REFORME LMD BIOLOGIE

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1 REPUBLIQUE TUNISIENNE **** Ministère de l Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique et de la Technologie **** DIRECTION GENERALE DE LA RENOVATION UNIVERSITAIRE REFORME LMD BIOLOGIE PROGRAMMES ET CONTENUS DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES PROPOSES PAR LA COMMISSION NATIONALE SECTORIELLE DE BIOLOGIE Octobre 2009

2 Table des Matières OBJECTIFS ET MAQUETTES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES... 3 OBJECTIFS DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES...4 FICHES DE PRESENTATION DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES...5 CONTENUS DES PROGRAMMES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES CONTENUS DES PROGRAMMES DE L 1 (S1 ET S2)...28 CONTENUS DES PROGRAMMES DE L 2 (S3 ET S4)...55 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE APPLIQUEE AU SECTEUR DE LA SANTE (EX: MEDICALE) (S5)...93 CONTENUS DES PROGRAMMES DU PARCOURS : CONTROLE ET EXPLOITATION DES MICROORGANISMES (S5) CONTENUS DES PROGRAMMES DU PARCOURS : CONTROLE DE QUALITE DES PRODUITS ALIMENTAIRES (S5) PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE VEGETALE PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE APPLIQUEE AU SECTEUR PHARMACEUTIQUE PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE MARINE ET AQUACULTURE PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE ANIMALE...1 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : VALORISATION DES BIO RESSOURCES DES MILIEUX ARIDES PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 2

3 OBJECTIFS ET MAQUETTES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 3

4 Objectifs de la licence appliquée en Biotechnologies DOMAINE : SCIENCES ET TECHNOLOGIES MENTION : BIOTECHNOLOGIES OBJECTIFS : La licence appliquée en Biotechnologies vise la maîtrise d un ensemble de connaissances biologiques appliquées à la mise en oeuvre de méthodes et de procédés utilisant des organismes vivants des cellules vivantes ou des molécules biologiques actives Ces technologies du vivant sont réalisées dans un objectif de production service recherche Elles peuvent être appliquées A l agriculture A l environnement A l industrie A la santé LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 4

5 Fiches de Présentation de la licence appliquée en Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies Universités : Etablissements : Manouba Institut Supérieur de Biotechnologies de Sidi Thabet, Tunis El Manar Jendouba Institut Supérieur de Sciences Biologiques Appliquées, Institut Supérieur de Biotechnologies de Béja, Monastir Institut Supérieur de Biotechnologies de Monastir, Sfax Institut Supérieur de Biotechnologies de Sfax Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies - Semestre 1 Licence Appliquée Biotechnologies N Unité d'enseignement Nature de l'ue 1 C2i, Langues UT 2 Math Physique UF 3 Chimie UF 4 5 Biologie cellulaire Génétique Diversité du vivant UF UF Volume horaire semestriel Elément constitutif Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte C2i 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X Droit de l'homme 1H X Math appliquées 1H30 1H 3 3 X Physique 1H30 0H45 0H X Chimie Générale 1H30 0H30 0H X Chimie Organique 1H30 0H30 0H X Biologie cellulaire 1H30 0H30 0H X Génétique 1H30 0H45 0H X Biologie animale 1H30 1H X Biologie végétale 1H30 1H X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 5

6 Licence Appliquée en Biotechnologies Universités : Etablissements : Manouba Institut Supérieur de Biotechnologies de Sidi Thabet, Licence Appliquée Biotechnologies Tunis El Manar Jendouba Institut Supérieur de Sciences Biologiques Appliquées, Institut Supérieur de Biotechnologies de Béja, Monastir Institut Supérieur de Biotechnologies de Monastir, Sfax Institut Supérieur de Biotechnologies de Sfax Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies - Semestre 2 N Unité d'enseignement C2I Langues Droit de l'homme Biochimie Structurale Techniques d'analyses biochimiques Biologie moléculaire Microbiologie Natur e de l'ue UT UF UF 4 OPTIONNELLE 1 UO 5 OPTIONNELLE 2 UO Elément constitutif Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte C2I 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X Droit de l'homme 1H30 1H X Biochimie Structurale 1H30 0H30 1H 3 3 X Techniques d'analyses 1H 0H30 1H 3 3 X biochimiques Biologie moléculaire 1H30 0h45 0H X Microbiologie 1H30 1h X OPT X OPT X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES

7 Universités : Manouba Tunis El Manar Jendouba Monastir Sfax Licence Appliquée en Biotechnologies Etablissements : Institut Supérieur de Biotechnologies de Sidi Thabet, Institut Supérieur de Sciences Biologiques Appliquées, Institut Supérieur de Biotechnologies de Béja, Institut Supérieur de Biotechnologies de Monastir, Institut Supérieur de Biotechnologies de Sfax Licence Appliquée Biotechnologies Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies - Semestre 3 N Unité d'enseignement TIC Langues Gestion Physiologie animale Biotechnologie Animale Enzymologie /Génie Enzymatique Génie des Procédés Génétique Moléculaire Génie Génétique Natur e de l'ue UT UF UF UF 5 U Optionnelle 3 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte TIC et Multimédia 28H 2 2 X Anglais 28H 2 2 X Culture de 21H 2 2 X l entreprise Physiologie animale X Biotechnologie Animale Enzymologie &Génie 10H X Enzymatique 30 10H Génie des Procédés X 30 Génétique 10H X Moléculaire 30 10H Génie Génétique X 30 OPT X OPT X 3 X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 7

8 Licence Appliquée en Biotechnologies Universités : Etablissements : Manouba Institut Supérieur de Biotechnologies de Sidi Thabet, Licence Appliquée Biotechnologies Tunis El Manar Jendouba Institut Supérieur de Sciences Biologiques Appliquées, Institut Supérieur de Biotechnologies de Béja, Monastir Institut Supérieur de Biotechnologies de Monastir, Sfax Institut Supérieur de Biotechnologies de Sfax Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies - Semestre 4 N Unité d'enseignement Langues Bioéthique et biosécurité Biochemie Métabolique Microbiologie Industrielle Physiologie Végétale Biotechnologie Végétale Opérations Unitaires Immunologie et Immunotechnologie Natur e de l'ue UT UF UF UF 5 OPTIONNELLE 4 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif d'ue Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Anglais 28H 2 2 X Culture de l entreprise 21H 2 X Bioéthique / Biosécurité 28H 2 2 X Biochimie Métabolique H X Microbiologie 21 17H Industrielle X Physiologie Végétale 21 3h X Biotechnologie Végétale h X Opérations Unitaires 21 10h X Immunologie et 21 10h Immunotechnologie X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 8

9 Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la santé Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies N Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) - Semestre 5 Unité d'enseignement Langue et communication Culture de l Entreprise Bioinformatique Biotechnologie des Macromolécules Biotechnologie cellulaire et applications Biotechnologie des Microorganismes appliquée au secteur Médical Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif d'ue Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et 2 2 X communication Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X Génomique et 1H30 1H30 0H45 3 X transcriptome Protéomique 1H30 1H30 0H45 3 X Cultures cellulaires et 1H30 1H15 3 X tissulaires Technologies cellulaires 1H30 1H15 3 X Identification et typages 1H30 1H15 3 X des bactéries et des virus Identification et typage 1H30 1H15 3 X des parasites et mycologie Pharmacologie 1H30 0H30 0H45 3 X moléculaire Toxicologie moléculaire 1H30 0H30 0H45 3 X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 9

10 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) Semestre Volume horaire semestriel Crédits Coefficients Régime d'examen Natur (14 semaines) Elément constitutif N Unité d'enseignement e de Cour ECUE ECUE d'ue (ECUE) s Contrôle Régime l'ue Cours TD TP intég (le cas UE (le cas UE continu mixte ré échéant échéant 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 10

11 Programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 5 N Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Microorganismes d intérêt médical et pharmaceutique Microorganismes spécifiques à l Industrie Agroalimentaire Microorganismes en Industrie, Agronomie et Environnement Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif d'ue Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X Microorganismes pathogènes 1H30 0H30 0H45 3 X et maladies émergentes Microorganismes producteurs 1H30 0H30 0H45 3 X de molécules d intérêt Identification et contrôle de microorganismes pathogènes 1H30 0H30 0H45 3 X en Agroalimentaire Exploitation et Production de Microorganismes utiles en 1H30 0H30 0H45 3 X Agroalimentaire Fermentation microbienne : Technologie et formulation 1H30 0H30 0H45 3 X des produits finis Microbiologie de l Environnement et Microorganismes d intérêt 1H30 0H30 0H45 3 X agricole OP X OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 11

12 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre Volume horaire semestriel Crédits Coefficients Régime d'examen Natur (14 semaines) Elément constitutif N Unité d'enseignement e de Cour ECUE ECUE d'ue (ECUE) s Contrôle Régime l'ue Cours TD TP intég (le cas UE (le cas UE continu mixte ré échéant échéant 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 12

13 Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires مراقبة جودة المواد الغذاي ية Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) - Semestre 5 N Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Contrôle des Aliments et des Produits Agroalimentaires Technologies Agroalimentaires Techniques de Contrôle de Qualité Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif d'ue Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X Contrôle biochimique 1H30 0H30 0H45 3 X Contrôle microbiologique 1H30 0H30 0H45 3 X Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des 1H30 0H30 0H45 3 X Boissons Technologies des Céréales, des Produits Carnés et des Produits de 1H30 0H30 0H45 3 X la Me Applications de Management de Qualité 1H30 0H30 2 X Rhéologie et Techniques d analyses sensorielles 1H30 0H30 0H30 2 Techniques de qualité de conservation, d emballage 1H30 0H30 0H30 2 X et de conditionnement OP X OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 13

14 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 14

15 Programmes du Parcours : Biotechnologie Végétale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies N Licence Appliquée en Biotechnologies (Parcours : Biotechnologie Végétale) - Semestre 5 Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Biotechnologie végétale et Biochimie Génétique et Amélioration des Plantes Biotechnologies basées sur l utilisation de l ADN Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X. Biotechnologie végétale et conservation des phytoressources 1H30 0H30 0H45 3 X Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux 1H30 0H30 0H45 3 X Eléments de Génétique quantitative et Sélection 1H30 0H30 0H45 3 X classique Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques 1H30 0H30 0H45 3 X Biotechnologie 1H30 0H30 0H45 2 X Moléculaire Typage et Marqueurs 1H30 0H30 0H45 2 X Moléculaires OP X OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 15

16 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Parcours : Biotechnologie Végétale) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 1

17 Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5) Domaine : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologie Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre 5) Unités Elément constitutif (ECUE) C-CI TD TP h/s H/S Coeff Coef,UE Crédits Régime d examen d enseignement Unité d enseignement transversale continu mixte Langues (Français, Anglais) 2h 2 2 X UE 1: Unité transversale Informatique et statistique appliquée 2h 2 2 X d enseignements Culture de l Entreprise (Organisation de l entreprise) : 1h X Unités d enseignement fondamentales Industries des médicaments (fabrication, 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X UE 2 : Industrie production, contrôle) pharmaceutique Maîtrise environnementale des procédés 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X pharmaceutique UE 3 : Biotechnologie Bioressources pharmaceutiques (animales, 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X pharmaceutique végétales et microbiennes) Médicaments issus de la biotechnologie 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X Techniques d analyses et détection rapide UE 4 : Techniques 1h 1h45 2h45 38h X microbiologiques d analyses Techniques d analyse et détection rapide 1h 1h45 2h45 38h X physicochimiques Unités d enseignement optionnelles spécifiques ( à choisir obligatoirement crédits ) U.OP OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 17

18 Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre ) N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 18

19 Programmes du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) - Semestre 5 UE Unité Transversale Technologie Aquacole Culture des organismes aquatiques Valorisation des bioressourses aquatiques OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO Crédits Horaire Régime d examen ECUE ECUE UE Coef Contrôle Régime C TD TP CI continu mixte Anglais 2 2 2H X Culture de l Entreprise (Création d entreprises) 2 2 1H30 X Biostatistiques 2 2 2H X Milieu de culture 2 2 0H30 0H45 0H45 X Alimentation en Aquaculture 2 2 0H30 0H45 0H30 X Reproduction contrôlée d organismes 2 2 0H30 0H45 0H30 aquatiques Culture et élevage des invertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Culture et élevage des vertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Biomolécules aquatiques d intérêt 3 3 1H 1H 0H45 X Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 19

20 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) - Semestre N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 20

21 Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Animale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie Animale) - Semestre 5 UE Unité Transversale Biotechnologies moléculaire et cellulaire Biotechnologies de la reproduction et du développement animal Exploitation et valorisation des produits d origine animale OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO ECUE Crédits Coef Horaire Régime examen Contrôle Régime C TD TP CI continu mixte Anglais 2 2 2H X Culture de l Entreprise (Création d entreprises) 2 2 1H30 X Biostatistiques 2 2 2H X Biotechnologie moléculaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologie cellulaire et tissulaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologie du développement 3 3 1H30 0H45 0H30 X Technologie de la reproduction animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biomolécules d intérêt 3 3 1H30 0H45 0H30 X Valorisation des produits et des sousproduits d origine animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 21

22 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Animale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie Animale) - Semestre N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 22

23 Programmes du Parcours : Valorisation des bio ressources des milieux arides Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 5 UE Unité Transversale Valorisation des Phytoressources Valorisation des ressources Animales Exploitation industrielle des Bioressources OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO Horaire Régime examen ECUE Crédits Coef Contrôle Régime C TD TP CI continu mixte Anglais: préparation à la certification 2 2 2H X Culture de l Entreprise (Création d entreprises) 2 2 1H30 X Bioinformatique 2 2 1H 1H X Phytoressources en milieu aride 3 3 1H30 1H15 X Biotechnologies végétales 3 3 1H30 1H15 X Bioressources animales 3 3 1H30 1H15 X Biotechnologies animales 3 3 1H30 1H15 X Biomolécules d intérêt industriel 2 3 1H 0H45 X Extraction, analyse et identification de biomolécules 2 3 1H 0H45 X Génie fermentaire et transformations alimentaires 2 1H 0H30 0H30 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 23

24 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 24

25 Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies UNITE D ENSEIGNEME NT ECONOMIE D ENTREPRISE, NORME ET LEGISLATION VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) - Semestre 5 Nature de l UE UT UF UNITES D ENSEIGNEMENT LANGUE/ ANGLAIS NORME ET LEGISLATION CULTURE DE L ENTREPRISE (ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE) MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX BIOTECHNOLOGIE VEGETALE 2 HORAIRE COURS TD TP 1H 1H 0H30 0H30 0H30 0H30 Cours intégré 2H 2H 1H CREDIT COEFFI CIENT 1 1 Régime d'examen Contrôle continu X Régime mixte X BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE REGLEMENTATI ON & VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX TECHNOLOGIE & BIOCHIMIE VEGETALES UF UF UO VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION VEGETALE ETUDE ET GESTION DE LA DIVERSITE VEGETALE PLANTES MEDICINALES ET AROMATIQUES REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE GESTION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX 2 OPT. 1 : BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES VEGETALES OPT. 2 : TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX 1H 1H30 1H30 1H30 1H30 1H30 1H30 0H30 1H 0H30 1H 1H 0H30 1H 1H 1H 0H30 0H X X X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 25

26 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) - Semestre 5 N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 2

27 CONTENUS DES PROGRAMMES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 27

28 Contenus des programmes de L 1 (S1 et S2) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 28

29 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE DIVERSITE DU VIVANT Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences et Mention : Biotechnologies et autres Technologie mentions des sciences du vivant. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la S1 mention LF Parcours : 1- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Permettre à l étudiant d acquérir une formation de base sur - la diversité et l importance du règne végétal et du règne animal dans la Biosphère - la morphologie et le développement des végétaux inférieurs et des plantes à fleurs - les Protozoaires, la biologie et la diversité des Métazoaires ( invertébrés et vertébrés) 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) 3- Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Biologie végétale 1h30 0H 1H Biologie animale 1h30 0H 1H15 3 Total 3H 0H 2H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets laboratoire Stages Autres (terrain) Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 29

30 Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Biologie végétale : Introduction, les grandes lignes de la classification du règne végétal, étude des angiospermes 2- Biologie animale : Introduction, les protozoaires, les métazoaires : invertébrés et vertébrés 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Biologie végétale : Réalisation de coupes anatomiques, reconnaissance des organes et utilisation d une flore, terrain, histologie, morphologie et anatomie des appareils végétatif et reproducteur des angiospermes. Reproduction sexuée et multiplication végétative 2-Biologie animale : Reconnaissance et classification des différents taxons : étude des Protozoaires, des Spongiaires et des Cnidaires ; étude des Vers, des Mollusques et des Arthropodes ; étude des Vertébrés (Poissons, Amphibiens, Reptiles, Oiseaux et Mammifères) 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) Utilisation de préparations microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Sorties sur le terrain ; Collections de référence ; Confection d herbier Ouvrages de référence : - Initiation à la Biologie Végétale par J. ZAFFRAN édition Ellipse - Biologie végétale les Cormophytes par R. GORENFLOT et B. DE FOUCAULT édition Dunod - Biologie animale. Structures et Fonctions par J. COUSIN édition Ellipse - Croissance et développement des animaux par J.-Y. PATTIER édition Ellipse -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE 1-Biologie Végétale 2- Biologie Animale Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Coef. de Pondéra Pondéra Autre TP et l ECUE Ecrit TP -tion Ecrit Oral -tion s Autres 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 30

31 TOTAL 10% 10% 10% Validation des stages et des projets..... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 31

32 Annexe 1 Unité d Enseignement DIVERSITE DU VIVANT Code UE : COURS 21H ECUE n 1 BIOLOGIE ANIMALE Code ECUE : I. Introduction: Diversité du vivant A. Place du règne animal dans le monde vivant B. Diversité et évolution du monde animal C. Principes de la classification: systémique et nomenclature II. Les Protistes à affinité animale: les Protozoaires A. Présentation générale et particularités (Amibe- Trypanosome- Paramécie) B. Intérêt médical (maladies- épidémies ) et écologique (espèces indicatrices) des protozoaires C. Etude de cycles biologiques (1ou plus: Leishmaniose par exemple) III. Biologie et Diversité des Métazoaires A. Les Invertébrés 1. Spongiaires et Cnidaires: plan d organisation - diversité- intérêts économique et écologique (exploitation et valorisation) 2. Les vers: Plathelminthes- Némathelminthes Annélides: plan d organisation- diversité- intérêts médical (étude de cycles biologiques parasitaires), écologique et biologique 3. Les Mollusques: - Classification et Diversité - Intérêts écologique et économique (espèces comestibles: exploitation et valorisation) 4. Les Arthropodes: - Classification et Diversité. - Intérêts médical, agronomique, écologique, économique : espèces utiles- nuisibles venimeuses, bio indicateurs ) 5. Les Echinodermes: présentation générale et intérêt biologique B. Les Vertébrés 1. Particularités morphologiques et biologiques 2. Diversité (Poissons Amphibiens Reptiles Oiseaux- Mammifères) 3. Intérêt biologique, écologique et économique LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 32

33 TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES 1. Etude des Protozoaires (Amibe Trypanosome- Paramécie) des Spongiaires et des Cnidaires (comparaison et reconnaissance de quelques taxons des côtes tunisiennes) II. Etude des Vers Comparer Trématodes Cestodes- Nématodes et Annélides Reconnaissance des principaux taxons (Douve- Ténia- Ascaris- Ver de terre ) III. Etude des Mollusques Diversité du groupe- Reconnaissance des espèces fréquentes, comestibles Dissection d un mollusque (escargot ou moule) IV. Etude des Arthropodes Diversité du groupe Reconnaissance: scorpions- myriapodes- araignées et tiquesinsectes à intérêt en agronomie ou autre Etude du criquet et de quelques larves d insectes V. Etude des Vertébrés I: Poissons Amphibiens et Reptiles Classification: poissons cartilagineux et poissons osseux Classification, diversité et reconnaissance des Amphibiens: grenouilles - crapauds et têtards Classification et reconnaissance des Reptiles: tortues- lézards- couleuvres et vipères VI. Etude des Vertébrés II: Oiseaux et Mammifères Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces d oiseaux Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces de Mammifères LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 33

