LES DIFFÉRENTS USAGES DES INDEX

LES DIFFÉRENTS USAGES DES INDEX Les index servent d abord à comparer la valeur génétique des animaux, donc à les classer pour choisir les meilleurs en tant que reproducteurs. Mais ils peuvent avoir des usages secondaires plus larges : calcul du progrès génétique passé, prévision d évolution génétique, analyse de la part de la génétique dans les différences de production observées dans le temps ou dans l espace. LE CHOIX DES REPRODUCTEURS : SÉLECTION DES MEILLEURS ANIMAUX Les schémas de sélection se basent sur les index pour le choix des Pères et Mères à Taureaux destinés à procréer la prochaine génération de taureaux d IA, ou pour le choix des taureaux de service à l issue du Contrôle de Descendance. Le choix des vaches en vue du renouvellement d un troupeau procède de la même démarche de tri des meilleurs animaux sur les valeurs d index, avec une pression de sélection nettement plus faible que pour les 3 autres voies. Le progrès génétique réalisé sur les 4 voies de la reproduction : Pères à Taureaux, Mères à Taureaux, pères à génisses (taureaux de service), mères à génisses (fiche 13) repose donc sur l utilisation des index. LE PLAN D ACCOUPLEMENT : ASSOCIATION DES INDEX DES VACHES ET DES INDEX DES TAUREAUX Les index sont utilisés dans les élevages pour l établissement du plan d accouplement. Au préalable, le Bilan Génétique de Troupeau permet d analyser les points forts et les points faibles en matière de génétique, et de définir ainsi les objectifs de sélection du troupeau: par exemple, INEL + amélioration mamelle, ou ISU, qui combine l essentiel des index ayant une importance économique (fiche 11). On peut alors déterminer le Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 1

Catégorie groupe de taureaux correspondant à cet objectif. On réalise ensuite le classement des femelles selon leur index propre pour les vaches, selon l index ascendance pour les génisses, sans distinguer ces 2 catégories. On peut mettre ensuite en correspondance les groupes de femelles et les groupes de taureaux dans l ordre suivant : de femelles Catégorie de taureaux Mères-supports de testage : taureaux de testage vaches d une même promotion (en général, vache en L1), non triées Moins bonnes vaches, dont on ne taureaux de races bouchères à vêlages souhaite pas garder la descendance faciles (croisement industriel) femelle (si pas de risque de vêlage difficile) Meilleures vaches ou génisses meilleurs taureaux sur le même objectif sur l objectif de sélection du troupeau Autres vaches et génisses autres taureaux correspondant à l objectif L accouplement individuel de chaque vache peut enfin se faire en tenant compte de ses particularités et de son pedigree, et en lui associant un taureau ne présentant pas de défauts sur les mêmes caractères qu elle. On recommande de vérifier globalement sur le plan ainsi conçu que le bilan génétique prévisionnel des accouplements répond aux orientations définies pour le troupeau. Raisonné globalement en début de campagne, le plan d accouplement permet d utiliser de façon optimale les disponibilités de semences (testage, taureaux «réservés testage» dont les doses sont limitées, éventuellement achats extérieurs). LES MOYENNES D INDEX POUR ANALYSER LE PASSÉ Les index sont calculés pour les animaux actifs, mais aussi pour les animaux disparus. Il est donc possible d analyser l évolution du niveau génétique sur plusieurs années à partir des moyennes d index par promotion d animaux, taureaux ou vaches. Le Bilan d Indexation (fiche 15) regroupe l ensemble des éléments statistiques relatifs aux index des mâles et des femelles sur une dizaine d années. Les courbes du progrès génétique ainsi obtenues (fiche 13) permettent de constater a posteriori l amélioration du niveau génétique en quantité de lait pour les 3 grandes races laitières, la progression génétique du TP depuis le début des années 90 (races Holstein et Normande), et la baisse du niveau génétique TB amorcée dans les 3 races depuis 1995-96. Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 2

LES INDEX FACE AUX PERFORMANCES BRUTES POUR APPRÉHENDER LA PART DE LA GÉNÉTIQUE ET CELLE DU MILIEU La confrontation de l évolution génétique dans le temps, et celle des performances sur la même période, pour les mêmes catégories d animaux permet d évaluer la responsabilité de la génétique et celle des effets dus au milieu dans les changements observés de la production. Figures 1-2 - 3 Evolution de la production, du niveau génétique et de l effet troupeau de 88 à 98 - taux butyreux ( en écart à 1988, index 98/3) Par exemple, pour les 3 grandes races, le Contrôle Laitier a enregistré une forte hausse du taux butyreux (TB), de l ordre de 2 à 3 entre 1988 et 1997. L analyse des figures 1 à 3 montre sur la même période une augmentation de l effet troupeau moyen annuel qui représente l effet année et les modifications importantes dans la conduite de l alimentation des vaches. Ceci indique que depuis 1990 les pratiques sont de plus en plus favorables à l expression du TB. Dans le même temps, le niveau génétique des troupeaux contrôlés, après avoir atteint un maximum vers 94-95, a amorcé une baisse sensible. Cette baisse reste encore masquée en 1997 par des conditions très favorables à la production de TB, mais si elle perdure comme le montrent les prévisions pour 2003 (figures 7 à 9), elles devrait bientôt amener la stabilisation puis la baisse du TB contrôle. Figures 4-5 - 6 Evolution de la production, du niveau génétique et de l effet troupeau de 88 à 98 - lait ( en écart à 1988, index 98/3) Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 3

