Le Maldi tof pour les orthopédistes?

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Transcription:

Le Maldi tof pour les orthopédistes? Didier Tandé Laboratoire de Bactériologie CHU Brest DT/CRIOGO BREST 2013 1

D aucun ont le parlement DT/CRIOGO BREST 2013 2

D autres le château de la Duchesse Anne DT/CRIOGO BREST 2013 3

Nous nous avons le Maldi-Tof DT/CRIOGO BREST 2013 4

Une nouvelle technologie doit répondre aux besoins du clinicien qui sont l identification bactérienne pour le diagnostic, la recherche des mécanismes de résistance pour le traitement, le typage pour l épidémiologie, la virulence pour le diagnostic aussi. Elle doit aussi répondre aux besoins de fonctionnement du laboratoire : rapidité de résultat, débit de tests, coûts, et organisation du travail. Jean-Pierre Marcel DT/CRIOGO BREST 2013 5

Que voudraient nos amis cliniciens? À TO : Prélèvement Identification Sensibilités DT/CRIOGO BREST 2013 6

Le principe : espèce ionique : matrice Échantillon / Matrice 1) 2) cible 1. Désorption 2. Ionisation : sous l impulsion du rayon laser, une partie des molécules de l échantillon est ionisée, puis ces molécules sont accélérées sous haut Laser voltage vers l analyseur. MH + + A M + AH + «tube de vol» 3. Séparation temps de vol Détecteur DT/CRIOGO BREST 2013 7

En vrai Dépôt de l échantillon Matrice HCCA DT/CRIOGO BREST 2013 8

sur le MALDI-TOF DT/CRIOGO BREST 2013 9

Résultats DT/CRIOGO BREST 2013 10

En Orthopédie on est pas si pressé : alors c est quoi l intérêt? Rapidité de l identification quand même! Plus vite dans le tempo Moins d antibiotiques inutiles = moins de résistances Précision dans l identification Différenciations fines des espèces = ne pas tout mélanger Quasi exhaustivité des identifications : 4613 (+ 900) souches pour 2180 (+ 110) espèces Ne pas rater une cible Traitements longs et lourds Raison de plus pour ne pas se tromper dans les cibles DT/CRIOGO BREST 2013 11

Une autre façon de travailler Gain de qualité de travail : Moins d hésitation à identifier Plus d identifications demandées Vérifications faciles Moins d échecs d identification : 87 % de succès dans notre expérience Influence sur les prises de décision lors de la discussion avec le biologiste Un intérêt clinique évident (à exploiter encore ) Significativement moins de ré-isolements gain de temps HORS IDENTIFICATION Moins recours à la biologie moléculaire pour les bactéries difficiles DT/CRIOGO BREST 2013 12

Une autre façon de travailler Prélèvements d orthopédie : Prise en compte de prélèvements multiples : 5 Prédominance des staphylocoques à coagulase négative Nombreux morphotypes sur les nombreuses boites de pétri ensemencées Nécessité de comparer les souches Pour affirmer l identité des souches Pour différencier contaminants et pathogènes Le MALDI-TOF procure un confort et une sécurité vis-à-vis de ces problèmes DT/CRIOGO BREST 2013 13

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Répartition des bactéries dans les IP monomicrobiennes Ana 8% BGN 10% PA EB Streptocoques Entérocoques 14% NH BH SA 40% SCN 8% SE 17% Pascale Bémer, Toulouse, 20/09/2013 17 DT/CRIOGO BREST 2013 17

Les résultats de Brest Méti R Staphylococcus haemolyticus 100% Streptococcus pyogenes Staphylococcus pasteuri Streptococcus dysgalactiae dysgalactiae Staphylococcus pettenkoferi Streptococcus dysgalactiae Staphylococcus aureus 16% Streptococcus agalactiae Staphylococcus capitis 40% Streptococcus anginosus Staphylococcus c est hominis autre chose que SCN Streptococcus constellatus Staphylococcus lugdunensis Streptococcus gordonii Staphylococcus saccharolyticus Streptococcus mitis Staphylococcus saprophyticus Streptococcus sanguis Staphylococcus simulans Staphylococcus warneri Streptococcus oralis Staphylococcus xylosus Streptococcus pneumoniae Staphylococcus caprae Streptococcus alpha Staphylococcus epidermidis 57% DT/CRIOGO BREST 2013 18

Les chirurgiens se mettent au latin Finegoldia magna Peptostreptococcus anaerobius Peptostreptococcus micros Peptoniphilus harei Propionibacterium acnes Clostridium sp. Bacteroides thetaiotaomicron Anaerococcus hydrogenalis Anaerococcus murdochii Actinomyces veronii Actinomyces neuii Actinomyces odontolyticus Tous les ana ne se valent pas! Vis-à-vis des antibiotiques : Lévofloxacine Lincomycine Métronidazole DT/CRIOGO BREST 2013 19

Peut être pas perçus comme très utiles par les chirurgiens pourtant Détection des facteurs de virulence : leucocidine Panton Valentine Non mais Détection des SARM : Non mais Etablissement des liens de clônalité : Oui mais Identification directe à partir des tissus : Non mais Détection des résistances ß-lactamases à spectre étendu Carbapénèmases DT/CRIOGO BREST 2013 20

Entérobactéries et BLSE Céfotaxime : 0,5 mg/ml Incubation avec et sans ac.clav : 20 minutes Brest DT/CRIOGO : travail BREST personnel 2013 21

Souche BLSE et CTX DT/CRIOGO BREST 2013 22

Faudrait pas oublier Un bon chirurgien : Bons prélèvements Un bon laboratoire : Techniques de cultures adaptées Un bon infectiologue : Une bonne gestion de l ensemble des choix thérapeutiques DT/CRIOGO BREST 2013 23

Enfin ce que le maldi ne peut encore faire DT/CRIOGO BREST 2013 24