34 Annexe 1 Unité d Enseignement DIVERSITE DU VIVANT Code UE : COURS 21H ECUE n 2 BIOLOGIE VEGETALE Code ECUE : I. Introduction: Importance du règne végétal dans la biosphère II. Les Grandes lignes de la classification et de diversité du règne végétal D. Les thallophytes (Algues- Champignons- Lichens). E. Les Cormophytes 1. Bryophytes (Mousses) 2. Ptéridophytes 3. Spermaphytes i. Gymnospermes (Ex. Pin) ii. Angiospermes (mono- et Dicotylédones) III. Etude des Angiospermes A. Les caractéristiques propres à la cellule végétale B. Les Tissus végétaux, notamment les méristèmes primaires et secondaires C. L appareil végétatif (tige- feuille- racine) et adaptations fonctionnelles D. La multiplication végétative E. L appareil reproducteur et biologie de la reproduction sexuée TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES (Intégrés) I. Cellule végétale et tissus végétaux II. Appareil végétatif (morphologie) III. Appareil végétatif (anatomie) IV. Fleur et inflorescence: biologie florale V. Fruits et graines VI. Multiplication végétative naturelle et artificielle LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 34

35 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE CHIMIE Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences et Mention : Biotechnologies et autres Technologie mentions des sciences du vivant. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la S1 mention LF Parcours : 4- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Chimie générale : Connaître la structure des atomes, des liaisons chimiques ainsi que la thermodynamique chimique afin de comprendre la stabilité et les transformations des produits. Chimie organique : connaître les principales fonctions chimiques ainsi que leurs caractéristiques. 5- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) - Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Chimie générale 1h30 0H30 0H Chimie organique 1h30 0H30 0H45 3 Total 3H 1H 1H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets laboratoire Stages Autres (terrain) Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 35

36 Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Chimie générale : Atomistique et liaison chimique, thermodynamique chimique et cinétique chimique 2- Chimie organique : Analyse élémentaire de composés organiques, propriétés chimiques des hydrocarbures, Propriétés des alcools, les amines, les dérivés carbonylés, les acides et leurs dérivés 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1-Chimie générale: Dosages volumétriques (méthodes de calcul, Préparation de solution titrée, Acidimétrie, Manganimétrie, Iodométrie, Argentimétrie 2-Chimie organique : Extraction de produits organiques, Synthèse d acide salicylique, Identification par chromatographie. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE 1-Chimie générale 2- Chimie organique TOTAL Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Coef. de Pondéra Pondéra Autre TP et l ECUE Ecrit TP -tion Ecrit Oral -tion s Autres 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours 10% 10% 10% Validation des stages et des projets..... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 3

37 Annexe 1 Unité d Enseignement CHIMIE 1 Code UE : COURS 21 H ECUE n 1 CHIMIE GENERALE Code ECUE : I. Atomistique et liaison chimique - Structure des atomes - Classification périodique des éléments - Liaison chimique - Théorie L.C.A.O. - Hybridation sp 3, sp 2, sp de l atome de carbone II. Thermodynamique chimique - Système - Variable et fonction d état - Transfert - Réactions réversibles ou irréversibles - Le premier principe : Transfert de travail et transfert de chaleur - Condition d équilibre - Le deuxième principe : énoncé, expression et fonction thermodynamique - Loi d action de masse, constante d équilibre - Calcul du PH des solutions aqueuses - Etude expérimentale des vitesses de réaction : Réaction d ordre 1et 2 III. Cinétique chimique - Effet de la température sur la vitesse de réaction - Formule d ARRHENIUS - Notion de catalyseur TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES Objectifs : Maîtriser et connaître différents dosages avec des applications concrètes sur les dosages volumétriques 1. Méthode de calcul 2. Préparation de solutions titrées Acide/base, permanganate de potassium, iode, nitrate d argent 3. Acidimétrie Dosage des sulfites, de l acidité du vin ou des jus, de l acidité de la matière grasse 4. Manganimétrie Dosage direct de l acide oxalique et dosage indirect des sucres réducteurs 5. Iodométrie Degré colorimétrique de l eau de Javel et Indice d Iode de la matière grasse. Argentimétrie Méthode de Mohr LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 37

38 Annexe 1 Unité d Enseignement CHIMIE 1 Code UE : ECUE n 2 CHIMIE ORGANIQUE Code ECUE : COURS 21 H I. Analyse élémentaire d un composé organique - Formule brute - Formule composée II. Représentation spatiale d un carbone saturé - Représentation de CRAM - Projection de FISHER et de NEWMAN III. Propriétés chimiques des Hydrocarbures - Alcanes - Alcènes - Alcynes IV. Propriétés des alcools V. Les amines VI. Les dérivés carbonylés - Aldéhydes - Cétones VII. Les acides et leurs dérivés TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES Extraction de produits organiques : Liquide/Liquide Synthèse d acide salicylique Identification par chromatographie en couche mince LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 38

39 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE BIOLOGIE CELLULAIRE ET GENETIQUE Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences et Mention : Biotechnologies et autres Technologie mentions des sciences du vivant Diplôme et Parcours LA Biotechnologies. Parcours : tous les parcours de la Semestre S1 mention LF Parcours : 1- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Permettre à l étudiant d acquérir une formation de base sur la structure des cellules vivantes, les divisions cellulaires (méïose et mitose), l analyse de la transmission des gènes chez les Procaryotes et les Eucaryotes. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Biologie cellulaire 1h30 0h30 0H Génétique 1h30 0h45 0H30 3 Total 3H 1h15 1h Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux au laboratoire Durée Projets Stages Autres Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 39

40 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Biologie cellulaire : Introduction, membrane plasmique, cytosol, organites, noyau et divisions cellulaires 2- Génétique : Introduction, génétique des procaryotes, génétique des eucaryotes, complémentation fonctionnelle, génétique extrachromosomique Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Biologie cellulaire : Techniques d étude de la cellule,observation des cellules et des organites, mitose, méïose 2-Génétique : Transformation bactérienne, croisements chez les champignons, croisements chez la Drosophile. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) Utilisation de préparation microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Ouvrages de référence : - La Cellule de PRESCOTT - Introduction à l analyse génétique de GRIFFITHS et Collaborateurs de BOECK -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra TP et Ecrit TP Autre -tion Ecrit Oral Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 1-Biologie Cellulaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Génétique 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours Total 10% 10% 10% 50% 20% LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 40

41 .3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 41

42 COURS 21H I. Introduction Annexe 1 Unité d Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE Code UE : ECUE n 1 BIOLOGIE CELLULAIRE Code ECUE : A. Propriétés communes à toutes les cellules vivantes B. Structure cellulaire et structure acellulaires (Virus) C. Cellule Procaryotes et cellules Eucaryotes D. Diversité des cellules eucaryotes: cellule végétale- cellule animale- cellules des champignons II. Etude de la membrane plasmique F. Structure et organisation moléculaire G. Rôle physiologique de la membrane B1. Transport de substances B2. Transfert de l information H. Différenciation morpho-fonctionnelle de la Membrane III. Le Cytosol IV. Les organites A. Ribosomes B. Réticulum endoplasmique C. Appareil de Golgi D. Lysosomes E. Mitochondries F. Peroxysomes et glyoxysomes G. Chloroplastes H. Cytosquelette I. Noyau V. Division Cellulaire A. Mitose B. Méiose TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES I. Techniques d étude de la cellule Avec exercices d application et observation et étude de cellules II Etude et observation des organites II. Mitose III. Méiose LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 42

43 COURS 21H Annexe 1 Unité d Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE Code UE : ECUE n 2 GENETIQUE Code ECUE : I. Introduction à la Génétique A. Rappels de la Mitose et de la Méiose B. Notions de caractères gènes allèles - mutations II. Analyse génétique des Procaryotes III. Analyse génétique des Eucaryotes I. Cas des Haploïdes J. Cas des Diploïdes On traitera la transmission des caractères contrôlés par: 1. un couple d allèles 2. deux ou plusieurs couples d allèles. III. Notions préliminaires de génétiques extra-chromosomique TRAVAUX DIRIGES & TRAVAUX PRATIQUES 1. Transformation bactérienne 2. Réalisation et étude des croisements chez les champignons 3. Analyse et croisements chez la drosophile Des séries d exercices seront proposées parallèlement aux étudiants comme complément du cours. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 43

44 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE MATHEMATIQUES ET PHYSIQUE Université :. Etablissement : Domaine de la formation : Sciences et Mention : Biotechnologies et autres Technologie mentions des sciences du vivant Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la S1 mention LF Parcours : 3- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Mathématiques appliquées : Permettre à l étudiant en biologie d acquérir l essentiel des outils et des techniques mathématiques et statistiques pour savoir traduire et modéliser certains problèmes issus de la Biologie Physique 1 : Permettre à l étudiant en biologie de comprendre les phénomènes physiques liés au vivant et les principes physiques de fonctionnement des équipements utilisés dans l observation et l étude des cellules, des molécules et des organismes 4- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Mathématiques appliquées 1H30 1H 3 2-Physique 1 1H30 0H45 0H45 3 Total 3H 1H45 0H Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Activités pratiques Durée de l UE Travaux au Projets Stages Autres Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 44

45 laboratoire 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Mathématiques appliquées : Fonction numériques d une variable réelle, Equations différentielles, Fonctions à plusieurs variables, Calcul matriciel et système d équations linéaires, Probabilités élémentaires, Statistique. 2- Physique 1 : Mécanique, Electricité et électronique, Optique géométrique, mécanique des fluides Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) Mathématiques appliqués : Pour les applications, l accent sera mis sur des exemples simples relevés en biologie Physique 1 : 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examens finaux de l UE.2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra TP et Ecrit TP Autre -tion Ecrit Oral Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 1-Maths appliquées 10% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Physique 1 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours Total 15% 5% 10% 50% 20%1 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 45

46 .3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 4

47 Annexe 1 Unité d Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE Code UE : ECUE n 1 MATHEMATIQUES APPLIQUEES Code ECUE : COURS 21H Recommandations : L accent sera mis sur les concepts de base sans trop s attarder sur les démonstrations Fonctions numériques d une variable réelle - Rappels : domaine de définition, opérations sur les fonctions (fonctions puissances, polynomiales, rationnelles, trigonométriques, exponentielle et logarithme) - Dérivabilité. Formule de Taylor (à l ordre 2 ou 3), développements, limites, calculs approchés, exemples et applications - Représentations graphiques - Primitives et intégrales : définitions, méthodes de calculs (changement de variables et intégration par parties) Equations différentielles - Définitions et exemples - Equations différentielles linéaires du premier ordre. Méthodes de résolution. Applications - Equation différentielles linéaires du second ordre à coefficients constants. Méthodes de résolution. Applications Fonctions à plusieurs variables - Définitions et exemples (on se limitera à 2 variables) - Dérivées partielles, recherche d extremum d une fonction, gradient et applications. Calcul matriciel et systèmes d équations linéaires - Définition d une matrice, opération sur les matrices, inversion d une matrice carrée - Applications : résolution de systèmes linéaires Probabilités élémentaires - Introduction à l analyse combinatoire - Espaces de probabilités : illustration par des exemples simples - Probabilités conditionnelles et évènements indépendants - Variables aléatoires discrètes et lois de probabilités usuelles Statistique - Echantillonnage statistique. Représentation de données : séries statistiques, tableaux statistiques - Estimation : définition et propriétés d un estimateur, estimation ponctuelle et par intervalle - Tests de signification : procédure générale, niveau de signification d un test, test de comparaison LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 47

48 - Test d adéquation du Khi-deux. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 48

49 Annexe 1 Unité d Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE Code UE : COURS 21H ECUE n 2 PHYSIQUE 1 Code ECUE : Mécanique - Cinématique du point : référentiels, trajectoire, vitesse, accélération, relativité du mouvement - Dynamique : notions de forces, principes de la dynamique, travail et énergie, lois de conservation, chocs, oscillateur harmonique. Electricité et électronique - Loi de Coulomb, champ potentiel électrostatique - Moment dipolaire - Action d un champ extérieur - Eléments de magnétostatique - Notions sur les fonctions de l électronique Optique géométrique - Lois de Snell-Descartes, systèmes plans, systèmes sphériques - Lentilles, applications : l œil, la loupe, le microscope Mécanique des fluides - Hydrostatique : pression, statique des fluides, théorème d Archimède, tension superficielle - Hydrodynamique : différents types d écoulement, théorème de Bernouilli et applications - Viscosité d un fluide - Phénomène de diffusion, loi de Fick. TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES 21H LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 49

50 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Biochimie structurale et Techniques d Analyses Physicochimiques Nombre de crédits Code UE. Université : Etablissement :.. Domaine de la formation Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies et autres mentions des Sciences du vivant Diplôme et Parcours Semestre LA Toutes les licences habilitées en Sciences du vivant... Parcours :.. LF..Parcours : 1- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Permettre aux étudiants d acquérir les formations de base sur les structures des biomolécules ; leurs propriétés physicochimiques ainsi que des techniques de caractérisation et d analyse 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Chimie ; physique et Biologie cellulaire 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Biochimie structurale 1H30 0H30 1H 3 2- Techniques d analyse 1H 0H30 1H 3 Total 2H30 1H 2H 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux sur terrain Durée Projets Stages Autres Crédits Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 50

51 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Propriétés et étude structurale des glucides, des lipides, des protéines et des acides nucléiques. 2- Méthodes d extraction, de séparation, d identification et de dosage des molécules biologiques : méthodes spectroscopiques, chromatographiques, électrophorétiques et radioisotopiques Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l occasion d une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) A préciser par les institutions -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Mixte..2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne ECUE 1-Biochimie structurale 2- Techniques d analyses Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra -tion Ecrit Oral Ecrit TP Autre TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 51

52 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 52

53 Annexe 1 Unité d Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE ET TECHNIQUES D ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES Code UE : ECUE n 1 BIOCHIMIE STRUCTURALE Code ECUE : 1H30 Cours, 0H30 TD et 1H TP Plan du Cours Objectifs : Renforcer les connaissances de Base des étudiants sur les structures des molécules biologiques ainsi que sur leurs principales caractéristiques. I- Introduction générale II- Les glucides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation III- Les lipides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation IV- Les acides aminés et les protéines - Les acides aminés * Structure, composition et classification * Propriétés physicochimiques *Identification, dosage et utilisation - Les protéines * Structures, composition et fonction * Propriétés physicochimiques * Méthodes d analyse V- Les nucléotides et acides nucléiques - Structure des nucléotides - Structure des acides nucléiques - Propriétés physicochimiques des nucléotides et des acides nucléiques - Identification et dosage des nucléotides et des acides nucléiques. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 53

54 Unité d Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE ET TECHNIQUES D ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES Code UE : ECUE n 2 TECHNIQUES D ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES DES BIOMOLECULES Code ECUE : 1H Cours, 0H30 TD et 1H TP Objectifs : Concrétiser les connaissances théoriques de base des étudiants dans le domaine de la Biochimie en leur présentant les techniques d extraction, de séparation, d identification et de dosage des molécules biologiques. Plan du Cours I- Méthodes d extraction, de préparation et de fractionnement - Prélèvement - Conservation (congélation et lyophilisation) - Précipitation, dialyse et filtration - Centrifugation et ultracentrifugation II- Méthodes spectroscopiques - Spectre de lumière (UV, visible, IR) - Colorimétrie et spectrophotométrie - Principe de la fluorimétrie III- Méthodes chromatographiques - Principe de la chromatographie - Les différents types de chromatographie IV- Méthodes électrophorétiques - Principe de l électrophorèse - Les différents types d électrophorèse - Les différentes méthodes de révélation V- Méthodes isotopiques - Principe de l utilisation des radio-isotopes - Utilisation et mesure de la radioactivité - Radio-protection. Enseignements pratiques Objectifs spécifiques des TP: Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l occasion d une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 54

55 Contenus des programmes de L 2 (S3 et S4) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 55

56 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Enzymologie et Génie enzymatique, Génie de Procédés Nombre des crédits :... Code UE :... Université :... Etablissement :... Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et parcours Semestre LA : Licence Appliquée Parcours : Tous les Parcours de la Mention Biotechnologie S3 LF Parcours : 1- Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) En ECUE enzymologie et génie enzymatique, l étudiant devra acquérir les connaissances élémentaires concernant les enzymes, les propriétés des réactions enzymatiques dans le cas la cinétique Michaelienne. Il devra aussi être capable de déterminer leurs paramètres cinétiques en présence ou en absence des effecteurs biologiques et physiques de la réaction enzymatique. Cet enseignement aura aussi pour objectif de faire connaître les méthodes de préparation et d immobilisation des enzymes pour pouvoir les utiliser en biotechnologie. L objectif du cours de génie des procédés est de concevoir, calculer et faire fonctionner à l échelle pilote, l appareillage dans lequel s effectuent des transformations physiques, chimiques ou biologiques. en utilisant un ensemble d opérations et permettant de préparer un (ou des) produit(s) à partir de matières disponibles. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Chimie Générale, Chimie Organique, Biochimie Structurale, Math et Physique 3- Elément constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Enzymologie et Génie Enzymatique 1h30 0h30 0h Génie des Procédés 1h30 0h45 0h30 3 Total 3 h 1.15 h 1.15 h 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux sur de l UE Projets Stages Autres terrain Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 5

57 Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Catalyse chimique et enzymatique, Cinétique Michaelienne, constantes cinétiques, dosages enzymatiques, effecteurs enzymatiques, immobilisation des enzymes. 2- Transfert de quantité de mouvement, transfert de matière, transfert de chaleur Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objectifs, des contenus des procédures d organisation de chaque activité) 1- Acquérir une formation pratique en enzymologie et génie enzymatique de base indispensable en biotechnologie : - maîtriser les conditions expérimentales permettant d optimiser une réaction enzymatique et déterminer les paramètres cinétiques de l enzyme. - maîtriser les conditions d immobilisation d une enzyme 2- Acquérir une formation pratique dans les méthodes de mesure (pression, viscosité, écoulement, pertes de charge ). 5- Méthodes pédagogiques moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC possibilités d enseignement à distance ) Rétroprojecteur, Data show soutenus par des supports de cours, pas de possibilités d enseignement à distance. Ouvrages : 1- Biochimie Générale (Jacques-Henry Weil) 10 ème édition DUNOD (par exemple) 2- Génie enzymatique, 1998, Loncle et Daniel, Edition : DOIN 3- Génie des procédés : principes fondamentaux du génie des procédés et de la technologie chimique, Henri Fauduet, Lavoisier 4- Méthodes de Génie des procédés, avril 2004, Bergel, Hermes Sciences Publication 5- Le génie chimique à l usage du chimiste, Joseph Lieto, Lavoisier - Examen et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)... Régime mixte Validation de l UE (préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) ECUE Epreuves Ecrit TP Autres Epreuves Pondéra -tion Ecrit TP Autres Pondé ra -tion Coef. de l ECUE 1- Enzymologie et Génie Enzymatique 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 2- Génie des Procédés 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20%.3- Validation des stages et des projets.. Coef. de l UE au sein du parcours LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 57

58 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 58

59 Annexe I Unité d Enseignement : ENZYMOLOGIE ET GENIE ENZYMATIQUE, GENIE DE PROCEDES Code UE : ECUE 1 : ENZYMOLOGIE ET GENIE ENZYMATIQUE Code ECUE : Enzymologie (13h) I- Catalyse enzymatique (4h) - Définition - La catalyse enzymatique : état de transition et énergie d activation... - Spécificité enzymatique... - Les cofacteurs enzymatiques... - Classification des enzymes... II- Cinétique michaelienne (h) - Equation de Michaelis - Menten... - Les phases de la réaction enzymatique... - Détermination des constantes cinétiques Km et Vmax... - Etape limitante de la réaction et signification du Kcat, efficacité catalytique, unité enzymatique et activité spécifique - Détermination des constantes cinétiques à partir de représentations graphiques (Représentation de Lineweaver et Burk et Représentation d Eadie Hofstee et autres représentations graphiques) III- Effecteurs de réaction enzymatique (3h) - Les différents types d effecteurs de la réaction enzymatique - Les inhibiteurs (compétitifs, non compétitifs, incompétitifs) et détermination des paramètres cinétiques - Influence de la température et du ph Génie enzymatique (8h) I - Nature et origine des enzymes II - Les préparations industrielles des enzymes III - Les méthodes d immobilisation des enzymes Méthode physique : immobilisation par adsorption Méthode chimique : immobilisation par fixation covalente sur un support. IV - Les applications en biotechnologie (exemples) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 59

