ELECTROPHYSIOLOGIE PRINCIPES ET TECHNIQUES



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Transcription:

ELECTROPHYSIOLOGIE PRINCIPES ET TECHNIQUES TRANSPORTS MEMBRANAIRES ELECTROGENIQUE Fabrice DUPRAT Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire Université de Nice Sophia-Antipolis Décembre 2002 1

Objectifs de ce cours Comprendre le fonctionnement des canaux ioniques. Comprendre les données présentées dans un article scientifique. Lecture des représentations classiques (courbes courant/potentiel, inactivation,...) Signification des paramètres mesurés en électrophysiologie (conductance, seuil d activation, probabilité d ouverture, ctes de temps...) 2

Déroulement du cours Durée du cours 5 h sur les principes et techniques de l'electrophysiologie. 3 h sur les bases de neurosciences et la plasticité synaptique. Evaluation (examen final du C4): Etude d un ou plusieurs cas concrets (articles de littérature scientifique en Anglais). Questions de cours sur les principales notions. Prévoir un dictionnaire Anglais/Français et une calculatrice. 3

Plan du cours LES PHENOMENES ELECTRIQUES EN BIOLOGIE ETUDE DES PHENOMENES ELECTRIQUES D ORIGINE BIOLOGIQUE TRANSPORTS MEMBRANAIRES LES CANAUX IONIQUES NOTIONS DE BIOPHYSIQUE TECHNIQUES D ETUDE: LE POTENTIEL IMPOSE GATING DES CANAUX IONIQUES LE PATCH CLAMP TECHNIQUE D ETUDE: LE COURANT IMPOSE CANAUX ENDOGENES ET EXOGENES POINTS DE REPERES 4

LES PHENOMENES ELECTRIQUES EN BIOLOGIE 5

Les phénomènes électriques en biologie L'anguille électrique La torpille 6

ETUDE DES PHENOMENES ELECTRIQUES D ORIGINE BIOLOGIQUE 7

Animal entier: EEG E.E.G.: Electroencephalogramme Electrodes externes Electrodes implantées 8

Animal entier: ECG E.C.G.: Electrocardiogramme Electrodes externes 9

Organe entier: coeur Cœur entier Cœur isolé perfusé de souris R 200 ms P Q S T Electrodes Drici et al Circulation 2002 10

Organe entier: cerveau Microélectrodes 11

Tissus: tranche de cerveau Electrodes 12

Tissus: nerf isolé 13

Cellules: Neurones en culture Microélectrode Pipette de patch clamp 14

Protéine canal KcsA Zhou et al. 15

TRANSPORTS MEMBRANAIRES 16

Assymétrie de la membrane plasmique Bicouche lipidique Protéines membranaires Interne Externe Concentrations ioniques dans les cellules de vertébrés Na 14 140 K 160 3 Ca 10-4 1 Cl - 14 150 17

Protéines de la membrane plasmique x75000 18

Notions générales sur les transports membranaires A C C Gradient de [A] Transports passifs Diffusion facilitée ATP Qté transportée Gradient de [C] Transports actifs secondaires Transports actifs avec consommation d ATP Gradient de [ ] 19

A B Symports A B Transports membranaires A C A Antiports A B B Electroneutre Electrogène Electrogène Electroneutre Electroneutre A Uniports C Gradients de A et B Electrogène ATP Electroneutre Gradient de C 20

Synapse électrique, jonctions Gap 21

Synapse électrique, jonctions Gap 30 µm 30 µm 100 µm 22

Conclusion sur les transports membranaires Transports électrogèniques Possibilité de mesures électrophysiologiques Cas des canaux ioniques 23

LES CANAUX IONIQUES 24

Les canaux clonés ou exogènes Structure protéique connue Nombre de segments transmembranaires Homologies de séquence Sites consensus Réalisation d anticorps, d antisens, de sonde d hybridation,... 25

