Institut Français de de la la Vigne et et du du Vin Vin Goûts moisis terreux (GMT) Origines Microbiologiques Laurence GUERIN Fabienne Guyot Béatrice VINCENT Institut Français de la Vigne et du Vin www.itvfrance.com Moisissures & GMT 1
Identification des microorganismes responsables Échantillonnage à la parcelle : 200 baies prélevées de façon aléatoire par grappillon de 5 baies Lessivage des 200 baies dans une solution de lavage (1 ml / baie) Analyse de la solution de lavage après dilution appropriée sur un milieu de culture spécifique. Photo : B. VINCENT 2006 ITV France Moisissures & GMT 2
Penicillium type 1 Photo : B. VINCENT 2006 ITV France Penicillium type 2 Botrytis Penicillium type 4 Levure Penicillium type 3 Isolement, purification et identification par méthodes classiques et biologie moléculaire de chaque colonie ayant un aspect différent Photo : B. VINCENT 2006 ITV France Moisissures & GMT 3
3 ème étape : Identification & caractérisation des souches L identification est réalisée par les unités IFV de Tours et de Nantes par analyse de l ADN (~1 mois). Après identification les souches sont étudiées en laboratoire pour déterminer leur capacité à produire de la géosmine : Mise en culture des souches pures en milieu de culture CYA Incubation et croissance Dosage de la géosmine dans le milieu de culture Présence de géosmine : souche à production autonome = production primaire Absence de géosmine : Test de production associée à Botrytis = production secondaire Moisissures & GMT 4
Répartition de la flore fongique de différents vignobles Millésime 2004 Val de Loire Botrytis P. minioluteum P. ni P. purpurescens,cladosporium, Alternaria,M ucor...geotricum Penicillium P. expansum P. spinulosum P. janczewski Beaujolais Aspergillus Botrytis P. purpurescens P. ni Cladosporium, Alternaria, M ucor, Geotricum... Penicillium Aspergillus P. purpurogenum P. minioluteum ou restrictum P. spinulosum P. P. thomii brevicompactu P. expansum m Moisissures & GMT 5
Répartition de la flore fongique de différents vignobles Millésime 2004 Botrytis : dont Botrytis producteur de géosmine Bourgogne P. purpurescens P. ni Bordelais P. minioluteum,cladosporium, Alternaria,M ucor...geotricum Aspergillus Penicillium. P brevicompactu m P. verrucosum. P purpurogenum ou restrictum P. spinulosum Botrytis P. expansum Alsace Cladosporium, Alternaria, M ucor, Geotricum... Penicillium P. purpurescens Botrytis P. expansum P. herqueii Cladosporium Alternaria, M ucor Geotricum... Penicillium P. purpurescens Moisissures & GMT 6
Caractérisation des souches productrices. 1 ère culture : souche pure 2 ème culture : mixte Botrytis + Penicillium En milieu de synthèse stérile Photo : B. VINCENT 2006 ITV France Sur baies de raisins désinfectées Photo : B. VINCENT 2006 ITV France Absence de géosmine dans les 2 modalités : souche non productrice Présence de géosmine dans la culture pure : production primaire : P. expansum, P. thomii, P. janczenski, P. aethiopicum, P. citrinum, P. clavigerum, P. commune, P. crustosum Absence de géosmine dans la culture pure & présence de géosmine en culture mixte : production secondaire associée à Botrytis : P. expansum, P. purpurescens... Moisissures & GMT 7
Production de géosmine en milieu CYA à 3, 6 et 9 jours ~ Cultures Pures ~ 140 > 1000 > 8000 476 470 120 100 80 60 40 20 0 Bactéries Filamenteuses Bo trytis Gamay Bo trytis Pino t no ir P. exp ansum To urs P. expansum Villefranche P. janczewski Tours P. ni 3 B P. ni 3S P. purp urescens Beaune P. thomii Tours Moisissures & GMT 8
Étude de l influence du cépage, de l hygrométrie et de la température sur la croissance de certaines moisissures et de leur capacité de production en géosmine Moisissures & GMT 9
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Température ( C) 25 Hygrométrie (%) 90 Durée croissance (jours) 6 800 Moyenne [géosmine](ng/l) 700 600 P.expansum 500 400 300 200 P.minioluteum P.purpurescens P.thomii Suspension témoin spores seules spores+cya spores+agar 100 0 M1536 M2150 M2236 M3214 M1536 M2150 M2236 M3214 M1536 M2150 M2236 M3214 Chenin gamay Raisin table Cépages Souche Moisissures & GMT 12
P.expansum P.purpurescens M2236 M2150 P.thomii M1536 M3214 P.minioluteum Moisissures & GMT 13
Schémas épidémiologiques complexes en fonction des régions : Diversité des microorganismes producteurs en fonction des régions :» diversité des genres,» diversité des espèces pour un même genre,» diversité des souches pour une même espèce,» diversité en fonction des millésimes. Diversité des modes de production de la géosmine :» production secondaire liée à la présence de Botrytis,» production autonome indépendante de la présence d autres espèces fongiques. Moisissures & GMT 14
Merci de votre attention. Moisissures & GMT 15