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SUJETS D'EXAMENS ~J!'-J'""~J'~~""~~J'""'I-~~ IMAITRIS~ 2ème CVCLE JUIN 2003

UNIVERSITE HENRI POINCARE-NANCY 1 FACULTE DES SCIENCES SUJET D'EXAMEN DIPLOME: MBCP Option Animale Durée du sujet: 2 heures Rédacteur: Professeur Thomton Epreuve de : UE 6 Physiologie et signalisation de la cellule Session de :juin 2003 Date: Horaire: 0 Documents autorisés IR]Documents non autorisés 0 Calculatrices autorisées IR]Calculatrices non autorisées Décrivez les différents types de modulation et communication présents au niveau des synapses (en comparant les neurotransmetteurs de faible poids moléculaireet les peptides neurotransmetteurs).

UNIVERSITE HENRI POINCARE-NANCY 1 FACUL TE DES SCIENCES SUJET D'EXAMEN DIPLOME: MBCP Option Animale Durée du sujet: 2 heures Rédacteur: Professeur Thomton Epreuve de : UE 6 Physiologiedes grandes fonctions Session de :juin 2003 Date: Horaire: 0 Documents autorisés 181Documents non autorisés 0 Calculatrices autorisées 181Calculatrices non autorisées Décrivez le fuseau neuromusculaire et sa fonction. Quels rôles jouent les différentes parties du cerveau impliquées dans le contrôle du mouvement?

UNIVERSITE DE NANCY 1 DIPLOME: cellulaire Epreuve d' Session de Date: Maîtrise de biologie et physiologie Immunologie Juin 2003 Durée du sujet: 2h Nom du rédacteur: A. Ropars Documents non autorisés 1 ) Expliquez le déroulement d'une allergie respiratoire (au sens large du terme) et les différents médicaments permettant de la soigner. Durée conseillée pour traiter la question: 30 mn. 2 ) Expliquez pourquoi la synthèse de cytokines et l'apoptose sont 2 phénomènes essentiels pour une réponse immunitaire efficace et contrôlée. Durée conseillée pour répondre à la question: Ih 30.

~,,r t ;\. MAITRISE DE BIOLOGIE CELLULAIRE ET PHYSIOLOGIE OPTIONS«SCIENCES DE LA CELLULE ET DE L'ANIMAL» (MBCP A) ET «SCIENCESET TECHNOLOGIESDU VÉGÉTAL» (MBCPV) Epreuve de Génétique Moléculaire et Cellulaire Sujet rédigé par Elisabeth WEBER Durée: 2 heures - Sans documents IL N'EST PAS DEMANDE DE RECITER LE COURS MAIS D'UTILISER CERTAINES DONNEES POUR EXPLIQUER LES RESULTATS PRESENTES... IL N'EST PAS NON PLUS NECESSAIRE DE CONNAITRE LE NOM EXACT DES DIFFERENTS GENES ET PROTEINES IMPLIQUES DANS LES PHENOMENES DECRITS MAIS PLUTÔT DE JUSTIFIER LEUR MODE D'ACTION. Chez la levure Saccharomyces cerevisiae, 3 loci sont impliqués dans la détermination du signe conjugal, tous trois sont situés sur le chromosome III : le locus MA T, le locus HMR et le locus HML. Il existe deux formes alléliques possibles pour ces loci: la forme a qui est généralement présente au locus HMR, la forme a généralement présente au locus HML. Au locus MAT, les levures haploïdes (n) ont soit l'allèle a, soit l'allèle a. Pour pouvoir conjuguer, 2 levures n doivent porter des allèles MAT différents. Elles se reconnaissent alors par le biais de peptides spécifiques excrétés dans le milieu et de récepteurs de surface spécifiques. Les levures diploïdes qui possèdent à la fois MAT(a) et MAT(a) ne peuvent conjuguer avec aucun type de levures (phénotype«non mating»). La délétion du locus MAT(a) conduit, chez des levures n, à un phénotype «amating», c'est-à-dire que ces levures deviennent capables de conjuguer avec des levures n portant MAT(a) mais ne conjuguent plus avec des levures n MAT(a). Des levures n ayant subi la délétion de MAT(a) restent «a-mating». La délétion des loci HML et/ou HMR ne modifie pas la conjugaison des levures haploïdes, quel que soit l'allèle présent au locus MAT. Commenter et interprétez ces données. Des séquences d'environ 200 pb chacune, appelées ici AEB, ont été mises en évidence de part et d'autre des loci HMR et HML mais pas du locus MAT. Pour des levures n possédant l'allèle a au locus MAT, la délétion des séquences AEB de part et d'autre de HMR(a) conduit à un phénotype «non-mating». L'insertion de séquences AEB de part et d'autre du locus MAT conduit à un phénotype «a- mating» chez des levures n, quel que soit l'allèle au locus MAT.

