Sciences, Technologies, Santé. Sciences de la vie et de la santé. Biologie Intégrative des Interactions Plantes Microbes Environnement

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1 Niveau : MASTER année Domaine : Mention : Spécialité : Volume horaire étudiant : 109 h p. 129 h p. pro Sciences, Technologies, Santé Sciences de la vie et de la santé Biologie Intégrative des Interactions Plantes Microbes Environnement 38 h p. 130 h p. pro 12 h p. 43 h p. pro M2 120 ES h 6 mois 141 h cours magistraux travaux dirigés travaux pratiques cours intégrés stage ou projet Formation dispensée en : français anglais Contacts : Responsable de formation Dirk REDECKER Professeur dirk.redecker@u-bourgogne.fr Composante(s) de rattachement : Scolarité secrétariat pédagogique Yamina AIT TAGADIRT Nathalie THOMAS Secretariat.msavan@u-bourgogne.fr UFR SVTE Objectifs de la formation et débouchés : Objectifs : Le M2M BIIPME est une évolution du M2 Pro PPB. L objectif général du parcours du M2M BIIPME est de former à, et par la, des spécialistes ayant une vision intégrative du gène à la communauté et possédant des fortes compétences dans le domaine des interactions abiotiques plante-environnement et biotiques plante-plante et plante-microorganisme. Le savoir-faire acquis dans cette formation couvre de nombreux domaines de en bénéficiant de l investissement des membres de l UMR Agroécologie, ainsi que du Technopôle Agronov actuellement mis en place sous la tutelle du Grand-Dijon. Le parcours professionnel du M2M BIIPME, qui reprend les enseignements déjà existants dans LE M2proPPB permettra aux diplomés d apporter des solutions aux problématiques liées à l utilisation les végétaux comme sources de composés d intérêt pour le domaine de la santé et du bien-être. Débouchés du diplôme (métiers ou poursuite d études) : L objectif général du M2M Biologie Intégrative des Interactions Plante Microbe Environnement est de former de former de futurs cadres/chercheurs du secteur végétal et de l agro-environnement en particulier. Le M2M offre à la fois une formation à, et par la dans le domaine de l agroécologie, de la génétique, de la physiologie et de la jeudi 21 mai

2 biochimie végétales, et une formation professionnelle. La formation est axée (i) sur la préparation d'une thèse de Doctorat qui peut être réalisée dans le cadre de l'ecole Doctorale Environnement - Santé STIC de l'université de Bourgogne et d'autres universités à l'échelle nationale et internationale (ii) une intégration dans le monde professionnel, selon le parcours suivi par l étudiant Compétences acquises à l issue de la formation : Maîtrise des concepts fondamentaux scientifiques et techniques dans les secteurs concernés par les différentes spécialités de M2 : maîtrise des connaissances au niveau moléculaire, cellulaire du fonctionnement du vivant, dans les domaines de la biologie tournés vers la Santé ou le Végétal, et dans les domaines agroalimentaires et de l innovation en biotechnologies. Capacité d'appliquer les connaissances et techniques des différentes sous disciplines à un problème ou une question biologique. Expérimentation. Capacité d analyser et développer des protocoles. Connaissance des règles essentielles en matière d'hygiène et de sécurité par rapport aux risques chimique, biologique et radioactif dans les laboratoires de biologie. Communiquer: rédiger clairement, préparer des supports de communication en utilisant diverses techniques (rapport, diaporama, note de synthèse, poster,...), et les commenter pour un public, averti ou non, en français et en anglais. Spécialisation scientifique et méthodologique permettant de maîtriser les concepts et les outils nécessaires à l'exploitation des développements récents dans les domaines couverts par les différentes spécialités. Compétences acquises à l issue de l année de formation : Selon le parcours choisi par l étudiant le M2M BIIPME offre une formation à et par la ou une formation professionnalisante. En termes de formation à la, les compétences acquises concernent: - l acquisition de la démarche de pour gérer les agrosystèmes et ainsi résoudre les problèmes actuels de la production végétale. Elle consiste à connaître, comprendre et exploiter les régulations biotiques et leurs interactions afin d optimiser la conduite et la gestion des agrosystèmes à différentes échelles - la connaissance des méthodes Connaissances approfondies des techniques récentes d analyse des gènes et du génome, de la dynamique des protéines et de leur structure - la compréhension et à la mise en place d'une réflexion approfondie sur les mécanismes moléculaire sous-jacents à la réponse adaptive des plantes à des facteurs biotiques et abiotiques. Les étudiants sont également sensibilisés à l importance de l acquisition de ces connaissances fondamentales en termes de finalisée. En termes de formation par la, le stage de 6 mois dans un laboratoire de permettra d'acquérir des compétences professionnelles dans le développement d'un projet scientifique : étude bibliographique, expérimentations, rédaction et présentation des résultats de. En termes de préparation à la vie professionnelle, les compétences acquises sont : - connaissance du vocabulaire des différents domaines abordés. Vue d ensemble des processus et d analyse de l état d avancement d un projet. Compétences managériales et de communications permettant de présenter de manière synthétique son projet personnel et professionnel. Capacités de travail en groupe ; - Détections des dangers, de risques et mise en place d une démarche d évaluation du risque en matière d alimentation et ses limites Principe de traçabilité et d autocontrôle Notions de fraudes Structure, fonctionnement, rôles de contrôle des agences nationales de sécurité alimentaire Décodage des informations portées par une étiquette ; Les compétences permettant en autres : de connaître et manipuler les génomes des plantes complexes ; de réaliser l analyse structurale et fonctionnelle des génomes des plantes cultivées ; de mettre en œuvre des stratégies moléculaires permettant la production de molécules d intérêt pour la santé et le bien-être par les végétaux ; de traiter des eaux usées utilisant les microalgues (chenal algal à haut rendement) ; comprendre l intérêt de cibler le(s) compartiment(s) et de connaître les modifications post-traductionnelles des protéines chez les plantes dans le contexte de la production potentielle de protéines recombinantes ; d utiliser de méthodes analytiques modernes (chromatographie en phase gazeuse, spectroscopie UV-VISIR, et techniques modernes de microscopie, pour effectuer analyses de ces molécules. 2