60 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 0

61 Unité d Enseignement : Enzymologie et Génie enzymatique, Génie de Procédés Code UE : ECUE 2 : Génie des procédés Code ECUE : Objectifs : Les objectifs de cet enseignement sont de - faire comprendre les mécanismes d écoulement des fluides, les lois de la diffusion de la matière et de la chaleur ainsi que les mécanismes de transfert de matière et de chaleur entre phases. - faire apprendre à réaliser des mesures de températures et à établir des bilans. - former aux méthodes qui permettent de calculer ou simuler les échanges de chaleur Cours 21H Introduction sur le génie des procédés I- Transfert de quantité de mouvement (Mécanique des fluides) - Notions générales - Fluides au repos : modèle continu, fluides compressibles et incompressibles, statique des fluides. Cinématique : champs de vitesse, lignes et tubes de courant, conservation de la masse. - Bilans de quantité de mouvement et d'énergie, relation de Bernoulli. - Écoulements laminaires et turbulents : expérience de Reynolds, nombre de Reynolds, couche limite laminaire, écoulements turbulents en conduite. - Mesure des débits : diaphragme venturi- rotamètre - compteur - normalisation AFNOR. - Perte de charge par frottement et perte de charge singulière. - Puissance à mettre en œuvre pour faire circuler un fluide dans une installation donnée. - Organes de circulation : o Pompes centrifuges : NPSH et rendement o Pompes volumétriques. II- Transfert de matière - Introduction sur les phénomènes de transfert de matière - Nomenclature des systèmes diffusionnismes - Diffusion moléculaire - équations constitutive et générale : Expression de la loi de Fick, coefficient de diffusion. - Diffusion en régime stationnaire : fluides au repos, diffusion en régime laminaire et diffusion dans les solides. - Diffusion en régime non stationnaire - Coefficients de transfert et leur obtention - Transfert de matière entre phases : théorie du film, de la pénétration et du renouvellement de la surface. - Notions communes aux échangeurs de matière. III- Transfert de chaleur - Les bases : Mesure de température ; Bilans d'énergie ; Coefficients locaux d'échanges ; Notions de résistance thermique ; Coefficient global d'échange - Les mécanismes : Conduction ; application au calorifugeage ; Rayonnement ; applications : pertes thermiques, erreurs concernant la mesure de la température d'un gaz ; Convection forcée et convection libre ; Calcul des coefficients d'échange LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 1

62 - Technologie : Echangeurs de chaleur ; Différence de température moyenne ; Mise en oeuvre de la méthode des unités de transfert ; Méthodes de calculs des appareils d échange thermique - Etudes d'échangeurs, détermination de coefficients d'échange, simulation de fonctionnement... TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES Illustrations et démonstrations pratiques : Unités et dimensions utilisées en mécanique des fluides. Mesure de la pression : les manomètres Mesure des viscosités. Régimes d'écoulement. Débitmètres. Mesure des pertes de charge par frottement et singulières. Caractéristiques d'une pompe centrifuge. Calcul d un circuit hydraulique LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 2

63 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIE ANIMALES Nombre de crédits Code UE. Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la S3. mention.. LF..Parcours : 1- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Physiologie animale : Faire acquérir des connaissances de base sur quelques aspects de la physiologie animale en tant que spécialité carrefour qui considère l être vivant dans son ensemble, intégrant les aspects moléculaires, cellulaires et fonctionnels, en relation avec les autres disciplines biologiques, avec pour finalité une meilleure compréhension des processus vitaux. Biotechnologie animale : Faire acquérir les notions de biologie de la reproduction et d embryologie, de reproduction assistée et initier à la culture et la manipulation de cellules animales ainsi qu à la transgenèse animale. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Biologie cellulaire, biochimie, biologie animale, génétique, microbiologie, biologie moléculaire 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits Physiologie animale 1H30 0H30 1H 3 Biotechnologie animale 1H30-1H 3 TOTAL 3H 0H30 2H 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Crédits 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 3

64 Physiologie animale : Milieu intérieur, régulation physiologique, mécanismes nerveux, mécanismes endocriniens, l axe hypothalamohypophysaire. Biotechnologie animale: Biologie de la reproduction, embryologie, culture de cellules animales, hybridation cellulaire, croissance et différenciation in vitro, reproduction assistée, transgenèse animale Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) Physiologie animale : Potentiels d action, contraction du muscle squelettique et cardiaque, contraction du muscle lisse, régulation hormonale, groupes sanguins et hémostase, expérimentations assistées par ordinateur (EXAO) Biotechnologie animale: Culture cellulaire, fusion cellulaire, insémination artificielle, fécondation in vitro, transfert et congélation d embryons, greffe de moelle osseuse Visites de laboratoires et de centres spécialisés 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux.2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) Epreuves Epreuves Pondéra Ecrit TP Autres -tion Ecrit TP Autres Pondér a -tion Coef. de l ECUE 1- Physiologie animale 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 1- Biotechnologies animales 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 4

65 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 5

66 LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE Annexe I Unité d Enseignement : PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES ANIMALES COURS : 21 H Code UE : ECUE 1 : PHYSIOLOGIE ANIMALE Code ECUE : I- LE MILIEU INTERIEUR - Les compartiments liquidiens de l'organisme - Notions d hématologie (Sang, hématopoïèse et Hémostase) - Equilibre acido-basique - Notion d homéostasie II- LA REGULATION PHYSIOLOGIQUE A- MECANISMES NERVEUX - Propriétés physiologiques des cellules nerveuses et musculaires : Excitabilité, transport et transduction de signaux - Transmission de l influx nerveux : transmission synaptique, neuro-médiation et neuro-modulation - Action physiologique du système nerveux autonome, cas de la médullo -surrénale B- MECANISMES ENDOCRINIENS - Biosynthèse et sécrétion des hormones - Mécanismes de l action hormonale : les hormones comme molécules informatives des systèmes endocrine et paracrine - Transduction de signaux hormonaux - Régulation hormonale - Bases de l exploration endocrinienne C- L AXE HYPOTHALAMO-HYPOPHYSAIRE ENSEIGNEMENTS PRATIQUES ET DIRIGES Les enseignements pratiques porteront sur l étude - des potentiels d action - de la contraction du muscle squelettique et cardiaque - de la contraction du muscle lisse LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES

67 - de la régulation hormonale - des groupes sanguins et de l hémostase Prévoir des expérimentations assistées par ordinateur (EXAO) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 7

68 Unité d Enseignement : PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES ANIMALES Code UE : ECUE 2 : BIOTECHNOLOGIES ANIMALES Code ECUE : COURS : 21 HEURES I- Notions de Biologie de la reproduction et d embryologie II- Culture de cellules animales: lignées établies et clones cellulaires, cellules souches III- Hybridation cellulaire IV- Croissance et différenciation in vitro V- Reproduction assistée : insémination artificielle, fécondation in vitro, conservation et transfert d embryon, clonage. VI- Transgenèse animale TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES - Culture cellulaire - Fusion cellulaire - Insémination artificielle - Fécondation in vitro - Transfert et congélation d embryons - Greffe de moelle osseuse Visites de laboratoires et de centres spécialisés. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 8

69 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Génétique moléculaire et Génie génétique Nombre de crédits : Code UE : Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : Semestre LA Biotechnologies Parcours Tous les parcours S3 LF Parcours 1- Objectifs de l UE (savoirs aptitudes et compétences) Permettre à l étudiant de connaître et comprendre les concepts et méthodes théoriques et pratiques en génétique moléculaire et en génie génétique. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Génétique, Biologie moléculaire 3- Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits 1- Génétique moléculaire 1H30 0H45 0H Génie génétique 1H30 0H30 0H45 3 Total 3H 1H15 1H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ) Durée Activités pratiques de l UE Travaux au laboratoire Projets Stages Autres Crédits 4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Génétique moléculaire : Rappels, Test de complémentation fonctionnelle, Les mutations géniques, Les gènes mutateurs et anti-mutateurs, Les mutations et le code génétique, Mutations et épissage des ARN, Les suppresseurs, Régulation de l expression des gènes, LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 9

70 génétique inverse. 2- Génie génétique : Les outils du génie génétique (définition et outils de base), les techniques de base en génie génétique (préparation des acides nucléiques, techniques de séparation, clonage moléculaire, ) 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objectifs des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Génétique moléculaire : Test de croissance et de complémentation fonctionnelle, Recherche et sélection de mutants chez les bactéries et/ou les phages, Détection de mutations par des techniques moléculaires 2- Génie Génétique : Purification, séparation et/ou amplification des acides nucléiques, Etablissement de banques d ADN (digestion, ligation, préparation de plasmides recombinants, transformation, sélection de clones recombinants), Hybridation ADN/ADN, Criblage de banques d ADN, Analyse et établissement de cartes de restriction 5- Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC, possibilités d enseignement à distance ) - Examens et évaluation des connaissances.1- Méthodes d évaluation et régime des examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux.2- Validation de l UE (préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) ECUE Epreuves Ecrit TP Autres Epreuves Pondéra -tion Ecrit TP Autres Pondér a -tion Coef. de l ECUE 1- Génétique Moléculaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 2- Génie Génétique 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 70

71 Annexe I Unité d Enseignement : GENETIQUE MOLECULAIRE ET GENIE GENETIQUE Code UE : ECUE 1: GENETIQUE MOLECULAIRE Code ECUE : Cours 21 H I- Rappels sur la nature, structure, organisation et fonctionnement du matériel génétique II- Test de complémentation fonctionnelle Principe et application in vivo Application in vitro III- Les mutations géniques Définition Classes de mutation Agents mutagènes et mode d action Gènes mutateurs et gènes anti-mutateurs IV- Utilisation des mutations pour la détection du code génétique in vivo V- Mutation agissant sur l épissage des ARN chez les eucaryotes VI- Les suppresseurs Définition Classes de suppresseurs et mode d action VII- Régulation de l expression des gènes VIII- Notion de génétique inverse TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES - Test de croissance et de complémentation fonctionnelle - Recherche et sélection de mutants chez les bactéries et/ou les phages - Détection de mutations par des techniques moléculaires LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 71

72 Unité d Enseignement : GENETIQUE MOLECULAIRE ET GENIE GENETIQUE Cours 21 H Code UE : ECUE 2: GENIE GENETIQUE Code ECUE : I- Les outils du génie génétique 1- Définition du génie génétique 2- Les outils de base du génie génétique 2.1- Les enzymes agissant sur les acides nucléiques Les enzymes de restriction Les outils enzymatiques autres que les enzymes de restriction 2.2- Les vecteurs Généralités Les plasmides Les phages Les cosmides Les vecteurs eucaryotes Autres types de vecteurs : BAC, PAC, YAC, Les vecteurs navettes Les vecteurs d expression II- Techniques de base en génie génétique 1- Préparation des acides nucléiques 1.1- Extraction et purification 1.2- Estimation des quantités d ADN 1.3- Conservation de l ADN 2- Rappel des techniques de séparation des acides nucléiques 2.1- Electrophorèse 2.2- Centrifugation 3- Clonage moléculaire 3.1- Principe et stratégies de clonage moléculaire 3.2- Les banques d ADN 4- Détection et caractérisation des acides nucléiques 4.1- Hybridation moléculaire 4.2- Séquençage de l ADN 5- Amplification, modification des acides nucléiques 5.1- Amplification enzymatique de l ADN 5.2- La mutagenèse - Autres techniques.1- Cartographie à la nucléase S1.2- Polymorphisme de la taille des fragments de restriction (RFLP).3- Amplification aléatoire de l ADN polymorphe (RAPD) TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES - Purification, séparation et/ou amplification des acides nucléiques LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 72

73 - Etablissement de banques d ADN (digestion, ligation, préparation de plasmides recombinants, transformation, sélection de clones recombinants) - Hybridation ADN/ADN, Criblage de banques d ADN - Analyse et établissement de cartes de restriction LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 73

74 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Physiologie et Biotechnologie Végétales Nombre de crédits : Code UE : Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : Semestre L.A. Biotechnologies Parcours: Tous les parcours de la mention S4 LF Parcours 1- Objectifs de l UE (savoirs aptitudes et compétences) Permettre à l étudiant d acquérir une formation de base sur - les mécanismes fondamentaux régissant la croissance et la différenciation chez les végétaux vasculaires - la culture in vitro des tissus végétaux et leur utilisation dans les différents domaines de la production végétale, la micropropagation et l'amélioration des plantes - la modification des génomes par fusion somatique ou par transfert dirigé de gènes d'intérêt pour des applications en agriculture, agro-alimentaire, pharmacie et environnement 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Biologie végétale, Biologie cellulaire et moléculaire, microbiologie, génétique et biochimie 3- Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits 1- Physiologie Végétale 1H30 0H15 1H Biotechnologie Végétale 1H30 0H30 0H45 3 Total 3H 0H45 1H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ) Activités pratiques de l UE Travaux au laboratoire Durée Projets Stages Autres Crédit Total LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 74

75 4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1-Physiologie Végétale: relations hydriques et nutrition minérale; photosynthèse; régulateurs de croissance, dormance et physiologie de la floraison. 2- Biotechnologie végétale: culture de tissus végétaux et de cellules végétales in vitro et micropropagation; modification du génome et amélioration des plantes Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objectifs des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Physiologie végétale: Physiologie de la germination ; activités photosynthétique et respiratoire ; dosage de l'azote protéique. 2- Biotechnologie végétale : Confection de milieu de culture et repiquage ; culture de méristème ; haplodiplométhodes; transformations moléculaires et visite de centres spécialisés 5- Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC, possibilités d enseignement à distance ) - Présentation de documents audiovisuels et EXAO - Ouvrages de référence suggérés : * Physiologie végétale : nutrition et métabolisme, par Paul MAZLIAK, éd. Dunod * L'expérimentation en physiologie végétale, par Roger PRAT, éd. Hermann * La culture in vitro et ses applications horticoles, par R.Augé et al. éd. Lavoisier * Amélioration des plantes et biotechnologies, par Y. Demarly et M.Sibi - Examens et évaluation des connaissances.1- Méthodes d évaluation et régime des examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux.2- Validation de l UE (préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). Contrôle continu ( 30 % ) Examen final (70% ) Epreuves Pondératio Epreuves Pondératio ECUE 1- Physiologie végétale 2- Biotechno logie végétale Ecri t Autr es 5 % 5% 5% 5% TP 5 % 5 % Ecri t Oral TP Coef. de l ECUE 5 0 % 25% 10% 50% 3 50% 25% 10% 50% 3 Coef de l UE au sein du Parcour s LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 75

76 .3- Validation des stages et des projets LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 7

77 LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE UNITE D ENSEIGNEMENT DE PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIE VEGETALES L2/S4 ECUE Physiologie Végétale Cours (21H) : 1- Relations hydriques et nutrition minérale 2- Photosynthèse et respiration 3- Régulateurs de croissance 4- Dormance 5- Floraison Travaux pratiques et dirigés (18H): Graines et germination Croissance végétale Photosynthèse Respiration Dosage de l azote protéique Favoriser l expérimentation assistée par ordinateur. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 77

78 LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE UNITE D ENSEIGNEMENT DE PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIE VEGETALES L2/S4 ECUE Biotechnologies végétales Cours (21H) : I- Multiplication végétative in vitro : 1- Technologie de la culture in vitro 2- Micropropagation : culture des méristèmes et assainissement, culture de bourgeons, organogenèse adventive et régénération 3- Embryogenèse somatique et semences artificielles 4- Culture de cellules isolées II- Modification du génome et amélioration des plantes : 1- Variabilité somaclonale et sélection in vitro 2- Haplodiploïdisation : androgenèse et gynogenèse 3- Hybridations interspécifiques et sauvetage d embryons 4- Culture et fusion des protoplastes 5- Génie génétique et transformation des végétaux : plantes transgéniques Travaux pratiques et dirigés (18H): Culture in vitro de méristèmes Androgenèse Culture de protoplastes Transformation génétique Favoriser les visites de laboratoires et de centres spécialisés. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 78

79 BIOETIQUE ET BIOSECURITE Objectifs : Sensibiliser les étudiants aux problèmes liés aux développements des technologies en Sciences du Vivant et leur impact sur la santé, la sécurité et l environnement, en identifiant les approches d évaluation de risque et en présentant les normes et les législations ainsi que les questions éthiques. Introduction Plan du cours I- Risques Biologiques et Biotechnologiques - Microorganismes pathogènes et armes biologiques - Substances toxiques et cancérigènes - Organismes génétiquement modifiés II- Concept de biosécurité - Principe de précaution - Méthodes d évaluation de risque - Normes de sécurité III- Problèmes éthiques et avancées technologiques - Expérimentation animale - Essais cliniques - Reproduction médicalement assistée - Clonage thérapeutique et reproductif - Génétique prédictive - Thérapie génique - Don d organes IV- Législation en Tunisie et conventions internationales LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 79

80 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE BIOCHIMIE METABOLQUE & MICROBIOLOGIE INDUSTRIELLE Nombre de crédits Code UE. Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention : Biotechnologies. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologies. Parcours : tous les parcours de la S4. mention.. LF..Parcours : 1- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) 1- Biochimie métabolique : Permettre à l étudiant d acquérir des connaissances sur les principales voies du métabolisme intermédiaire jusqu au cycle de l Urée, en faisant ressortir le bilan en ATP. Le métabolisme du glycogène est traité comme modèle de régulation hormonale. 2- Microbiologie industrielle : Présenter à l étudiant l intérêt et les sources de microorganismes industriels, leur multiplication, les méthodes de sélection et d amélioration ainsi que leurs applications potentielles dans les domaines de la santé, de l agroalimentaire et de l environnement. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Biochimie structurale - Chimie organique - Biologie cellulaire et génétique - Microbiologie et Biologie moléculaire. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Biochimie 1h30 0h30 0H45 3 métabolique 2- Microbiologie Indus. 1h30 1H15 3 Total 3H 0h30 2H 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 80

81 1 Total 1 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Biochimie Métabolique : Métabolisme des glucides, des lipides, des acides aminés, bilan énergétique et cycle de l urée. 2- Microbiologie Industrielle Les microorganismes industriels, Les voies métaboliques et leur régulation, Production des métabolites, Technologie de la fermentation 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) Biochimie métabolique Microbiologie industrielle: les TP intégrés doivent permettre la mise en évidence de certaines étapes des voies métaboliques étudiées chez des microorganismes industriels 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : - Contrôle continu - Examen final.2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE Ecrit Contrôle continu EPREUVES TP et Oral Autres Pondéra -tion Ecrit Oral Examen final EPREUVES TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 1-Biochimie métabolique 5 % 5% 5% 50 % 25% 10% 50% 3 2-Microbiologie industrielle 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets. Stage en entreprise ou visites d entreprises LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 81

82 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 82

83 Annexe 1 Unité d Enseignement Biochimie Métabolique et Microbiologie Industrielle Code UE : ECUE n 1 Biochimie Métabolique Code ECUE : Plan du Cours 21 h A- Métabolisme des Glucides 1- Catabolisme du glucose - Formation du Glu- - Phosphate (digestion, voie des pentoses phosphates, glycogénolyse) -la glycolyse (voie d Embden- Meyerrhoff-Parnas) -décarboxylation oxydative du pyruvate -bilan en NADH de la glycolyse (aérobie et anaérobie) 2 Cycle tricarboxylique - Entrée du pyruvate dans le cycle de l acide citrique - différentes étapes enzymatiques du cycle - bilan du cycle de Krebs : énergétique, pouvoir réducteur, métabolites intermédiaires - cycle de Krebs carrefour du métabolisme cellulaire 3- Cycle glyoxylique, néoglucogenèse 4- Métabolisme du glycogène et sa régulation B Métabolisme des lipides 1- Voies de dégradation des lipides et bilan énergétique 2- Voies de Biosynthèse des lipides C- Cycle de l Urée 1- Phases mitochondriale et cytosolique 2- bilan du cycle D- Métabolisme des acides aminés 1- voie de Biosynthèse des A.A 2- voie de Dégradation des A.A TP/TD 18h - Illustrations de certaines réactions des voies métaboliques étudiées et dosages de métabolites intermédiaires ( cholestérol, Glu--P, transamination etc.) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 83

84 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 84

85 ECUE n 2 MICROBIOLOGIE INDUSTRIELLE Code ECUE : Cours (21H) I) Les microorganismes industriels II) Les voies métaboliques et leur régulation 1) Cas de métabolites I aires (acides organiques, acides aminés, enzymes) 2) Cas de métabolites II aires (Antibiotiques, polysaccharides, biosurfactants ) III) Amélioration de la production des métabolites : 1) Par voie génétique : amélioration des souches 2) Par voie fermentaire en régulant les différents paramètres de culture (ph, température, aération, conduite etc ) IV) Technologie de fermentation : 1) Introduction 2) Cinétique de croissance microbienne 3) Les modes de conduites de fermentation (Fermentation en batch, en fed batch et en continu). 4) Bilan des fermentations (Rendement, productivité, taux de croissance, coefficient de transfert d oxygène etc.) 5) Opérations en aval des fermentations et récupération des métabolites (extraction, purification et concentration). Travaux pratiques (18H) 1) Présentation du fermenteur, préparation et stérilisation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 85