t Comment pouvez-vous expliquer ces résultats? L'inactivation de gènes tels que SIR2, SIR3, SIR4, RAP 1 et ABFI dans des cellules haploïdesconduità un phénotype«non mating» alors que la séquencedes locimat, HMR et HML n'est pas modifiée dans ces mutants. Certaines mutations des gènes codantles histonesh4 et H3 donnentégalementun phénotype«nonmating». L'ADN génomique de souches haploïdes MAT(a), sauvages d'une part et mutantes sir d'autre part, a été utilisé pour des expériences d'hybridation ADN/ADN dans les conditions suivantes: digestion de l'adn par une enzyme ayant un seul site de coupure dans l'allèle a et hybridation avec une sonde interne à cet allèle. Les résultats suivants ont été obtenus: - si l'adn génomique a été déprotéinisé avant digestion enzymatique, l'hybridation permet de détecter 4 bandes pour l'adn de la souche sauvage comme pour l'adn des mutants sir. - Si l'adn génomique est extrait dans des conditions qui periï1et de préserver l'association spécifique de protéines à l'adn, 3 bandes majeures d'hybridation sont obtenues pour l'adn de la souche sauvage et 4 bandes majeures sont obtenues pour l'adn des mutants sir. Commentezet interprétez ces résultats. Les souches utilisées en laboratoire sont, pour la plupart, mutées dans le gène HO (génotype ho). Si par transformation, le gène HO fonctionnel est apporté dans des souches haploïdes ho, on observe au bout de quelques générations une majorité de cellules diploïdes. Comment pouvez-vous expliquer ce résultat?,- MATa +- a2 210aa _, a1 '75 aa 1 - n- - X 704 bp Ya 747 bp Z -1 328 bp MATa +-. a2 119aa a1.1 I~ _12~_~a.. X 70~bp Ya 6~2 bp Z -i 328bp La protéine al est un activateur transcriptionnel ; la protéine a2 est un répresseur transcriptionnel La protéine al associée à la protéine a2 forme un répresseur transcriptionnel Isolément, les protéines al et a2 n'ont pas de rôle défini.

,., ~ DaBCP Option Végétale. Biotechnologies JP Jacquot 'J/:1~ h. Pas de documents 1 les de calculette Sui te à de brillantes études à l'uni versi té Henri Poincaré, et titulaire d' illl diplôme de maîtrise BCP Option végétale, vous avez réussi à vous faire engager dans une société CE Biotechnologie dont nous tairons le nom. Votre directeur vous darande èe réaliser le proj et suivant: 1 suppr:im2r le site PvuI du plasmide pet-3d 10 pts 2 déléter le T7 tag présent entre les sites NcoI et B3IrriHI en insérant à la place un nouveau si te PvuI entre les deux si tes NcoI et B3IrriHI 10 pts Vous disposez dans les docurœnts suivants: èe la carte du plasmide et èe sa séquence en nucléotides de la séquence codante du gène arrpicilline avec la position du si te PvuI de la structure de plusieurs sites de restriction uniques. Proposez des stratégies de clonage et décrire les séquences correspondantes. Chacune des questions vaut 10 pts. A'ITENTION : LA SEX;:2UENCENUCLEDI'IDIQUE de PEI'- 3d EST CELLE DU BRIN REVERSE PAR RAPPORT A L'ENCADRE SOUS LA CARTE ID PLASMIDE PS1 Ce n'est pas pour vous embêter j1ai pris les données telles qu'elles sont présentées dans le catalcgue èe la société... PS2 Bon courage

