Faut il avoir peur des E. coli BLSE? G. Arlet Faculté de Médecine, Université Pierre et Marie Curie Hôpital Tenon, AP-HP Paris Explosion des ESBL Extended-Spectrum ß-Lactamases: a Clinical Update D L. Paterson and R. A. Bonomo Clin. Microbiol. Rev. 2005, 18: 657-86 Historique des BLSE 1983 SHV-2 en Allemagne 1984 CTX-1 (TEM-3) en France Depuis cette date environ 100 dérivés de TEM une trentaine dérivés de SHV 1
Historique des BLSE Klebsiella pneumoniae Épidemies hospitalières Réanimations E. coli : TEM-3, 4, 6, 7, 8, 11, 12, 23, 24, 26, 29, 49, 71, 112, 126 SHV-2, 2a, 4, 5, 7, 8, 12 Salmonella : TEM-3, TEM-4, TEM-20, TEM-25, TEM-27, SHV-2 K. oxytoca : TEM-3, TEM-7, TEM-10, TEM-26, SHV-2, SHV-5 P. mirabilis : TEM-3, TEM-20, TEM-21, TEM-26 P. stuartii : TEM-3 C. freundii : TEM-3, TEM-7, TEM-8, TEM-26 E. cloacae : TEM-3, TEM-5, TEM-26, SHV-2 E. aerogenes :TEM-3,10, 12, 24, 26, SHV-4, 3 et 5 S. marcescens : TEM-3, SHV-2, SHV-4 P. aeruginosa : TEM-42, SHV-2 Evolution BLSE AP-HP 70 K. pneumoniae 60 E. coli E. aerogenes 50 Enterobacter spp. 40 K. oxytoca 30 P. mirabilis Citrobacter spp. 20 Providencia sp. 10 S. marcescens autres 0 21/09/09 1995 1996 1997 1998 G. Arlet 2009 1999 2000 2001 2002 2003 Nouvelles ß-lactamases de classe A et résistance aux C3G CTX-M : Céfotaximase VEB-1 : Vietnamiense extended-spectrum ß-lactamase BES-1 : Brazilian extended-spectrum ß-lactamase GES-type : Guyana extended-spectrum ß-lactamase IBC-1 : GES-type PER-1, PER-2 : Pseudomonas aeruginosa The success story of CTX-M 2
BLSE CTX-M Phénotype des CTX-M CTX CAZ FEP ATM CTX-M-1 64 0.5 16 16 CTX-M-15 256 128 32 128 CTX-M-16 16 8 2 8 CTX-M-19 1 64 0.5 4 0.02 OXY-1 CTX-M-11 CTX-M-22 CTX-M-23 CTX-M-1 CTX-M-15 CTX-M-28 CTX-M-3 CTX-M-29 CTX-M-30 CTX-M-12 CTX-M-10 CTX-M-8 CTX-M-25 CTX-M-26 CTX-M-21 CTX-M-13 CTX-M-24 CTX-M-14 CTX-M-18 CTX-M-19 CTX-M-16 CTX-M-9 CTX-M-27 CTX-M-17 Arbre phylogénétique des CTX-M * Groupe M-1 (Kluyvera ascorbata) * * Groupe M-8 (Kluyvera georgiana) Groupe M-25 Groupe M-9 (Kluyvera georgiana) CTX-M-5 CTX-M-4 CTX-M-6 CTX-M-7 Groupe M-2 (Kluyvera ascorbata) CTX-M-20 Toho-1 21/09/09 CTX-M-31 G. Arlet 2009 CTX-M-2 3
"The CTX-M ß-lactamase pandemic" R. Canton and T.M. Coque Curr Opin Microbiol. Oct. 2006 BLSE dans le monde Vietnam 2000-2001 Hôpital E. coli, KP 30% Cambodge 2004-2005 Communautaire E. coli 35% Pakistan India Japon 2002 2006 2003 Hôpital Communautaire Communautaire E. coli, Hôpital divers? E. coli KP Enterobacter? 52% 30% 25% >60% 14% Chine 1998-2002? divers 20 à 60% Corée 2000 Hôpital Taiwan 1998-2002 Hôpital E. coli, KP E. coli, KP 10% 30% 5,6% 13,5% BLSE dans le monde Amérique latine 2000 Hôpital E. coli KP 8,5-18% 45-52% USA 2001-2002 Hôpital E. coli KP 5,1% 7,2% Canada 2001-2002 Hôpital E. coli KP 4,9% 4,2% 4
Blow up of the ESBL R C3G chez E. coli Prevalence of resistance to extended-spectrum cephalosporins among E. coli isolates from bacteraemias (European Antimicrobial Resistance Surveillance System) 2002 2007 R C3G chez E. coli Augmentation de la résistance Aux céphalosporines de 3ème génération No data 2002 <1% 2007 1-5% 5-10% 10-25% 25-50% >50% Isolats invasifs d E. coli (sang et LCR) 28% 23% 40% earss R C3G chez E. coli Augmentation de la résistance Aux céphalosporines de 3ème génération No data 2002 <1% 2007 1-5% 5-10% 10-25% 25-50% >50% Isolats invasifs d E. coli (sang et LCR) 0,8% 2,5% earss 5
Augmentation des E. coli BLSE Depuis 10 ans à l AP-HP x4 taux d attaque des EBLSE x5 % E. coli parmi les EBLSE Septicémies à E. coli BLSE Hôpital Pitié Salpétrière Entre 2001 et 2006 : % Coli BLSE x 10 (0,4 à 4,3%) Densité d incidence 1000 jours H x 10 (0,002 à 0,02) 56 % en ICU 69% sondage urinaire 70% antibiothérapie antérieure (C3G : 37%, FQ : 50%) BLSE, les nouvelles donnes Escherichia coli CTX-M Long séjour Communauté 6