Superfamilles des canaux clonés Canaux Cl - Récepteurs canaux Canaux Na P P P P Canaux Ca 2 P P P P sous unités α, β, δ, γ 26

Sous unités auxiliaires: Kvβ2 Van Huizen et al. 1999, FEBS Lett. 457, 107-111. 27

Structure et assemblage des Kv Kv 1 2 3 5 4 x4= P 6 28

Structure et assemblage des Kir P 29

Structure et assemblage d autres canaux 30

Structure du récepteur-canal nicotinique 31

Passage des ions K Miller et al. 32

Filtre de sélectivité Zhou et al2001 33

Deshydratation des ions K Zhou et al 2001 34

Passage des ions K Zhou et al 2001 35

Classification des canaux ioniques Nature du/des principaux ions transportés Na Cl - Ca K Face externe Face interne 25.10-9 m 36

Régulation des canaux ioniques Régulation par un agoniste (ROC) AMPA GABA Face externe Régulation par le potentiel (VOC) --- Face interne Régulation par un ligand intracellulaire (SMOC) Ca AMPc 37

Biophysique des canaux ioniques Propriétés biophysiques: Canaux à rectification entrante Canaux à rectification sortante Canaux voltage dépendant Canaux avec une inactivation. 38

Pharmacologie des canaux ioniques Classification selon la sensibilité Exemple: Canaux apamine sensible (K Ca ) 39

Pathophysiologie des canaux ioniques Canaux potassiques Diabète, Ataxie épisodique de type 1 Syndrome du long QT Syndrome de Bartter Canaux sodiques La paramyotonie congénitale, la paralysie périodique familiale hyperkaliémique Syndrome du long QT Syndrome de Liddle Pseudohypoaldostéronisme de type 1 Canaux calciques La paralysie périodique familiale hypokaliémique L'hyperthermie maligne Syndrome de Lambert-Eaton, sclérose latérale amyotrophique, diabète de type I Canaux chlore La mucoviscidose La myotonie congénitale et la myopathie pseudohypertrophique de Becker. 40

Pharmacologie clinique des canaux ioniques Canaux sodiques Anti-arythmiques de la classe IA (quinidine, lidocaïne, encaïnide) Anti-arythmiques de la classe IB (lidocaïne) Anti-arythmiques de la classe IC (encaïnide) Pyréthrinoïdes (bioperméthrine) Diurétiques (amiloride). Canaux potassiques Anti-arythmiques de la classe III (amiodarone) Sulphonylurées (glibenclamide) Ouvreurs K ATP (nicorandil). Canaux calciques Anti-arythmiques de la classe IV (vérapamil). 41

NOTIONS DE BIOPHYSIQUE 42

Analogie électricité /eau / ion PHENOMENE ELECTRIQUE ANALOGIE AVEC L EAU PHENOMENE IONIQUE Courant électrique: i ou I Qté de charges (e - ) circulant par unité de temps. Porteurs de charges: électrons Produit par un générateur de courant: Sens positif = celui des charges positives Courant d un fleuve Débit d eau entre 2 points Pompe péristaltique Courant ionique: i ou I Quantité de charges (et non d ions) par unité de temps = flux global entre 2 points Porteurs de charges: ions Ampères: 10-6 A=1µA, 10-9 A=1nA, 10-12 A=1pA Résistance: R Obstacle au passage des électrons Barrage sur un fleuve Les vannes sont ± ouvertes Résistance d un canal: Résistance R ou r en ohm: Ω (10 9 Ω =1MΩ) Conductance : g= 1/R Conductance d un canal: r = 1/g Conductance g ou γ en siemens: 10-12 S = 1 ps = capacité à laisser passer des ions 43

Analogie électricité /eau / ion PHENOMENE ELECTRIQUE ANALOGIE AVEC L EAU PHENOMENE IONIQUE Potentiel électrique: E (U, V) Quantité de charges en un point Quantité d eau en un point Différence de potentiel ou tension: U, V (E) Différence en quantité de charges entre 2 points Produit par un générateur de tension Différence niveau d eau Différence de potentiel Différence de quantité de charges Volts: mv: 10-3 V 44