.. SEQUEK::E NtJCL!DTJDJ:QUE le pet- 3d 1 TICICA'IGIT 'IGACAœITA 'l'ca'icgataagctitaa'igc OOI'AGI'ITAT 51 CN::N:JITAAATIGCI'AACGC~ CGroI'A'IGAA A'ICI'AACAAT 101 G:GCTCA'ICG 'ICA'ICCICG3 ~ CI'G3A'IœIG TNXJ::ATNr: 151 crrœrra'ig CCG3I'ACIGC CG3X.'CICIT GCG33ATA'IC GICCATICCG 201 ~ CAGICACI'ATGX:GIGCIGC TAGC.œI'ATA 'IŒ:GTIGA'IG 251 CAATI'ICI'AT œr:::r::x:œar 'l'ci'c:g3.ag:acigiccgacc G:TI'IGIXX3 3 01 ccœccpillc crœrcœit CGCrACI'IG3 AG:::.CJCrA'IC GN::rN:JXJ3A 351 'ICA'IG3CGACCK:N:.CCGIC CIGIOOATAT CCG3ATATAGTICCIœI'IT 401 CAG:::AAAAAAccccrcAAGA. CCCGI'1TAGA~ OOI'TA'IGCTA 451 GIT.ATIœTC ~ ~ CAGCI'ICCIT 'IC'G33:TITG 501 'ITAGCAGX'GG8.'Iœ.GACCCA'ITIGCTGIC CACCAGICAT œragc:ca'rg 551 GTATA'ICICC TICITMAGI' T~T TATI'ICTAGA ~ 601 'TGIœICICC cratagigag 'ICGI'A'ITAAT TJ:DX'G33AT CGAGA'ICICG 651 A'IœICI'ACG ~T CGIG3CCG3C A~ ~ 701 œrrgc'tg3::: OC'CI'ATA'ICG~ CGA'IG:D3AA ~ 751 G::CACI'ICG3 GCI'CA'IGAœ Gcl'lGl'l'lCG GCGIG33I'AT ~ 801 CCCGI'CDXX3aD3ACIGIT ~ 'ICCI'IœA'IG CACCATIœI' 851 'IGC:.'G:L'G3C GI'GCTCAACGOC'CICAACCI'FCr~ 'IGCI'ICCTAA 901 'TGCAG3AGICœATAPGJJA GAGCGICGACCGA'IGC.'CCITGAGAGCCI'IC 951 AN:œ:PGrCA GCI'CCTICCG GIG33C'G:.Œ mea'tgaci'a 'ICGTCGCCGC 1001 ACITA'IGACI' GICI'ICITI'A 'TCA'IGCAACI'CGr~ GJ:G:'CGGCAG 1 051 c:œicig33r CATITICG3C ~ TIC.œIG3AG CGCGACGA'IG 1101 A'I'CGX.'CTGI'cœrIG::.'Cm' A~ TIGCACGCCC 'l'c'g2icaagc 1151 CI'IŒIC'ACr œrccx::gcx:::accaaacgi'it ~ CN:5:ITA'ITA 12 01 'IC'G:::CG3:AT~ ~ ACGICI'I'G:::T <D:GI'I'CG:.'G 12 51 ~ G3A'IG:XX:TI' CCCCA'ITA'IG ATTCI'ICICG ~ 13 01 CA'ICG33A'IG CCCG:GI'IGC ~ ~ GI'AGA'IGACG 13 51 ~ N::NrITCAA G3A~ C'G32TCITAC CJ:>œcrNCr 1401 'l'cga'icaci GACC.œTGATCGTCACG:X.'GATTTA'I'GCCGCCICG3C.GAG 1451 ~ CD:IrI'G3CAT G3ATI'GI'Nr: ca::cgcccra TACCrIGI'CI' 1501 occr.cccax GI'I'G2GI'CGC œ:rœa'ig8a ~ CTCGACCIGA 1551 A~ ~ œr~t 'ICACCACICCAAGAA.TI.G3A 160 1 œcaatc:aat 'ICI'I'G:G3AG AACIGIGAAT ~ ~ 1651 GAACATA'ICCA'I'CG2GICCG CCA'ICICCAG ~ ~ 17 01 ~ 'IGXID:'CIG3 ~ GCA'IGA'ICGI' œrccigicg 1751 TIGAG3AœC ~ G:::ŒmITGC crtacid3it ~ 1801 A'ICACCGATA~ ~ CIGCIGCIGC AAAACGICIG 1851 CGACCIGAGCAN:AN:NlGA A'IG3ICI'ICG GITICCGIGI' TICGI'MAGI' 19 01 ~ ~ cr.ccra::n::.catta'igi'tcc G3A'ICIœAT 1951 CG::J:G:lArr.r:r.'J:œI'G:rrAC CCIGIG3AAC ACCI'ACA'ICT GI'ATTAACGA 2001 ~ TIGACCC'IGA GIGATI'ITIC 'ICIG3ICCCG CCGCA'ICCAT 2 051 N:.CœCN:JIT GrITACCC'TC N::AN:.GITCC IDrAAC.CG0:3 CA'IGI'ICA'IC 2101 KI.'ClGrNCC CGrA'IŒIGA GCA'ICCI'CTC 'ICGITI'CA'IC OOI'A'ICATTA 2151 c:ccc:x:a'igaacjgan:(iccc CC'ITACACG} NXJ::A'ICIDr GNx:AAN:AG 2201 GAAJ:.N.P.œG CCCITAACATm::cc.œ:rrr A~ AGN:::NITAPC 2251 GCI'I'CJ:'mAG AAlCICAACG ~ G3A~ œ.agn::arrcr 2301 GIGAA'ICœI' ~ GCIGA'IGAGC TTTACC.œAG cro:::.acg::x; 2351 C'GI'I'ICG3TGA'IGACG3TGAAACCICIGA~ 'TCXX:G3AGAC 2401 G3ICACAœI' 'IGICIGI'AAG CG3ATG:::.'CG3~ G:X:CGI'C'AG3 2451 ~ G33I'GI'ID3C ~ ~T GN:.CC:PaICA

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~ Sites de restriction. AatII BamHI EgIII FcoRI MscI NcoI PvuI PvuII SalI ScaI Spb1 SspI gacg'ic gga'icc AgA1CT gaattc TggCCA CCATgg CgA'ICg CagCl'g g'icgac AçfrACr gcatgc AATA'IT

~ SE(UEN:E TRAIDITE ID GENE b1a CODANT'RJJR LA RESISTAN:E AL' AMPICILI.JNE 1/1 31/11 A'IGlGrA'ITCMCATTICc:mGICG:CcrrATI'CCCTITTITCD3œATIT'Iœcrrœr ~~ili~~~~~~~~~~~~~~~~~ 61/21 91/31 GITTITœrCK:.CCAClN>.l>ŒCIGGIGA»..GrAA»..GATœI'GPAGATCAGTIGOOI'<rA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 121/41 151/51 CGAGIGG3I'TACA'ICClN>.CIGGATCICNCJ:.œG3l'ANJrA'ICcrrG.ZIBlGrTITm::cœ ~~~~ili~~~~~~~~ili~~~~~~ 181/61 211/71 ClN>.GPA cm TIT CCA A'IG A'IG.Kr. K:r TIT A».. GIT CIG cm 'IGI'G3: CD3 GrA Tm 'ID: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 241/81 271/91 CJ:TI.GITŒCG:CG33CMG.ZIBCMCICG3l'm::m::ATACK:.'mT'ICI'CAGl>KrŒCTIG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 301/101 331/111 GITG.ZIBTAC'ICACCAGICJ:CAGPAAN.;CATcrrl>ŒGATG3:A'IGJ:CAGrANlAGPA'rIA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 361/121 391/131 'IœlGrœrG:C~~A'IGlGrGATNCK:rCD3G:CNCTmcrrCIGJ:CA~~ ~~~~ili~~~~~~~~~~~~~~ili 421/141 451/151 ~~~AN.;G.Z\1}cm~œI'TITTIG~NC~~GATCATGrAK:rm::m ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 481/161 511/171 GATCGI"IG3GPA~G.Z\1}CIGl>KrClN>.G:CATACCANCGK:.G.ZIBc:mGK:.~l>ŒA'IG ~~~~~~~~~~ili~~~~~~~~~ 541/181 571/191 ccrœaœaa'igœaj:cal>œtigcg:a»..cmtmk:rg3:gpacmcrrk:rcmœr ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 601/201 631/211 'ICCœ;CMCM'ITA~GK:.'IG3A'IGG.ZIBCD3GATA»..GITœA~CCAcrrCIGcœ ~~~~~ili~~~~~~~~~~~~~~ 661/221 691/231 'IŒG:CmCCGœrcn::'IG3TITATI'œI'GATA»..'ICI'~G:CG3l'G.ZIBc:m~'ICI' ~~~~~~~~ili~~~~~~~~~~~ 721/241 751/251 cœooi'a'ica'itœaœacigg33ccagatooi'anjrccc'iccc:ma'icgragita'ictac ~~iliili~~~~~~~~~~~~~~ili~ 781/261 811/271 NJ:3NJ:3G33lGrCAGœAPCrA'IGGATGPACGAl>KrNlACAGA'ICœI'G.ZIBATAOOI'm:: ~~~~~~~~~~~~~~~~~ili~~ 841/281 'ICA CIG A'IT AN.; 00' 'IG3 TM ~ leu ile lys bis ~ stc:p