86 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Opérations Unitaires et Immunotechnologie Nombre de crédits : Code UE : Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : Semestre L.A. Biotechnologies Parcours: Tous les parcours de la mention S4 LF Parcours 4- Objectifs de l UE (savoirs aptitudes et compétences) Permettre à l étudiant d acquérir une formation sur - les opérations unitaires d un procédé de fabrication chimique/biologique allant de la matière première au conditionnement du produit fini : préparation, conditionnement et acheminement des matières premières, transformation des réactifs en produits, séparation, purification et conditionnement des produits - les techniques immunologiques utilisées dans un but de diagnostic d analyse, de production, de prévention et de traitement: Ces techniques sont basées sur l application de connaissances immunologiques fondamentales que l étudiant devra maîtriser 5- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Chimie, Génie des procédés, Biologie cellulaire et moléculaire, Microbiologie, Génétique et Biochimie, Génie génétique. - Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits 1- Opérations unitaires 1H30 0H45 0H Immunologie et Immunotechnologies 1H30 0H45 0H30 3 Total 3H 0H45 1H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ) Activités pratiques de l UE Travaux au laboratoire Durée Projets Stages Autres Crédit LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 8

87 Total 4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Opérations unitaires. Distillation, Séchage, Lyophilisation, Filtration, Décantation, Froid industriel. 2- Immunologie et immunotechnologie : Les fonctions du système immunitaire, les cellules et les organes de l immunité, les réponses immunes innée et adaptative, la réaction antigène anticorps, les techniques immunochimiques et cellulaires Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objectifs des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1-Opérations unitaires : Distillation eau/éthanol, Microfiltration et Ultrafiltration, Centrifugation et décantation, Cinétique de séchage. 2- Immunologie et immunotechnologie Purification d Immunoglobulines et d anticorps par chromatographie, ELISA, Immuno-empreinte, Immunohistochimie, Immunofluorescence, préparation d anticorps monoclonaux 5- Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC, possibilités d enseignement à distance ) - Présentation de documents audiovisuels et EXAO, visites d usines et de laboratoires - Examens et évaluation des connaissances.1- Méthodes d évaluation et régime des examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux.2- Validation de l UE (préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). Contrôle continu ( 30 % ) Examen final (70% ) Epreuves Pondératio Epreuves Pondératio ECUE Ecrit Autres TP Ecrit Oral TP Coef. de l ECUE Coef de l UE au sein du Parcours 1- Opérations unitaires 5 % 5% 5 % 50 % 25% 10% 50% 3 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 87

88 2- Immunologi e immunotech no-logie 5% 5% 5 % 50% 25% 10% 50% 3.3- Validation des stages et des projets LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 88

89 LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE UNITE D ENSEIGNEMENT OPERATION UNITAIRE ET IMMUNOTECHNOLOGIE L2/S4 ECUE Opérations Unitaires OBJECTIFS: Donner des connaissances permettant le dimensionnement des appareils industriels mettant en oeuvre: la distillation, la concentration, la filtration, le séchage. Cours (21H) : 1. Introduction aux opérations unitaires du génie des procédés 2. Etude de la distillation. - Principe de la distillation. - Unité de séparation FLASH - Distillation simple en fonctionnement continu, en Batch, Distillation Fractionnée - Mac Cabe et Thiele, Détermination du N.E.T. Méthode de Ponchon et Savarit - Distillation azéotropique 3. Lyophilisation -Principaux paramètres du cycle de lyophilisation - Automatisation d un proédé de lyophilisation - Lecture de graphiques de lyophilisation et interprétation - Méthode pour l établissement d une recette de lyophilisation - Problèmes particuliers de la lyophilisation: études de cas - Les appareils industriels -Systèmes de chargement et de déchargement des lyophilisateurs industriels 4. Séchage - Théorie du séchage: Terminologie du séchage; Mécanismes intervenant au cours du séchage (transferts de chaleur, courbe de séchage et modélisation); Principe de calcul des sécheurs - Description et dimensionnement des sécheurs de solides poreux ou divisés :Séchage à pression atmosphérique, Séchage sous vide partiel, Séchage à la vapeur d eau 5. Filtration et séparation sur membrane - Les lois de l écoulement en milieu poreux - Filtration sur support - Microfiltration tangentielle - Ultrafiltration. Décantation statique et centrifuge -Décantation sous l action de la pesanteur - Décantation centrifuge - Essorage centrifuge en continu et par établissement de cycles 7. Le froid industriel Travaux pratiques et dirigés (18H): LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 89

90 Distillation eau/ethanol Centrifugation et Taux de décantation Cinétique d un séchage d un solide Microfiltration et Ultrafiltration LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 90

91 LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE UNITE D ENSEIGNEMENT OPERATION UNITAIRE ET IMMUNOTECHNOLOGIE L2/S4 ECUE Immunologie et Immunotechnologie Cours (21H) : L utilisation des propriétés des réponses immunes, des anticorps et des techniques immunologiques dans divers domaines de recherche, de contrôle, d analyse biomédicale et de production doit apparaître à travers les exemples et les applications Introduction à l immunologie 1H - Notion d antigène - Rôles et propriétés du système immunitaire Les organes et les cellules de l immunité 7H - Les organes lymphoïdes : localisation, structure et fonction - Les différentes cellules immunitaires : morphologie, fonction, marqueurs de différenciation - La circulation des cellules de l immunité L immunité innée 2H - Les barrières naturelles - La réaction inflammatoire L immunité adaptative 7H - Propriétés : notion de spécificité, diversité et mémoire, application à la vaccination et la sérothérapie - Les étapes de la réponse : activation, prolifération, différenciation - L étape effectrice Les anticorps monoclonaux et recombinants 4H - Principe d obtention - Banques combinatoires d anticorps et banques de peptides - Application Travaux pratiques et dirigés (18H): - Structure et diversité des anticorps : purification des Ig et d anticorps par chromatographie - La réaction antigène anticorps et techniques d étude Notion d affinité, d avidité, de spécificité La précipitation Ag/AC LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 91

92 ELISA et Immunoempreinte - Immunohistochimie, Immunofluorescence, Cytométrie de flux - Préparation d anticorps monoclonaux LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 92

93 Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: Médicale) (S5) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 93

94 Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la santé Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies N Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) - Semestre 5 Unité d'enseignement Langue et communication Culture de l Entreprise Bioinformatique Biotechnologie des Macromolécules Biotechnologie cellulaire et applications Biotechnologie des Microorganismes appliquée au secteur Médical Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Elément constitutif Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et 2 2 X communication Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X Génomique et 1H30 1H30 0H45 3 X transcriptome Protéomique 1H30 1H30 0H45 3 X Cultures cellulaires et 1H30 1H15 3 X tissulaires Technologies cellulaires 1H30 1H15 3 X Identification et typages 1H30 1H15 3 X des bactéries et des virus Identification et typage 1H30 1H15 3 X des parasites et mycologie Pharmacologie 1H30 0H30 0H45 3 X moléculaire Toxicologie moléculaire 1H30 0H30 0H45 3 X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 94

95 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) Semestre N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cour s TD TP Cour s intég ré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE (le cas échéant UE ECUE (le cas échéan t UE Contrôle continu 1 Stage pratique UF Validation Régim e mixte LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 95

96 Contenus des programmes du Parcours Biotechnologie appliquée au secteur de la santé Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) Intitulé de l UE Biotechnologie Cellulaire et Applications Nombre de crédits Code UE. Université : Monastir... Etablissement : ISBM... Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention :.Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical S5 LF..Parcours : (L3) Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Acquérir les notions de bases de la culture cellulaire et tissulaire. Maîtriser les techniques liées à la culture cellulaire appliquées au secteur médical. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Immunologie- Microbiologie- physiologie. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Cultures cellulaires et tissulaires 1h30 1H Technologie 1h30 1H15 3 Cellulaire Total 3H 2H Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Total Crédits 1 1 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 9

97 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Culture Cellulaire et tissulaire : les différents types de culture. Techniques de culture. Cellules souches et culture en bio-réacteur. 2- Technologie cellulaire : diversité cellulaire et tissulaire. Observations, identification, analyses et applications dans le secteur médical Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Culture cellulaire et tissulaire: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d expérimentale de la culture cellulaire et tissulaire. 2-Technologie Cellulaire 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : - Contrôle continu - Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE 1- Culture cellulaire et Tissulaire 2- Technologie cellulaire Ecrit Contrôle continu EPREUVES TP et Oral Autres Pondéra -tion Ecrit Oral Examen final EPREUVES TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 97

98 Annexe 1 Unité d Enseignement : Biotechnologie Cellulaire et applications Code UE : ECUE n 1 : Cultures cellulaires et tissulaires Code ECUE : Plan du Cours : 21 h 1- Introduction à la culture cellulaire 2- les différents types de cultures cellulaires : - les cellules primaires - les lignées cellulaires 3- les besoins nutritifs : milieux de culture et additifs 4- le système de banques de cellules 5- Les techniques de culture des cellules - Congélation/décongélation - Détachement des cellules - Repiquage ou passage - Comptage des cellules, tests de prolifération et de viabilité - les cellules souches et différentiation cellulaire 7- techniques d études d adhésion cellulaire 8- La culture en bio réacteur (homogènes /hétérogènes) TP : - observations microscopiques ( cellules et tissus) - cultures cellulaires Annexe 2 Unité d Enseignement : Biotechnologie Cellulaire et applications Code UE : ECUE n 2 Technologies cellulaires Code ECUE : Plan du Cours : 21 h 1- Diversité tissulaire et cellulaire 2- Méthodologies : - techniques histologiques - Techniques cytogénétiques - Techniques immunohistochimiques LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 98

99 - Techniques électrophysiologiques - Techniques de conservation des cellules souches et des semences 3 Applications biotechnologiques (fécondation in vitro, reproduction in vitro, greffe, clonage ) TP : - réalisation et interprétation d un caryotype - test immunocytochimique LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 99

100 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE Pharmacologie -Toxicologie Université : Monastir... Etablissement : ISBM... Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention :.Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical S5 LF..Parcours : (L3) Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Acquérir les notions de bases de la pharmacologie et de toxicologie et comprendre les mécanismes gérant l action des molécules a intérêt thérapeutique où à effets toxiques sur l organisme humain et inversement. Acquérir le savoir faire pour identifier, doser et tester ces molécules. Avoir des connaissances sur les stratégies du développement d un médicament et les outils biotechnologiques utilisés. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Chimie organique -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Immunologie- Physiologie animale. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Pharmacologie 1h30 0h30 0H Toxicologie 1h30 0h30 0H45 3 Total 3H 1H 1H Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Crédits 1 1 Total LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 100

101 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Pharmacologie : Acquérir les notions de bases de la pharmacologie et comprendre les mécanismes gérant l action de molécules a intérêt thérapeutique sur l organisme humain. Acquérir des connaissances sur les stratégies du développement d un médicament et les outils technologiques utilisés. 2- Toxicologie 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Pharmacologie: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d expérimentation pharmacologique sur l animal. 2-Toxicologie : 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : - Contrôle continu.2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). Contrôle continu Examen final EPREUVES EPREUVES ECUE Pondéra Pondéra TP et TP et Ecrit Oral -tion Ecrit Oral -tion Autres Autres 1- Pharmaco 40 % 5 % 5 % 50% 3 2- Toxico 40 % 5 % 5 % 50% 3 TOTAL 80 % 10% 10% 100 % Coef. de l ECUE Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 101

102 Annexe 1 Unité d Enseignement : Pharmacologie - Toxicologie Code UE : ECUE n 1 Pharmacologie Code ECUE : Plan du Cours : 21 h Chapitre I : Pharmacologie Générale et stratégie du développement d un Médicament (3h) I- La Pharmacocinétique II- La Pharmacodynamie III- Phase de découverte de la molécule active (étude clinique) Chapitre II : Les Tests d activités (5h) I- Les tests d activités Analgésique II- Les tests d activités parasympatholytique III- Les tests d activités spasmolytique IV- Les tests d activités Anti-inflammatoire V- Les tests d activités diurétique VI- Les tests d activités Anti-infectieux (antibiotique, antivirale, antifongique) Chapitre III : Les outils technologiques pour l identification des molécules à intérêt thérapeutique (h) I- Bioinformatique appliquée à la recherche pharmaceutique II- La chimie combinatoire (Chimie High Tech) III- Drug Design IV- Screening et criblage Chapitre IV : La Pharmacogénétique et la Pharmacogènomique (h) I- Introduction et définitions II- Polymorphismes génétiques et Médicaments III- right Drug, right person, right time : la pharmacologie moderne Travaux Pratiques : Pharmacologie * SEANCE I : Etude des analgésiques (Aspirine / agent algogène : acide acétique) et Etude de l activité parasympatholytique (Test de salivation) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 102

103 * SEANCE II : Etude in vitro d une activité spasmolytique (organe isolé) * SEANCE III : Etude de la létalité et de la neurotoxicité d un médicament : Ondansétron (Zophren ) Annexe 2 Unité d Enseignement : Pharmacologie - Toxicologie Code UE : ECUE n 1 Toxicologie Code ECUE : Plan du Cours : 21 h Chapitre 1 : Introduction à la Toxicologie (1h) Objectifs de la Toxicologie moderne, Domaines de la Toxicologie Médicale Définitions (Toxique, toxine, xénobiotique, concept de la dose, relation dose effet) Classes des toxiques (Médicaments, drogues, toxiques alimentaires, toxiques agroalimentaires, toxines, produits chimiques, produits de combustions). Chapitre 2 : Métabolisme et Transport des Xénobiotiques (2h) Les différents enzymes du métabolisme des xénobiotiques Les transporteurs des xénobiotiques Régulation de l expression de ces enzymes et transporteurs : mécanismes et conséquences toxicologiques Les radicaux libres et leur importance en toxicologie ; adduits à l ADN et aux protéines : signification et conséquences. Les interrelations substrats endogènes substrats exogènes. Chapitre 3 : Toxicologie d organes (h) Toxicologie vis-à-vis des différents organes : Foie et système digestif, rein, SNC, coeur, muscle, poumon, peau, sang, système reproducteur, fœtus. Méthodes d études de la toxicologie (mise en évidence de la toxicité vis-à-vis de ces différents organes avec évaluation du risque) Immuno-toxicologie Toxicité des produits issus des biotechnologies Chapitre 4 : Toxicologie in vitro (h) Les méthodes alternatives Modèles cellulaires, méthodes de culture ; différents types de culture, leur possibilités et leurs limites Les modèles de peau ; corrélation des expériences in vivo et in vitro : le cas de LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 103

104 l irritation cutanée et oculaire Modèles cellulaires rénaux Modèles cellulaires hépatiques Les modèles cellulaires pulmonaires Modèle de barrière hématoencéphalique Les lignées immortalisées Etude des effets des toxiques sur la morts cellulaires : apoptose, nécrose, autophagie Chapitre 5 : Génotoxicologie, Cancérogénèse, Mutagénèse (h) L ADN comme cible de toxiques chimiques : Les lésions et réparation de l ADN (macrolésions, microlésions : adduits, dépurination, désamination, liaisons croisées, ) La cancérogenèse chimique Bases anatomopathologiques des concepts de bénignité et de malignité Les tests de génotoxicité et de mutagenèse et l évaluation du risque mutagène et cancérogène TP/TD L enseignement dirigé comprendra : - l analyse de tests et des résultats (exercices) de mise en évidence de la toxicité néphtotoxicité, hépatotoxicité et de la neurotoxicité en exemple - l analyse de tests de mutagenèse et de cancérogenèse L enseignement pratique comprendra : - une approche méthodologique de la toxicologie comprenant l utilisation des modèles cellulaires - des approches de génomique, de protéomique et de métabonomique - qu une initiation à la culture cellulaire de lignées tumorales, (cellules Hep G2) - les tests de mise en évidence de mort cellulaires (Fragmnation de l ADN, techniques TUNEL, dosage des caspases) et d atteintes oxydatives (oxydation de l ADN et lipoperoxydation) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 104

105 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE Biotechnologie des Macromolécules Université : Monastir... Etablissement : ISBM... Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention :.Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical S5 LF..Parcours : (L3) Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) - Maîtriser les méthodologies utilisées pour l analyse des génomes et les perspectives qu ouvrent ces approches dans divers domaines (gènes marqueurs de maladies). - Identifier les protéines extraites d une culture cellulaire ou d un tissu, leur localisation dans les compartiments cellulaires ainsi que leurs modifications post-traductionnelles en fonction du temps, de l environnement et de l état pathologique. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire. Génie génétique et génétique Moléculaire. Informatique et bioinformatique. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1-Génomique/ trascriptome 1h30 0h30 0H Protéomique 1h30 0h30 0H45 3 Total 3H 1H 1H Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 105

106 1 Total 1 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Génomique/ Transcriptome : Langage et méthodologies utilisées pour l analyse des génomes. Analyse des phénomènes transcriptionnels. 2- Protéomique : Technologies liées aux protéines et Ingéniering 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Génomique-transcriptome: Organisation des ateliers 2-Protéomique : Organisation des ateliers. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : - Contrôle continu - Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE 1-Génomique- Transcripto me Ecrit Contrôle continu EPREUVES TP et Oral Autres Pondéra -tion Ecrit Oral Examen final EPREUVES TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 2- Protéomique 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20%.3- Validation des stages et des projets... Coef. de l UE au sein du parcours LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 10

107 Annexe 1 Unité d Enseignement : Biotechnologie des Macromolécules Code UE : ECUE n 1 Génomique - transcriptome Code ECUE : Plan du Cours : 21 h 1- Bases de données en génomique : structure du génome procaryote et eucaryote (1h) 2- Un exemple de stratégie de séquençage de génome (1h) 3- Analyse qualitative et quantitative de l expression génétique (2h) - méthode SAGE - méthode puce à ADN 4- Recherche de marqueurs et de gènes candidats dans les génomes (2h) 5- Recherche de marqueurs de prédisposition aux maladies chez l homme (2h) - Analyse des phénomènes transcriptionnels : (12) - Régulation de la transcription : promoteur, facteurs de transcription - Modification de l ARN : épissage, RNAediting, stabilité - Méthodes d études structurale et de quantification : Northern blot, RT-PCR, RACE, extension d amorce, RNase protection. 7- Brevetabilité des gènes et des génomes (1h) TP/TD : - Informatique et génomes : bases de données et méthodes d analyse - recherche de partenaire en double hybride dans la levure - analyse d une banque Annexe 2 Unité d Enseignement : Biotechnologie des Macromolécules Code UE : ECUE n 1 Protéomique Code ECUE : Plan du Cours : 21 h Plan du Cours : Protéomique 1- Introduction (1h) 2- Différentes approches de la protéomique (4h) - techniques d extraction - séparation ( chromato, HPLC..) - Séparation par Electrophorèse 2D : LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 107

108 *Isoelectrofocalisation (IEF) *Immobilized ph gradient (IPG) *2 ème SDS PAGE *Révélation des protéines et de leurs modifications Posttraductionnelles 3- Identification des protéines (3h) - Identification par Spectrométrie de masse (SM) - Recherche des protéines d intérêt par analyse d image 4- Séquençage (3h) - Composition en acides aminés, dégradation d Edman - Coupures chimiques et enzymatiques des protéines - Consultation des bases de données 5 Méthodes d analyse des protéines (8h) - Expression des protéines en systèmes cellulaires : Production des protéines recombinantes (Culture des cellules, Western Blot) - Peptide à activité biologique - Mutagenèse dirigée - Technique de double hybride - Technique de «phage display» - Les enjeux de la protéomique (2h) - Recherche de biomarqueurs - Outils thérapeutiques LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 108

109 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical Nombre de crédits Code UE. Université : Monastir... Etablissement : ISBM... Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention : Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours Semestre LA Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical S5 LF..Parcours : (L3) Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Maîtriser les technologies d identification et de typage des Bactéries, virus et des parasites impliquées dans les maladies microbiennes en utilisant des méthodes biochimiques, microbiologiques, immunologiques et de biologie et de génétique moléculaire. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Microbiologie - Immunologie -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Génétique- Physiologie. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1-Bactéries et Virus 1h30 1H Parasites et mycoses 1h30 1H15 3 Total 3H 2H Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire Total Crédits 1 1 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 109

110 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) Bactéries et virus: Etudier les agents infectieux et les caractériser en utilisant des approches biochimiques, génétiques et moléculaires. Utiliser les outils de biologie moléculaire pour identifier les agents infectieux 2- Parasites : Le cours sera axé sur le diagnostic moléculaire et le typage des parasitoses humaines les plus répandues en Tunisie et qui ont une répercussion directe sur la santé publique Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Bactéries et Virus: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d analyse et de contrôle des virus et des bactéries. 2-Parasites et mycoses: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d analyse et de contrôle des parasites. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : - Contrôle continu - Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). ECUE 1- Bactéries /Virus 2- Parasites/myco ses Ecrit Contrôle continu EPREUVES TP et Oral Autres Pondéra -tion Ecrit Oral Examen final EPREUVES TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 110