Si l évolution phénotypique de la quantité de lait (Contrôle Laitier) observée sur les figures 4 à 6 reste positive pour les 3 grandes races, elle croît moins vite depuis les années 1990 que sur la période précédente. Elle reste plus rapide en Holstein qu en Normande et Montbéliarde, et on constate que le progrès génétique annuel ne s est pas ralenti : + 110 kg/an en Holstein, + 60 kg en Normande, + 70 kg en Montbéliarde. L adaptation des élevages à la situation de quota, et la recherche de pratique plus économiques ont conduit à un arrêt de l intensification ((baisse du chargement et de l apport de concentrés). L évolution de l effet troupeau lait montre d ailleurs que depuis 1990, les conditions de production (alimentation notamment) se sont stabilisées et n évoluent plus en faveur de la quantité de lait. DES MOYENNES D INDEX POUR PRÉVOIR LE PROGRÈS GÉNÉTIQUE En donnant les tendances du progrès génétique sur les années passées, et en sachant que les animaux actifs aujourd hui, dont on connaît la valeur génétique moyenne, seront les parents des futures générations, on peut aussi approcher les évolutions génétiques possibles à l avenir. Le Bilan Génétique de l IA (tableaux 1-2 et 3), qui est une photographie du niveau génétique des taureaux d insémination utilisés sur une campagne, est un élément complémentaire pour estimer le progrès futur. Bilan génétique de l IA 1997 - base 97 tableau 1 Race Montbéliarde nb INEL TP TB Lait Mamelle Morpho- Comptages Longévité IAP logie cellulaires Index moyen des IAP 476 285 32 0,1-0,3 763 111 114-0,2 0,6 Evolution moyenne annuelle sur 10 ans (1987-1997) + 3,9 + 0,02-0,04 + 98 + 0,9 + 1,4-0,01 + 0,06 tableau 2 Race Normande nb INEL TP TB Lait Mamelle Format Comptages Longévité IAP cellulaires Index moyen des IAP 496 302 34 +0,4-0,8 776 0,6 0,9 0,2 0,8 Evolution moyenne annuelle sur 10 ans (1987-1997) +4,7 + 0,12 +0,03 + 86 + 0,03 + 0,07 + 0,01 + 0,10 Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 4

tableau 3 Race Holstein nb INEL TP TB Lait Mamelle Morpho- Comptages Longévité IAP logie cellulaires Index moyen des IAP 2 539 814 39 0,8-0,1 789 0,8 1,1 0,0 0,5 Evolution moyenne annuelle sur 10 ans (1987-1997) + 6,0 + 0,07-0,16 + 144 + 0,08 + 0,12-0,01 + 0,07 Source : Bilan Génétique de l IA, CR n 2689, Institut de l Elevage Des statistiques telles que le Bilan Génétique des inséminations (index moyen annuel de l ensemble des IA premières réalisées dans une race), ou des éléments issus du bilan national d indexation (index moyen annuel des troupeaux d une même race ou des vaches de même âge, effet troupeau annuel) donnent une fidèle image des choix génétiques réalisés au cours des années. Pour les caractères de production où les femelles de la base de sélection sont indexées, une synthèse de ces informations permet d établir une prévision d évolution génétique. Celle-ci peut toutefois être infléchie lors des événements d importance tels que des modifications dans la règle des quotas ou des changements dans les pratiques d élevage induisant une conservation des femelles sensiblement différente. LA COMBINAISON DES INDEX DES VACHES ET DES TAUREAUX POUR PRÉVOIR L ÉVOLUTION FUTURE DU NIVEAU GÉNÉTIQUE Figures 7-8 - 9 Prévision d évolution du niveau génétique TP et TB pour les vaches en 3 e lactation ( en écart à 1988, index 98/3) A partir du Bilan génétique de l IAP (index des pères) et de l index moyen annuel des troupeaux de vaches contrôlées (index des mères), il est possible de prévoir l index ascendance moyen des vaches qui seront en production dans les 6 années à venir. Ainsi, lorsqu on analyse la promotion des vaches en 3 e lactation, on note que la baisse du niveau génétique TB amorcée depuis les années 95-97 dans les 3 grandes races évoluera de Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 5

façon différente. Elle sera accentuée en race Holstein, stabilisée en race Normande, et légèrement redressée après l an 2000 en race Montbéliarde. Le niveau génétique TP, sur la même période, devrait poursuivre son progrès en races Normande et Holstein, et se stabiliser après une légère baisse en race Montbéliarde. L évolution du niveau génétique lait des 3 grandes races se poursuivra selon le rythme observé depuis déjà une dizaine d années (100 kg/an en Holstein, 60 kg/an en Normande et Montbéliarde). Toutes les évolutions génétiques et phénotypiques de 1987 à 1996 de même que les prévisions d évolution génétique jusqu en 2002, sont disponibles auprès de l Institut de l Elevage. (CR n 2642). Janvier 1999 La sélection et les index chez les bovins laitiers et les caprins Page 6