et de la recherche médicale PUBMED MEDLINE Bases de données bibliographiques PubMed englobe la base Medline constituée des références indexées à l aide du MeSH (Medical Subject Headings) à laquelle s ajoute la «frange supérieure» des références très récentes non encore indexées par l équipe de la Nationale Library of Medicine des Etats Unis. Ce système permet une mise en ligne très rapide mais implique une double interrogation de la base. Le traitement documentaire tient compte du facteur d impact des revues. Le portail PubMed contient aussi des hyperliens vers divers sites contenant des articles en texte intégral, et menant vers d autres ressources factuelles (génétique, chimie ). Un site important d archives ouvertes est lié à PubMed : PubMed Central (environ articles en accès libre) Contenu : 22 millions de références bibliographiques dans PubMed émanant de revues biomédicales indexées dans le corpus Medline depuis Lien vers le texte intégral lorsque disponible P a g e 3 10
4 Domaine : tous les domaines biomédicaux (biochimie, biologie, médecine clinique, économie, éthique, odontologie, pharmacologie, psychiatrie, santé publique, toxicologie, médecine vétérinaire) 88%, français 3% (soit environ 100 revues éditées en France) Diffuseur : United States National Library of Medicine (NLM) Accès : libre sur Internet pour les bibliographies (Interface d'interrogation libre et gratuite de la base MEDLINE depuis 1997)/ Payant pour le texte intégral (accès gratuit via votre ENT et sur le campus de l Université) Interface: avec le thésaurus MeSH Astuce : connecté à votre compte personnel MyNCBI sur PubMed, les résultats peuvent être filtrés selon le texte intégral disponible en ligne à votre Université TOXNET Bases de données bibliographiques Contenu : Bases de données factuelles sur la toxicologie, les produits chimiques dangereux, la santé environnementale et les domaines associés, la toxicologie génétique. Diffuseur: National Library of Medecine, U.S Accès : libre sur Internet : SCIENCE DIRECT Contenu : Cette base propose aussi bien des livres électroniques (227 ebooks) que des bouquets de revues en ligne (2000 revues dont trois titres de l'éditeur Cell : Cell Biophysical Journal, Cell et Cancer Cell ( )). Elle donne accès aux archives et aux numéros courants. Domaine : Médical et sciences biomédicales Langue d interrogation : multilingue Diffuseur : Elsevier WILEY - Current Protocols Contenu : Guides et instruments d'initiation à la recherche. 3 titres accessibles : Current Protocols in Cell Biology Current Protocols in Immunology Current Protocols in Molecular Biology Domaine : Sciences, Santé Astuce : Pour choisir le type de document à consulter (revue ou livre électronique), il faut d'abord lancer une recherche sur la plateforme. Vous pourrez sélectionner votre type de document sur la page des résultats. P a g e 4 10
5 -Bases de données Grand public - EUREKA SANTE répertoire des maladies répertoire des médicaments répertoire des produits de parapharmacie lexique médical phytothérapie ( PASSEPORT SANTE.NET ( Site québécois sur les maladies et les médecines douces -Bases de données pour la traduction français-anglais et vice versa - MeSH INSERM ( CISMeF ( Cet outil documentaire contient également une base de données francophone TERMESCIENCES ( -Bases de données Spécialisées- Kiné KINEDOC Bases de données bibliographiques Contenu : Bibliographies d ouvrages, de périodiques, de recommandations professionnelles, de littérature grise (mémoires et thèses, notices techniques, congrès et manifestations professionnelles, textes officiels législatifs et réglementaires). P a g e 5 10
6 Domaine : Masso-kinésithérapie/physiothérapie. Ce site propose des références d articles, de travaux de recherche, de manifestations scientifiques et de textes officiels. exclusivement Diffuseur: réseaukinedoc de professionnels de la documentation et de la masso-kinésithérapie. Le moteur de recherche, l interface d indexation et de consultation ont été réalisés par l Institut national des sciences appliquées (INSA) de Rouen. Accès : libre sur Internet. Nombreux liens vers des textes intégraux : Interface : structuré sans index (fonctionne par mots-clés sur le titre, sous titres, résumés). PEDro Contenu : Base de données factuelles comprenant plus de essais cliniques contrôlés randomisés (ECR), revues systématiques et recommandations de pratique clinique en physiothérapie. Si possible, un lien fournit le texte intégral. Domaine : physio-kinésithérapie, mais des traductions en français sont disponibles. Accès : libre sur Internet : Odontologie DOSS Contenu : Base bibliographique spécialisée en odontostomatologie indexant les références bibliographiques de 250 périodiques, donne accès au texte intégral de 200 périodiques universitaires, 30 ouvrages et 17 revues. Recence également les abstracts des séminaires de l IADR (International association for dental research) /AADR (American association for dental research) Domaine : spécialisée en odontostomatologie (tous domaine : chirurgie,orthopédie, radiologie, esthétique, protèse, pédiatrie, gérontologie ) Diffuseur : EbscoHost Interface : avec thésaurus ACADEMIE NATIONALE DE CHIRURGIE DENTAIRE ( Pharmacie P a g e 6 10