111 .3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 111

112 Annexe 1 Unité d Enseignement : Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical Code UE : ECUE n 1 Bactéries et Virus Code ECUE : Plan du Cours : 21 h Unité d enseignement «Identification et typages des bactéries et des virus» I - Bactériologie Moléculaire 1. Diversité et virulence des bactéries pathogènes : - Les entérobactéries - Les cocci Gram-positif - Les cocci Gram-négatif - Les anaérobies stricts - Les bactéries intracellulaires - Les bactéries particulières (mycobactérium,.) 2. Identification moléculaire - Apport des différentes techniques moléculaires : RFLP-PCR, REP, séquençages - Exploitation du diagnostic moléculaire dans l épidémiologie bactérienne II- Virologie Moléculaire 1. Mécanismes généraux de l infection virale - dans la cellule - dans l organisme 2. Récepteurs moléculaires des virus : exemples 3. Techniques classiques d études des virus - Conditions de prélèvement, de culture et de conservation des virus - Techniques classiques de diagnostic virologique directes (microscopiques) et indirectes (sérologiques) 4. Techniques moléculaires d identification des virus - Apport de la biologie moléculaire - Techniques d hybridation moléculaire - Différents types de PCR - Génotypages : HIV, hépatites B, C.. 5- Exploitation du diagnostic viral dans l épidémiologie et la lutte anti-virale - Etudes de quelques cas ( HIV, hépatites, grippe, grippe aviaire.) TP : - techniques immunosérologiques : ELISA, hémaaglutination, immunoempreinte - PCR LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 112

113 Annexe 2 Unité d Enseignement : Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical Code UE : ECUE n 1 Les Parasites et les mycoses Code ECUE : Plan du Cours : 21 h Chapitre I : Notions de base en Parasitologie - Définitions (différents types de parasitisme, spécificité parasitaire) - Notion de cycle de vie - Prophylaxie Chapitre II : Les différents types de parasitoses en Tunisie Systématique, épidémiologie et cycles évolutifs de : - les unicellulaires : taxoplasmose et leischmania.. - les plathelminthes (douves et ténias.) - les nématodes (ascaris ) - autres parasites (acariens.) Chapitre III : Les Outils de diagnostic des parasites - Techniques de diagnostic classique (directes et indirectes) - Techniques de diagnostic moléculaire : Applications à des parasitoses précises * apport des technologies moléculaires * Polymorphisme des parasitoses - Apport du typage dans une étude éco-épidémiologique Chapitre IV : Moyens de prévention et luttes CHAPITRE V : LES MYCOSES Les aspergilloses LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 113

114 Définition, agents pathogènes, répartition géographique, pouvoir pathogène, facteurs favorisant l'infestation, mode de contamination, clinique. Les candidoses Epidémiologie (Agent pathogène: morphologie et écologie, facteurs de risque), Clinique, prophylaxie. TP : Enseignements pratiques Les travaux pratiques seront une application directe des notions étudiées en cours. 1- Identification directe et indirecte de quelques parasites (morphologie, immunosérologie, immunoempreinte) et des vecteurs (moustiques, anophèles, phlébotomes, limnées, tiques.) 2- Identification moléculaire d un parasite au choix : - Extraction d ADN - Réaction de PCR permettant le diagnostic moléculaire ou le typage génétique du parasite. - Analyse, interprétation et discussion des résultats 3- Observation et identification les différentes formes parasitaires et fongiques (œuf, larve, adulte/conidie) de chaque embranchement. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 114

115 Contenus des programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes (S5) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 115

116 Programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 5 N Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Microorganismes d intérêt médical et pharmaceutique Microorganismes spécifiques à l Industrie Agroalimentaire Microorganismes en Industrie, Agronomie et Environnement Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Elément constitutif Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise (Création des entreprises) 1H30 2 X Bioinformatique 2 2 X Microorganismes pathogènes et maladies 1H30 0H30 0H45 3 X émergentes Microorganismes producteurs de molécules 1H30 0H30 0H45 3 X d intérêt Identification et contrôle de microorganismes pathogènes en 1H30 0H30 0H45 3 X Agroalimentaire Exploitation et Production de Microorganismes utiles 1H30 0H30 0H45 3 X en Agroalimentaire Fermentation microbienne : Technologie et formulation 1H30 0H30 0H45 3 X des produits finis Microbiologie de l Environnement et Microorganismes d intérêt 1H30 0H30 0H45 3 X agricole OP X OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 11

117 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre N Unité d'enseignement Natur e de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cour s TD TP Cour s intég ré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE (le cas échéant UE ECUE (le cas échéan t UE Contrôle continu 1 Stage pratique UF Validation Régim e mixte LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 117

118 Contenus des programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes UE1 : Microorganismes d Intérêt Médical et Pharmaceutique ECUE 1. Microorganismes pathogènes et maladies émergentes. I- Introduction 1. Notions d agents infectieux et de pouvoir pathogène 2. Barrières naturelles et défenses induites de l organisme hôte II- Flore microbienne normale 1. Relation entre la flore normale et l hôte 2. Microorganismes opportunistes 3. Coopération entre les microorganismes III- Différents types d agents pathogènes 1. Bactéries pathogènes 2. Champignons pathogènes 3. Parasites 4. Virus 5. Agents transmissibles non conventionnels ou Prions IV- Mécanismes de pathogénicité microbienne 1. Pénétration des agents microbiens dans l organisme hôte : différentes portes d entrée 2. Processus d invasion et différents modes de transmission 3. Mise en échec des défenses de l hôte V- Vecteurs et maladies vectorielles VI- Emergences et ré-émergences de maladies infectieuses 1. Facteurs de risque d origine anthropique 2. Facteurs de risque naturels 3. Classification des émergences et ré-émergences VII- Perspectives de lutte (surveillance épidémiologique, coopération internationale, réponse adaptée par vaccins et antiviraux) TP / TD : Manip I. Rappels microbiologiques : Milieux de culture techniques d ensemencement colorations simples et différentielles Manip II. Principes et méthodes du diagnostic microbiologiques Manip III. Mise en évidence des germes de l aire et de la flore cutanée. Etude de l efficacité des désinfectants et antiseptiques. Manip. IV. Examen cytobactériologique des urines (ECBU). Séances V et VI : Microorganismes vectoriels et maladies émergentes: Travaux de recherches effectués par les étudiants et exposés. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 118

119 ECUE 2. Microorganismes Producteurs de Molécules d Intérêt. Introduction 1. Rappel : Présentation générale des bactéries - Principales morphologies bactériennes Principaux métabolismes bactériens - Différentes utilisations des bactéries. 2. Définition de l industrie de la fermentation. I. Les Molécules d Intérêt : 1. Microorganismes en industrie : Types de microorganismes en industrie - Caractéristiques d un microorganisme industriel - Types de produits industriels - Systèmes de culture (système de culture fermé ; système de culture ouvert). 2. Production d enzymes : Enzymes commerciales - Conversion des stérols. 3. Production de métabolites primaires : Acides aminés - Acides organiques - Alcools et solvants - Lipides Polysaccharides - Vitamines et additifs alimentaires. 4. Production de métabolites secondaires : Antibiotiques - Produits pharmacologiques (Alcaloïdes, immunosuppresseurs) Insecticides Arômes. 5. Production d énergie.. Produits de microorganismes génétiquement modifiés : Insuline - Hormone de croissance humaine Vaccins - Facteurs de croissance II. Exploitation des Toxines des Microorganismes: 1. Les toxines bactériennes : Définitions, classification, structure, pathogénicité, mécanismes d action, moyens de lutte. Utilisation des toxines bactériennes en médecine (ex: dystonies, botox, vaccins), utilisation des toxines bactériennes en industrie agroalimentaire (ex: insecticides, vaccination des bovins), utilisation des toxines bactériennes pour le bioterrorisme (ex: l anthrax). 2. Les Phycotoxines : Définition des toxines de microalgues, origine, classification, toxicité, prévention : installation des réseaux de surveillance, intérêt pharmacologique des phycotoxines (ex: dysfonctionnement des cellules nerveuses, analgésie). 3. Les Mycotoxines : Définition et polymorphisme, toxicité, moyens de préventions. Utilisation des champignons microsopiques toxiques dans l industrie pharmaceutique (la pénicilline). 4. Toxines des microorganismes : Identification et Caractérisation - Purification des toxines, caractérisation physicochimique et biochimique, impact thérapeutique TP / TD : 1. Différentes techniques utilisées en Microbiologie et Test d activité antibactérienne sur boite de pétri utilisant une souche produisant des bactériocines et dirigés contre des bactéries indicatrices. 2. Réalisation d antibiogramme (méthode de diffusion et méthode de dilution), détermination de la CMI, détermination de la CMB ; test de Got. 3. Mise au point de la production de quelques enzymes (Galerie API). 4. Extraction, Détection et Dosage des Toxines : (Utilisation de l HPLC et de la CPG). 5. Utilisation des toxines de microorganismes : (Exposés : Utilisation des toxines bactériennes, des mycotoxines et des phycotoxines).. Etude de quelques caractéristiques physicochimiques et biologiques des toxines protéiques : (Détermination de la masse, de la structure et de la dose létale 50). LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 119

120 UE2 : Microorganismes spécifiques à l Industrie Agroalimentaire ECUE 1. Identification et contrôle de microorganismes pathogènes en Agroalimentaire I. Origine et nature de la flore microbienne des aliments 1. Flore issue des animaux et des végétaux 2. Contamination par les manipulateurs 3. Contamination par l'environnement 4. Contaminants industriels II. Évolution de la flore 1. Types d'évolution 2. Activité des microorganismes III. Incidences sanitaires de la présence de microorganismes 1. Accidents liés à la prolifération d'une flore peu ou pas pathogène : «intoxication» 2. Maladies liées à la présence de germes pathogènes 3. Intoxinations IV. Toxi-infection alimentaire collective (T.I.A.C.) Différentes toxi-infections alimentaires et TIAC : Salmonelles, Staphylocoques, Clostridium perfringens, Clostridium Botulinum (Botulisme), Bacillus cereus, Campylobacter, Escherichia coli, Listeria Travaux Pratiques : TP 1- Méthode de routine pour le dénombrement des Microorganismes Méthode par comptage des colonies à 30 C TP 2- Dénombrement des Pseudomonas spp. Dans les viandes et les produits à base de viande TP 3- Dénombrement de Staphylococcus aureus dans les aliments Méthode par comptage des colonies TP 4- Dénombrement de Bacillus cereus dans les aliments Méthode par comptage des colonies à 30 C. ECUE 2. Exploitation et Production de Microorganismes utiles en Agroalimentaire. I- INTRODUCTION Définition d un aliment Les micro-organismes dans les aliments Utilisation des micro-organismes en agro-alimentaire LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 120

121 Mécanismes biochimiques des principales fermentations microbiennes II- Les fermentations lactiques - Les fermentations lactiques thermophiles - Les fermentations lactiques mésophiles - Les fermentations lactiques avec les levures - Les fermentations lactiques thérapeutiques III- La fermentation alcoolique - la production du pain - La production des boissons alcoolisées IV- La fermentation acétique V- La fermentation propionique VI- Les microorganismes producteurs d acide citrique, d autres composés organiques et de compléments alimentaires VII- Les microorganismes en tant qu aliments TRAVAUX PRATIQUES : TP N 1 : Rappels des différentes techniques microbiologiques acquises TP N 2 : Etude des ferments lactiques utilisés dans la fabrication du yaourt TP N 3 : Fermentation alcoolique chez la levure de bière : Suivi de la consommation du glucose et de la production de l éthanol par la levure TP N 4 : La fermentation acétique TP N 5 : Les ferments propioniques dans la fabrication des fromages LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 121

122 UE3 : Microorganismes en Industrie, Agronomie et Environnement ECUE 1. Fermentation microbienne : Technologie et formulation des produits finis. I. Sources des microorganismes industriels 1. Techniques de screening I et II 2. Conservation des cultures 3. Développement des souches II. Bioénergétique du métabolisme microbien III. Techniques d immobilisation des microorganismes 1. Principe de l immobilisation 2. Principales techniques d immobilisation : Adsorption Inclusion Réticulation - Encapsulation IV. Techniques avancées de fermentation 1. Batch alimenté à volume variable vs Batch alimenté à volume constant 2. CSTR with Recycle (Continous Strirred Tank Reactor) Culture en continue avec recyclage 3. SBR (Sequenced Batch Reactor) 4. FES (Fermentation à l état solide) 5. MBR (Bioréacteur à membrane) V. Design des Bioréacteurs 1. Configuration des Bioréacteurs 2. Caractéristiques des Bioréacteurs 3. Transfert de matière 4. Transfert de chaleur 5. Forces de cisaillement VI. Régulation et contrôle du fermenteur 1. Les capteurs 2. Les stratégies de contrôle : contrôle en boucle ouverte / contrôle en boucle fermée 3. Automatisation d une fermentation 4. Modélisation 5. Downstream Processing et formulation de produits. Séparation solide liquide 7. Récupération des constituants intracellulaires 8. Concentration des produits biologiques 9. Purification par chromatographie 10. Formulation de produits 11. Commande et contrôle du Downstream processing VII. Aspects économiques de fermentation 1. Estimation des coûts 2. Design du procédé. VIII. Etudes de cas d application 1. Production d'antibiotiques par biotechnologies 2. Production de la levure boulangère 3. Fabrication des yaourts et des laits fermentés 4. Traitements biologiques des eaux résiduaires 5. Biotechnologies dans la métallurgie extractive LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 122

123 ECUE 2. Microbiologie de l Environnement et Microorganismes d Intérêt Agricole Chapitre I. Analyse des microorganismes dans leur environnement - Rappel : Systématique bactérienne et phylogénie ; Notion d espèce - Chronomètres moléculaires - L ARNr 1S comme marqueur moléculaire pour l analyse des communautés microbiennes - Microorganismes cultivables et non cultivables - Méthodes d analyse des communautés microbiennes, culture-indépendantes (ARISA, DGGE, TGGE, SSCP, librairies 1s, FISH) - Associations microbiennes dans l environnement - Marqueurs moléculaires, SNPs et typage Chapitre II. Monitorage des microorganismes dans l environnement - Biodiversité et fonctions des microorganismes dans des communautés complexes de l environnement - Marquage par des isotopes stables, BrdU - Librairies métagénomiques dans des chromosomes artificiels - Génomique et protéomique de microorganismes d intérêt environnemental - OGM dans l environnement - Biocapteurs, biosensors et Biorapporteurs microbiens - Application des biorapporteurs Lux pour l analyse des contaminations chimiques et la détection des microorganismes dans divers environnements - Micropuces à ADN Chapitre III. Technologies microbiennes pour la décontamination de l environnement - Dégradation, minéralisation et métabolisme microbiens des xénobiotiques - Voies cataboliques des pesticides chimiques - Génome de Pseudomonas putida - Ingénieries des protéines via l évolution accélérée des gènes (DNA shuffling) - Immobilisation et élimination des métaux lourds : l opéron mer, métallothionéines eucaryotiques chez Ralstonia eutropha - Résistance aux radiations et bioremédiation, Deinococcus radiodurans et radionucléides - Dégradation des hydrocarbues Chapitre IV. Microorganismes et fertilité : Interactions plantes-microbes - Rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques du sol (cycles du carbone, azote et phosphate) - Fixation de l azote, ammonification, nitrification, dénitrification et microorganismes dénitrifiants dans le sol - Associations plantes-microbes, phyllosphère et rhizosphère - PGPR, production d hormones et solubilisation du phosphate - Bactéries actinorhiziennes et champignons mycorhiziens Chapitre V. Contrôle (lutte) biologique des ravageurs des plantes - Notion du contrôle biologique microbien : Biocontrôle - Biocontrôle des bactéries et champignons phytopathogènes - Biopesticides : la cholestérol oxydase de Strepromyces - Bacillus thuringiensis : toxines Cry et VIP et autres facteurs de virulence LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 123

124 Contenus des programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires (S5) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 124

125 Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires مراقبة جودة المواد الغذاي ية Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) - Semestre 5 N Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Contrôle des Aliments et des Produits Agroalimentaires Technologies Agroalimentaires Techniques de Contrôle de Qualité Nature de l'ue UT UF UF UF Volume horaire semestriel Elément constitutif Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X Contrôle biochimique 1H30 0H30 0H45 3 X Contrôle 1H30 0H30 0H45 3 X microbiologique Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des Boissons Technologies des Céréales, des Produits Carnés et des Produits de la Me Applications de Management de Qualité Rhéologie et Techniques d analyses sensorielles Techniques de qualité de conservation, d emballage et de conditionnement 1H30 0H30 0H45 3 X 1H30 0H30 0H45 3 1H30 0H30 2 X 1H30 0H30 0H30 2 1H30 0H30 0H UE optionnelle 5 UO OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 125 X X

126 OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 12

127 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 127

128 Contenus des Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires UE1 : Contrôle des Aliments et des Produits Agroalimentaires ECUE 1. Contrôle Biochimique des Aliments I- L eau et son importance dans la qualité des aliments 1. Propriétés et disponibilité de l eau dans les aliments 2. Activité de l eau et modifications des aliments : altérations chimiques et enzymatiques, développement des microorganismes 3. Normes sanitaires de l eau alimentaire II- contrôle des additifs alimentaires 1. Codification des additifs alimentaires et normes 2. Présentation et rôle de quelques additifs naturels et chimiques : les anti-oxydants, les colorants alimentaires, les gélifiants, les conservateurs, les exhausteurs de goûts.. III- Les glucides dans les aliments 1. Source, rôle nutritionnel et importance dans l'alimentation 2. Propriétés de gélification des glycanes 3. Les farines IV- Les protéines alimentaires 1. Propriétés techno fonctionnelles : Elasticité, Gélification, émulsification..) 2. sources biologiques et contrôle en qualité nutritionnelle Les protéines animales (lait, œufs, viandes) Les protéines végétales (albumines, prolamines, gluthélines et globulines) Nouvelles sources de protéines alimentaires V- Les lipides alimentaires 1. Propriétés de solidification des lipides 2. Qualité des huiles : sources (végétales, animales, naturelles, industrielles, OGM..) méthodes d étude et normes. ECUE 2. Contrôle Microbiologique des Aliments I- Les flores microbiennes des aliments : évolution et rôles 1- Origine des micro-organismes peuplant les aliments 2- Devenir et rôle des micro-organismes contaminant les aliments II- Transformations des aliments par les micro-organismes 1- Relations avec le métabolisme microbien 2- Principales altérations alimentaires d origine microbienne 3- Utilisation des micro-organismes dans la fabrication d aliments LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 128

129 III- Infections alimentaires d origine bactérienne 1- Définitions et caractères généraux 2- Micro-organismes responsables de toxi-infections alimentaires Micro-organismes agissant principalement par leur pouvoir invasif Micro-organismes agissant par la sécrétion d une entérotoxine Micro-organismes agissant par la sécrétion d une toxine neurotrope- le botulisme 3- Les éléments du diagnostic d une toxi-infection alimentaire collective (TIAC) 4- Surveillance des TIAC IV- Hygiène alimentaire appliquée à la restauration TRAVAUX PRATIQUES TP N 1 : Principes généraux des analyses microbiologiques des produits alimentaires TP N 2 : Méthodes de quantification des populations contaminantes TP N 3 : Etude des flores d altération de la qualité marchande des aliments : Flore lipolytique, flore caséolytique, flore mésophyle protéolytique, flore psychrotrophe TP N 4 : Etude des flores d altération de la qualité marchande des aliments (suite) : Flore susceptible de résister aux traitements thermiques et flore fongique. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 129

130 UE2 : Technologies Agroalimentaires ECUE 1. Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des Boissons. Introduction aux technologies alimentaires I. Technologies du lait et produits dérivés : 1. Composition du lait 2. Critères d appréciation et de qualité 3. Méthodes de conservation 4. La crème et le beurre : dénominations, shama de fabrication, écrémage, préparation et maturation, barattage, lavage et malaxage, analyse de contrôle de qualité. 5. Les fromages : définition, technologie de fabrication.. Lae Yaourt : présentation, fabrication, variétés et spécificités. 7. Autres produits laitiers. II. Technologies des matières grasses alimentaires 1. Les lipides : définition, sources et rôles dans l alimentation. 2. propriétés physico-chimiques et notionnelles des matières grasses. 3. Traitement technologiques des matières grasses : préparation des graisses et des huiles, extraction des huiles végétales, traitement et purification, traitements de modification (fractionnement, transestérification, hydrogénation partielle et totale). 4. Méthodes d évaluation de la consistance des corps gras. 5. Les substituts de matières grasses et apport énergétique réduit. Réglementation des corps gras alimentaires. III. Technologie des boissons à base de fruits : 1. Le jus de fruit : dénominations et composition 2. Opérations de fabrication : cueillette, préparation des fruits, extraction, décantation et entreposage, tamisage et centrifugation, clarification, pasteurisation, conditionnement. TP : 1. Technologies du lait et produits dérivés 2. Technologie des boissons à base de fruits 3. Visites d usine de fabrication ECUE 2. Technologies des Céréales, des conserves alimentaires, des Produits Carnés et des Produits de la Mer. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 130