pet-3a-dvectors pet-3a pet-3b pet-3c pet-3d DNA DNA DNA DNA Cal.No. 69418.3 69419-3 69420-3 69421-3 TB026 12/98 The pet-3a-d veetors carry an N-terminal T7oTagœsequence and BamH 1cloning site. These veetors are the precursors to many pet family vectors; the pet-23a-d(+) series corresponds to pet-3a-d but incorporates several additional features. Unique sites are shown on the circle map. Note that the sequence is numbered by the pbr322 convention, so the T7 expression region is reversed on the circular map. The c1oninglexpression region of the coding strand transcribed by T7 RNA polymerase is shown below. pet-3asequencelandmarks T7 promoter T7 transcription start T7 otag coding sequence T7 terminator pbr322 origin bja coding sequence 615-631 614 519.551 404-450 2814 3575-4432 EcoR 1(4638) Apo 1(4638) Gia 1(24) Hind 111(29) The mars for pet-3b, pet-3c and pet-3d are the same as pet-3a (shown) with the following exceptions: pet-3b is a 4639bp plasmid; subtract Ibp from each site beyond BamH 1at 510. pet-3c is a 4638bp plasmid; subtract 2bp from each site beyond BamH 1 at 510. pet-3d is a 4637bp plasmid; the BamH 1site is in the same reading Crame as in pet-3c. An Nco 1site is substituted for the Nde 1site with a net 1bp deletion at position 550 of pet-3c. As a result, Nco 1 cuts pet-3d at 546. For the rest ofthe sites, subtract 3bp from each site beyond position 551 in pet-3a. Nde 1 does not eut pet-3d. pet-3a (4640bp) Sph 1(843) EcoN 1(903) Sall(928) PshA 1(993) Eag 1(1216) Nru 1(1251) ApaB 1(1329) BspM 1(1331) BspLU11 1(2752). Afllll(2752) Sap 1(2636) 6st11071(2523) 6saA 1(2504) Tth111 1(2497) 6sm6 1(2393) Pvu 11(2343) Bsm 1(1636) Ava 1(1702) Msc 1(1723) Bpu10 1(1858) BscG 1(1912) 17 promoter primer #69348-3 ~ Bg/II 17promoter.. Xbal ~ AGA TCTCGA TCCCGCGAAA TT AA T ACGACTCACT ATAGGGAGACCACAACGGTTTCCCTCT AGAAA T AA TTTTGTTT AACTTT AAGAAGGAGA ~ 17oTag pet-30 BamH! Bpu11021 TA TACA T ATGGC TAGCA TGACTGGTGGACAGCAAA TGGGTCGCGGA TCCGGC TGCT AACAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGCTGCTGCCAiiGCTGAGCAA TAAëTï::GëATÀA MetA 1oSerMetThrG 1yG 1yG 1nG 1nMetG 1yArgG 1ySerG 1yCysEnd 17 terminator Drimer #69337-3- AACAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGCTGCTGCCACCGCTGAGCAA T AAC TAGCA T pet -3b. GGTCGGGA TCCGGC TGCT A pet-3d Neo!. GI yargaspproaloa leasnlysai earglysg 1uA log 1uLeuA 1cA loa 1oThrAI cg lug InEnd TGGCT AGC. MetAleSer.. pet-3c.d. GGTCGGA TCCGGCTGC T AACAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGC TGC TGCCACCGCTGAGCAA T AACT AGCA T AA. G 1yAro!1 earoleuleuthrlysprog 1uArqLysLeuSerTroLeuLeuPrcProLeuSerAsnAsnEnd. T ACCA 17 termtnator CCCC TTGGGGCC TCT AAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG pet-3a-dcloning/expression region