Analogie électricité /eau / ion PHENOMENE ELECTRIQUE ANALOGIE AVEC L EAU PHENOMENE IONIQUE Capacité: C composé d un isolant entouré de 2 surfaces de conducteur = capacité d accumuler des charges - - - - - - - - - - 2 réservoirs Capacité membranaire =la membrane plasmique est un isolant entouré de 2 conducteurs Capacité spécifique (µf/cm 2 ) - Loi d ohm: U = RI Si U = constante: si R alors I Si I=constante: si R alors U Barrage: si le courant alors la différence de niveau 45

Potentiel d équilibre - Loi de Nernst Potentiels d inversion dans les cellules de vertébrés Interne Externe E ion = 58 log [ion] ext / [ion] int Na 14 140 58 mv K 160 3-100 mv Ca 10-4 1 232 mv Cl - 14 150 60 mv Voltmètre 0 mv K Cl - Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - Gradient de [K ] Gradient de [Na ] Gradient de charges Inclusion d un canal K Inclusion d un canal Na Gradient de [K ] Gradient de [Na ] Gradient de charges Gradient de [K ] Gradient de [Na ] Gradient de charges - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Na Cl - K K Cl - Na Cl - - Na K Cl - Cl - K Cl - Na Cl - K Cl - Cl - Na K Cl - Na Cl - K Cl- Na Cl - K Cl - Na Cl - -90 mv Polarisée 60 mv Dépolarisée 46

Enoncé de la loi de Nernst E ion = RT zf [ ion] ln [ ion ext ] int Potentiel d équilibre d un ion E ion R: constante des gaz parfaits: 8,315 J.K -1.mole -1 (1 J = 1 V.C) T: température absolue en K ( K = C 273,16) z: valence de l ion (1 pour Na et K, 2 pour Ca 2 et -1 pour Cl - ) F: constante de Faraday: 9,648.10 4 C.mole -1 Valeurs de RT/F selon la température: Ln = 2,303 Log Si z = 1 et à 20 C on a: E ion = [ ion] 58log [ ion ext ] int Température ( C) RT/F (mv) 0 23,54 5 23,97 10 24,40 15 24,83 20 25,26 25 25,69 30 26,12 35 26,55 37 26,73 47

TECHNIQUES D ETUDE LE POTENTIEL IMPOSE 48

Aspect technique du potentiel imposé Double microélectrodes E I // E = I = 1/g Rg1 x / gi Imposé Calculé Mesuré E imposé E mb I injecté 49

Le modèle de l ovocyte de xénope Ovocytes de xénopes Injection d ARN ou d ADN Etude des canaux clonés ou exogènes Double microélectrodes 50

Préparation des ovocytes de xénopes 51

Ovocytes: Injection d ARN ou d ADN 52

Le poste d enregistrement en double microélectrodes 53

Préparation des pipettes 54

Etude des courants natifs ou endogènes Preparation d un tissu 55

[ K ] Potentiel imposé par l expérimentateur [ ] Externe Gradient de charges imposé [K ] Gradient de [K ] Interne Flux net de K sortant [ - ] Flux net de K sortant Flux net de K nul Flux net de K entrant = état d équilibre (Nernst) 56

Potentiel imposé E = R x I Imposé Calculé Mesuré Courant (µa, na, pa) 5 Potentiel imposé E K =-70 mv Externe -100-50 Potentiel (mv) 0 50-5 Interne Gradient [K ] 57

Représentation schématique d un canal Externe Externe ---- Externe g Na = 0 g K = 0 g Na = 0 g K > 0 g Na > 0 g K = 0 I Na = 0 I K = 0 I Na = 0 I K > 0 I Na > 0 I K = 0 Interne V m = 0 mv Interne ---- V m = E K = - 84 mv Interne V m = E Na = 58 mv 58

