Rapport annuel d'activité, année 215 Laboratoire National de Référence Rhinotrachéite infectieuse bovine (IBR) Nom du responsable du LNR Stephen VALAS Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les noms des unités associées au LNR Unité Rétrovirus des Ruminants Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les noms des laboratoires associés au LNR Anses Niort Nombre de laboratoires agréés et/ou reconnus dans le réseau 81 Précisez la catégorisation du danger (en SA) sinon la justification de l'existence du LNR (SA, SV et SSA) DS2 1
Les faits marquants de l'année - Forte imbrication de la référence avec les dispositifs de surveillance: mobilisation importante du LNR en diagnostic de confirmation. - Mise à disposition pour les gestionnaires d'une grille nationale d'aide à la gestion basée sur les données quantitatives des tests ELISA compétitifs. - Renforcement du contrôle de conformité des réactifs: ajout de nouveaux critères d'exigences portant sur l'homogénéité intra-lot et inter-lots. - Mise en place à l'échelle nationale de plusieurs échantillothèques bovines: sérums et laits d'animaux indemnes, infectés et vaccinés. - Organisation d'une journée technique sur la référence des DS2/DS3 - Accréditation 1725 en portée flexible. 1. Méthodes développées ou révisées Nombre de méthodes développées ou révisées proposées à l autorité compétente 2 Donner le nom et une brève description de chacune de ces méthodes - BioLisa Kit IBR gb Ab: ELISA compétitif sur sérum individuel. Fournisseur: Biosellal - Serelisa BHV-1 Ab Mono Indirect: ELISA indirect sur sérum individuel; Fournisseur: Synbiotics Nombre de méthodes développées ou révisées qui sont susceptibles d être prêtes pour être proposées à l autorité compétente au cours de l année 216 2 Donner le nom et une brève description de chacune de ces méthodes - ELISA indirect sur sérum individuel; Fournisseur: Biosellal - ELISA compétitif ge (test compagnon des vaccins DIVA) 2. Matériels biologiques ou chimiques, échantillons et souches d'intérêt Information disponible auprès du LNR 2
3. Activités d'analyse 3.1. Analyses officielles de première intention Nombre d'analyses officielles de première intention réalisées dans l'année (de biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...) Détaillez ici par type d'analyse de première intention sans objet 3.2. Analyses officielles de confirmation Nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées dans l'année (de biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...) 22 Détaillez ici par type d'analyse de confirmation 172 tests ELISA 48 test de séroneutralisation virale 1 test PCR Forte augmentation par rapport aux années précédentes Taux de confirmations par type d'analyse (= nombre de résultats confirmés / nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées) 143/22 3.3. Autres analyses Nombre estimé d'autres analyses (non officielles) réalisées dans l'année en lien avec le mandat de LNR 55 3
Détaillez ici par type d'autres analyses Forte augmentation des analyses dû à la caractérisation des différentes échantillothèques en cours de constitution 4. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence et de réactifs biologiques Le LNR produit-il et fournit-il des réactifs? Non Le LNR fournit-il des matériaux de référence? Oui Cette activité est-elle une obligation découlant de textes réglementaires, normatifs ou infra-réglementaires (notes de service). Si oui, lesquels? Oui. Les matériaux de référence sont fabriqués en faisant référence aux guides ISO 3 et 32, ainsi qu au guide FD V3-115 pour l utilisation de matériaux de référence. Quels sont les types de matériaux de référence (MRE, MRI, contrôles positifs ou négatifs, autre) produits et fournis? Les matériaux de référence disponibles sont des MRE et un MRI Quel est le format (sérum, souche, produit chimique, autre) de ces matériaux de référence? Sérums en flacons sous une forme lyophilisée et conservés à -18 C Quel est le nombre de lots produits et fournis par an? (moyenne sur les 5 dernières années) 85 Quelles sont les quantités produites/fournies par lot? (moyenne sur les 5 dernières années) 3 4
Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années Stable Le LNR réalise-t-il des contrôles de réactifs commerciaux? Oui Cette activité est-elle une obligation découlant de textes réglementaires, normatifs ou infra-réglementaires (notes de service). Si oui, lesquels? Selon la norme U47-31 Quelles sont les modalités de contrôle (initiaux, répétitifs, lot par lot)? Contrôles initiaux avant commercialisation et contrôles de conformité de lot Quel est le nombre de contrôles - ou de lots contrôlés - par an? (moyenne sur les 5 dernières années) 4 Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années Stable 5. Activités d'expertise scientifique et technique 5.1. Demandes d expertise scientifique et technique du ministère (chargé de l agriculture, santé, etc ) ou d instances communautaires et internationales qui concernent votre domaine de compétence Nombre de rapports d'est rendus dans l'année 1 5
Détaillez ici les demandes d'est et les noms des mandataires Problème d'export de bovins en Algérie; DGAl 5.2. Autres expertises Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise (internes: CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de commissions de normalisation (Afnor...). Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré. Le Responsable du LNR-IBR est membre scientifique du Comité de Suivi et d Evaluation de l ACERSA. Il participe à ce titre à différents GT sur la thématique IBR. Le temps consacré est évalué à 3 jours par mois. Le chargé de mission référence du laboratoire fait partie de la commission de normalisation de l'afnor - U47 A "Méthodes d'analyses en santé animale". Il participe aux réunions du groupe de travail santé animale GT4 "réactifs" et "révision de la norme U47-4". Il fait partie du comité technique de la plateforme PAS et fait partie du GT validation de méthode de l'anses. Il est coordinateur des EILA en santé animale pour l'anses. Le temps consacré est évalué à 3 jours par mois en intégrant le temps de préparation. 5.3. Dossiers de demande d'agrément Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année 5.4. Activités de conseil aux professionnels Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré Activités de conseil auprès des laboratoires agréés, des professionnels (GDS, éleveurs), des vétérinaires, des producteurs de réactifs : 65 appels téléphoniques. Expertise épidémiologique à la demande d'un GDS: 2 jours Participation aux assemblées générales de certains GDS: 3 jours Journées d échange avec les producteurs de réactifs : 2 jours Journée Nationale de la Référence Professionnelle : 1 jour 6
