Responsable de Pôle Dr B. RIGOU poste 97 75 Chef de service Pr R. Césaire poste 24 24 Praticiens hospitaliers Dr F. Najioullah poste 3614 Dr L. Fagour poste 1031 Cadre de santé M J. Neret poste : 35-73 Secrétariat Mme G Bellemare Mme J Palin poste : 24 24 Secteurs techniques Culture virale poste : 32-01 Biologie Moléculaire poste : 24-33 32-00 Sérologie poste : 32-09 Jours et heures de réception des prélèvements Du lundi au vendredi de 8h à 16 h00, Salle de Réception des prélèvements Bâtiment EFS Niveau 1
CULTURES VIRALES Les milieux de transport sont fournis par le laboratoire Transport dans les plus brefs délais (<4h) à 4 C dans une glacière. Au-delà de ce délai et hors heures ouvrables, conserver à +4 C Rotavirus/Adenovirus. Recherche directe des Ag viraux Selles Herpès Virus Simplex 1 et 2 (HSV 1/2). Détection antigène et culture. Lésions cutanéo-muqueuses Pot stérile pour coproculture Sur écouvillon. Mettre dans flacon stérile AVEC milieu de transport viral CMV 7 j 1j IgG anti CMV (contrôle d'immunité) 32-09 S 3j IgM anti CMV + IgG anti CMV (infection aigüe) 32-09 S 3j Détection/quantification du virus CMV (PCR) < S 5j LCR S 5j Biopsie d organe urine Lavage broncho-alvéolaire (LBA) Pot ECBU AVEC milieu de transport DENGUE En période d épidémie délai sérologie : 2j Détection, typage du virus de la dengue (PCR) S 5j S 5j 5j 2 à 3j
LCR 2 à 3j IgG et IgM anti Dengue (sérologie) 32-09 S 5j Détection du Chikungunya (PCR) CHIKUNGUNYA S 2j LCR 2j Liquide articulaire IgG et IgM anti Chikungunya (sérologie) 32-09 s 5j Sérologie EBV EBV 32-09 S 5j GRIPPE (virus influenzae) Grippe A et grippe B: détection par PCR Rhinopharynx, nez Aspirations naso-pharyngées Lavage broncho-alvéolaire (LBA) milieu de transport viral. HEPATITE A Anticorps anti HAV totaux et IgM anti peuvent être réalisées sur le même tube Anticorps anti HAV totaux (statut immunitaire) 1 à 2 j 1 à 2 j 1 à 2 j 32-09 S 1j
IgM anti HAV (diagnostic hépatiteaigüe) 32-09 S 1j HEPATITE B Les 3 analyses de sérologie HBV peuvent être réalisées sur le même tube sec Dépistage : Ag HBs, Ac anti HBc, Ac anti HBs 32-09 S 1j Diagnostic d'hépatite aigüe : Ag HBs, IgM anti HBc 32-09 S 2j Contrôle post-vaccinal Ac anti HBs 32-09 S 1j Détection/quantification de l'adn VHB (PCR) maximum S 10j HEPATITE C Sérologie VHC (dépistage) 32-09 S 2j Sérologie VHC (confirmation) 32-09 S 10j Charge virale ARN VHC (PCR) Génotypage du virus VHC maximum maximum S 10j 24-33 S/D 4 sem.
Herpes simplex virus 1 et 2 Herpès simplex virus 1 et 2 : PCR LCR Biopsie Pot ECBU stérile avec milieu de transport Ponction chambre antérieure Lésions cutanéo-muqueuses milieu de transport viral Nez-gorge-oeil milieu de transport viral HPV Prélèvement endocervical Milieu Labonord (Easyfix) Thinprep HTLV S/D Sérologie HTLV-1/2 32-09 S 2j Test de confirmation HTLV-1 32-09 S 10j Charge provirale HTLV-1 35-64 D LCR 35-64 D Liquide articulaire 35-64 D METAPNEUMOVIRUS HUMAIN (hmpv) Rhinopharynx, nez milieu de transport viral. Aspirations naso-pharyngées
Lavage broncho-alvéolaire (LBA) IgG et IgM anti parvovirus (sérologie) PARVOVIRUS B19 32-09 s 5j Détection du virus VZV (PCR) VARICELLE-ZONA Ponction chambre antérieure LCR Biopsie Lésions cutanéo-muqueuses Sérologie VIH 1-2 Sur écouvillon. Mettre dans flacon stérile AVECmilieu de transport VIH Les 3 analyses de sérologie VIH peuvent être réalisées sur le même tube sec 2j 2j 2j 32-09 S 1j Test de confirmation VIH 32-09 S 5j Antigénémie p24 32-09 S 2j Charge virale ARN VIH1 (PCR) Résistance par génotypage (Protease+RT/Integrase) Doit parvenir moins de 6 heures après prélèvement 24-33 S
Doit parvenir moins de 6 heures après prélèvement. Préciser sur ADN génomique si nécessaire. VIRUS RESPIRATOIRE SYNCITIAL (VRS) 24-33 S/D 7j Détection du VRS par PCR Aspirations nasales Rhinopharynx, nez milieu de transport viral. Lavage broncho-alvéolaire (LBA) ZIKA Détection du virus du Zika (PCR) s foetal s Urine LCR Placenta Liquide articulaire Pot ECBU ANALYSES SOUS TRAITEES Sérologie virale il n est pas nécessaire de prélever un tube par analyse. Prévoir un tube de 5 ml pour 2 analyses Adenovirus 4j 4-7 j Avidité des IgG anti-cmv
4j 4-7 j Coxsackie A, B 4j 4-7 j Echovirus 4j 4-7 j Enterovirus total 4j 4-7 j Hépatite delta 4j 4-7 j Herpès virus 1 et 2 4j 4-7 j Rougeole 4j 4-7 j Varicelle-Zona 4j 4-7 j Virus Influenzae (grippe) 4j 4-7 j Virus des oreillons 4j 4-7 j Virus parainfluenzae type 1, 2, 3 4j 4-7 j
Virus West Nile 4j 15 j (CNR Guyane) BIOLOGIE MOLECULAIRE (PCR) Enterovirus LCR 3j 8j gorge milieu de transport viral Epstein Barr Virus (EBV) LCR 2j 7j Salive maximum 2j 7j Herpès virus 8 10j Biopsie AVEC milieu de transport ADN proviral VIH1 enfant (PCR) maximum 24-33 D 7j 3j 10j Virus BK Urines 10j 10j Virus JC LCR 2j 10j
Parvovirus B19 maximum 5j