3 En termes de formation par l intégration dans le monde de l entreprise, le stage de 6 mois permettra d'acquérir des compétences professionnelles dans la gestion d un projet de R et D, rédaction d un mémoire de et rendu de ses travaux, travail en équipe. Modalités d accès à l année de formation : sur sélection : Les nombre d'étudiants admis au M2BIIPME est au maximum de 25 par parcours. La qualité du dossier universitaire (mentions, stages) et la motivation des candidats sont pris en compte dans la sélection des étudiants. Peuvent être candidats au M2 BIIPME les titulaires : - d'un Master 1 dans le domaine Biologie-Santé (Sciences de la vie et de la santé, Biologie et produits de santé, Biochimie, Physiologie, Biologie Cellulaire ou autre M1 équivalents), - d'un diplôme d'ingénieur dans les secteurs des biotechnologies, de l'agro-alimentaire ou de l'agro-environnement - d'un diplôme étranger susceptible d'être admis en équivalence d'un des diplômes français ci-dessus. Les étudiants étrangers qui ne disposent pas de l un des diplômes français requis pour l accès à la formation devront impérativement constituer un dossier auprès du service des Relations Internationales (voir calendrier et date limite de dépôt de dossier sur la page web relative à ce service : rubrique «International» et «Venir à l UB à titre individuel»), même s ils sont en cours de formation dans le supérieur en France au moment du dépôt de dossier. Les étudiants de nationalité française disposant des diplômes requis ou équivalents, mais obtenus à l étranger doivent constituer un dossier de validation d acquis (à retirer à la scolarité centrale ou à la scolarité de l UFR SVTE). Leur candidature sera étudiée en fonction de leur projet universitaire et professionnel, de leur maîtrise de la langue française, et de l adéquation de leurs diplômes avec le niveau et la formation qu ils souhaitent intégrer. par validation d acquis ou équivalence de diplôme en formation initiale : s adresser à la scolarité organisatrice de la formation en formation continue : s adresser au service de formation continue de l université ( ) Organisation et descriptif des études : Schéma général des parcours possibles : Semestre 3 parcours Biologie Intégrative des Interactions Plante Microbe Environnement: - UE1 Agroécologie (6 crédits ES) - UE2 Anglais et Déontologie (6 crédits ES) - UE3 Option (une option au choix parmi 2 : Génétique et sélection, Signalisation Cellulaire Végétale) (6 crédits ES) - UE4 Rapport Bibliographique (6 crédits ES) - UE5 Méthodologies (6 crédits ES) Semestre 3 parcours professionnel Plantes Productions Biotechnologies: - UE1 Agroécologie (6 crédits ES) - UE4 Rapport Bibliographique (6 crédits ES) - UE6 Préparation à la vie professionnelle (6 crédits ES) - UE7 Santé et bien-être (6 crédits ES) - UE8 Biotechnologies végétales (6 crédits ES) Semestre 4: - UE9 Stage de 6 mois en laboratoire de (UE 8a) ou en entreprise (UE8b) (30 ES) tableau de répartition des enseignements et des contrôles de connaissances assortis 3

