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1 DataCite au service des données identifier pour valoriser Herbert Grüttemeier INIST-CNRS Université d été GFII, 12/9/2013

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5 DOI pour l accès et la citation URL n est pas persistant (ex. Wren JD: URL decay in MEDLINE- a 4-year follow-up study. Bioinformatics. 2008, Jun 1;24(11):1381-5). Digital Object Identifier (DOI) offre une alternative Identifiant largement utilisé pour les articles scientifiques Chercheurs, auteurs, éditeurs savent comment l utiliser Place les jeux de données sur le même plan que les articles Jeu de données Yancheva et al (2007). Analyses on sediment of Lake Maar. PANGAEA. doi: /pangaea

6 Un DOI pourquoi? DOI (Digital Object Identifier): identifiant persistant qui permet la citation et fournit un lien stable vers des ressources numériques, comme les données de la recherche constitué de deux parties: /datacenter.123xy Préfixe Suffixe

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8 Au niveau infrastructure, les noms DOI sont des handles.

9 From KE workshop presentation, The Hague, June 2011 (L. Lannom)

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11 DataCite Consortium international porté par des institutions locales Centré sur la valorisation des jeux de données et autres données non textuelles dans les services d information Collaboration avec les centres de données et organismes gérant des données Fournit des standards, workflows et bonnes pratiques Initialement, mais pas exclusivement, basé sur le système DOI Protocole d accord, Paris, février 2009 Créé officiellement le 1er décembre 2009 à Londres

12 Technische Informationsbibliothek (TIB), Germany Canada Institute for Scientific and Technical Information (CISTI) California Digital Library, USA Purdue University, USA Office of Scientific and Technical Information (OSTI), USA The British Library Technical Information Center of Denmark (DTU) Library of TU Delft, The Netherlands ZBMed, Germany ZBW, Germany GESIS, Germany Library of ETH Zürich, Switzerland Institut de l Information Scientifique et Technique (INIST-CNRS), France Swedish National Data Service (SND) Australian National Data Service (ANDS) Conferenza dei Rettori delle Università Italiane (CRUI) National Research Council of Thailand (NRCT) Affiliated members: Digital Curation Center, UK Microsoft Research Interuniversity Consortium for Political and Social Research (ICPSR), USA Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), USA Korea Institute of Science and Technology Information (KISTI) Bejiing Genomic Institute (BGI) Harvard University Library, USA Membres DataCite Actuellement 24 membres dont 7 membres affiliés

13 Structure DataCite Fondation Internationale DOI Membre DataCite Administrateur général (TIB) Institution membre Institution membre Membre associé Collaboration Data Centre Data Centre Centre données Data Centre Data Centre Centre données

14 DataCite les différents rôles Agence d attribution de DOI Maintenance infrastructure Maintenance d une base de métadonnées interrogeable Gestion des identifiants à long terme Etablissement et partage de bonnes pratiques Agences de données (centres de données, institutions de recherche, producteurs de données, bibliothèques) Assurance qualité Stockage et accès au contenu Création des identifiants Création et mise à jour des métadonnées

15 Bridging the gap DOIs in Use: DataCite CrossRef has registered more than 51 million DOIs on behalf of scholarly publishers. But CrossRef DOIs are not the only DOIs available in the scholarly community. DOIs for datasets associated Publishers with scholarly research are being Data registered centres by institutions in the DataCite network. DataCite and CrossRef have committed to the interoperability of their DOIs. Ideally, scholarly content like journals will cite related data by the appropriate DataCite DOI, and in return, the data record will cite the relevant article s CrossRef DOI. (from CrossRef Quarterly, January 2012)

16 Bridging the gap

17 Citation de données Relier l article et les données sous-jacentes via les DOI: The dataset: Storz, D et al. (2009): Planktic foraminiferal flux and faunal composition of sediment trap L1_K276 in the northeastern Atlantic. Is supplement to the article: Storz, David; Schulz, Hartmut; Waniek, Joanna J; Schulz-Bull, Detlef; Kucera, Michal (2009): Seasonal and interannual variability of the planktic foraminiferal flux in the vicinity of the Azores Current. Deep-Sea Research Part I-Oceanographic Research Papers, 56(1), ,

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20 PS PS PS PS PS IRD ( gr av /1 0 cm 3 ) San d ( %) CaCO3 ( %) T OC ( %) Rad io ( %/ san d) Smec t ( %/ cl ay) IRD ( gr av /1 0 cm 3 ) San d ( %) CaCO3 ( %) T OC ( %) Rad io ( %/ san d) Smec t ( %/ cl ay) IRD ( gr av /1 0 cm 3 ) San d ( %) CaCO3 ( %) T OC ( %) Rad io ( %/ san d) Smec t ( %/ cl ay) IRD ( gr av /1 0 cm 3 ) San d ( %) 55 30' 55 30' 55 0' 55 0' 54 30' 54 30' 54 0' 54 0' Scale: 1: at Latitude Source: Baltic Sea Research Institute, Warnemünde CaCO3 ( %) T OC ( %) Rad io ( %/ san d) Smec t ( %/ cl ay) IRD ( gr av /1 0 cm 3 ) San d ( %) CaCO3 ( %) T OC ( %) World vector shore line Grain size class KOLP A Grain size class KOEHN2 Grain size class KOEHN Geochemistry Grain size class KOLP B Grain size class KOLP DIN 20 m Rad io ( %/ san d) Smec t ( %/ cl ay) De quels types de données parlons-nous? 0.0 Earth quake events => doi: /gfz.geofon.gfz2009kciu Climate models => doi: /wdcc/dphase_mpeps Sea bed photos => doi: /pangaea Videos => doi: / Digitized ancient documents => doi: /l Computational models => doi: /02/4e9f69c011bc8 Audio records => doi: /pangaea Grey Literature => doi: /gbv: Medical case studies => doi: /eaacinet2007/cr/ Age (kyr) max. : kyr PS1389-3ff