t pet.3arestrictionsites TB026 12/98 Enzyme 'Sites Locations E e ' Sites Locations E ' Sites Locations Aatll 1 4567 Cac81 32 Pvul 1 4015 Acel 2 929 2522 Cjel 18 Pvull 1 2343 Aeelll 5 974 2261 2402 2704 3944 CjePI 22 Real 4 766 3472 4480 4585 Aeil 86 Cial 1 24 Rsal 3 165 2558 4125 Mill 1 2752 CviJl 79 Sal! 1 928 Alul 18 CviRI 21 Sapl 1 2636 Alwl 14 Odet 10 458 479 1858 2020 2560 Sau961 16 Alw2 1 8 280 868 1455 1746 2570 3027 3436 3602 4142 4568 Sau3AI 25 3070 4231 4316 Opnl 25 Seal 1 4125 Alw441 3 2566 3066 4312 Oral 2 2445 2860 SerFI 16 AlwNl 1 3168 Osai 2 805 1724 SlaNI 22 ApaBI 1 1329 Eael 6 295 676 808 1216 1721 Stel 5 138 614 3017 3208 3886 Apol 1 4638 4033 SgrAI 1 687 Aval 1 1702 Eagl 1 1216 Sphl 1 843 Aval! 8 1076 1164 1413 1716 1758 Eam11051 3645 Sspl 1 4449 2037 3783 4005 Earl 2 2636 4440 Styl 2 435 1646 BamHI 1 510 Eeil 4 1672 2826 2972 3800 Taql 9 24 339 643 651 929 Bani 9 76 119 690 711 825 Ee0471114 234 773 1054 2006 1404 1545 2852 4296 1043 1482 1566 3593 Eco571 2 3300 4312 Taqll 6 947 2654 3993 4178 4331 BanI! 2 752 766 EeoNI 1 903 4348 Bbsl 3 1007 1870 4623 EeoO1O915 431 801 1716 1758 4621 Tfii 6 1129 1283 1581 1802 2306 Bbvl 24 EeoRI 1 4638 2727 Becl 9 737 830 1267 1356 1663 EeoRII 6 129 1335 1718 2778 2899 Thal 25 1675 3682 3806 4093 2912 Tsel 24 Bce831 7 399 962 1132 2843 3141 EeoRV 2 187 378 Tsp451 9 124 212 1157 1424 2191 3382 4250 Faul 11 2404 2499 3901 4112 Beell 3 887 1444 3254 Fokl 12 Tsp5091 10 58 251 580 630 1596 Bcgl 8 506 540 974 1008 2329 Fspl 4 262 1635 1733 3867 1610 3512 3818 4073 4638 2363 4150 4184 Gdill 5 295 676 808 1216 4033 T!h1111 1 2497 Btal 8 230 448 544 589 1766 Hael 7 1197 1269 1326 1723 2767 Tth11111 5 2213 3342 3349 3381 4637 3247 3500 3835 2778 3230 UbaJi 21 8g11 3 1212 1446 3765 Haell 11 Vspl 2 629 3817 8g111 1 646 Haelll 23 Xbal 1 588 Bpml 4 1109 1663 2279 3715 Hgal 11 Xmnl 2 2310 4244 Bpu101 1 1858 HgiEIi 1 3338 Bpu110211 458 Hhal 31 Enzymes!hatdonetcutpET-3a: Bsal 2 613 3706 Hin41 5 16 334 1418 3644 3718 MI! Agel Apal Ascl Avrl! BsaAI 1 2504 Hinell 2 930 4186 Bael Bcll Bmgl BsaXI BseRI BsaBI 3 645 651 1949 Hindlll 1 29 BsrGI BssHII BstEIi BstXl Bsu361 BsaHI 6 691 712 826 1483 4182 Hinfi 11 Oralll Ordl! Fsel Hpal Kpnl 4564 Hphl 12 Mlul Muni Neol Notl Nsil BsaJl 9 115 129 435 805 811 Maell 10 1178 1234 1823 1847 2077 NspV Pacl Pmel PmI! RleAl 1444 1646 1724 2912 2503 3455 3871 4244 4564 Rsrll Sael Saell SexAl Sfil BsaWI 6 380 970 1941 2958 3105 Maelll 17 Sgfi Smal Sna81 Spel Srtl 3936 Mboll 11 Sse83871Stul Sunl Swal Xeml Bsbl 2 2468 4188 Mmel 4 222 309 2967 3151 Xhol BscGI 1 1912 Mnl! 30 Bsil 3 2925 4309 4616 Mscl 1 1723 BsiEI 7 289 933 1219 2668 3092 Msel 18 4015 4164 Msl! 7 1308 1739 1934 2325 3897 Bsl! 21 4056 4415 Bsml 1 1636 Mspl 28 BsmAl 4 613 2393 3706 4482 MspA11 7 462 1418 2343 2462 3094 BsmBI 1 2393 3339 4280 BsmFI 4 829 1150 1375 2023 Mwol 37 B5OFI 45 Narl 4 691 712 826 1483 Bsp241 10 513 545 658 690 3245 Neil 10 171 812 1536 1762 2090 3277 3423 3455 4549 4581 2396 2431 3132 3828 4179 Bsp1286110 280 752 766 868 1455 Ndel 1 550 1746 2570 3070 4231 4316 NgoAIV 4 678 1046 1206 1560 BspEI 2 380 1941 Nhel 2 229 543 BspGI 3 1336 1413 2278 Nlalll 27 BspLU11 1 2752 NlalV 25 BspMI 1 1331 Nrul 1 1251 Bsrl 20 Nspl 4 843 2097 2389 2756 8srBI 2 2685 4486 P11110812 1035 3663 BsrOI 2 3706 3880 PfiMI 2 1598 1647 BsrFI 7 160 678 687 1046 1206 Plel 5 629 917 2646 3131 3634 1560 3725 PshAl 1 993 Bstll071 1 2523 Psp511 2 1716 1758 BstYI 9 510 646 1944 3393 3404 Psp140614 1178 2077 3871 4244 3490 3502 4270 4287 Pstl 1 3890

