Intérêt de l Analyse Moléculaire dans les Tumeurs des Tissus Mous Dr Sophie Le Guellec Service d Anatomie et Cytologie Pathologiques, Institut Claudius Regaud le-guellec.sophie@claudiusregaud.fr
Intérêt de l analyse moléculaire dans les Tumeurs des Tissus Mous 1- Types d anomalies rencontrées 2- Intérêts Diagnostic Pronostic Thérapeutique
Anomalies moléculaires dans Tumeurs des Tissus Mous Anomalies simple, spécifique (50%) Anomalies complexe, non spécifique (50%) Translocation réciproque (15%) Mutation activatrice (20%) Mutation inactivatrice (<1%) Amplification simple (15%)
Anomalies moléculaires dans Tumeurs des Tissus Mous Anomalies simple, spécifique (50%) Anomalies complexe, non spécifique (50%) Translocation réciproque (15%) Mutation activatrice (20%) Mutation inactivatrice (<1%) Amplification simple (15%)
Sarcomes avec translocation réciproque (15%) TUMEURS Chromosomes impliqués Gènes impliqués Prévalence Méthodes Implication TRANSLOCATION Ewing/PNET t(11;22)(q24;q12) t(21;22)(q22;q12) t(7;22)(p22;q12) t(17;22)(q12;q12) t(2;22)(q33;q12) t(1;22)(p36;q12) t(4;22)(q31;q12) t(16;21)(p11;q22) EWSR1-FLI1 EWSR1-ERG EWSR1-ETV1 EWSR1-ETV4 EWSR1-FEV EWSR1-ZSG EWSR1-SMARCA5 FUS-ERG 85-95% 5-10% <1% Rare Rare Rare Rare Rare FISH (EWS) RT-PCR Diagnostic Traitement Synovialosarcome t(x;18)(p11;q11) t(x;18)(p11;q11) t(x;18)(p11;q13) t(x;20)(p11;q13) SS18-SSX1 SS18-SSX2 SS18-SSx4 SS18L1-SSX1 65% 35% Rare Rare FISH (SS18) RT-PCR Diagnostic Traitement Liposarcome myxoïde t(12;16)(q13;p11) t(12;22)(q13;q12) FUS-DDIT3 EWSR1-DDIT3 95% rare FISH (DDIT3) RT-PCR Diagnostic Traitement Rhabdomyosarcome alvéolaire t(2;13)(q35;q14) t(1;13)(p36;q14) t(2;x)(p35;q13) t(2;2)(p35;q23) PAX3-FOXO1A PAX7-FOXO1A PAX3-MLLT7 PAX3-NCOA1 60-80% 10-20% Rare Rare FISH (FOXO1A) RT-PCR Diagnostic Pronostic Traitement Sarcome à cellules claires t(12;22)(q13;q12) EWSR1-ATF1 >90% FISH (EWS) Diagnostic Tumeur desmoplastique à petites cellules rondes Chondrosarcome myxoïde extrasquelettique t(11;22)(p13;q12) t(21;22)(q22;q12) t(9;22)(q22;q12) t(9;17)(q22;q21) WT1-EWSR1 ERG-EWSR1 EWSR1-NR4A3 TAF2N-NR4A3 >90% rare 75% 25% FISH (EWS) RT-PCR FISH (EWS) RT-PCR Diagnostic Diagnostic Histiocytome fibreux angiomatoide t(2;22)(q34;q12) EWSR1-CREB1 90% FISH (EWS) Diagnostic Dermatofibrosarcome de Darier-Ferrand t(17;22)(q22;q13) COL1A1-PDGFB >90% FISH (PDGFB) Diagnostic Traitement Tumeur myofibroblastique inflammatoire t(2;19)(q23;q13) TPM4-ALK >50% FISH (ALK) RT-PCR Diagnostic Sarcome du stroma endométrial de bas grade t(7;17)(p15;q21) JAZF1-SUZ12 60% FISH (JAZF1) Diagnostic
Synovialosarcome «Sondes encadrantes» Cellule normale (Absence de cassure) Cellule avec réarrangement de SS18
Anomalies moléculaires dans Tumeurs des Tissus Mous Anomalies simple, spécifique (50%) Anomalies complexe, non spécifique (50%) Translocation réciproque (15%) Mutation activatrice (20%) Mutation inactivatrice (<1%) Amplification simple (15%)
Sarcomes avec mutations activatrices (20%) TUMEURS MUTATION ACTIVATRICE Tumeur Stromale intestinale (GIST) Tumeur Desmoide Chromosomes impliqués 4q12 4q12 1p36 3p21 5q21 Gènes impliqués KIT PDGFRA SDH CTNNB1 APC Prévalen ce 80% 10% rare >85% <5% Méthodes Implication Séquençage Diagnostic Pronostic Traitement Séquençage Diagnostic GIST Tumeur desmoide Mutation du gène KIT ou PDGFRA Mutation du gène CTNNB1 (β-caténine)