BLSE dans les maisons de retraite (AP-HP) Long séjour versus court séjour 2001-2006 Incidence équivalente (0,28 vs 0,35/ 1000 J) Mais augmentation de 4 fois en 4 ans en LS Beaucoup plus de E. coli (80% vs 50%) Délais d acquisition plus long (30j vs 2j) Urines (80% vs 50%) Résistance fluoroquinolones (95% vs 70%) Plus grande clonalité (transmission croisée) E. coli BLSE in Nursing Home Irlande du Nord 2004-2006 294 patients dans 16 centres 40% de porteurs (0-75%) 51% n ont pas d antécédents hospitaliers récents (1 an) 13,5% ont des antécédents d UTI à E. coli BLSE Analyse multivariée : traitement par FQ et UTI récentes seul facteurs de risque BLSE en milieu communautaire Infections Peu de données en France 1999 : 1,5% en ville 2005 : 1,7% (ColBVH) 2006 : 1,1% (Onerba) 7
BLSE en milieu communautaire Plus de 80% de résistance FQ et TSU CTX-M age moyen plus bas (37 ans) Dissémination horizontale dans la communauté Prévalence de CTX-M-15 E. coli à Paris en 2002 Diffusion d un clone d E. coli CTX-M-15 isolé aussi bien à l hôpital que dans les long séjours et en ville. REP-PCR BamHI plasmidic fingerprint Eckert, C et al. AAC. 2004 et Kassis-Chikhani, N; Vimont, S et al EID. 2004 Paris, Tunis et Bangui Puis le succès En fait, le monde entier 8
Qu a-t-il de particulier? proche de souche UPEC MLST Virulent Souris / biofilm TN03 ECOR52 (O25a) ECOR51 (O25a) TNB2-4 (O6) II CFT073 (O6) ECOR57 (O2) ECOR62 (O2) IX RS218 (O18) 381A (O81) VIII DEC2a (O55) DEC1a (O55) EPEC 1 E2348/69 (O127) ECOR60 (O4) ECOR59 (O4) VI DAECT19 (O21) ECOR64 (O75) C1845 (O75) IH11128 (O75) VII DAEC20 (O75) TN03 (O25b) 10/10 0.01 EC7372 (O25b) 10/10 TN34 (O25b) 10/10 TU (O25b) 10/10 I CAF (O25b) 10/10 DAEC11 (O25b) * DAEC18 (O25b) ECOR66 (O4) 10/10 DAEC213 (O1)(D phylogenetic group) E. fergusoni Mais pap,hly cnf1 ne possède PAS les facteurs de virulence habituels des UPEC TN03 TN34 TU CAF EC7372 Biofilm et communautés bactériennes intracellulaires Kau, A et al Current Opinion in Microb. 2005 9
ST131-O25b:H4-CTX-M-15 En France Entre 94 et 03 : <5% E. coli (collection Branger) Entre 06 et 07 : 46% E. coli BLSE (collection Clermont) En 2005: 7% porteurs sains en Ile de France ST131 sensible En Angleterre Entre 05-06: 83% E. coli BLSE En LS 50% des E. coli BLSE BLSE en France Onerba COLBVH AP-HP IU Communautaire Entérobactéries Ts plvmts Hôpital Entérobactéries Ts plvmts Hôpital Entérobactéries Année 2006 2005 2005 % BLSE 1,1 1,6 % E. coli 66 49 % E. coli CTX-M 83 76 70 % E. coli % ST131 CTX-M- O25b:H4 15 57,5 42 78 42 56 Les autres raisons du succès Efficacité de l ISEcp1 Rôle des plasmides Systèmes d addiction plasmidique Transmission horizontale Origine animale? 10
Efficacité de l ISecp1 In Vitro : de Kluyvera à E. coli In Vivo : entre entérobactéries Dans le monde Dans un même lieu ISEcp1 et CTX-M diversité des plamides Caratolli AAC 2009 CTX-M enfants de Kaboul 8 enfants co-infectés par E. coli et KP 11
PCR replicon typing des plasmides codant pour les BLSE de E. coli PCR replicons typing chez E. coli producteurs de TEM-1, IRT et BLSE de type TEM 12
Systèmes TA chez plasmides incf codant pour les CTX-M chez E. coli 13
1991 : 0,7% Portage BLSE en milieu communautaire Espagne 2002 : 5,5% (3,7% chez volontaires sains) 2004 : 8,1% 2005-2006 : 7,4% Portage et diffusion BLSE en milieu communautaire Etudes de Séville et de Madrid Origine Patients infectés (UTI) aux urgences sans ATCD d'hospitalisation dans le mois Membres de la famille vivants sous le même toit Membres de la famille ne vivant pas sous le même toit Témoins aux urgences sans infection % 67 27,4 15,6 7,4 Facteurs de risques Diabète Partage de la même nourriture à domicile BLSE en milieu communautaire Transmission en milieu communautaire Même clône au sein de la même famille 1. 42% étude de Séville 2. 66% étude de Madrid 14
BLSE et nourriture Etude de Séville Pas de lien avec le type d alimentation carnée BLSE chez Salmonella et E. coli d origine animale : rares même si ont été décrit des petites épidémies BLSE contrôle en milieu communautaire Portage très long : parfois > 1 an Différents clones au sein d une même famille Faut -il détecter l entourage devant un cas d infection? Faut-il détecter les «bons colonisateurs»? Nouvelles molécules anti-plasmide BLSE et l avenir! Réservoir effrayant 10% de la population chinoise 15% de la population indienne 8% de la population espagnole Faites le calcul!!!! 15