Durée UNIVERSITE HENRI POINCARE, NANCY 1 FACULTE DES SCIENCES SUJET D'EXAMEN DIPLOME: Maîtrise de Biolologie 1 cellulaire et Physiologie - option Science et technologie du végétal 2 heures Epreuve de : Réponses l'environnement Session: Juin 2003 Date: Horaire: Traitez les questions suivantes: des plantes à 1 Nomdu rédacteur: P. Dizengremel DDocuments autorisés ŒJDocuments non autorisés ŒJCalculatrices autorisées DCalculatrices non autorisées 1) La Figure 1 présente la réponse de plusieurs paramètres hydriques et métaboliques de feuilles de plants de Tournesol soumis à un déficit hydrique progressif. Commentez les résultats obtenus. (a) g,~ ~- 2 -'- "E'"" : 1.5 ~ ~ 1.\1 ëe 0.5 ès 2.5 / -0- OsmotlC pressure Turgor (b) 0.8 0. 0 ci -; 0.6 ~ '" -g "E 0 0.4 " <ii 16 0.2 ùj -0.5-1 -1.5-2 -2.5 Figllre -1.Theeffectofexpos<I"ta increasingwaterdeficit(leafwaterpotential, -0-9. MPa)on water relations, gas exchangeand R<lBPcontentof s<lnflower(helianthus... c, c: 1500 annuus L) leaves with 0.35 mmol CO2 mor' air and 1200 mmol m-2,,' plloto- 400 0 16 syntheticaliy active radiation. (a) Osmotic presstlre and t<lrgo' (b) Stomatal " conductance (mol m-2,,') and intereeliular CO2 concentration (}.Lmolmar'). 300 (c) Photosynthetic rate (}.Lm01 m-2 s-i) and rib<llosebisphosphate (R<lBP, }.Lmolm-2) 0 " (after Cimenez et al., 1992; Gimenez and Lawlo <lnp<lblished). 200 0 ffi 100 ïj " (c) 50 ~ 40 '" 16 ~ 30 ~ ~ 20 ~"- 10 0. 0-0.5-1 -1.5-2 -2.5-0-A RuBP 0 150 125 100 "- 75 cc cr: 50 25 0. 0-0.5-1 -1.5-2 -2.5 0 Water patential (MPa) 2) L'effet de l'ozone sur les végétaux supérieurs a fait l'objet de nombreuses expériences dont certaines, menées sur des espèces différentes, sont décrites ci-dessous: - de jeunes plants de pin loblolly (Pinus taeda) ont été placés pendant 3 ans dans des chambres à ciel ouvert soumises soit à de l'air filtré (CF), soit à de l'air ambiant (NF = non filtré), soit à de l'air enrichi 2 fois en ozone (2x) par rapport à l'air ambiant (ce qui correspond à 92 ppb ou nll-1 pendant 12h par jour au cours de la saison de croissance d'avril à Octobre). La Figure 2 présente l'activité photosynthétique (A) et l'activité de la Rubisco (B) mesurées chez des aiguilles du premier "flush" de l'année 1989 (89-1), du 3ème"flush" de l'année 1989 (89-3) ainsi que du premier "flush" de l'année 1990 (90-1). Les résultats sont exprimés par rapport à la dose cumulée d'ozone depuis le début de l'expérience. A

- la Figure 3 présente les résultats de quantités de protéines des 2 sous-unités de la rubisco:. la LSU dans des aiguilles de 1 an lors d'exposition de pins d'alep pendant 24 jours à 200 nll-1 d'ozone (fig. 3A, C: contrôle sans ozone, 03: exposition à l'ozone). la SSU, dans de jeunes feuilles, lors d'exposition pendant 3 semaines de haricots à une concentration en ozone dans l'air ambiant augmentée de 80 ppb (ou nll-1) (fig. 3B, NF = non filtré ou air ambiant; + 80, en présence d'ozone); l'expérience est répétée 3 fois (3 pistes). - la Figure 4 présente les résultats de l'effet de l'ozone sur les quantités de transcrits des 2 sous-unités de la rubisco:. les transcrits rbcl obtenus au jour 24 de traitement, dans des aiguilles âgées d'1 an de pins d'alep soumis pendant 24 jours à 200 nll-1 d'ozone (fig. 4A. C: contrôle sans ozone, 03 : exposition à l'ozone). les transcrits rbcs obtenus au jour 21 de traitement, dans des aiguilles âgées d'l an d'épicéas soumis pendant 24 jours à 200 nll-1 d'ozone (fig. 4B. C: contrôle sans ozone, 03: exposition à l'ozone) 120 ~ 100 * '-' <U.~ :> CIJ 80.~ ~ 60 -... <U ::: ~ ~ 40 0 c A B 100 ïo!:p.. 80 ê. 60 ~ ~ >- g..8 20 i:l. 0 0 100 200 300 0 100 200 300 400 Cumulative Ozone Exposure (ppm.h) () _. CIJ -. () 40... :::.0 «20 ~ 0 ~ '-'. R 89-1 CF. R 89-1 NF c R 89-12x ~ R 89-3 CF. R 89-3 NF 0 R 89-3 2x Ji.. R 90-1 CF ~ R 90-1 NF + R 90-1 2x tr z /A'\ Proteins A. ~ LSU ~' c 03 @.~... NF +80 " \1 \.~][fj ~, '..... Rubisco,~,..:,,,' 4E -ssu ~WU- @ Transcripts rbcl li~..~!@i~,i..,i c 03 @ clay rbcs C 03 of=l 211- -- 1 ~~ 4-2.