21 Dataset Text Collection Event Film Audiovisual Image InteractiveResource Model PhysicalObject Service Software Sound Workflow Other Type de ressources DataCite (propriété resourcetypegeneral) Anything that is the foundation of further research is research data Data is evidence Actuellement Dataset largement majoritaire > Text > Image > Collection dans MDS DataCite

22 Services DataCite DataCite Metadata Store (MDS) Création DOI et enregistrement des métadonnées associées DataCite Metadata Search https://mds.datacite.org Recherche des métadonnées associées aux jeux de données enregistrées dans DataCite DataCite OAI Provider Exposition des métadonnées de DataCite en OAI-PMH DataCite Statistics Statistiques enregistrement DOI et résolution DOI

23 Services DataCite DOI Citation Formatter En collaboration avec CrossRef Création différents formats de citation pour les DOI DataCite et CrossRef Content Negotiation Exposition des métadonnées stockées dans MDS en choisissant parmi un large éventail de formats. Possibilité d accéder directement aux données grâce à un type différent de résolution de DOI DataCite Metadata Schema Schéma de métadonnées DataCite DataCite Test Environment

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26 Table 1: DataCite Mandatory Properties Champs métadonnées

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33 Type organisme Nom organisme Acronyme Type objet (General Resource Type) Caractéristique objet Centre données créé Organisme recherche international CEA /CNRS Institut Laue-Langevin ILL Datasets Données de la recherche X Organisme recherche Editeur / Organisme de Recherche Institut Français de Recherche pour l'exploitation de la Mer IFREMER Datasets Données de la recherche X Office National d'etudes et de Recherches Aérospatiales ONERA Text Articles X Structure fédérative recherche Université /CNRS /IRD Observatoire Midi-Pyrénées OMP Datasets Données de la recherche X Organisme recherche Centre National de Recherche Scientifique CNRS Datasets Données de la recherche X Université Université Lorraine UL Text Manuscrits anciens X Université Université Nouvelle-Calédonie UNC Text Thèses X Université /CNRS Maison René Ginouvès MAE Film Films X Organisme recherche Observatoire Mammifères Echantillonneurs Milieu Océanique MEMO Datasets Données de la recherche X Structure fédérative recherche Institut Pierre-Simon Laplace IPSL Datasets Données de la recherche X Structure fédérative recherche /CNRS Archives données issues statistiques publiques ADISP Text Enquêtes X Organisme recherche Centre National de Recherche Scientifique CNRS Images Image Images Organisme recherche Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale INSERM Datasets Cohortes Enseignement Supérieur et Recherche Ecole Normale Supérieure Lyon ENS Text Articles dictionnaire Editeur Cercle de Recherche et d' Action Pédagogique CRAP Text Articles Structure fédérative Université /CNRS Observatoire océanologique Villefranche OBS-VLFR Datasets Données de la recherche Structure fédérative Université / CNRS / IRD Observatoire océanologique Banyuls sur Mer OBS-BANYULS Datasets Données de la recherche Editeur Editeur Nouveau Monde Text Articles Structure fédérative recherche Université / CNRS / INP Grenoble Grenoble Images Parole Signal Automatique GIPSA-lab Text Articles, Rapports Organisme recherche Institut national de la Recherche Agronomique INRA Datasets Données de la recherche Organisation des Nations Unies pour Données de la recherche, Organisme international l'education, la Science et la Culture UNESCO Datasets, Service Services Organisme recherche / Filiale CNES Collecte Localisation Satellites CLS Datasets Données de la recherche Enseignement Supérieur et Recherche Ecole Nationale Aviation Civile ENAC Event, Text Actes colloque Structure fédérative recherche CEA / CNRS Observatoire des Micro & Nano Technologies OMNT Text Commentaires articles Structure fédérative recherche Université / IRISA Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires IRISA Datasets Données de la recherche Organisme recherche Centre National de Recherche Scientifique CNRS Text Articles Université Université Pierre et Marie Curie UPMC Text Résumés livres Université Université Paris Diderot Paris VII Text, Audiovisual Articles, Vidéos

34 Initiatives liées Thomson-Reuters Data Citation Index European Persistant Identifier Consortium (EPIC) ODIN European project (ORCID and DataCite Interoperability Network) CODATA/ICSTI Working Group on Data Citation OpenAIREplus project Creation of the Research Data Alliance

35 Comment nous contacter?

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