Anomalies moléculaires dans tumeurs des tissus mous Anomalies simple, spécifique (50%) Anomalies complexe, non spécifique (50%) Translocation réciproque (15%) Mutation activatrice (20%) Mutation inactivatrice (<1%) Amplification simple (15%)
Sarcomes avec mutations inactivatrices (<1%) Tumeur rhabdoide Inactivation bi-allélique du gène INI-1
Anomalies moléculaires dans tumeurs des tissus mous Anomalies simple, spécifique (50%) Anomalies complexe, non spécifique (50%) Translocation réciproque (15%) Mutation activatrice (20%) Mutation inactivatrice (<1%) Amplification simple (15%)
Sarcomes avec amplification simple (15%) TUMEURS Chromosomes impliqués Gènes impliqués Prévalence Méthodes Implication AMPLIFICATION Liposarcome 12q13-15 MDM2 95-100% FISH Diagnostic différencié/dédifférencié 12q15 CDK4 90-95% Angiosarcome sur tissus irradiés 8q24 MYC >50% FISH Diagnostic
Sarcomes avec amplification simple (15%) Liposarcome bien différencié /dédifférencié +++ Ostéosarcome parostéal Sarcome intimal Amplification du gène MDM2
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts???? Diagnostic? Pronostic? Thérapeutique?
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic
Diagnostic = Informations cliniques (++) + Morphologie + Immunohistochimie + Biologie Moléculaire
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic Bénin / malin : LPS bien différencié/ Lipome remanié, HCF/ DFSP, Myxome/ MXFS/ LPS myxoide,
Clinique: H, 22 ans, Tumeur cutanée de 3 cm, de la paroi thoracique antérieure Morphologie: tumeur cutanée à cellules fusiformes monomorphes Immunohistochimie: CD34 hétérogène
Biologie moléculaire Cellule avec fusion PDGFB - COL1A1 PDGFB - COL1A1 PDGFB COL1A1 Dermatofibrosarcome de Darier-Ferrand
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic Bénin / malin : LPS bien différencié/ lipome remanié, HCF/ DFSP, myxome/ MXFS/ LPS myxoide, Sarcomes à cellules rondes de l enfant: rhabdo, PNET/Ewing, SS,
Clinique: H, 16 ans, Tumeur de 6 cm, paroi thoracique Morphologie: tumeur à cellules rondes monomorphes, maligne Immunohistochimie: Pankératine (AE1/AE3 -) EMA - CD99 +/- PS100 focale Desmine - CD45 -
Biologie moléculaire Cellule avec réarrangement de SS18 Synovialosarcome (peu différencié à cellules rondes)
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic Bénin / malin : LPS bien différencié/ lipome remanié, HCF/ DFSP, myxome/ MXFS/ LPS myxoide,, Sarcomes à cellules rondes de l enfant: rhabdo, PNET/Ewing, SS, LPS dédiff sans composante bien différencié et/ou hors du répropéritoine
Clinique: Md M, 59 ans, masse 7 cm, cuisse Morphologie: tumeur à cellules fusiformes et pléomorphe Immunohistochimie: Pankératine - PS100 - AML + Desmine + Caldesmone + MDM2 +
Clinique: Md M, 59 ans, masse 7 cm, cuisse Morphologie: tumeur à cellules fusiformes et pléomorphe Immunohistochimie: Pankératine - PS100 - AML + Desmine + Caldesmone + MDM2 + Biologie moléculaire Liposarcome dédifférencié (avec composante hétérologue de type LMS)
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic Bénin / malin : LPS bien différencié/ lipome remanié, HCF/ DFSP, myxome/ MXFS/ LPS myxoide,, Sarcomes à cellules rondes de l enfant: rhabdo, PNET/Ewing, SS, LPS dédiff sans composante bien différencié et/ou hors du répropéritoine GIST c-kit et DOG1 négatif en IHC