- la Figure S présente les résultats d'activités enzymatiques déterminées soit:. sur les aiguilles des pins loblolly (Fig. SA, même traitement que Figure 2). sur les aiguilles d'épicéa (Fig. SB, même traitement que Figure 4B). sur les aiguilles de pin d'alep (Fig. SC, même traitement que Figures 3A et 4A). - la Figure 6 montre les résultats des effets de l'ozone sur les pins d'alep au niveau de la quantité de protéines et de transcrits de la phosphoénolpyruvate carboxylase (aujour 24 du traitement, identique à celui rencontré dans les figures 3A, 4A et SC) Commentez soigneusement l'ensemble des résultats et fournissez une hypothèse d'action de l'ozone sur le métabolisme carboné primaire foliaire. 2001,-.,, * '-' 150... >.. -.::: <:J -< 100 Q,)... -.::: CIl a:; 50 @ =- ~ Photosynthesis ~ Rubisco 0 0 100 200 300 400 G6PDH = glucose 6 phosphate déshydrogénase Cumulative Ozone Exposure (ppm.h) PFK = phosphofructokinase PEPC = phosphoénolpyruvate PK = pyruvate kinase carboxylase NADP-ME = enzyme malique à NADP NAD-ME = enzyme malique à NAD 12 10 8 6 4 2,.., ~ 0 'B 0 0\1...:: '; 0:; CI:: 0 PFK. Fumarrase 0 G6PDH. PEPC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 ~. :~ ụ.... 2.i;.. o:i ~ 1 0-1)?~ 1 riu..j-~ '"' 1:- 0 10 20 30 40 50 60 70 Daysof Ireahnent ho t s 80 90 100 ~f~';~ PEPe ~:y; ~;.. --_._-- c 03 pepe ~ r:- I\\~v'v'-- (; 7~~ V\,t:; c 03 3

UNIVERSITE HENRI POINCARÉ, NANCY 1 FACULTÉ DES SCIENCES et TECHNIQUES SUJET Diplôme: Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie Mention: Génétique Moléculaire et Cellulaire Epreuve de: Bioloqie du Développement Session de :juin 2003 Date: Horaire' D'EXAMEN Durée des sujets: Ih Nom du rédacteur: Professeur Michel DAUÇA [ ] Documents autorisés [X] Documents non autorisés [ ] Calculatrices autorisées [X] Calculatrices non autorisées Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Génétique du Développement Sujet de Monsieur le Professeur M. DAUÇA A partir de quelques exemples de votre choix, vous montrerez la diversité chez la drosophile des mécanismes régulant l'expression des gènes du développement et des fonctions exercées par les protéines codées par ces gènes. NB: Les sujets de Monsieur le Professeur Michel DAUÇA et de Monsieur Bertrand AIGLE sont à traiter sur des copies séparées. Il sera tenu compte de la qualité de la rédaction et de l'illustration ainsi que de la maîtrise de l'orthographe.

UNIVERSITE HENRI POINCARÉ, NANCY 1 FACULTÉ DES SCIENCES et TECHNIQUES SUJET D'EXAMEN Diplôme: Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie Mention: Génétique Moléculaire et Cellulaire Epreuve de : Bioloqiedu Développement Session de :juin 2003 Date: Horaire. Durée des sujets: Ih Nom du rédacteur: Bertrand AIGLE [ ] Documents autorisés [X] Documents non autorisés [ ] Calculatrices autorisées [X] Calculatrices non autorisées Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Génétique du Développement Voir sujet ci-joint Les sujets de Monsieur le Professeur Michel DAUÇA et de Monsieur Bertrand AIGLE sont à traiter sur des copies séparées.

Examen MGMC, juin 2003 Génétique du développement Sujet de cours proposé par B. Aigle Durée 1 heure, aucun document n'est autorisé Justifiez vos réponses et soyez clairs et concis! La sporulation chez la bactérie Bacillus subtilis est gouvernée par une série de facteurs de transcription qui sont soumis à des régulations spatiales et temporelles. La phase d'initiation est contrôlée par la protéine SpoOAqui est considérée comme le régulateur clé pour l'entrée dans la voie de sporulation. Des travaux ont été menés afin de déterminer si SpoOA pourrait avoir éventuellement d'autres rôles que ceux décrits jusqu'à présent. Dans un premier temps, le gène de la GFP ("green fluorescent protein") a été placé sous le contrôle des promoteurs PspoIlGet Pspacc. Pspaccest un promoteur constitutif alors que PspoIlG(promoteur de l'opéron spolie) est sous le contrôle de la forme active de SpoOA. Les cellules de B. subtilis ont été analysées pour la présence de fluorescence (Fig. 1) trois heures après l'entrée dans le processus de sporulation (stade d'engouffrement -"engulfment"- atteint). GFP Po;pollG-gfp P spac C-gfp Fig. 1 : Localisation subcellulaire de la GFP. La fluorescence apparaît ici sous forme blanche. La barre blanche = 1/lm. 11 Interprétez les résultats obtenus Fig. 1. SpoOA est-elle uniquement active pendant la phase d'initiation de la sporulation? Remarque: la transcription à partir des deux promoteurs est due à la même forme de l'arnpolymérase (celle contenant le facteur sigma principal, cra). Des anticorps anti-spooa ont été utilisés afin de rechercher la présence éventuelle postdivisionnel. Les résultats sont montrés Fig. 2. de SpoOA dans le sporangium 2/ Interprétez. Ces résultats sont-ils compatibles avec ceux présentés Fig. 1? Remarque: l'utilisation d'anticorps anti-cramontre des signaux d'intensité très similaire entre le compartiment «forespore» et le compartiment cellule-mère «<mother cell»). 2h Fig. 2 : Localisation subcellulaire de SpoOA. Les cellules sporulantes de la souche sauvage sont collectées à différents temps après le début de la sporulation et observées par microscopie. La protéine SpoOA est détectée par immunofluorescence à l'aide d'anticorps anti-spooaet d'un anticorps secondaire lié au FITC (fluorophore vert). Les cellules représentatives sont entourées par les rectangles et les flèches indiquent la localisation de la «forespore» au niveau de ces cellules. La barre blanche = l/lm 3h 4h

