Connaissances actuelles sur les maladies du bois

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Transcription:

Département fédéral de l'économie, de la formation et de la recherche DEFR Agroscope Connaissances actuelles sur les maladies du bois Olivier Viret, Valérie Hofstetter, Katia Gindro et Pierre-Henri Dubuis Lien de la vigne, Paris, 13 mars 2015

Introduction: esca et maladies du bois Maladie décrite depuis l Antiquité Une des plus mystérieuse maladie de la vigne Prédominant sur vieilles vignes (>25 ans) Présentes dans toutes les régions viticoles du monde Symptômes spectaculaires, par foyers ou sur plantes individuelles Réduit la pérennité de la vigne et augmente les frais de production 2

Symptômes de l esca Apoplexie forme foudroyante Symptômes foliaires forme lente Confusion possible: carence Mg 3

Situation en Suisse romande La Côte: 9.3 C, 954 mm Lavaux: 10 C, 1116 mm Chablais: 8.9 C, 1032 mm Valais: 9.2 C, 598 mm 4

Situation en Suisse romande Evolution depuis 2001, suivi tous les deux ans 100 parcelles en Suisse romande (La Côte, Lavaux, Chablais, Valais) 400 ceps par parcelle (> 28 000 plantes par année d observation) Nombre de ceps avec symptômes foliaires et apoplexie en août sept. 100 Parcelles atteintes (apoplexie et symptômes foliaires (%)) 90 80 70 60 50 40 30 20 2001 2004 2006 2008 2010 2012 2014 10 0 La Côte Lavaux Valais Chablais 5

Situation en Suisse romande 8 Apoplexie (%) 8 Apoplexie + symptômes foliaires (%) 7 7 6 5 4 3 2 1 2001 2004 2006 2008 2010 2012 2014 6 5 4 3 2 1 2001 2004 2006 2008 2010 2012 2014 0 La Côte Lavaux Valais Chablais 0 La Côte Lavaux Valais Chablais 8 Symptômes foliaires (%) 8 Eutypiose(%) 7 7 6 5 4 3 2 1 2001 2004 2006 2008 2010 2012 2014 6 5 4 3 2 1 2001 2004 2006 2008 2010 2012 2014 0 La Côte Lavaux Valais Chablais 0 La Côte Lavaux Valais Chablais 6

Pertes économiques Seuil de remplacement de l ensemble de la parcelle? Parcelle de 30 ans 1094 ceps Chasselas > 40% remplacement en 10 ans (>430 ceps) 7

Symptômes et champignons Esca Black dead arm (BDA) Eutypiose 8

Maladies du bois et champignons Fomitiporia mediterranea Phaeomoniella chlamydospora Phaeoacremonium aleophilum Eutypa lata Phomopsis viticola Botryosphaeria sp. 9

Communauté fongique 1. Plantes saines (n ayant jamais montré de symptômes durant les 8 ans de suivi du vignoble) (N=69) 2. Plantes montrant les symptômes foliaires de l esca pour la première fois l année du prélèvement (N=38). 3. Plants soudés-greffées avec des greffons de la même parcelle (N=73). 4. Plantes atteintes d eutypiose (N=21) Prélèvement non destructif 10

Méthode A Suivi quotidien durant 4 semaines Jour 1 Fragments de bois 15 copeaux provenant de 3 parties différentes du tronc sur milieu gélosé (PDA+auréomycine) Jour 2-28 Croissance des champignons Isolation des champignons en culture pure dès leur apparition 11

Résultats 2893 isolats fongiques identification des champignons par séquençage de marqueurs moléculaires (ITS1, ITS4 ) = 158 espèces de champignons appartenant à 74 genres et 41 familles taxonomiques différentes 12

Espèces attribuées aux maladies du bois sont présentes BDA Esca Esca Esca Esca Esca Eutypiose Excoriose Pied noir Dépérissement jeunes vignes 13

Fréquences des espèces liées aux maladies du bois saines symptômes foliaires de l esca La fréquence est élevée et similaire entre les plantes avec symptômes foliaires et les plantes saines 14

Abondance des espèces associées aux maladies du bois Pas liées aux maladies du bois de la vigne Cadophora sp. Cadophora mellini Cadophora luteo-olivacea Phaomoniella chlamydospora Stereum rugosum Fomitiporia mediterranea Phaeoacremonium sp. Phaeoacremonium mortoniae Phaeoacremonium viticola Phaeoacremonium aleophilum Phomopsis viticola Fusicoccum aesculi Eutypa lata Diplodia seriata saines symptômes foliaires d esca Pas plus de 2% de différence entre plantes symptomatiques et plantes saines 15

Abondance des autres espèces? Classes Ordres Asymptomatic saines symptômes Esca-symptomatic foliaires d esca Asymptomatic saines symptômes Esca-symptomatic foliaires d esca Plantes symptomatiques, saines et atteintes d eutypiose: communauté fongique très similaire 16

Transmission des champignons par le greffage? Pas de traitement à l eau chaude! METHODE 1) Élimination des racines des cires protectrices et de l'écorce. 2) Lavage à l eau. 3) Stérilisation à l eau de Javel 3,5 % pendant 10 min. 4) 15 sections du bois à intervalles réguliers (sécateur stérilisé: alcool/flamme). 6) Transfert en milieu nutritif stérile (PDA+aureomycine). 17

Transmission des champignons par le greffage? saines symtomatiques de l esca plants soudé-greffés Botryosphaeria et Phomopsis sont fréquents dans tous les types de plantes 18

Transmission des champignons par le greffage? saines symptomatiques de l esca plants soudé-greffés Les espèces responsables de l esca et de l eutypiose ne sont que très peu ou pas présentes dans les plants soudé-greffés 19

Transmission des champignons par le greffage? saines symptomatiques de l esca plants soudé-greffés Les champignons associés au déclin des jeunes plants (Cylindrocarpon et Cadophora = Phialophora) sont surtout présents sur les plants soudégreffés 20

Spécificité des espèces Analyses en composantes principales Plantes saines Plants soudé-greffés Symptômes foliaires de l esca La communauté fongique des plants soudé-greffés est différente de celle des plantes adultes saines ou atteintes d esca Hofstetter et al. 2012. Fungal Diversity 54: 51-67. 21

Structure du bois de vigne Autres plantes ligneuses Vigne Vitaceae cambium cambium 22

Recouvrement des plaies de taille Plantes ligneuses Vigne Plaies de taille se recouvrent par l écorce et le cambium Ne recouvre jamais ses plaies de taille 23

Taille de la vigne Conséquences de la taille: Plaies et dessèchement vers l intérieur du bois Source: A. Crespy, manuel pratique de la taille de la vigne, 2006 24

Conclusions Communauté fongique: La stricte association de symptômes spécifiques avec des espèces fongiques est discutable Les communautés fongiques des plantes saines et symptomatiques sont pratiquement identiques mais différentes de celles des plants soudé-greffés Le greffage n est pas une source majeur de contamination La vigne comme les autres plantes ligneuses contient des champignons endophytes dont le comportement peut changer durant la vie de la plante Lutte: la lutte directe contre les maladies du bois est illusoire (pénétration des matières actives dans le bois, complexité de la communauté fongique, lien de causalité incertain ) Taille: la vigne ne recouvre pas ses plaies de taille qui représentent la source principale de contamination et de dépérissement, la taille nécessite une réflexion et un soin particulier pour assurer des flux de sève intacts Physiologie: en Suisse, les vignes physiologiquement équilibrées, de vigueur modérée, dans des climats secs ne sont que très peu touchées 25

Merci de votre attention 26