Loi de Goldman Hodgkin Katz [K ] int = [K ] ext [K ] int > [K ] ext Flux sortant E K Total Flux sortant E K Total Flux entrant Flux entrant 59

Courants totaux Technique d étude: le voltage clamp 60

Technique d étude: le voltage clamp Courants totaux 61

GATING DES CANAUX IONIQUES 62

Structure et gating des canaux clonés Biggin & Sansom 2001 63

Canaux voltage-dépendant [K ] int > [K ] ext [K ] int = [K ] ext E K E K Seuil d activation Seuil d activation 64

Interactions senseur au voltage et pore (Kcsa) Fermé (rétracté) Ouvert (extrudé) Activation Inactivation Inactivé (rétracté) Inactivé (extrudé) Gandhi et al. 2000 65

Gating des canaux ioniques Rectification entrante Diffusion facilitée V Blocage des courants sortants V I I 66

Rectification entrante Milieu externe K Membrane K Spermine Mg 2 Milieu interne 67

Canaux temps-dépendant Activation Inactivation 68

Patch Clamp Enregistrements de courants unitaires 69

LE PATCH CLAMP 70

Configurations du Patch Clamp 71

Poste de Patch clamp 72

Courant unitaire 73

Courant unitaire 74

Modèle F 1 k 2 k -2 F 2 k 1 k -1 O k i I 75

Histogramme d amplitude 76

Sommation des courants unitaires 77

Courant total i unitaire = γ ion. (V m -E ion ) I total = i unitaire. N. P o = g ion. (V m -E ion ) 78

Cas d une membrane comportant plusieurs conductances Schéma électrique Courants du nœud de Ranvier 79

TECHNIQUE D ETUDE LE COURANT IMPOSE 80

Current clamp Potentiel d action en current-clamp 81

CANAUX ENDOGENES ET EXOGENES 82

Etude des canaux natifs ou endogènes Dissociation mécanique et enzymatique Patch clamp 83

Cultures de cellules Etuce des canaux clonés ou exogènes Transfection, infection, injection Patch clamp 84

POINTS DE REPERES 85

Canaux ioniques des végétaux: Arabidopsis thaliana 86

Historique 1 2600 ans avant JC Les Egyptiens étudient les phénomènes liés à l anguille électrique. 1790 GALVANI: Existence de phénomènes électriques au niveau de la matière vivante. 1827: Loi d OHM. 1848 DU BOIS REYMOND: Propriétés électrogènique de la peau de grenouille. 1868 BERNSTEIN: L intérieur et l extérieur des cellules sont composés d électrolytes de différentes concentrations séparées par une membrane perméable à ces électrolytes. 1888 NERNST: Loi de Nernst donnant le potentiel d équilibre d un ion. 1902 BERNSTEIN: Théorie de la membrane: - le potentiel de repos est du à la membrane, - notion de membrane électrique et de membrane biologique, - les concentrations ioniques sont différentes de part et d autres de la membrane - au repos la membrane n est perméable qu au potassium. 87

Historique 2 1910 EINTHOVEN: Naissance de l ECG (électrocardiogramme) 1920-1945: Naissance de l électrophysiologie, due aux améliorations techniques après la II nde guerre mondiale. 1935: Microélectrode intracellulaire. 1937 HODGKIN: Des courants locaux peuvent dépolariser la membrane. 1948 ROSENBERG-USSING: Différence entre les transports actifs et les transports passifs, au niveau des épithéliums. 1949 LING-GERARD: Première microélectrode de verre. 1952 HODGKIN-HUXLEY: Technique du voltage clamp 1952 CORABOEUF: Naissance de l électrophysiologie en France. 1958 USSING: Etude des différentes perméabilités (K et Na ) sur les épithéliums, chambre de Ussing. 1981 NEHER - SAKMANN: Technique de patch clamp. 2000 NEHER - SAKMANN : Prix Nobel de Médecine. 88