CI ~,/1,:t: )1...1,~; UNIVERSITE HENRI POINCARE, NANCY 1 FACULTE DES SCIENCES SUJET D'EXAMEN DIPLOME: Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie iopn'orf:sc..'c..~cj-tcùl"",ljj,,k d,... "'~~hsi Epreuve de :. Interactions Plantes Microorganismes Session: Date: Horaire: Durée du sujet: 2 heures Nom du rédacteur: B.BOITON DDocuments autorisés IIDDocumentsnon autorisés IIDCalcu1atricesautorisées DCalcu1atrices non autorisées Dans le but de comparer l'assunilationde l'ammonium chez les ectomycorlrizesde Hê1re(Fig. 1) et d'epicéa (Fig. 2 et 3), celles-ci ont été incubées dans un milieu de culture renfermant de l'ammoniummarqué à l'isotope l~, en présence ou en absence de Méthionine sulfoximine (MSX). A partir des cinétiques d'accnmul$on des composés dans la celluleet de l'enrichissementisotopique des acides aminés, déduire les voies métaboliques d'incorporation de l'ammonium dans les composés organiques et les enzymes impliquées, pour chacun des deux types de mycorhizes. (1'~ès 2. et 3 jointes)

~ ).,? \,(c; t....- ~ ~ ~600 Z ~ --- 1000.- 70 ~ = 0.- ~ 400 5 ~0 u ~ 501'.".'. ~ Z 800 ~.5 30 ~vi0 0 0 0 2 4 Time (h) 6 8 Figure 1 : Effect of anmonium feeding and 1 mm MSX on the levels on intracellularariunonium(inset:. ~). total tree aminoacids(ii.[j) and glutamine (8. 0) in ectomycorrhizas of Fagus sylvatica. Open symbols. without MSX; closed symbols. withmsx...'..

e =' 1: J 1.8-1.6 : ~ ' ~ 1.4 -!: 1.2 0. 1.0-0.8 A ~ f";' '" t". ",0;1 ri) "0... g~l1 0" 12'~.~ ~ 10 e;)~-!: 9 12 0 ~ : (Ü - 8 ~ 3 6 9' 12 15 ' Incubation period (h), 18 Figure 2. Effect of ammoniumfeedd1gon the-leveis of the h1tracelluiarammonium (A) and the total free amino acid pool (B). The ~hed spruce-hebe1oma sp. ectomycorrbizas collected!rom a nursery were incubate4 in Pachlewski's medium conn.ining 5 mm ammonium sulphate (50 atom % excess,cea France), without enzymeb1hibitor~~wdh2smmmsx œ '" ':,' SOLA B 40 ~z 10 0 0 3 6 9 12 15 18 3 6 9 12 15 Incubation period (h) 18 Figure 3. Tune course of lsn incoiporationin the amido-n of glutamine (0), the amino-n of glutamine(e), glutamate(8), y-aminobutyricacid (+) and alanine (A)of spmce ectomycorrhizas fed with 5 mm ls~2s04 (50 Item % excess, CEA France).The detachedspmce-hebeloma sp. ectomycorrhizascollected from a nursery were incubated in Pachlewski's medium, without enzymeinhibitor(a) or containing2.5 mmmsx (B).

Epreuve de 'P.~j).QLb. LE,.". UNIVERSITE DE NANCY l FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES DIPLOME (1:(~.t1: 1:.1:$ {;.'13,:tJ SUJET M.~..13.~...P..~..f:...f!!... (I?ii.f?...B İ.. L( Cf /JI - -.-- (II oi e.f...f".~~~.5a;h1-~ S.' "/ <> ' 6J.p ri. 0. Vl....ni{.8.P.t=$.... Ii. T... E. ev.ry f., EI:t ~.. ti)iu~ f. T.l ~ Session de Ji..J.~M 2..~~.~... Date,... Horaire, '.'." '. D'EXAMEN J tf Durée du sujet 2.: ~...... Nom du rédacteur r:e.l.(f.~.ky... Documents autorisés ~ 1 NON 1 (1) Calculatrices autorisées L OUI linon 1 (1) (lt Rayer la mention inutile 1.- Question principale (temps conseillé: 1 heure 30) Les transferts de D1atière dans les quatre processus fondamentaux de pédogenèse des principales zones bioclimatiques: facteurs, mécanismes et résultats. 11.-5 questions à réponses brèves go minutes) : CD Dans quels sols se forme la gibbsite? @ Caractères essentiels d'un humus de type mull? @ Qu'est-ce qu'une rendzine? @)Citez les trois caractéristiques d'une "structure vertique". @ Pourquoi les nitrates sont-il entraînés rapidement dans les eaux de drainage?