Virologie. Dr. Florence ABRAVANEL, MCU-PH Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse

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1 Virologie Dr. Florence ABRAVANEL, MCU-PH Laboratoire de Virologie, CHU de Toulouse 06/09/2006

2 Qu est-ce qu un virus? Aspect fonctionnel : entité qui se caractérise par : un seul type d acide nucléique (ADN ou ARN) un parasitisme intracellulaire strict Aspect structural (virion) : entité constituée : d un génome (ADN ou ARN) d une capside de nature protéique parfois d une enveloppe

3 Virus en microscopie électronique Adenovirus (virus nus) Virus de la rougeole

4 Virus en microscopie électronique Virus HIV Capside Enveloppe

5 Nature des virus Particules inertes en solution aqueuse Pas de multiplication virale dans l environnement Passe à travers les filtres de 0,3 microns

6 Attachement Une multiplication Pénétration intra-cellulaire Décapsidation Synthèse des protéines Réplication Assemblage Libération par bourgeonnement Libération par lyse cellulaire

7 Résistance dans l environnement Classiquement les virus enveloppés sont peu résistants dans le milieu extérieur: inactivation rapide dans le milieu extérieur (ex: HIV, Grippe ) Virus nus plus résistants transmission indirecte par aliments souillées (ex: HAV, Poliovirus ) Conséquence pour le transport des prélèvements à visée diagnostic: faible T

8 Interaction virus - population Réservoirs de virus Transmission Modalités épidémiologiques des infections virales Prévalence et incidence des infections virales

9 Modalités épidémiologiques Epidémies : cas groupés dans le temps Pandémies : épidémies à l échelle mondiale Endémies : circulation permanente du virus dans la population Cas sporadiques : infections isolées

10 Réservoirs Homme individu malade ou asymptomatique excrétant du virus par différentes voies (aérienne, fécale-orale, sexuelle) Animal ex : rage - fièvre jaune Hépatite E

11 Transmission Directe inter-humaine Indirecte eau souillée - coquillages vecteur (moustique, tique) matériel ou produit biologique contaminé

12 HSV, Enterovirus 70 V. rougeole V. rage VZV, V. rougeole,v. Influenza VRS HBV, HCV, HIV HSV, CMV, EBV, Adenovirus HBV Enterovirus, HAV, rotavirus HSV, HBV HPV HIV HSV, HBV, HCV HPV, Rage

13 Physiopathologie des infections Infection aiguë Ex: HAV, grippe Infection latente Ex: Herpes virus CMV, HSV, VZV Infection chronique Ex: HIV, HCV..

14 Utilisation des antiviraux Tous virostatiques réduisent la contagiosité en diminuant l excrétion virale Traitement prophylactique post-exposition Traitement des infections aiguës ou chroniques

15 Attachement Cibles des Pénétration antiviraux Décapsidation Synthèse des protéines Réplication Assemblage Libération par bourgeonnement Libération par lyse cellulaire

16 Gestion du risque viral Dépistage Vaccination Traitement Information des sujets et du personnel Règles universelles d hygiène Circuit à risque viral Isolement dans l espace > temps Locaux et matériels adaptés

17 Prévention #1: méthodes générales Isolement Arrêt du personnel malade Mesures universelles d hygiène Lavage des mains Gants Matériels et utilisation (procédures et modes opératoires) Traçabilité

18 Prévention #2: méthodes spécifiques Diagnostics rapides Vaccinations patients / personnel Contrôles de l immunité Traitement Sérothérapie Antiviraux

19 Principaux désinfectants Virus enveloppés Détergents Alcool 70, Chlorhexidine, ammoniums quaternaires, Ensemble des virus (dont virus nus) Formol / formaldéhyde (P3) Eau de javel (++) Aldéhydes (glutaraldéhyde) (Sanytex )

20 Transmission sanguine Transfusion sanguine et produits sanguin HBV, HCV, HIV, CMV,. Sélection des donneurs + dépistage Ac et génomique Déleucocytation, chauffage, Accident d exposition au sang Mode opératoire, formation, conditions de travail, Hémodialyse

21 Principaux antiseptiques Ensemble des virus (dont virus nus) Dérivés chlorés (Dakin, ) Dérivés Iodés (Bétadine, ) Alcool à 70 +/-

22 Vaccins anti-viraux Inactivés Complets inactivés: HAV, rage, encéphalite japonaise, encéphalite à tiques Recombinants: HBV Sous-Unitaires : Influenza Vivants atténués Rougeole-Oreillons-Rubéole VZV Fièvre Jaune Séroprophylaxie : HBV, rage,

23 Diagnostic virologique Recherche des anticorps dirigés contre un virus (sérologie) - Technique de dépistage de l infection Recherche directe du virus: - Technique de confirmation - Prélèvement adéquat au niveau du site de multiplication du virus - Culture virale ou amplification du génome virale (PCR)

24 ATNC ou Prions Caractères : - maladies transmissibles - reproduites par inoculation cérébrale - incubation silencieuse et très longue - dégénérescence SNC - fatale (spongiose) - absence de réactions inflammatoires et immunitaires - absence de structure évocatrice d un microorganisme dans le SNC - résistance inhabituelle aux nucléases et radiations ionisantes - résistance partielle aux protéases

25 Définition - identification de la PrP par S. Prusiner (1982) - démonstration de l implication de son gène dans la susceptibilité aux ATNC Un prion est une entité infectieuse protéique dont l unique support de pathogénicité est lié à une conformation pathologique d une protéine du soi, la PrPc.

26 Physipathologie Entrée macrophages voie sanguine / lymphatique clairance organes lymphoïdes terminaisons nerveuses système nerveux périphérique système nerveux central

27 Physipathologie et diagnostic - Accumulation de protéines anormales PrPsc dans le SNC - Concentration de PrPsc corrélées avec la clinique Diagnostic: Recherche de la PrPsc dans le LCR