1 Utilisation d EXCEL comme base de données BASE DE DONNÉES DU TAUX D HORMONES REPRODUCTIVES DES FEMMES Données fournies par le professeur Paul Biscof du département de Gynécologie et d'obstétrique de l Hôpital Universitaire de Genève. Utiliser la base de données contenant les informations de 20 femmes en bonne santé âgées de 20 à 35 ans provenant toutes de la région de Genève en Suisse. Ces femmes n ont pas utilisé de contraceptifs oraux durant les trois derniers mois précédant le début de l étude. À partir du premier jour de leur cycle menstruel (déterminé par le début de leurs menstruations), toutes les volontaires ont fait une prise de sang quotidienne et ont fait la prise de sang jusqu au premier jour de leur prochain cycle menstruel. Six hormones ont été mesurées dans ces échantillons de sang: FSH LH Prolactine Oestrogène Progestérone Testostérone UI = Unités internationales ; pg = picogrammes ; ng = nanogrammes Les données concernant le stage de développement des follicules dans les ovaires ont été obtenues par ultrasons. Comment préparer votre base de données Ouvrir le document EXCEL Hormones.xls disponible sur www.bpellerin.blogspot.com Il y a deux lignes vides entre chaque volontaire. Pour les supprimer, sélectionner les colonnes A à H et utiliser la fonction trier de A Z (plus petit au plus grand) du menu Données pour supprimer les lignes retrouvées entre les volontaires.
2 Retourner à la ligne 1 et sélectionner les cellules A1 à H1 Dans le menu Données, sélectionner le Filtre et choisir Filtre automatique De petites flèches pointant vers le bas apparaîtront dans le coin inférieur droit des cellules A à H de la ligne 1. Quand vous cliquez sur une d elles, vous obtenez le menu suivant : Cliquer sur «(sélectionner tout)» pour libérer tous les volontaires et sélectionner 3
3 Vous avez maintenant filtré toutes les informations concernant les volontaires ayant le numéro 3. Remarquer que la flèche de la cellule A1 possède le symbole. Ceci indique qu un filtre a été utilisé dans cette colonne. Vous remarquerez également que le nombre d entrées filtrées est indiqué dans le coin inférieur gauche de la feuille. Ici on a «33 enregistrement(s) trouvé(s) sur 579». Pour retourner à une base de données complète, cliquer sur le symbole de la cellule A1 et sélectionner tout. Utiliser l option personnalisée Cette option est très utile si vous désirez comparer des résultats, par exemple le volontaire 3 et le volontaire 7. Retourner à la base de données complète, cliquer sur la flèche de la cellule A1 et sélectionner personnalisé. Une fenêtre apparaîtra.
4 Entrer les informations suivantes : Volontaire 3 ou 7 comme dans le tableau suivant puis appuyer sur OK. Vous venez de filtrer les informations pour les volontaires 3 et 7 seulement. Maintenant, aller à la cellule B1 et cliquer la flèche afin de sélectionner le jour 8. Vous pouvez maintenant comparer les résultats du jour 8 pour les deux volontaires sélectionnés. Remarquer que les flèches des cellules A1 et B1 possèdent le symbole. Ceci signifie qu un filtre est utilisé dans les deux colonnes. Sélectionner tout dans les deux cases pour revenir à la base de données complète. Exercice #1 : Quel volontaire à le niveau d œstrogène le plus élevé au 8 e jour du cycle menstruel quand le niveau de prolactine est supérieur ou égal à 10 ng ml -1? Commencer avec la base de données complète. Filtrer le jour 8 de la cellule B1 Maintenant, cliquer sur la flèche de la cellule E1 et sélectionner Filtres numériques.
5 Quand la fenêtre apparaîtra, entrer «est supérieur ou égal à» et «10» 12 résultats sont filtrés Maintenant, sélectionner toutes les informations des 12 lignes, choisir Données dans le menu et sélectionner trier Une fenêtre apparaîtra, Trier à partir de la Cellule F1 et choisir l ordre décroissant. Cette action vous a permis de pouvoir comparer les niveaux d œstrogène (pg ml -1 ) avec un niveau élevé de prolactine ( 10 ng ml -1 ) pendant le 8 e jour du cycle menstruel à partir des 20 volontaires. Réponse : Volontaire #7 Exercice #2. a) Combien de volontaires démontrent un niveau de progestérone supérieur à 1 ng/ml au 9 e jour du cycle menstruel? (Réponse: 4 volontaires) b) Laquelle des 20 volontaires démontre un niveau de FSH supérieur à 10 UI/mL pour 5 jours. Ces jours sont-ils consécutifs? (Réponse: Il y a 5 entrées pour le volontaire 14 et les jours ne sont pas consécutifs.) Les méthodes pour le a) et le b) sont les suivantes. a) Débuter avec une base de données complète. Sélectionner le jour 9 de la cellule B1. Sélectionner Personnalisé dans la cellule G1. Entrer dans la fenêtre : Supérieur à et 1. OK b) Débuter avec une base de données complète. Sélectionner Personnalisé dans la cellule C1. Entrer dans la fenêtre : Supérieur à et 10. À partir de la cellule A1, sélectionner le numéro des volontaires un à un.
