BIOLOGIE CLINIQUE ACTUALITES ET PERSPECTIVES D AVENIR Ph. Biol. Jean Darimont Pharmalouvain mars 2011
BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique
La Biologie Clinique est impliquée dans > 70% du diagnostic médical et du suivi médical.
BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE BIOMARQUEURS : probnp Adam12 PlGF
BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay)
Un ELISA en sandwich. (1) La plaque est recouverte avec un anticorps de capture; (2) l'échantillon est ajouté, et tout antigène présent se lie à l'anticorps de capture; (3) l'anticorps de détection est ajouté, et se lie à l'antigène; (4) L'anticorps secondaire lié à l'enzyme est ajouté, et se lie à l'anticorps de détection; (5) Le substrat est ajouté et est converti par l'enzyme en une forme détectable (colorée ou fluorescente).
BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE PCR (Polymerase chain reaction) Amplification cyclique d un fragment d ADN ou ARN Mesure de la quantité d acide nucléique produit par fluorescence
BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE PCR Neisseria gonorrheae Chlamydia sp Herpes virus
BIOLOGIE CLINIQUE TECHNIQUE Spectrométrie de masse MALDI-TOF Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time of Flight
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Recherche et mise en évidence de l agent pathogène au site d infection. Prise en charge thérapeutique par une antibiothérapie probabiliste adaptée ultérieurement sur base des résultats microbiologiques.
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Traitement précoce et adapté à la sensibilité du germe en cause = Diminution de la morbidité et de la mortalité
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Tests d orientation : Coloration de Gram, Tests d agglutination Mise en culture : Gélose au sang, Mac Conkey Incubation : 37 C, 42 C Air ambiant, CO2, Anaérobiose 18h, 24h, 48h. 3 semaines
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF INFECTION BACTERIENNE Examen et Identification secondaire Antibiogramme adapté
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Mesure des masses moléculaires des composants bactériens (protéines, peptides, oligonucléotides, oligosaccharides, ) ionisés par le laser permettant l obtention de spectres comparés à des spectres de référence.
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Bactéries MRSA Bacillus anthracis Levures, champignons Colonies Hémocultures ****************
BIOLOGIE CLINIQUE MALDI-TOF Pas de purification préalable de l échantillon Nature des solvants, de la matrice Epaisseur et séchage du dépôt
FAST AND EASY MICROORGANISM IDENTIFICATION Data Acquisition Benchtop instrument Automated system Unattended Operation MALDI Biotyper Reference Library Ready-to-use library Real-Time analysis Sample Preparation Optimized quality Robust 5 min protocol MALDI Biotyper Data Analysis Automated data processing Signal identification Pattern matching
MALDI Biotyper: MALDI-TOF MS Microorganism Identification? Selection of colony Acquisition of MALDI-TOF profile spectrum Identification Unknown Microrganism Preparation onto MALDI target plate Data interpretation 1 sample in < 10 minutes, 96 samples in < 1.5 hours
BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE ORGANISATION 1980s.2010s
BIOLOGIE CLINIQUE ORGANISATION Phase pré-analytique Phase analytique Phase post-analytique
Prélèvement BIOLOGIE CLINIQUE PHASE PRE-ANALYTIQUE Saisie ou Encodage de la demande d analyses Contrôle de qualité du prélèvement Etiquettage (code-barres) Tri et Centrifugation Débouchage et Aliquotage Distribution
BIOLOGIE CLINIQUE PHASE ANALYTIQUE Numération + formule leucocytaire Glycémie Toxoplasmose IgG..
BIOLOGIE CLINIQUE PHASE POSTANALYTIQUE Validation technique Validation biologique Transmission des résultats Interprétation
ORGANISATION 1980S Chimie clinique (Enzymologie, Microdosages, ) Hématologie Microbiologie + Annexes : RIA, Toxicologie, Endocrinologie
ORGANISATION 2010S CORE-LAB
CORE-LAB Plateau technique commun aux différentes disciplines de la biologie clinique où l on consolide tous les moyens d analyse en termes d automation et intègre les différentes étapes d analyses au niveau d une même zone, la mieux robotisée possible.
MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR ( CONFIGURATION DE LA CITADELLE) Coagulation auto. CHR Citadelle Liège Belgique STAR 1 STAR 2 MPA Modular Pre Analytics IPB PSS ACU DSP AQN BCL RSF Entrée des échantillons Table tri éch. non centrifugés centrifugeuses déboucheuse Aliquoteuse Etiquetteuse Reboucheuse FSS FSS OBM 1 2 Tables tri IML séro toxico RIA IMM SNI... sortie racks sortie erreurs Poste pilotage MPA UCL PSM TSM Modulars Tampon ligne de transport Tampon Tampon table torunante Modular <EEEE> Hormono séro hép Torch Modular <PPPE> Chimie prot. sp. Médicaments urine Poste pilotage Modular Tampon Modular <PPE> Chimie prot. sp. Drogues urine
Consultance-Analyse FLUX DES ÉCHANTILONS Flux d échantillons Routine Réception Déballage Ettiquettage sachet demande Ettiquettes BC Ettiquettage tubes Centrif. Pré-analytqiue Ettiquettes postes travail 68 22... Assez tubes? OUI NON Aliquottage TRI Demande Transport secretariat Encodage prlvt labo Encodage / intégration Analytique Chargement Chargement Chargement Chargement Chargement Aliquotage Aliquotage CA 7000 CD ELX 1 ELX 2 BN AU 600 RIA RIA Auto Ac Séro man BEP Post- Analytique Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N Ranger série et N
Consultance-Analyse 180 1303 tubes à centrifuger ( Max 160 tubes / 30') 160 140 120 100 80 60 40 20 0 07:00-7:30 07:30-8:00 08:00-8:30 08:30-9:00 09:00-9:30 09:30-10:00 10:00-10:30 10:30-11:00 11:00-11:30 11:30-12:00 12:00-12:30 12:30-13:00 13:00-13:30 13:30-14:00 14:00-14:30 14:30-15:00 15:00-15:30 15:30-16:00 16:00-16:30 16:30-17:00 17:00-17:30 17:30-18:00 18:30-19:00 19:00-19:30 19:30-20:00 18:00-18:30 20:00-20:30 20:30-21:00 21:00-21:30 21:30-22:00 22:00-22:30 Vert 50 serum 43 serum 42 serum 41 serum 40 gly 30 citrate 20
Module Sample Buffer core unit Ions Chimie: c 701 Chimie : c 502 Immuno: e 602 Haut volume 3-15 millions tests par an
MODULE PREANALYTIQUE Tri Centrifugation Débouchage Aliquotage Transfert (vers analyseurs) = AUTOMATIQUES
Input sorter Output sorte
MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR ( CONFIGURATION DE LA CITADELLE) Coagulation auto. CHR Citadelle Liège Belgique STAR 1 STAR 2 MPA Modular Pre Analytics IPB PSS ACU DSP AQN BCL RSF Entrée des échantillons Table tri éch. non centrifugés centrifugeuses déboucheuse Aliquoteuse Etiquetteuse Reboucheuse FSS FSS OBM 1 2 Tables tri IML séro toxico RIA IMM SNI... sortie racks sortie erreurs Poste pilotage MPA UCL PSM TSM Modulars Tampon ligne de transport Tampon Tampon table torunante Modular <EEEE> Hormono séro hép Torch Modular <PPPE> Chimie prot. sp. Médicaments urine Poste pilotage Modular Tampon Modular <PPE> Chimie prot. sp. Drogues urine
TOTAL LAB AUTOMATION ( TLA) 1 ou 2 MPA STANDARD centri 1 ou 2 tables de tri Automate 3 Automate 2 Automate 1 20' TRI tubes / aliquots postes de travail non connectés Archivage Automates Chimie Immuno-analyses Hybride Chimie + I-analyses
PRESCRIPTION CONNECTEE Prescription informatisée au «lit du malade» Impression de la demande d analyses Edition des étiquettes code-barres Prélèvement Transfert (télélifts, télétubes )
CORE-LAB Biologie moléculaire Microbiologie Cytométrie de flux Immunohématologie (Banque de sang) Toxicologie Spectrométrie de masse RIA
BIOLOGIE CLINIQUE 1. Technique 2. Organisation 3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Biomarqueurs + + + Techniques + + Organisation + + +
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Biomarqueurs + + + Techniques + + Organisation + + + Espérance de vie + + Progrès de la médecine + +
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Couverture Sécurité sociale?? Forfaitarisation (Enveloppes budgétaires) Agrément et Accréditation ISO15189
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE COUT + + + How to manage this?
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE Belgique - Nombre Laboratoires >700 (1980s)..180 (2010s)
BIOLOGIE CLINIQUE ECONOMIQUE 3 Mégalaboratoires pour analyses non urgentes Wallonie Flandre Bruxelles + Laboratoires locaux pour analyses urgentes + Laboratoires étrangers
MEGALABORATOIRES 24h/24 Accréditation ISO15189 Consultation des résultats (via sites sécurisés) Call-centers intelligents
MEGALABORATOIRES INCONVÉNIENTS Erreurs préanalytiques + +.. Transport des échantillons (timing ).. Bactériologie? Contact Médecin prescripteur/laboratoire.. Prescription + +.. Interprétation? (autres techniques diagnostiques) Dérive vers DTC (Direct To Consumer Testing)
MEGALABORATOIRES QUALITE?
BIOLOGIE CLINIQUE SPÉCIALITÉ MÉDICALE Sites performants ( Centralisation, Automation, Collaboration externe) Aide à la prescription Aide au diagnostic clinique
NOUVEAUX ENJEUX DE LA FONCTION DE BIOLOGISTE CLINICIEN Maitrise de la Technique Maitrise de la Qualité Maitrise du Management Maitrise des coûts Hyperspécialisation? Collaboration avec d autres spécialistes? chimistes, physiciens, bioingénieurs Consultant actif (corps médical, patient)
MERCI POUR VOTRE ATTENTION