4 SEMESTRE 3 PARCOURS RECHERCHE BIOLOGIE INTEGRATIVE DES INTERAIONS PLANTE MICROBE ENVIRONNEMENT UE1 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Agroécologie 64, 65 65, , écrit TOTAL UE (1) : contrôle continu - : contrôle terminal UE2 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Anglais et déontologie Anglais scientifique Déontologie et aspects juridiques de la , oral TOTAL UE UE3 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Module optionnel au choix UE3a Signalisation Cellulaire Végétale UE3b Génétique et sélection 64, 65, , oral TOTAL UE UE4 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Mémoire bibliographique 64 6, mémoire + oral 3 3 TOTAL UE UE5 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Méthodologies Méthodologies de Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire 64, 65 65, , écrit 3 3 TOTAL UE TOTAL S SEMESTRE 3 PARCOURS PROFESSIONNEL PLANTE PRODUION BIOTECHNOLOGIE 4

5 UE1 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Agroécologie 64, 65 65, , écrit TOTAL UE (1) : contrôle continu - : contrôle terminal UE4 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Mémoire bibliographique 64 6, mémoire + oral 3 3 TOTAL UE UE6 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Préparation à la vie professionnelle 6, écrit TOTAL UE UE7 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Santé et bienêtre 6, écrit TOTAL UE UE8 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Biotechnologies végétales 6, écrit TOTAL UE TOTAL S SEMESTRE 4 UE9 discipline CNU CM TD TP Total ES Type éval (1) Stage UE9a Stage de de 6 mois en laboratoire UE9b Stage en entreprise de 6 mois 64, 66, 68 TOTAL UE 30 (1) : contrôle continu - : contrôle terminal Mémoire et soutenance orale Mémoire et soutenance orale TOTAL S

6 Modalités de contrôle des connaissances : Les connaissances sont évaluées dans le respect de la charte des modalités de contrôle des connaissances adoptée par le conseil d administration de l université du 18 octobre 2004 ; Les examens se déroulent dans le respect de la charte des examens adoptée par le conseil d administration de l université du 2 avril Les règles communes aux études LMD sont précisées sur le site de l Université Sessions d examen UE1, 5, 6, 7 et 8: épreuve écrite en fin du semestre 3. Une session de rattrapage est prévue en juillet. UE2 : l évaluation porte sur la présentation en anglais du rapport bibliographique UE3 : épreuve orale en novembre (en fin de module) UE4 : l évaluation porte sur le contenu du mémoire bibliographique (2 rapporteurs/mémoire) et la réponse aux membres du jury lors de la soutenance orale (voir ci-dessous) UE9 : l évaluation porte sur le contenu du mémoire de stage (2 rapporteurs/mémoire), la présentation orale et la réponse aux membres du jury. Un contrôle de remplacement pourra être organisé par l'équipe pédagogique en cas d'absence justifiée à une épreuve de contrôle continu. Règles de validation et de capitalisation : Principes généraux : COMPENSATION : Une compensation s effectue au niveau de chaque semestre. La note semestrielle est calculée à partir de la moyenne des notes des unités d enseignements du semestre affectées des icients. Le semestre est validé si la moyenne générale des notes des UE pondérées par les icients est supérieure ou égale à 10 sur 20. CAPITALISATION : Chaque unité d enseignement est affectée d une valeur en crédits européens (ES). Une UE est validée et capitalisable, c est-à-dire définitivement acquise lorsque l étudiant a obtenu une moyenne pondérée supérieure ou égale à 10 sur 20 par compensation entre chaque matière de l UE. Chaque UE validée permet à l étudiant d acquérir les crédits européens correspondants. Si les éléments (matières) constitutifs des UE non validées ont une valeur en crédits européen, ils sont également capitalisables lorsque les notes obtenues à ces éléments sont supérieures ou égales à 10 sur 20. 6