Clinique: F, 59 ans, Tumeur de 6 cm, paroi gastrique Morphologie: tumeur à cellules épithélioides Immunohistochimie: AML + CD34 - CD117 (C-Kit) - / DOG-1 +/- Biologie moléculaire GIST
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Diagnostic Bénin / malin : LPS bien différencié/ lipome remanié, HCF/ DFSP, myxome/ MXFS/ LPS myxoide,, Sarcomes à cellules rondes de l enfant: rhabdo, PNET/Ewing, SS, LPS dédiff sans composante bien différencié et/ou hors du répropéritoine GIST c-kit et DOG1 négatif en IHC Formes inhabituelles de sarcome avec translocation
Clinique: H, 80 ans, Tumeur de 6 cm, para-vertébrale, profonde Morphologie: tumeur à cellules rondes monomorphes, maligne Immunohistochimie: Pankératine (AE1/AE3) focale Chromogranine +/- CD45 - PS100 +/- CD99 +
Biologie moléculaire RT-PCR: présence d un transcrit de fusion EWS-Fli1 Tumeur de la famille Ewing
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Pronostic
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Pronostic Rhabdomyosarcome alvéolaire : PAX7>PAX3
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Pronostic Rhabdomyosarcome alvéolaire : PAX7>PAX3 GIST : exon 11 KIT, exon 18 PDGFRA
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Thérapeutique Histotype-dépendant Preuve moléculaire indispensable Sarcomes de l enfant: PNET/Ewing, rhabdo alvéolaire, SS, tumeur desmoplastique, fibrosarcome infantile Sarcome de l adulte : GIST mutation: facteur prédictif réponse ITK
X 2 Bonne réponse Absence de réponse
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Thérapeutique Histotype-dépendant Preuve moléculaire indispensable Sarcomes de l enfant: ewing, rhabdo alvéolaire, SS, tumeur desmoplastique, fibrosarcome infantile Sarcome de l adulte : GIST mutation: facteur prédictif réponse ITK LPS myxoide/ cellules rondes trabectidine (yondelis )
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Thérapeutique Histotype-dépendant Preuve moléculaire indispensable Sarcomes de l enfant: ewing, rhabdo alvéolaire, SS, tumeur desmoplastique, fibrosarcome infantile Sarcome de l adulte : GIST mutation: facteur prédictif réponse ITK LPS myxoide/ cellules rondes trabectidine (yondelis ) DFSP/ fibrosarcome sur DFSP ITK
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Thérapeutique Histotype-dépendant Preuve moléculaire indispensable Sarcomes de l enfant: ewing, rhabdo alvéolaire, SS, tumeur desmoplastique, fibrosarcome infantile Sarcome de l adulte : GIST mutation: facteur prédictif réponse ITK LPS myxoide/ cellules rondes trabectidine (yondelis ) DFSP/ fibrosarcome sur DFSP ITK LPS dédiff risque métastatique /sarcome indiff
Sarcome à génomique «simple» sarcome génomique complexe Pour le diagnostic Pour le pronostic Emergence grading moléculaire Pour la thérapeutique Recherche systématique Fixation formol tamponné Congelation sytématique suspicion clinique sarcome Proscrire liquide de Bouin Oncomip.fr: http://www.oncomip.org/ Site Groupe Sarcome Français : http://www.gsf-geto.org/
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mou RREPS: objectifs RREPS: objectifs Assurer une deuxième lecture systématique de tout nouveau cas Biologie moléculaire systématique pour toute suspiçion d anomalie
Analyse moléculaire des tumeurs des tissus mous Intérêts Pronostic Rhabdomyosarcome alvéolaire : PAX7>PAX3 GIST : exon 11 KIT, exon 18 PDGFRA Facteur pronostic Grade histologique Grading moléculaire??