7 ACADEMIE NATIONALE DE PHARMACIE ( Psychiatrie / Psychologie PUBPSYCH Bases de données bibliographiques Contenu : Plus de références bibliographiques produites par 7 bases de données internationales : ERIC, ISOC-Psicología, MEDLINE, DANS, NORART, PASCAL, PSYNDEX. Contient également des tests, des programmes de traitement et des données de la recherche. Domaine : Psychiatrie et psychologie (dont psychologie de l éducation) Langue majoritaire : européenne Langue d interrogation : Quadrilingue (Fr, En, Es, De) Diffuseur : Inist-CNRS, Leibniz Institute for Psychology Information (ZPID), National Library of Medicine (NLM) (entre autres) Accès : libre sur Internet pour les bibliographies (Interface d'interrogation libre et gratuite de la base MEDLINE depuis 1997)/ Payant pour le texte intégral (accès gratuit via votre ENT et sur le campus de l Université) Astuce : Le bouton HFF (Help Finding Full text ) affiche les possibilités d accès au texte intégral d un document. En fonction du lieu où vous vous trouvez, l accès au texte intégral est possible via l option pay-per-view sur le site de l éditeur (payant) ou par l intermédiaire de liens avec des bibliothèques hébergeant la revue ou l ouvrage choisi (gratuit). -Revues en ligne- BIOMED CENTRAL Contenu : 244 revues évaluées par les pairs, publiées en Open Access Domaine : Santé Accès : libre sur Internet : BMJ Sous format papier à Paris 13 Contenu : Revue académique britannique de médecine générale fondée en Les articles sont disponibles depuis le 1er numéro. Domaine : Santé (Médecine générale) LA REVUE DU PRATICIEN P a g e 7 10
8 Sous format papier à Paris 13 Contenu : Revue mensuelle qui propose des articles rédigés par des experts souvent universitaires Domaine : Médecine MÉDECINE, de la médecine factuelle à nos pratiques Contenu : revue de médecine générale fondée sur les principes de la médecine factuelle (Evidence Based Medicine) afin de fournir une information didactique et fiable, centrée sur le patient. Domaine : Médecine générale PÉDAGOGIE MÉDICALE Sous format papier à Paris 13 Contenu : Revue trimestrielle incluant : des articles originaux de pédagogie fondamentale ou appliquée, dans le champ de la médecine et aux autres sciences de la santé. des innovations dans le domaine des nouvelles techniques éducatives et des réalisations pédagogiques exemplaires tant pour la formation médicale initiale que pour la formation médicale continue. Est accessible l'intégralité du contenu, notamment les articles non encore publiés dans l'édition papier mais acceptés par le comité de rédaction et les articles de moins de deux ans. Domaine : Santé SPINGER Contenu : 1250 revues scientifiques, disponibles depuis les 15 dernières années 1450 archives de revues scientifiques plus de 7300 livres électroniques Domaine : toutes disciplines en sciences et sciences humaines, en particulier : médecine, sciences de l'ingénieur, physique, chimie, sciences de la terre, informatique majoritaire Accès : Payant (accès gratuit via votre ENT et sur le campus de l Université) SCIENCE DIRECT Contenu : Cette base propose aussi bien des livres électroniques (227 ebooks) que des bouquets de revues en ligne (2000 revues dont trois titres de l'éditeur Cell : Cell Biophysical Journal, Cell et Cancer Cell ( )). Elle donne accès aux archives et aux numéros courants. Domaine : Médical et sciences biomédicales P a g e 8 10
9 Langue d interrogation : multilingue Diffuseur : Elsevier WILEY Contenu : 1730 revues disponibles en texte intégral depuis les 15 dernières années Domaine : toutes disciplines, en particulier médecine, sciences du vivant, chimie Astuce : Pour choisir le type de document à consulter (revue ou livre électronique), il faut d'abord lancer une recherche sur la plateforme. Vous pourrez sélectionner votre type de document sur la page des résultats. -Bases d images et de vidéos- IMAGES EN SCIENCES DE LA SANTE Contenu : Sélection de tutoriels, images et vidéos en Sciences et Santé Domaine : Sciences et Santé Diffuseur : Université de Montréal Accès : site institutionnel librement accessible sur Internet : -Institutions publiques - MINISTERE DES AFFAIRES SOCIALES ET DE LA SANTE Onglet dossier : La santé de A à Z (ex : plomb) Les grandes agences sanitaires : ABM : Agence de la biomédecine ANSEM : Agence nationale de sécurité sanitaire de l alimentation, de l environnement et du travail ANSM : Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé (répertoire des médicaments) HAS : Haute autorité de santé (fondée en 2004) évaluer l'intérêt médical des médicaments et leur remboursement par l'assurance maladie Améliorer la qualité des soins et de l information médicale P a g e 9 10
10 développer la collaboration entre les acteurs du système de santé en France et à l étranger InVS : Institut de veille sanitaire (surveillance, vigilance et alerte en santé publique) ACADEMIE NATIONALE DE LA SANTE ( Rapports et prises de position Dossiers thématiques : cannabis, éoliennes, cancer, alcoolisme, -Autres institutions nationales - INSTITUT PASTEUR (recherche, santé, demain) INSTITUT CURIE (lutte contre le cancer) ( CONSEIL NATIONAL DE L ORDRE DES MEDECINS ( -Institutions de la zone européennes - SITE DE L UE [réglementation] ( ATLAS STATISTIQUE REGIONALE DE L UE ( OMS -Institutions internationales - [statistiques, rapports voir aussi l Insee] P a g e 10 10
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