131 I. Technologie des Céréales : 1. Le blé : présentation, composition 2. La minoterie. 3. La farine du blé : composition et analyse de contrôle de qualité. 4. Etude du comportement des pâtes : analyse avec l alvéographe de Chopin, tests de panification. II. Technologies des Conserves alimentaires : 1. Les conserves en Tunisie : diversité, importance, limites et contraintes 2. Les niveaux de transformation. 3. Les variantes d appertisation. 4. Exemple de schéma de fabrication des produits appertisés. 5. Opérations unitaires dans la fabrication de produits appertisés. Cycles de stérilisation. 7. Aspects nutritionnels et contrôle de qualité des produits appertisés. III. Technologies des Produits carnés : 1. Composition et structure du muscle 2. Transformation du muscle en viande 3. La qualité de la viande 4. Fabrication des produits de charcuterie 5. Conservation des produits carnés : conservation par le froid, fumaison, salaison. IV. Technologies des Produits de la mer 1. Principaux produits de la mer et leur production. 2. Composition et valeur nutritive des produits de la mer 3. Evaluation de la qualité des produits de la mer 4. Techniques de conservation des produits de la mer : conservation par le froid, appertisation, séchage, salage, fumage. TP : 1. Techniques des conserves alimentaires et contrôle de qualité 2. Visites d usines et d institutions de traitement et de fabrication. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 131

132 UE3 : Techniques de Contrôle de Qualité ECUE 1. Applications de Management de Qualité 1ere partie : Introduction Les raisons de la mise en place des outils d amélioration de la qualité selon les Référentiels internationaux Quels et comment utiliser ces outils? L analyse des données La recherche des solutions et les améliorations enregistrées Démarche de mise en place d un procédé d amélioration Applications et approche INTERACTIVE 2eme partie : Les Outils de management de Qualité * Outils de mise en place Kaizen - les 5 S Travail en équipe Brainstorming Logique «est & n est pas» Fiche d acquisition des données Histogramme des fréquences QQOQCP Logigramme * Outils de mise en oeuvre Diagramme de Pareto Diagramme causes effets - méthode par familles Diagramme causes effets - méthode par processus Diagramme multi-criteres Matrice de pondération Typoscopie Arbre de décision * Outils d amélioration Diagramme de dispersion Diagramme de progrès Diagramme événementiel Diagramme de Gantt Diagramme polaire Rapport de projet Graphique * Les autres outils : AMDEC - Analyse de la valeur - Sigma 3eme partie : Cas d application A. Cas d application on line sur internet La reconnaissance internationale Le processus de certification : démarche et choix des organismes Le processus d accréditation : démarche et choix des programmes B. Choix d un ou plusieurs référentiels d application ISO ISO 22000/HACCP - ISO C. Application des outils étudiés dans le cadre des référentiels choisis 4eme partie : Synthèse et évaluation de la formation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 132

133 ECUE 2. Rhéologie et Techniques d analyses sensorielles. Partie 1 : Analyses sensorielles 1. Introduction générale à l évaluation sensorielle a. Sens chimique des saveurs et des odeurs b. L utilisation des sens pour l évaluation des propriétés organoleptiques 2. Les différents types de tests a. Les tests de différence b. Les tests comparatifs c. Le profil sensoriel 3. Analyse statistiques et interprétation des résultats 4. Mise en place d une structure d analyses sensorielles Partie 2 : Rhéologie 1. Notions de contraintes et de déformation - Définitions : contrainte, déformation, cisaillement 2. Comportements rhéologiques des fluides : Fluides newtonien, thixotropique, fluide de Herschel-Bulkley, comportement à seuil 3. Les différents types de Rhéomètres 4. Analyse de la texture ECUE 3. Techniques de Qualité de Conservation, d Emballage et de Conditionnement I. La conservation des Aliments II. Les techniques du froid III. Les traitements thermiques IV. Destruction non thermique des microorganismes V. Le blanchiment VI. La Déshydratation des aliments VII. Techniques d Emballage et de Conditionnement : 1. Les matériaux d emballage et de conditionnement, structure et propriétés, coût, compatibilité, conditions de stockage, contrôle de qualité. 2. Emballage actif et intelligent 3. Conditionnement : palettisation, manutention, stockage et emballages pleins. 4. Conditionnement des produits alimentaires finis, présentation, influence sur la qualité, dates de péremption, étiquetage, systèmes biodégradables. 5. Emballage et conditionnement de produits biologiques à usage industriel, le vrac, le détail, les conditions de stockage. TP. Visite du centre technique d Emballage et de conditionnement de Tunis LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 133

134 Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie Végétale LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 134

135 Programmes du Parcours : Biotechnologie Végétale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies N Licence Appliquée en Biotechnologies (Parcours : Biotechnologie Végétale) - Semestre 5 Unité d'enseignement Langue et communication, Culture de l Entreprise et Bioinformatique Biotechnologie végétale et Biochimie Génétique et Amélioration des Plantes Biotechnologies basées sur l utilisation de l ADN Nature de l'ue UT UF UF UF 5 UE optionnelle 5 UO Volume horaire semestriel Elément constitutif Crédits Coefficients Régime d'examen (14 semaines) d'ue (ECUE) Cours Contrôle Régime Cours TD TP ECUE UE ECUE UE Intégré continu mixte Langue et communication 2 2 X Culture de l Entreprise 1H30 2 X (Création des entreprises) Bioinformatique 2 2 X. Biotechnologie végétale et conservation des phytoressources 1H30 0H30 0H45 3 X Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux 1H30 0H30 0H45 3 X Eléments de Génétique quantitative et Sélection 1H30 0H30 0H45 3 X classique Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques 1H30 0H30 0H45 3 X Biotechnologie 1H30 0H30 0H45 2 X Moléculaire Typage et Marqueurs 1H30 0H30 0H45 2 X Moléculaires OP X OP X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 135

136 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Parcours : Biotechnologie Végétale) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 13

137 Contenus du Parcours : Biotechnologie Végétale UE1 : Biotechnologie végétale et Biochimie ECUE 1. Biotechnologie végétale et Conservation des phytoressources I. Biotechnologie, Evaluation et conservation des ressources phytogénétiques 1. Identification variétale par marqueurs 2. Techniques de culture in vitro et conservation des phytoressources 3. Cryoconservation des phytoressources II. Amélioré ration des plantes industrielles 1. Haplodiploploidisation et applications en amélioration des plantes (blé, colza, trournesol, pomme de terre 2. Fusion des protoplastes et applications : sélection des fusions, induction de la stérilité mâle cytoplasmique, hybridation intra- et interspécifiques, transfert de l hérédité cytoplasmique. 3. Transgénèse et applications : a. Transfert des gènes de résistances aux facteurs abiotiques (salinité, sécheresse). b. Transfert des gènes de résistances aux facteurs biotiques (virus, champignons). c. Intérêt de la transgénèse en lutte biologique d. Transfert des gènes de résistances aux herbicides et insecticides e. Gènes de maturation des fruits : stratégies anti-sens. f. Transfert des gènes pour l amélioration de la qualité industrielle des plantes (huiles, biocarburants, produits cosmétiques ) ECUE 2. Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux Objectif L objectif de la formation est une connaissance précise de molécules végétales d usage industriel du point de vue de leur structure, de leurs voies de biosynthèse et de dégradation, de leur rôle dans la plante et de leur exploitation industrielle I- LES GLUCIDES UTILISES EN INDUSTRIE 1. La cellulose : Structure, propriétés et voies de biosynthèse 2. L amidon : composition chimique, propriétés physiques, enzymes de dégradation et de biosynthèse 3. les extraits sucrants II-LES PROTEINES VEGETALES 1. Généralités 2. Analyse protéomique 3. quelques exemples de protéines végétales d intérêt : Les protéines de réserve, les protéines membranaires, les protéines de stress. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 137

138 III- MATIERE GRASSE VEGETALE 1- Présentation générale et rôle physiologique des lipides. 2- Exploitation des propriétés techno-fonctionnelles et nutritionnelles des huiles végétales IV- LES PIGMENTS VEGETAUX (Présentation de quelques pigments : localisation, structure, rôle physiologique et leur exploitation industrielle) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 138

139 UE2 : Génétique et Amélioration des Plantes ECUE 1. Eléments de Génétique quantitative et Sélection classique. I. Eléments de statistique et de génétique des populations II. Rôle et place de l amélioration des plantes dans la science, l économie et l autosuffisance alimentaire. III. La reproduction chez les plantes : principe et diversité. IV. Polymorphisme, variation génétique et amélioration des plantes V. Méthodes et techniques de l amélioration des plantes autogames VI. Méthodes et techniques de l amélioration des plantes allogames. VI. Amélioration des plantes à multiplication végétative. VII. Quelques exemples d application. ECUE 2. Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques. I. Importance de la sélection végétale - l amélioration génétique classique - Impact de la Biologie moléculaire sur la création variétale et la qualité, l amélioration du rendement, la résistance aux maladies et la protection de l environnement (moins d intrants en agriculture) II. Sélection assistée par marqueurs moléculaires 1. Conversion assistée par marquage moléculaire : exemple le gène Bt chez le Maïs 2. Utilisation des marqueurs moléculaires pour l amélioration qualitative du tabac (faible teneur en nicotine) 3. Marqueurs moléculaires associés aux gènes de résistances aux maladies III. Marqueurs moléculaires dans des schémas de sélection IV. Cartographie génétique-liaison génétique 1. Test statistiques pour la liaison : LODscore 2. cartographie des gènes majeurs 3. QTL : variation d un caractère quantitatif V. Amélioration à partir de la cartographie de gènes ou QTL 1. Nombre de gènes impliqués dans la variation d un caractère quantitatif 2. principe de détection de QTL 3. corrélation aux marqueurs moléculaires LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 139

140 UE3 : Biotechnologies basées sur l utilisation de l ADN ECUE 1. Biotechnologie Moléculaire. A- Les techniques de mutagénèse in vivo I. Mutagénèse dirigée in vivo chez les bactéries 1. Par insertion d'un plasmide suicide par simple recombinaison homologue = mutagénèse dirigée insertionnelle 2. Par délétion/remplacement par double recombinaison homologue à l'aide de vecteurs de remplacement (plasmides thermosensibles intégratifs) 3. Applications de la mutagénèse dirigée II. La mutagénèse aléatoire 1. Les éléments génétiques transposables 2. Applications de la mutagénèse transpositionnelle aléatoire Le "gene tagging" B. Technologies transgéniques chez les plantes I. Principe de la transgénèse II. Technologies transgéniques chez les plantes transgénèse du génome nucléaire 1. Nature du transgène 2. Origine du transgène 3. Propriétés du transgène 4. Stratégies de transfert de gènes chez les plantes 5. Les méthodes de transformation. Insertion et expression du transgène 7. Problèmes rencontrés 8. Vérification moléculaire de l'intégration du transgène et de son expression III. Technologies transgéniques chez les plantes transgénèse du génome chloroplastique 1. Intérêts de la transgénèse chloroplastique 2. Applications de la transformation des chloroplastes 3. Comparaison entre la transformation nucléaire et celle des chloroplastes 4. Limites de la transgénèse chloroplastique TD : Analyses d'articles Scientifiques ECUE 2. Typage et Marqueurs Moléculaires. I. Introduction : Notion de diversité génétique, marqueurs génétiques, distances génétiques Définition d un marqueur génétique. Caractéristiques d un «bon» marqueur génétique Définition d un marqueur moléculaire Critères de classification : Critère génétique - Critère moléculaire II. Rappels sur les outils de la biologie moléculaire Les enzymes : Les polymérases - Les enzymes de restrictions LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 140

141 L hybridation L électrophorèse en gel Le séquençage III. Apports des marqueurs moléculaires Utilisation pour l identification individuelle et variétale Etablissement des relations phylogénétiques Utilisation en cartographie moléculaire Utilisation dans le clonage positionnel IV. Les marqueurs biochimiques L électrophorèse unidimensionnelle des isoenzymes Principe et différentes étapes de la technique Systèmes enzymatiques Méthodes d interprétation du polymorphisme enzymatique Avantages et inconvénients de la technique L électrophorèse bidimensionnelle des protéines dénaturées (2-D-SDS-Page) V. Les marqueurs à ADN Avantages des marqueurs à ADN Le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP) Les marqueurs de type PCR - Principe de la PCR Les techniques de MAAP (Multiple Arbitrarily Amplicon Profiling) Les marqueurs AFLP Les marqueurs ISSR Les marqueurs SSR : les microsatellites La technique DD- RT PCR TP et TD Extraction de l ADN génomique total d un végétal Spectrophotométrie et électrophorèse sur gel d agarose Réaction de PCR Lecture des zymogrammes et des profils électrophorétiques Réalisation d une matrice de données binaires Calculs des fréquences allèliques et des distances génétiques Etablissement des arbres phylogénétiques à partir des distances génétiques LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 141

142 Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 142

143 Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5) Domaine : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologie Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre 5) Unités Elément constitutif (ECUE) C-CI TD TP h/s H/S Coeff Coef,UE Crédits Régime d examen d enseignement Unité d enseignement transversale continu mixte Langues (Français, Anglais) 2h 2 2 X UE 1: Unité transversale Informatique et statistique appliquée 2h 2 2 X d enseignements Culture de l Entreprise (Organisation de l entreprise) : 1h X Unités d enseignement fondamentales UE 2 : Industrie pharmaceutique UE 3 : Biotechnologie pharmaceutique Industries des médicaments (fabrication, production, contrôle) Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutique Bioressources pharmaceutiques (animales, végétales et microbiennes) Médicaments issus de la biotechnologie 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h X Techniques d analyses et détection rapide UE 4 : Techniques 1h 1h45 2h45 38h X microbiologiques d analyses Techniques d analyse et détection rapide 1h 1h45 2h45 38h X physicochimiques Unités d enseignement optionnelles spécifiques ( à choisir obligatoirement crédits ) U.OP OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 143

144 Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre ) N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Stage pratique Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 144

145 Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5) Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE Nombre de crédits Code UE. Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences Technologie Diplôme et Parcours LA Biotechnologies. mention LF et Mention : Biotechnologies Parcours : tous les parcours de la Parcours : Semestre S5 5- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Etudier les bioressources microbiennes, végétales et animales dans l industrie pharmaceutique et médicale. Connaitre les principales biotechnologies (Génie génétique; Génomique et Protéomique) utilisées dans l'industrie pharmaceutique et les différentes catégories de médicaments biotechnologiques commercialisés ou en stade de recherche. - Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) BIORESSOURCES PHARMACEUTIQUES - Avoir des connaissances dans la diversité du vivant (taxonomie des microbes, des plantes et des animaux. - Maîtrise de certaines techniques d analyses physico-chimiques indispensables à l étude des biopharmaceutiques Médicaments issus de la biotechnologie - Avoir des pré-requis relatifs au domaine de l'industrie pharmaceutique - Avoir des connaissances des notions de base de Génétique, Biochimie, Microbiologie, Biologie Moléculaire, Biologie animale et végétale 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1-Bioressources 21 h 7 h 10 h 30 pharmaceutiques 3 2- Médicaments issus de la 21 h 7 h 10 h 30 biotechnologie 3 Total 42 h 14 h 21 h LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 145

146 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE 1-Bioressources pharmaceutiques 2- Médicaments issus de la biotechnologie Travaux au laboratoire Durée Projets Stages Autres 0h45/S visite 0h45/S visite Crédits 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Bioressources pharmaceutiques - Introduction à l industrie pharmaceutique : définition et principales bioressources de cette industrie (végétales, animales et microbiennes). - Principaux produits pharmaceutiques - Techniques d analyse et d étude des bioressources 2- Médicaments issus de la biotechnologie - Présenter aux étudiants un historique sur l'utilisation des biotechnologies dans l'industrie pharmaceutique - Connaître l'apport des biotechnologies (Biologie moléculaire, Génie génétique, Génomique, Protéomique ) dans la conception de nouveaux médicaments - Avoir des connaissances sur les principales catégories de médicaments biotechnologiques 4.2- Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Bioressources pharmaceutiques Etude des cas pratiques d analyse des principes actifs de microorganismes, de plantes et d animaux utilisés dans la fabrication des médicaments ou dans le diagnostic. 2- Médicaments issus de la biotechnologie Dans le cadre de cette partie d'enseignement, des visites des étudiants à des industries pharmaceutiques ou à des laboratoires de recherche de médicaments biotechnologiques sont prévues. 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) Diaporama PowerPoint illustrant les techniques d analyses et des échantillons représentatifs des différents groupes -Examens et évaluation des connaissances LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 14

147 .1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). 1- ECUE Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra TP et Ecrit TP Autre -tion Ecrit Oral Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours Total 10% 10% 10% 50% 20%.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 147

148 Annexe 1 Unité d Enseignement : BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE Code UE : ECUE n 1 : Bioressources pharmaceutiques Code ECUE : COURS Partie 1. Plantes médicinales et phytothérapie I Histoique II. Définitions -plantes médicinales (qu est-ce que la phytothérapie) -drogue végétale - médicaments à base de plantes III. Recherche des plantes a intérêt thérapeutique - criblage biologique systématique (screening botanique) - criblage phytochimique - criblage basé sur des sources bibliographiques informatisées IV. Source des plantes médicinales - plante cueillette - plante de culture - plantes cultivée améliorée - plante industrielle (alimentation, diététique, parfums, cosmétique, savons, textiles) V. Méthodologies de récolte du matériel végétal - culture et récolte des plantes médicinales (époque, condition, procédés) - séchage et conservation VI. Les principes actifs des plantes VII. Les méthodes d'extraction VIII. Précautions d emploi de la phytothérapie IX. Les plantes utiles en phytothérapie -fiche explicative de chaque plante -liste des plantes dangereuses X. Toxicologie et pharmacologie en phytothérapie XI. Application industrielle Partie 2. Bioressources microbiennes I. Les microorganismes à intérêt pharmaceutique I.1. Identification des microorganismes dans la nature : Techniques de screening I.2. Culture des souches I.3. La conservation des microorganismes I.4. Aspects microbiologiques du «scale up» II. Les principaux produits de la microbiologie industrielle II.1. Les antibiotiques II.2. Les enzymes II.3. Les acides aminés II.4. Les acides organiques II.5. Les composés spéciaux pour la médecine et la santé II.. Les biopolymères LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 148

149 II.7. Les biosurfactants II.8. Les vitamines et les aromes II.9. Les intermédiaires pour la synthèse organique II.10. Les méthodes de bioconversion III. Les applications biotechnologiques des microorganismes III.1. Les biosensors III.2. Les microarrays III.3. Les biopesticides Partie 3. Bioressources animales I. Définitions - Bioressources pharmaceutiques - Biopharmaceutiques II. Rappel sur la diversité des animaux III. Bioressources aquatiques IV. Bioressources terrestres V. Techniques d étude et d analyse des bioressources Annexe 2 Unité d Enseignement : BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE Code UE : ECUE n 2 : Médicaments issus de la biotechnologie Code ECUE : COURS A/ Historique des biotechnologies dans la production pharmaceutique - Apport des entreprises de biotechnologies aux grands groupes pharmaceutiques - Etapes de développement d'un médicament biotechnologique - Coût de développement et de création d'un médicament biotechnologique B/ Techniques de mise au point de nouveaux médicaments - La génomique et l invention des médicaments originaux - L'apport de la protéomique dans la conception de nouveaux médicaments - Le génie génétique - La technique des cellules hybridomes C/ Principales catégories des médicaments issus des biotechnologies microbienne, végétale et animale - Les hormones LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 149

150 - Les cytokines - Les facteurs de coagulation - Les anticorps monoclonaux - Les vaccins à base d'adn et les vaccins à base de protéines LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 150

