BIOLOGIE CLINIQUE ACTUALITES ET PERSPECTIVES D AVENIR

Transcription

1 BIOLOGIE CLINIQUE ACTUALITES ET PERSPECTIVES D AVENIR Ph. Biol. Jean Darimont Pharmalouvain mars 2011

2 BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique

3 La Biologie Clinique est impliquée dans > 70% du diagnostic médical et du suivi médical.

4 BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique

5 BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE BIOMARQUEURS : probnp Adam12 PlGF

6

7

8 BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay)

9 Un ELISA en sandwich. (1) La plaque est recouverte avec un anticorps de capture; (2) l'échantillon est ajouté, et tout antigène présent se lie à l'anticorps de capture; (3) l'anticorps de détection est ajouté, et se lie à l'antigène; (4) L'anticorps secondaire lié à l'enzyme est ajouté, et se lie à l'anticorps de détection; (5) Le substrat est ajouté et est converti par l'enzyme en une forme détectable (colorée ou fluorescente).

10 BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE PCR (Polymerase chain reaction) Amplification cyclique d un fragment d ADN ou ARN Mesure de la quantité d acide nucléique produit par fluorescence

11

12 BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE PCR Neisseria gonorrheae Chlamydia sp Herpes virus

13 BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE Spectrométrie de masse MALDI-TOF Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time of Flight

14 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Recherche et mise en évidence de l agent pathogène au site d infection. Prise en charge thérapeutique par une antibiothérapie probabiliste adaptée ultérieurement sur base des résultats microbiologiques.

15 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Traitement précoce et adapté à la sensibilité du germe en cause = Diminution de la morbidité et de la mortalité

16 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Tests d orientation : Coloration de Gram, Tests d agglutination Mise en culture : Gélose au sang, Mac Conkey Incubation : 37 C, 42 C Air ambiant, CO2, Anaérobiose 18h, 24h, 48h. 3 semaines

17 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Examen et Identification secondaire Antibiogramme adapté

18

19 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Mesure des masses moléculaires des composants bactériens (protéines, peptides, oligonucléotides, oligosaccharides, ) ionisés par le laser permettant l obtention de spectres comparés à des spectres de référence.

20

21

22 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Bactéries MRSA Bacillus anthracis Levures, champignons Colonies Hémocultures ****************

23 BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Pas de purification préalable de l échantillon Nature des solvants, de la matrice Epaisseur et séchage du dépôt

24 FAST AND EASY MICROORGANISM IDENTIFICATION Data Acquisition Benchtop instrument Automated system Unattended Operation MALDI Biotyper Reference Library Ready-to-use library Real-Time analysis Sample Preparation Optimized quality Robust 5 min protocol MALDI Biotyper Data Analysis Automated data processing Signal identification Pattern matching

25 MALDI Biotyper: MALDI-TOF MS Microorganism Identification? Selection of colony Acquisition of MALDI-TOF profile spectrum Identification Unknown Microrganism Preparation onto MALDI target plate Data interpretation 1 sample in < 10 minutes, 96 samples in < 1.5 hours

26 BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique

27 BIOLOGIE CLINIQUE ORGANISATION 1980s.2010s

28 BIOLOGIE CLINIQUE ORGANISATION Phase pré-analytique Phase analytique Phase post-analytique

29 Prélèvement BIOLOGIE CLINIQUE PHASE PRE-ANALYTIQUE Saisie ou Encodage de la demande d analyses Contrôle de qualité du prélèvement Etiquettage (code-barres) Tri et Centrifugation Débouchage et Aliquotage Distribution

30 BIOLOGIE CLINIQUE PHASE ANALYTIQUE Numération + formule leucocytaire Glycémie Toxoplasmose IgG..

31 BIOLOGIE CLINIQUE PHASE POSTANALYTIQUE Validation technique Validation biologique Transmission des résultats Interprétation

32 ORGANISATION 1980S Chimie clinique (Enzymologie, Microdosages, ) Hématologie Microbiologie + Annexes : RIA, Toxicologie, Endocrinologie

33

34

35 ORGANISATION 2010S CORE-LAB

36 CORE-LAB Plateau technique commun aux différentes disciplines de la biologie clinique où l on consolide tous les moyens d analyse en termes d automation et intègre les différentes étapes d analyses au niveau d une même zone, la mieux robotisée possible.

