Comment faciliter la réutilisation des données de recherche?

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1 Comment faciliter la réutilisation des données de recherche? Sana Tfaili Maître de Conférences des Universités UFR Pharmacie, Université Paris Sud Unité Interdisciplinaire Lip(Sys)²- Lipides: Systèmes analytiques et biologiques, Chimie Analytique Pharmaceutique 1

2 BUT: Gestion de données et amélioration de la puissance de calcul Producteurs des données avec différents formats de fichiers et méthodes de prétraitement et traitement de données. Création et gestion des bases de données Centralisation et stockage des données Ontologie, métafichiers, format commun pour la fusion de données (ex:.aia,.cdf) Amélioration de la puissance de calcul (Cloud) conversion commune, open access Management of Data for the Analysis of Lipids, Metabolites and Isotopes 'MoDALMI' 2

3 Conception des infobox permettant d afficher la base de connaissance directement sur le Wiki Contributeur de le wiki public DAAP Détection des divergences entre la base de officielles et les contributions des Mise à disposition automatique des données structurées à travers du wiki Validation et traduction des Groupe d experts Hébergement des et des données brutes et des traitements qui ont permis de déduire ces Public Déploiement de l ontologie de la base de officielles Validation et traduction des en RDF Accès restreint Extraction des métadonnées en respectant la base de officielles des protocoles et des mesures Définition de la requête pour sélectionner les données et écriture du script de traitement (MatLab ou R ou Python,...) fichiers de données au sein du serveur de stockage en réseau partagé au sein de l Université scripts de traitement, des données sélectionnées qui ont permis d obtenir les résultats (artefacts, la publication) Publication des résultats Légendes : Utilisation d un Wiki de type MediaWiki avec l extension LinkedWiki un accès via SPARQL partagé réseau public (http) Après chaque campagne de mesure Chercheurs protocoles expérimentales de le wiki privé DAAP En fonction des connaissance acquises définition d un nouveau projet Logiciel TopBraid pour écrire en RDFS les et les contraintes SHACL un accès via SPARQL Requêtage en SPARQL réseau en accès restreint (NAS) 3

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6 Conception des infobox permettant d afficher la base de connaissance directement sur le Wiki Contributeur de le wiki public DAAP Détection des divergences entre la base de officielles et les contributions des Mise à disposition automatique des données structurées à travers du wiki Validation et traduction des Groupe d experts Hébergement des et des données brutes et des traitements qui ont permis de déduire ces Public Déploiement de l ontologie de la base de officielles Validation et traduction des en RDF Accès restreint Extraction des métadonnées en respectant la base de officielles des protocoles et des mesures Définition de la requête pour sélectionner les données et écriture du script de traitement (MatLab ou R ou Python,...) fichiers de données au sein du serveur de stockage en réseau partagé au sein de l Université scripts de traitement, des données sélectionnées qui ont permis d obtenir les résultats (artefacts, la publication) Légendes : Publication des résultats Utilisation d un Wiki de type MediaWiki avec l extension LinkedWiki un accès via SPARQL partagé réseau public (http) Après chaque campagne de mesure Chercheurs protocoles expérimentales de le wiki privé DAAP En fonction des connaissance acquises définition d un nouveau projet Logiciel TopBraid pour écrire en RDFS les et les contraintes SHACL un accès via SPARQL Requêtage en SPARQL réseau en accès restreint (NAS) 6