151 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE TECHNIQUES D ANALYSES Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences Technologie Diplôme et Parcours LA Biotechnologies. mention LF et Mention : Biotechnologies Parcours : tous les parcours de la Parcours : Semestre S5 7- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Permettre aux étudiants de maîtriser les méthodes et les techniques rapides d analyses microbiologiques et physico-chimiques. 8- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) TAPC, Microbiologie, chimie et physique. 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs 1- Techniques d analyses et détection rapide microbiologiques 2- Techniques d analyses et détection rapide physicochimiques Volume horaire Cours TD TP Crédits 0 h 14h 24h h 14h 24h30 3 Total 0 h 28h 49h 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Activités pratiques de l UE 1- Techniques d analyses et détection rapide microbiologiques Travaux au laboratoire 1h45/s Durée Projets Stages Autres Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 151

152 2- Techniques 1h45/s d analyses et détection rapide physicochimiques 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Introduction à la pharmacopée, comptage des germes aérobies totaux, recherche des microorganismes spécifiés, test de stérilité et qualité microbiologique des préparations pharmaceutiques. 2- Méthodes d extraction, de préparation et de fractionnement, spectroscopiques, chromatographiques, électrophorétiques et isotopiques Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) C est une UE basée sur des TP et donc les manipulation sont très importantes. Plusieurs types de matériels (pour analyses chimiques, HPLC, CPG ; et microbiologiques, Electrophorèse, systèmes de coloration) seront mis à la disposition des étudiants. -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). 1- ECUE Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra -tion Ecrit Oral Ecrit TP Autre TP et Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Total 10% 10% 10% 50% 20% Coef. de l UE au sein du parcours.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 152

153 Annexe 1 Unité d Enseignement : TECHNIQUES D ANALYSES Code UE : ECUE n 1 : Techniques d analyses et détection rapide microbiologiques COURS Code ECUE : I. Introduction à la pharmacopée I.1. But et signification des méthodes de la pharmacopée II.2. Comparaison entre les pharmacopées européennes et l USP II. Comptage des germes aérobies totaux (Ph. Eur., 2..12) II.1. Description des testes généraux pour la détermination de l état microbiologique. II.2. principe II.2.1. Echantillonnage II.2.2. Préparation de l échantillon II.2.3. Inoculation (au choix) II.3. Les Milieux de culture utilisés II.4. Evaluation II.5. Plan de prélèvement III. Recherche des microorganismes spécifiés (Ph. Eur., 2..13) III.1.Tests décrits III.2. Signification des microorganismes spécifiés III.3. Sélection/Confirmation/Identification III.3.1. Principe III.3.2. Micro-organismes spécifiés : milieux sélectifs (Ph.Eur 2..13) III.3.3. Micro-organismes spécifiés : milieux indicateurs III.3.4. Limites (Pharmacopoeial Forum) III.3.5. Position Européenne sur les limites microbiennes IV. Test de stérilité (Ph. Eur., 2..1.) IV.1. Principe IV.2. Echantillonnage IV.3. Milieux de cultures utilisées IV.4. Evaluation des résultats IV. Qualité microbiologique des préparations pharmaceutiques (Ph. Eur., ) VI. Attributs microbiologiques (Bioburden) VI.1. Signification des résultats pour les PA/excipients VI.2. Résultats hors spécifications pour les PA/excipients. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 153

154 COURS Annexe 1 Unité d Enseignement : TECHNIQUES D ANALYSES Code UE : ECUE n 2 : Techniques d analyses et détection rapide physicochimiques Code ECUE : I- Méthodes d extraction, de préparation et de fractionnement 1. Prélèvement 2. Conservation (congélation et lyophilisation) 3. Précipitation, dialyse et filtration 4. Centrifugation et ultracentrifugation II- Méthodes spectroscopiques 1. Spectre de lumière (UV, visible, IR) 2. Colorimétrie et spectrophotométrie 3. Principe de la fluorimétrie III- Méthodes chromatographiques 1. Principe de la chromatographie 2. Les différents types de chromatographie IV- Méthodes électrophorétiques 1. Principe de l électrophorèse 2. Les différents types d électrophorèse 3. Les différentes méthodes de révélation V- Méthodes isotopiques 1. Principe de l utilisation des radio-isotopes 2. Utilisation et mesure de la radioactivité 3. Radio-protection. Partie 3. Techniques rapides de détection - Séance 1 : Test ELISA : Technique directe Technique Indirecte Technique Sandwich Technique Compétitive Manipulation :ELISA Sandwich - Séance 2 : Immunoblot - Séance3 : Agglutination de particules de latex - Séance4 : Immunofluorescence : Technique d inhibition de l hémagglutination Technique de fixation du complément Technique d hémolyse en gel - Séance 5 : manipulation :PCR et révélation TD : Techniques d hybridation sans amplification Hybridation par amplification du signal PCR et variantes Différents systèmes de révélation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 154

155 Fiche descriptive d une unité d enseignement (EU) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Nombre de crédits Code UE. Intitulé de l UE INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE Université :. Etablissement :.. Domaine de la formation : Sciences Technologie Diplôme et Parcours LA Biotechnologies. mention LF et Mention : Biotechnologies Parcours : tous les parcours de la Parcours : Semestre S5 9- Objectifs de l UE (savoirs, aptitudes et compétences) Maîtriser les spécificité techniques minimales dans le domaine de l industrie pharmaceutique et surtout dans le domaine réglementaire et socioéconomique ainsi que la maîtrise des risque des différents procédés utilisés dans ce domaines. 10- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Connaissance des différents procédés en génie des procédés pharmaceutique et les techniques de contrôle qualité 3-Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Industries des médicaments 21 h 7 h 10h Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques 21 h 7 h 10h30 3 Total 42 h 14 h 21 h 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires.) Durée Activités pratiques Travaux au de l UE Projets Stages Autres laboratoire 1- Industries des 0h45/S médicaments 2- Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques visite 0h45/S visite Crédits LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 155

156 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l UE) 1- Industrie des médicaments et Fabrication pharmaceutique 2- Les installations classées,le transport des matières dangereuses et les déchets et les rejets Activités pratiques de l UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d organisation de chaque activité) 1- Industries des médicaments Réalité de l industrie pharmaceutique dans le monde et en Tunisie Liste des industries en Tunisie et coordonnées Présentation du cadre réglementaire dans la mise en place d un nouveau produit pharmaceutique ; nouvelle molécule et générique Préparation d un dossier d AMM Exemple pratique du dossier d AMM Détails pratique et application de formulations pharmaceutique : aperçu pratique 2- Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques 5 Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d enseignement à distance) DATA show et présentation de cas pratiques Guide de l enregistrement du ministère de la santé publique Guide ICH pour la préparation du dossier CTD -Examens et évaluation des connaissances.1- Méthode d évaluation et régime d examens (Préciser le régime d évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées).2- Validation de l UE (Préciser les poids des épreuves d examens pour le calcul de la moyenne de l ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l UE au sein du parcours). 1- ECUE Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES Pondéra TP et Ecrit TP Autre -tion Ecrit Oral Autres Pondéra -tion Coef. de l ECUE 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 Coef. de l UE au sein du parcours Total 10% 10% 10% 50% 20%.3- Validation des stages et des projets... LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 15

157 Annexe 1 Unité d Enseignement : INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE Code UE : ECUE n 1 : Industries des médicaments Code ECUE : COURS Partie 1. Industrie des médicaments - Evolution de l industrie pharmaceutique - Brevets - Licences - Nouveaux produits - Etudes précliniques et cliniques - Mise en marché - Administration Partie 2. Fabrication pharmaceutique - Procédés de production - Théories reliées à la fabrication dans l industrie pharmaceutique - Théories de pré formulation et formulation industrielles - Optimisation et transposition d échelles - Contrôle qualité en industrie pharmaceutique : a) contrôle des matières première et produits finis : sources réglementaires : pharmacopées b) exemples pratiques de contrôle qualité en industrie pharmaceutique Annexe2 Unité d Enseignement : INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE Code UE : ECUE n 2 : Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques COURS Code ECUE : I. Les installations classées - Les organismes officiels dans le domaine de l environnement - Les principaux organismes professionnels - Contexte réglementaire et le régime juridique des installations classées - Les études (d impact, des déchets, des dangers) - L enquête publique - Faire évoluer les ICPE (modifications administratives, mise à jour de l arrêté préfectoral ) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 157

158 II. Le transport des matières dangereuses - Réglementation - Les bordereaux de suivi des déchets industriels - Le choix du transporteur - L enlèvement des déchets sur site (circulation, obligations du chauffeur, le véhicule d enlèvement ) - Le stockage intermédiaire sur plateforme de regroupement III. Les déchets et les rejets - Définitions - L obligation d élimination - La notion de responsabilité - Définir et classer les déchets (définition, codification et nomenclature) - Les étapes de la vie d un déchet - Comment regrouper les déchets - La gestion des déchets dans un laboratoire pharmaceutique - Les procédés des traitements des déchets (identifier et choisir) - Mettre en place des outils de gestion des déchets LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 158

159 Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 159

160 Programmes du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) - Semestre 5 UE Unité Transversale Technologie Aquacole Culture des organismes aquatiques Valorisation des bioressourses aquatiques OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO Crédits Horaire Régime d examen ECUE ECUE UE Coef Contrôle Régime C TD TP CI continu mixte Anglais 2 2 2H X Culture de l Entreprise (Création d entreprises) 2 2 1H30 X Biostatistiques 2 2 2H X Milieu de culture 2 2 0H30 0H45 0H45 X Alimentation en Aquaculture 2 2 0H30 0H45 0H30 X Reproduction contrôlée d organismes 2 2 0H30 0H45 0H30 aquatiques Culture et élevage des invertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Culture et élevage des vertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Biomolécules aquatiques d intérêt 3 3 1H 1H 0H45 X Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 10

161 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 11

162 Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie Marine et Aquaculture ECUE1 : Milieu de culture UE 1 Technologie Aquacole A Approvisionnement en eau 1- Besoins et débits 2 Caractéristiques physicochimiques 2 Ouvrages de prise et d amenée B Traitement 1 Epuration 2 Désinfection 3 Aération oxygénation C Recyclage 1 Objectifs 2 - Procédés ECUE2 : Alimentation en Aquaculture A Culture des micro algues 1 Caractéristiques physicochimiques des milieux de culture 2 - Techniques B - Elevage des proies 1 Milieux d élevage 2 Techniques de production 3 - Alimentation C Utilisation d Artémia 1 L emploi des Nauplii 2 L emploi des adultes D L aliment artificiel 1 L aliment en pâte 2 L aliment en granulés E Le zooplancton 1 Les techniques de collecte 2 Les utilisations ECUE3 : Reproduction contrôlée d organismes aquatiques A Reproduction contrôlée des Mollusques bivalves LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 12

163 1 L écloserie - Les structures - les techniques - Les espèces produites commercialement 2 La nurserie - Objectifs - Fonctionnement - Relations avec l écloserie B Reproduction contrôlée des crustacés 1 Obtention des pontes 2 Elevage larvaire C Reproduction contrôlée des poissons 1- Acclimatation, stabulation et maturation des géniteurs 2- Obtention des pontes, incubation des œufs et éclosion 3 Elevage larvaire UE 2 Culture des organismes aquatiques ECUE1 : Culture et élevage des invertébrés aquatiques A Les mollusques 1 - Méthodes et Techniques d élevage 2 - Espèces élevées B Les échinodermes 1 - Méthodes et Techniques d élevage 2 - Espèces élevées C Les crustacés 1 - Méthodes et Techniques d élevage 2 - Espèces élevées ECUE2 : Culture et élevage des vertébrés aquatiques A Les poissons 1 - Méthodes et Techniques d élevage 2 - Espèces élevées B Les tortues marines 1 - Méthodes et Techniques d élevage 2 - Espèces élevées LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 13

164 UE 3 Valorisation des bioressourses aquatiques ECUE1 : Biomolécules aquatiques d intérêt A Les biomolécules des macroalgues 1. Les alginates 2. Les laminarines 3. Les fucoïdes 4. Les carraghénanes de type kappa 5. Les Carraghénanes de type beta. Les Hydrolysats (source d Oligo-aliments et amendement de terres acides) B Les biomolécules des microalgues 1. Les Phycoérythrine 2. Les Flavonoïdes (Piègent les radicaux libres) C Les biomolécules de crustacés 1. Les Chitosane 2. Les Glucosamine et Sulfate de chondroïtine 3. Les Caraténoïdes 4. Les Protéines (enzymes et arômes) D Les biomolécules de Vertébrés 1. Protéines et enzymes (anti-gel, anti-microbiens, hydrolysat pour les saveurs et les arômes) 2. Les lipides (acides gras riches en Oméga-3 et phospholipides pour le traitement des maladies dégénératives) ECUE2 : Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques A Alimentation humaine directe B Les produits et les sous produits d origine marine dans l agroalimentaire 1. Les gélifiants 2. Les émulsifiants 3. Les épaississants 4. Les stabilisants C Les produits et les sous produits d origine marine dans l industrie pharmaceutique et médicale 1. Les anticoagulants 2. Les antiagrégants 3. Les amincissants 4. Les antitumoraux 5. Les antioxydants. Les cicatrisants D Les produits et les sous produits d origine marine dans la production cosméceutique LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 14

165 E Les produits et les sous produits d origine marine en agriculture 1. Engrais et de fertilisants 2. Composés pour l amendement des sols 3. Biopesticides F Les produits et les sous produits d origine marine en alimentation animale G Les produits et les sous produits d origine marine dans la lutte contre la pollution H Les produits et les sous produits d origine marine dans la fabrication de bijoux (perles, corail) I Les poissons ornementaux pour le marché de l aquariophilie LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 15

166 Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie Animale LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 1

167 Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Animale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie Animale) - Semestre 5 UE Unité Transversale Biotechnologies moléculaire et cellulaire Biotechnologies de la reproduction et du développement animal Exploitation et valorisation des produits d origine animale OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO ECUE Crédits Coef Horaire C TD TP CI Régime examen Contrôle continu Anglais 2 2 2H X Création d entreprises 2 2 1H30 X Biostatistiques 2 2 2H X Biotechnologie moléculaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologie cellulaire et tissulaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologie du développement 3 3 1H30 0H45 0H30 X Technologie de la reproduction animale Régime mixte 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biomolécules d intérêt 3 3 1H30 0H45 0H30 X Valorisation des produits et des sousproduits d origine animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 17

168 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Animale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie Animale) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 18

169 Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale UE1 : Biotechnologies moléculaire et cellulaire ECU E1 : Biotechnologies moléculaire (transgenèse) A- Rappels sur la manipulation et l amplification des gènes 1. ADN recombinant 2. Clonage 3. PCR B- Les techniques de transfert de gènes chez les animaux 1. Le modèle de la transgenèse chez la souris 2. Les constructions génétiques 3. Les méthodes de transfert 4. Les cellules cibles 5. Contrôle de l intégration et de l expression des transgènes C- Les applications de la transgenèse animale 1. Augmentation de la production animale 2. Lutte contre les maladies : différents modèles animaux de pathologie humaines 3. L amélioration de la qualité de la nourriture 4. La réduction de l impact environnemental 5. Amélioration du bien-être animal. Production de médicament chez l animal transgénique ECU E 2 : Biotechnologie cellulaire et tissulaire A- Techniques de culture de cellules animales 1. Milieux de cultures 2. Les conditions d incubation 3. La congélation et décongélation B- Les lignées de cellules animales 1. Lignées primaires 2. Lignées secondaires C- Différenciation in vitro et étude des marqueurs de différenciation 1. Modèle de l hématopoïèse 2. Organogenèse in vitro D- Teste fonctionnels in vitro 1. Croissance 2. migration 3. Adhésion 4. Apoptose E- La fusion cellulaire et la production d anticorps monoclonaux LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 19

170 UE2 : Biotechnologie de la reproduction et du développement animal ECU E 1 : Biotechnologie du développement A- Le développement embryonnaire in vitro 1. totipotence cellulaire 2. technologie de la culture embryonnaire (DIV : développement embryonnaire in vitro) B- Sexage embryonnaire 1. Le tri des spermatozoïdes mâles et femelles 2. le sexage des embryons C- Le clonage embryonnaire 1. La gémellité et la polyembryonie expérimentales 2. Le clonage d embryons par transfert de noyaux ECU E 2 : Technologie de la reproduction 1. Technologie du sperme 2. Production d ovocytes et d embryons in vivo 3. Production d embryons in vitro et transfert d embryons 4. Cryopréservation d ovocytes et d embryons 5. Production d embryons transgéniques UE3 : Exploitation et valorisation des produits d origine animale ECU E 1 : Biomolécules d intérêt A- Les sérums 1. de veau fœtal 2. de cheval pour la sérothérapie (antiscorpionique et antitétanique) B- Les anticorps 1. Anticorps pour le diagnostic 2. Anticorps pour la sérothérapie 3. Particularité des anticorps de dromadaire C- Les molécules à activité biologique 1. Les toxines 2. Autres molécules des venins ECU E 2 : Valorisation des produits et des sous-produits d origine animale A- Les peaux et l industrie du cuir et du textile B- Les produits et sous produits d origine animale dans l industrie agroalimentaire 1. Produits carnés 2. Produits laitiers 3. Approches biotechnologiques pour leur production, leur contrôle et leur conservation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 170

171 Programmes et Contenus du Parcours : valorisation des bio ressources des milieux arides LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 171

172 Programmes du Parcours : Valorisation des bioressources des milieux arides Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 5 UE Unité Transversale Valorisation des Phytoressources Valorisation des ressources Animales Exploitation industrielle des Bioressources OPT Nature de l UE UT UF UF UF UO Horaire Régime examen Contrô ECUE Crédits Coef le Régime C TD TP CI contin mixte u Anglais: préparation à la certification 2 2 2H X Culture de l Entreprise (Création d entreprises) 2 2 1H30 X Bioinformatique 2 2 1H 1H X Phytoressources en milieu aride 3 3 1H30 1H15 X Biotechnologies végétales 3 3 1H30 1H15 X Bioressources animales 3 3 1H30 1H15 X Biotechnologies animales 3 3 1H30 1H15 X Biomolécules d intérêt industriel 2 3 1H 0H45 X Extraction, analyse et identification de biomolécules 2 3 1H 0H45 X Génie fermentaire et transformations alimentaires 2 1H 0H30 0H30 X OPT X OPT X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 172

173 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 173

174 Contenus des Programmes du Parcours : valorisation des bioressources des milieux arides UE1 : Valorisation des phytoressources ECU1 : Les phytoressources en milieu aride : diversité et exploitation Contenu du cours : - Espèces pastorales /parcours - Arboriculture - Cultures oasiennes - Espèces médicales et aromatiques - Algues Contenu des TPs : - Reconnaissance (systématique) des espèces et constitution d un herbier - Sortie sur terrai ECU2 : Biotechnologies végétales et amélioration Contenu du cours : - Culture in vitro de cellules et tissus - Modification de génomes et amélioration des plantes : transgénèse, haploïdification, fusion de protoplastes - Transformation des phytomasse (microbiologique, enzymatique, chimique, ) - Culture algale Contenu des TPs : - Culture in vitro de tissues - Culture in vitro d anthères - Transgénèse végétale - Culture d une micro-algue UE2 : Valorisation des ressources animales ECU1 : Ressources animales en milieu aride Contenu du cours : - Espèces sauvages : Biodiversité et composition spécifique de la faune terrestre : Amphibiens, reptiles, avifaune, mammifères terrestres. - Intérêt et valorisation de la faune sauvage : valeur patrimoniale et intérêts (scientifique, médical, agronomique, écologique, économique) - Races domestiques - Ressources halieutiques ( à traiter pour chaque groupe : les espèces d intérêt économique leur localisation la reproduction - l exploitation (pêche et/ou Culture) l utilisation) : Les éponges et les coraux, les Mollusques (Céphalopodes - Bivalves et Gastéropodes), les Crustacés Décapodes, les poissons cartilagineux, les poissons osseux Contenu des TPs : - Systématique des espèces animales - Sortie sur terrain (Reconnaissance des espèces animales) - Visite : station d aquaculture - Visite d une ferme d élevage LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 174