37 MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR ( CONFIGURATION DE LA CITADELLE) Coagulation auto. CHR Citadelle Liège Belgique STAR 1 STAR 2 MPA Modular Pre Analytics IPB PSS ACU DSP AQN BCL RSF Entrée des échantillons Table tri éch. non centrifugés centrifugeuses déboucheuse Aliquoteuse Etiquetteuse Reboucheuse FSS FSS OBM 1 2 Tables tri IML séro toxico RIA IMM SNI... sortie racks sortie erreurs Poste pilotage MPA UCL PSM TSM Modulars Tampon ligne de transport Tampon Tampon table torunante Modular <EEEE> Hormono séro hép Torch Modular <PPPE> Chimie prot. sp. Médicaments urine Poste pilotage Modular Tampon Modular <PPE> Chimie prot. sp. Drogues urine

38 Consultance-Analyse FLUX DES ÉCHANTILONS Flux d échantillons Routine Réception Déballage Ettiquettage sachet demande Ettiquettes BC Ettiquettage tubes Centrif. Pré-analytqiue Ettiquettes postes travail Assez tubes? OUI NON Aliquottage TRI Demande Transport secretariat Encodage prlvt labo Encodage / intégration Analytique Chargement Chargement Chargement Chargement Chargement Aliquotage Aliquotage CA 7000 CD ELX 1 ELX 2 BN AU 600 RIA RIA Auto Ac Séro man BEP Post- Analytique Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N

39 Consultance-Analyse tubes à centrifuger ( Max 160 tubes / 30') :00-7:30 07:30-8:00 08:00-8:30 08:30-9:00 09:00-9:30 09:30-10:00 10:00-10:30 10:30-11:00 11:00-11:30 11:30-12:00 12:00-12:30 12:30-13:00 13:00-13:30 13:30-14:00 14:00-14:30 14:30-15:00 15:00-15:30 15:30-16:00 16:00-16:30 16:30-17:00 17:00-17:30 17:30-18:00 18:30-19:00 19:00-19:30 19:30-20:00 18:00-18:30 20:00-20:30 20:30-21:00 21:00-21:30 21:30-22:00 22:00-22:30 Vert 50 serum 43 serum 42 serum 41 serum 40 gly 30 citrate 20

40

41

42 Module Sample Buffer core unit Ions Chimie: c 701 Chimie : c 502 Immuno: e 602 Haut volume 3-15 millions tests par an

43 MODULE PREANALYTIQUE Tri Centrifugation Débouchage Aliquotage Transfert (vers analyseurs) = AUTOMATIQUES

44 Input sorter Output sorte

45 MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR ( CONFIGURATION DE LA CITADELLE) Coagulation auto. CHR Citadelle Liège Belgique STAR 1 STAR 2 MPA Modular Pre Analytics IPB PSS ACU DSP AQN BCL RSF Entrée des échantillons Table tri éch. non centrifugés centrifugeuses déboucheuse Aliquoteuse Etiquetteuse Reboucheuse FSS FSS OBM 1 2 Tables tri IML séro toxico RIA IMM SNI... sortie racks sortie erreurs Poste pilotage MPA UCL PSM TSM Modulars Tampon ligne de transport Tampon Tampon table torunante Modular <EEEE> Hormono séro hép Torch Modular <PPPE> Chimie prot. sp. Médicaments urine Poste pilotage Modular Tampon Modular <PPE> Chimie prot. sp. Drogues urine

46 TOTAL LAB AUTOMATION ( TLA) 1 ou 2 MPA STANDARD centri 1 ou 2 tables de tri Automate 3 Automate 2 Automate 1 20' TRI tubes / aliquots postes de travail non connectés Archivage Automates Chimie Immuno-analyses Hybride Chimie + I-analyses

47 PRESCRIPTION CONNECTEE Prescription informatisée au «lit du malade» Impression de la demande d analyses Edition des étiquettes code-barres Prélèvement Transfert (télélifts, télétubes )

48 CORE-LAB Biologie moléculaire Microbiologie Cytométrie de flux Immunohématologie (Banque de sang) Toxicologie Spectrométrie de masse RIA

49 BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique

50 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Biomarqueurs Techniques + + Organisation + + +

51 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Biomarqueurs Techniques + + Organisation Espérance de vie + + Progrès de la médecine + +

52 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Couverture Sécurité sociale?? Forfaitarisation (Enveloppes budgétaires) Agrément et Accréditation ISO15189

53 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE COUT How to manage this?

54 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Belgique - Nombre Laboratoires >700 (1980s)..180 (2010s)

55 BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE 3 Mégalaboratoires pour analyses non urgentes Wallonie Flandre Bruxelles + Laboratoires locaux pour analyses urgentes + Laboratoires étrangers

56 MEGALABORATOIRES 24h/24 Accréditation ISO15189 Consultation des résultats (via sites sécurisés) Call-centers intelligents

57 MEGALABORATOIRES INCONVÉNIENTS Erreurs préanalytiques Transport des échantillons (timing ).. Bactériologie? Contact Médecin prescripteur/laboratoire.. Prescription Interprétation? (autres techniques diagnostiques) Dérive vers DTC (Direct To Consumer Testing)

58 MEGALABORATOIRES QUALITE?

59 BIOLOGIE CLINIQUE SPÉCIALITÉ MÉDICALE Sites performants ( Centralisation, Automation, Collaboration externe) Aide à la prescription Aide au diagnostic clinique

60 NOUVEAUX ENJEUX DE LA FONCTION DE BIOLOGISTE CLINICIEN Maitrise de la Technique Maitrise de la Qualité Maitrise du Management Maitrise des coûts Hyperspécialisation? Collaboration avec d autres spécialistes? chimistes, physiciens, bioingénieurs Consultant actif (corps médical, patient)

61 MERCI POUR VOTRE ATTENTION