6 Recherche 1 La rupture des follicules se produit environ 36 heures après le pic de LH. 1) Choisir cinq volontaires parmi les 20 volontaires. Créer un graphique de dispersion (points reliés) de la concentration de LH en fonction des jours du cycle. a) Quels sont les cinq volontaires? (1) b) Soumettre le graphique du niveau de LH en fonction des jours du cycle. (3) 2) Étudier le graphique et déterminer les cinq concentrations maximales de LH. a) Quelles sont ces cinq valeurs? b) Quelle est la valeur minimale de ces cinq valeurs? (1) 3) Dans la base de données, filtrer toutes les volontaires donc la concentration est supérieure ou égale à la valeur que vous venez de déterminer en (b). Vous devez maintenant avoir la liste des volontaires ayant un niveau de LH supérieur ou égal à la valeur déterminée. a) Si la condition du filtre vous donnait moins de 6 volontaires, que devriez-vous faire à ce filtre pour avoir plus de candidates respectant le filtre? (1) b) Si vous aviez deux valeurs ou plus pour le même volontaire, que devez-vous faire à ce filtre pour n obtenir qu une seule valeur par volontaire? (1) c) Pourquoi certains volontaires sont absents de la liste après le filtrage? (1) d) Quelle est la valeur de la concentration de LH pour avoir le maximum de volontaires sans qu il n y ait de répétition? (1) Le pic pour la LH a lieu à un moment particulier lors du cycle menstruel et l ovulation se produit 36 heures plus tard. 4) Sélectionner les jours (colonne B) de toutes les volontaires du numéro 3 précédent et copier ces informations sur une autre feuille Excel. Additionner 1,5 à chacun des jours afin de déterminer le moment précis de l ovulation. Déterminer la moyenne et l écart-type pour les jours d ovulation pour cet échantillon de volontaires. a) Soumettre le tableau. (3)
7 La méthode de contraception Ogino-Knaus, dite aussi méthode rythmique, consiste à calculer la «période sécuritaire» où aucun ovule (oocyte) fécondable n est retrouvé dans les trompes utérines. Les ovules sont fécondables dans les 24 heures suivant l ovulation et selon certains gynécologues, la durée de vie des spermatozoïdes dans l utérus est possible jusqu à 7 jours après éjaculation. http://www.saburchill.com/ibbiology/ict/dataprocessing/014.html http://www.saburchill.com/ibbiology/ict/dataprocessing/011.html 5) En utilisant les données calculées au numéro 4, déterminer la période sécuritaire selon la méthode Ogino-Knaus du groupe des 20 femmes étudiées? a) Selon la moyenne b) Selon un écart-type c) Selon deux écarts-types (3) 6) Selon les informations fournies dans cette base de données, évaluer (passer en revue les implications et les limites) la méthode de contraception Ogino-Knaus. (5) Total : 20 points
8 Recherche 2 Selon le graphique ci-dessus, il existe plusieurs interactions entre les hormones dans un cycle, on t en propose quatre. 1. La rétroaction négative contrôle le niveau de FSH après que cette hormone ait stimulé la sécrétion d œstrogène. 2. Il existe une rétroaction positive entre le niveau de LH et celui de l œstrogène. 3. La testostérone est un précurseur de l œstrogène (la testostérone est fabriquée par les cellules ovariennes et ensuite convertie en œstrogène). 4. La prolactine est une hormone qui inhibe la sécrétion de progestérone. a) Définir les expressions suivantes i) rétroaction négative (1) ii) rétroaction positive (1) iii) corrélation négative (1) b) Si une hormone stimule une autre, devrait-il y avoir une corrélation positive ou négative entre leur concentration. Expliquer. (2) c) Choisir entre les interactions 1 à 4 proposées ci-haut. Laquelle as-tu choisie? (1)
9 d) Déterminer la période pendant laquelle la rétroaction choisie a lieu. Quelle est cette période? (1) e) Choisir 5 volontaires et déterminer la moyenne de la concentration sanguine de la première hormone pour chaque jour de la période déterminée en «d». Faire ma même chose pour la seconde hormone. Le tableau obtenu devrait avoir une colonne pour le jour, une colonne de la quantité moyenne de la 1 re hormone et une colonne pour la quantité moyenne de la 2 e hormone. Insérer ce tableau dans ton travail. (5) f) Faire un graphique combiné à points illustrant la relation entre les concentrations sanguines de ces deux hormones en fonction de la période sélectionnée du cycle. Le graphique devrait avoir deux axes verticaux et une droite la mieux ajustée pour chaque hormone. P.S. Des barres d incertitudes te donneront des points supplémentaires. (5) g) En utilisant ce graphique, indiquer le type de relation et expliquer comment la première hormone affecte la concentration de la seconde hormone. (3) Total : 20 points Grand total : 40 points.