175 ECU2 : Biotechnologies animales Contenu du cours : - Transgénèse animale - Culture cellulaire et clonage - Reproduction assistée - Cryopreservation - Lutte biologique contre les pestes - Elevage d animaux rares (exemples : aquaculture, faune sauvage, petits ruminants, mollusques, ver à soie, ) Contenu des TPs : - Culture cellulaire et cryopréservation - Fécondation in vitro - Visite de laboratoires spécialisés - Visite d une ferme/centre d élevage particulier (exp. faune sauvage, mollusques, ver de soie, ) - Visite d un verger/oasis : reconnaissance d insectes utiles (exp. de lutte biologique) UE3 : Exploitation industrielle des bioressources ECU1 : Biomolécules d intérêt industriel Contenu du cours : - Colorants et teintures - Huiles essentielles, flavonoïdes et alcaloïdes - Huiles alimentaires - Huiles industrielles - Biocarburants - Protéines et glucides d intérêt industriel Contenu des TPs : - Visites d usines de transformation de produits alimentaires et non alimentaires - Production de bio-éthanol - Production de savon ECU2 : Extraction analyse et identification de biomolécules Contenu du cours : - Méthodes d extraction et de purification (par solvants, CO 2 supercritique, hydrodistillation, ) - Chromatographie (CPG, HPLC,..) - Electrophorèse - RMN - Spectrophotométrie - Spectrométrie de masse Contenu des TPs - Extraction et identification de phénols - Extraction et identification d huiles essentielles ECU 3 : Génie fermentaire et transformations alimentaires Contenu du cours : LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 175

176 - Ingénierie de la fermentation - Fermenteurs de laboratoires et industriels - Calcul de paramètres et optimisation de la fermentation - Différents types de fermentations et de ferments Contenu des TDs/TPs - Conduite d une fermentation en bio-réacteur et effets des paramètres du milieu - Visite d usine LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 17

177 Programmes et Contenus du Parcours : Valorisation des ressources végétales LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 177

178 Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies UNITE D ENSEIGNEME NT ECONOMIE D ENTREPRISE, NORME ET LEGISLATION VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) - Semestre 5 Nature de l UE UT UF UNITES D ENSEIGNEMENT LANGUE/ ANGLAIS NORME ET LEGISLATION CULTURE DE L ENTREPRISE (ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE) MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX BIOTECHNOLOGIE VEGETALE 2 HORAIRE COURS TD TP 1H 1H 0H30 0H30 0H30 0H30 Cours intégré 2H 2H 1H CREDIT COEFFI CIENT 1 1 Régime d'examen Contrôle continu X Régime mixte X BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE REGLEMENTATI ON & VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX TECHNOLOGIE & BIOCHIMIE VEGETALES UF UF UO VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION VEGETALE ETUDE ET GESTION DE LA DIVERSITE VEGETALE PLANTES MEDICINALES ET AROMATIQUES REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE GESTION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX 2 OPT. 1 : BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES VEGETALES OPT. 2 : TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX 1H 1H30 1H30 1H30 1H30 1H30 1H30 0H30 1H 0H30 1H 1H 0H30 1H 1H 1H 0H30 0H X X X LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 178

179 Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) - Semestre N Unité d'enseignement Nature de l'ue Elément constitutif d'ue (ECUE) Volume horaire semestriel (14 semaines) Cours Cours TD TP intégré Crédits Coefficients Régime d'examen ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime mixte 1 Stage pratique UF Validation LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 179

180 Contenus des Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE : Langues, Economie, Normes et Législation Nombre des crédits : Code UE : VRV51... Université : SFAX Etablissement : Faculté des Sciences de Sfax... Domaine de formation : Sciences et Mention : Sciences du Vivant... Technologie... Diplôme et parcours Semestre LA : Licence appliquée Parcours : Valorisation des Ressources S5 Végétales 1- Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) Le cours de Langue : Français 1-comprendre : écouter :comprendre avec une relative aisance une interview de type argumentatif,comprendre une gamme étendue d enregistrement et y reconnaître les différents points de vue échangés ainsi que différencier l attitude du locuteur,suivre une interaction d une certaine longueur sur des sujets complexes voire abstraits. lire : déterminer le registre de langue approprié à a situation de communication, prévoir les procédés d argumentation appropriés à son intention de communication, s assurer de la qualité de l argumentation prévue par la discussion et la consultation d ouvrages de référence, mettre en correspondance titre,intertitre,et textes correspondants 2- parler : prendre part à une conversation : intervenir assez spontanément et avec précision lors de discussion et débats et lier ses interventions s à celles des interlocuteurs b- S exprimer oralement en continu : communiquer avec assurance, discourir de manière compréhensible et développer une argumentation avec un certain nombre d articulateurs, présenter clair développant des points de vue. 3- écrire : Transposer à l écrit un débat oral mené préalablement en classe, choisir un de des arguments avancés pendant ce débat et le développer par écrit, organiser un développement en plusieurs paragraphes en tenant compte de la situation de communication. Le cours de Normes et Législation : Présenter les normes et les exigences légales à respecter pour obtenir la commercialisation des produits agroalimentaires dans la Tunisie et l extérieur. Quelles normes à appliquer et à quels produits? Comment obtenir la conformité des produits? Que faut-il prendre en considération lors de la mise en circulation d un nouveau produit? 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) LANGUES : Français - maîtrise du texte explicatif (sujet d information, explication scientifique ou rapport technique) -maîtrise des techniques du résumé (reconnaissance du type de texte, établissement d un plan, réalisation).maîtrise des rédactions non argumentatives -maîtrises des techniques de la prise de notes (marche à suivre, éléments d organisation Pour le cours de Normes et Législation Chimie Générale, Chimie Organique, Biochimie Structurale, Méthodes d analyse physicochimiques. 3- Elément constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 180

181 Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Langues 2h Economie et gestion 2h 2 commerciale 3- Normes et Législation 1h 2 Total 1h 4h30 Annexe 1 Unité d Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET LEGISLATION Code UE : VRV51 ECUE n 1 : Langue (Français) Code ECUE :... Plan du cours Séance 1 : remue-méninges sur le sujet (1heure) Séance 2 : compréhension orale (1.30 heure) : écouter un discours argumentatif pour identifier les paramètres de la situation de communication, reconnaître la structure de l explication. Séance 2 : lecture (2heures) : comprendre et analyser les indices permettant une meilleure compréhension du texte argumentatif (indices d énonciation, indices d organisation, indices lexicaux Séance 3 : lecture /étude de la langue:( 2heures) : analyser la situation d énonciation et d argumentation, repérer les procédés de l argumentation Séance 4 : lecture vocabulaire (1 30heure) Séance 5 : lecture /écriture (2heures) Séance 5 : oral : simulation et rapport avec le thème jeux de rôle (1,30heure) : organisation d un débat en Séance : lecture /grammaire/ écriture (2 heures) :repérer les procédés de l argumentation, savoir utiliser les connecteurs logiques Séance 7 : Oral (2heures) : produire un discours argumentatif à l oral de façon vivante Séance 8 : lecture (1 heure) / orthographe /lecture : savoir accorder le participe passé Séance 9:lecture (2heure) : classer les arguments : argument inductif, argument déductif, raisonnement causal, argument contraignant, argument fondé sur les grandes valeur LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 181

182 Séance 10 : lecture 1 (1heure) : étudier les exemples, justifier leur emploi : Illustration, référence, preuve, Illustration, référence, preuve, témoignage Séance 11 : écriture (1 heure) : écrire un article scientifique en utilisant le discours argumentatif Séance 12 (1heure) : évaluation et remédiation Annexe 2 Unité d Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET LEGISLATION Code UE : VRV51 ECUE n 2 : NORMES ET LEGISLATION Code ECUE :... Plan du cours (14 H) Introduction Chapitre 1 : Intérêts de la normalisation dans le secteur agroalimentaire Chapitre 2 : Organisations mondiales et nationales des instances de normalisation et des institutions de législation Chapitre 3 : Normes de base, génériques et de familles de produits Chapitre 4 : Normes internationales Chapitre 5 : Normes et législation nationales Chapitre : Réalisation pratique de mise en conformité et laboratoires d essais Chapitre 7 : Implications pour les fabricants LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 182

183 Annexe 3 Unité d Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET LEGISLATION Code UE : VRV51 ECUE n 3 ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE Code ECUE :... Plan du cours 1. Economie générale - Economie contemporaine - Règles générales du droit des contrats - Mercatique - Concepts et études marketing - Comptabilité et analyse financière - Management processus et organisation de l entreprise - Finances d entreprise - Gestion et politique financière - Action commerciale internationale - Expérience professionnelle 2. Spécialisation «Commercial Produits Végétaux» - Economie des produits végétaux et produits végétaux - Les marchés des ressources végétales (l industrie pharmaceutique, le marché de l officine, le marché des établissements cosmétiques, le marché des services de santé ) En fonction des différents marchés : - Les produits/services (politique de prix, appels d offres, publicité des produits de santé, merchandising ) - Les approches commerciales (de la prospection à la négociation, de la vente à l après vente) LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 183

184 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Valorisation des ressources végétales. Nombre des crédits : Code UE : VRV52 Université : SFAX Etablissement : Facultés des Sciences de Sfax.. Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant... Diplôme et parcours Semestre LA Licence appliquée Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF... Parcours : Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) L'objectif de cette formation est d'acquérir des connaissances en microbiologie (écologie microbienne, biodégradation des résidus, Symbiose.) en biotechnologie végétale (culture in vitro, suspension cellulaires, la micro propagation.) et sur les techniques de transformations énergétique des végétaux. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Microbiologie, physiologie végétale Elément constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs 1- Microbiologie et fermentation des végétaux Volume horaire Cours TD TP Crédits 1h 0h30 0h Biotechnologie végétale 2 1h 0h30 0h Valorisation énergétique 1h 0h30 2 de la production végétale Total 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux sur terrain Durée Projets Stages Autres Crédits Total Annexe 1 LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 184

185 Unité d Enseignement : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES Code UE : VRV52 ECUE n 1 MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX Code ECUE :... Plan du cours - Bioréacteur à cellules immobilisées. Production de biomasse et recyclage de résidus. - Méthodes de détection d'agents phytopathogènes à l'aide de sondes moléculaires. - Identification de marqueurs génétiques (ex.: RAPD) aux fins de mise au point de méthodes de détection d'agents phytopathogènes. - Mécanismes cellulaires et moléculaires de résistance des plantes à l'infection microbienne. - Écologie et génétique des interactions sols-plantes-bactéries. Isolement, identification, caractérisation physiologique et génétique des bactéries associées aux plantes cultivées. - Agronomie, écologie et physiologie des symbioses Bradyrhizobium et Rhizobiumlégumineuses en cultures pures et intercalaires. - Étiologie et épidémiologie associées à la mycoflore phytopathogène du sol. - Écologie microbienne de la rhizosphère: micro-organismes utiles aux plantes. Écologie des micro-organismes modifiés génétiquement libérés dans l'environnement. - Biodégradation des résidus lignocellulosiques. Impact d'amendements frais ou compostés sur la microflore. - Symbiose Rhizobium-légumineuses: physiologie et génétique des bactéries et des nodosités (adaptation au froid). Biofertilisants. - Biomasse des groupes écologiques et activités de la microflore du sol et du compost. - Biochimie de l'humus. Biodégradation des composés organiques de synthèse. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 185

186 Annexe 2 Unité d Enseignement : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES Code UE : VRV52 ECUE n 2 BIOTECHNOLOGIES VÉGÉTALES 2 Code ECUE :... Plan du cours 1. Quelques procédés biotechnologiques des cultures in vitro - Bases cellulaires et physiologiques de l'organogenèse in vitro - Différenciation et dédifférenciation cellulaires - Aspects moléculaires de la variation somaclonale 2. Place des cultures in vitro dans les schémas de production des plantes - Micropropagation; caulogenèse; rhizogenèse - Embryogenèse somatique et semences artificielles 3. Suspensions cellulaires : conservation des souches et production de métabolites - Souches cellulaires: définition et établissement; cryoconservation - Stratégies biotechnologiques de production de métabolites secondaires 4. Intégration des cultures in vitro dans les stratégies d'amélioration des plantes - Bases génétiques de l'amélioration des plantes - L' haplodiploïdisation et son intégration dans les schémas de sélection - L'outil proroplaste et l'hybridation somatique - Notions de base de génie génétique : bases moléculaires de la relation Agrobacterium - plante et leur exploitation pour la création de plantes transgéniques; construction de vecteurs; transferts directs; secteurs d'application; législation 5. La micropropagation. Les plantes transgéniques et OGM 7. Biotechnologies et Biosécurité LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 18

187 Annexe 3 Unité d Enseignement : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES Code UE : VRV52 ECUE n 3 VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION VEGETALE Code ECUE :... Ressources 1- Ressources : Plan du cours - Cultures dédiées annuelles et pluri-annuelles (Plantes et herbacées Sylviculture) - Co-produits des cultures dédiées (Pailles et tiges de céréales et oléagineux - Résidus forestiers) - Autres co-produits et résidus (Agricoles Industriels Ménagers - Autres ) Lisiers, Fumiers, Paille combustible, Paille digestible, Cannes de maïs grain, Paille de colza, Paille de tournesol, Sarments, Déchets, Déchets municipaux, Rémanents forestiers, Haies et arbres épars, Connexes de bois, Bois bûche. - Matières organiques (Bois sec, Déchets de bois humides, Lisier, Fumier, Paille de céréale, Déchets ménagers, Boues d épuration déshydratées, Déchets agro-alimentaires). 2- Technologie de transformation - Voie oléo-chimique (Raffinage chimique et physique, Estérification, Hydrotraitement) - Voie thermochimique (Combustion Pyrolyse Gazéification - Valorisation du gaz de synthèse - purification, séparation - procédés catalytiques (FT, MeOH, DME)) - Voie biologique (Réactions enzymatiques Fermentation - Distillation, purification...) 3- Débouchés - Production directe d énergie : Chaleur, Vapeur, Électricité, - Carburants et combustibles : hydrogène, méthane, naphta, essence,s distillats, méthanol, éthanol, DME EMHV ; EEHV, ETBE, bio brut, charbon de bois autres Valorisation énergétique de la biomasse : La méthanisation, La Combustion, Potentiel chaleur, électricité, carburants, bois énergie, biogaz LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 187

188 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Biodiversité Végétale Terrestre. Nombre des crédits : Code UE : VRV53 Université : SFAX Etablissement : Facultés des Sciences de Sfax.. Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant... Diplôme et parcours Semestre LA Licence appliquée Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF... Parcours : Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) Permettre a l'étudiant d'acquérir une formation de base sur: -les systèmes écologiques et la gestion des ressources phytogénétiques -la valorisation et les techniques de culture des plantes médicinales et aromatiques.. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Botanique et biologie végétale Elément constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Etude et gestion de la diversité végétale 1h 30 1h 3 2- Plantes médicinales et 1h 30 0h 30 1h 3 aromatiques Total 3H 1H 30 1H 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux sur terrain Durée Projets Stages Autres Crédits Total LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 188

189 Annexe 1 Unité d Enseignement : BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE Code UE : VRV53 ECUE n 1 ETUDE ET GESTION DE LA BIODIVERSITE VEGETALE Code ECUE :... Plan du cours Biodiversité Biologie des extinctions Dynamique et viabilité des populations menacées Dynamique des systèmes Ecologiques et Gestion de la biodiversité Dynamique et modélisation des métapopulations Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Génétique des populations réduites ou morcelées Gestion des ressources phytogénétiques des populations spontanées et cultivées Aspects socio-économiques de la conservation et de la gestion des ressources biologiques Ecologie de la restauration et réintroductions. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 189

190 Annexe 2 Unité d Enseignement : BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE Code UE : VRV53 ECUE n 2 PLANTES AROMATIQUES ET MEDICINALES Code ECUE :... Plan du cours 1- Botanique des plantes médicinales et aromatiques 1-1. Plantes spontanées 1-2. Plantes cultivées 2- Valorisation médicale des plantes 3- Valorisation aromatique et cosmétique des plantes 4- Culture des plantes médicinales 5- Culture des plantes aromatiques - Aspects commerciaux -1.Circuits de commercialisation : -2. Importations -3. Exportations -4. Marché International 7- Aspects environnementaux : les plantes médicinales et aromatiques dans leur environnement 8- Gestion durable des ressources phytogénétiques industrielles et médicales LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 190

191 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Réglementation et valorisation des déchets végétaux. Nombre des crédits : Code UE : VRV54 Université : SFAX Etablissement : Facultés des Sciences de Sfax.. Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant... Diplôme et parcours Semestre LA Licence appliquée Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF... Parcours : Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) L'objectif de cette formation est de connaître les réglementations en vigueur en matière de contrôle de qualité. Déterminer les origines des déchets végétaux ainsi que le cadre et les obligations réglementaires. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Economie et gestion, droit de l homme Elément constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Réglementation et contrôle de la qualité 1h 30 1h 3 2- Gestion et valorisation 1h 30 1h 0H30 3 des déchets végétaux Total 3H 2H 0H Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux sur terrain Durée Projets Stages Autres Crédits Total LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 191

192 Annexe 1 Unité d Enseignement : REGLEMENTATION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX Code UE : VRV54 ECUE n 1 REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE Code ECUE :... Plan du cours 1. Introduction 2. Marques de distributeurs et marques de filières 3. Risques contractuels 4. Création et partage de la valeur 5. Standard de qualité minimum et marques de filières. Conclusion LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 192

193 Annexe 2 Unité d Enseignement : REGLEMENTATION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX Code UE : VRV54 ECUE n 2 GESTION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX Code ECUE : Les déchets végétaux Plan du cours Les déchets végétaux regroupent les déchets végétaux issus des tontes de gazon, les feuilles mortes, les tailles d'arbres et d'arbustes, l'élagage, les déchets de jardin des particuliers collectés séparément ou par le biais des déchèteries. 2. Origine des déchets Les déchets végétaux résultent notamment de l'entretien et du renouvellement : - des zones de loisirs, - des espaces verts publics, - des terrains de sport, - des jardins privés, - des collectivités territoriales, - des organismes publics ou parapublics (HLM, universités...), - des sociétés privées d'entretien des espaces verts, - des jardins des particuliers. 3. Cadre et obligations réglementaires 4. Obligations du détenteur* (producteur, collecteur, exploitants d installation de valorisation, etc) - Collecte et transport - Obligations de l'exploitant d'une installation d'élimination - Installation de compostage - Filières de traitement et de valorisation - Collecte - Valorisation - Compostage - Méthanisation - Incinération LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 193

194 Fiche descriptive d une unité d enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d une unité d enseignement (ECUE) Intitulé de l UE Technologie et biochimie végétale. Nombre des crédits : Code UE : VRV55 Université : SFAX Etablissement : Facultés des Sciences de Sfax.. Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant... Diplôme et parcours Semestre LA Licence appliquée Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF... Parcours : Objectifs de l UE (Savoir, aptitudes et compétences) Il s'agit d'acquérir des connaissances en biochimiques applique aux monde végétale (processus biochimique chez les végétaux, synthèse et structure des métabolites des plantes ) et en transformation des produits végétaux ( utilisation industrielle, extraction et isolement des constituants.) 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l UE concernée) Biochimie et biologie Végétale Eléments constitutifs de l UE (ECUE) 3.1- Enseignements Eléments constitutifs Volume horaire Cours TD TP Crédits 1- Biochimie appliquée aux ressources végétales 1h 30 0h 30 0h Technologie et 1h 30 1h 0h 30 3 transformation des produits végétaux Total 3H 1H30 1H 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires.) Activités pratiques de l UE Travaux sur terrain Durée Projets Stages Autres Crédits Total LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 194

195 Annexe 1 Unité d Enseignement : TECHNOLOGIE ET BIOCHIMIE VEGETALES Code UE : VRV 55 ECUE n 1 BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES VEGETALES Code ECUE :... Plan du cours - Compartimentation cellulaire des processus biochimiques chez les végétaux. - Membranes lipidiques, transporteurs protéiques et translocation cellulaire des métabolites. - Les protéines comme acteurs clés du métabolisme. - Synthèse et structure des métabolites typiques des végétaux. - Principes de base du génie métabolique. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 195

196 Annexe 2 Unité d Enseignement : TECHNOLOGIE ET BIOCHIMIE VEGETALES Code UE : VRV 55 ECUE n 2 TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX Code ECUE :... Plan du cours - Elaboration des constituants, des structures et des organes d'intérêt économique (organes de réserve, fibres alimentaires et agents de texture d origine pariétale, bois et fibres papetières ou textiles, produits du métabolisme secondaire) - Grands types d'utilisation industrielle des végétaux - Bases biologiques de la conservation des produits végétaux (réfrigération simple et atmosphère contrôlée, congélation, survie des fleurs coupées) - Forçage des organes (endive). - Extraction et isolement de constituants (fibres textiles, sucre de betterave et de canne, caoutchouc, protéines, lipides, amidon) - Quelques produits élaborés (farine et pain, malt et bière, raisin et vin) - Phytopathologie des produits frais. TP et TD et visites d entreprises - Démonstrations et analyses de documents - Visites d entreprises - Rédaction et présentation orale, par groupes de 3 ou 4, d un dossier scientifique et technique sur une plante ou un groupe de plantes d intérêt économique ou sur un thème se rapportant au programme du module. LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 19