6. Animation du réseau de laboratoires agréés ou reconnus 6.1. Organisation d'eila Précisez ici le nombre d'eila organisés par le LNR au cours de l année Nom (s) et nombre(s) d'eila que vous prévoyez d'organiser au cours de l année 216 EILA IBR sur matrice sérum et lait: 2 Précisez le nombre d'eil (hors EILA - dont EILV en lien avec méthodes en cours de validation telles que précisées dans le paragraphe 1) organisés par le LNR au cours de l année Précisez le nombre d'eil (hors EILA) que vous prévoyez d'organiser au cours de l année 216 6.2. Formation, organisation d'ateliers, accueil de stagiaires Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires agréés du réseau, organisées dans l'année 2 Détaillez ici ces activités et indiquez le nombre de participants par journée - Journée technique de la référence professionnelle: 12 participants. Présentation du bilan analytique annuel du LNR-IBR et de la programmation des activités. - Réunion annuelle de la coordination des EILA en santé animale Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux méthodes utilisées pour les contrôles officiels, organisées dans l'année 7
6.3. EILA auxquels le LNR a participé dans l'année Détaillez les EILA auxquels le LNR a participé dans l'année, dans le cadre : National; UE ( EILA organisé par le LRUE); International - ELISA lait/ahvla (UK) - ELISA sérum/coda-cerva (Belgique) 7. Participation aux activités de surveillance 7.1 PS/PC Existe-t-il un ou plusieurs PS/PC élaboré(s) par l'autorité sanitaire dans le champ du LNR? Non 7.2 Activités de surveillance hors PS/PC 7.2.1 Dispositif(s) hors PS/PC Indiquer si le LNR est intégré à un (ou des) dispositif(s) de surveillance (hors PS/PC)? Oui En dehors du dispositif PS/PC de la DGAl préciser si le LNR est intégré à un autre dispositif (Résapath, Salmonella, Resabeille,...) dispositifs obligatoire et volontaire de lutte contre l IBR 7.2.2 Gestionnaire du dispositif Indiquer qui est le gestionnaire de ce dispositif de surveillance GDS France/ACERSA 8
7.2.3 unités intégrées dans le dispositif Préciser si d'autres unités/entités de l'agence sont intégrées dans ce dispositif à vos cotés Non 7.2.4 Les partenaires et acteurs de ce dispositif de surveillance Sont acteurs ou partenaires de ce dispositif (plusieurs réponses possibles) : Le réseau de laboratoires du LNR Un réseau de vétérinaires Un réseau d'acteurs professionnels 7.2.5 Modalités de surveillance Préciser si ce dispositif repose (plusieurs réponses possibles) : Sur des modalités de surveillance programmées (active) 8. Activités de recherche en lien avec l activité de référence 8.1. Recherches méthodologiques pour la référence Détaillez ici les recherches méthodologiques que vous avez réalisées dans l'année : objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre d'appels à projets... Développement d'outils sérologiques pour le diagnostic spécifique de l'ibr: - Optimisation des trousses ELISA compétitif ge à travers la définition de nouveaux seuils de positivité, en vue de leur utilisation en diagnostic de confirmation pour la campagne de prophylaxie 215-16. - Poursuite du développement d'un test ELISA fondé sur des antigènes recombinants spécifiques du virus BoHV1 responsable de l'ibr - Définition d'une grille nationale d'aide à la gestion reposant sur les données quantitatives des tests ELISA gb compétitifs (définition de nouveaux seuils de positivité) 9
8.2. Recherches associées Détaillez ici les recherches associées auxquelles vous avez participé dans l'année: participations à des études cliniques, études d'incidences, modèles d'infections expérimentales, études toxicologiques, essais vaccinaux... L objectif principal des recherches associées conduites par le LNR-IBR est de recueillir des informations permettant d objectiver le rôle des différentes espèces de ruminants dans l épidémiologie des affections virales herpétiques et d évaluer les impacts d une éventuelle circulation interspécifique sur les opérations collectives de dépistage mises en œuvre chez les bovins en France. - Le LNR est partenaire scientifique du réseau SPAC (Stress Pathogène Chevreuil), réseau co-animé par L Inra de Toulouse et VetAgroSup, qui a pour but de collecter des données sur le rôle du chevreuil dans la circulation des pathogènes. Le LNR-IBR réalise régulièrement une expertise analytique sur des sérums de chevreuils collectés dans différents sites géographiques. - Le LNR-IBR a mis en place avec l'appui de GDS France une collecte d'échantillons pour appréhender dans leur globalité les évènements à l origine des positifs isolés dans les cheptels qualifiés indemnes d'ibr. La caractérisation de ces échantillons avec l'ensemble des outils actuellement disponibles devrait fournir des pistes d'investigation sur la circulation de génotypes viraux autres que celui responsable de l'ibr. - Des tests sérologiques fondés sur des protéines recombinantes dérivées de différents génotypes viraux sont en cours de développement. 9. Relations avec le CNR Existence d'un CNR Non 1. Autres mandats Le LNR détient-il d'autres mandats de référence dans le même domaine de compétences Non 1
Annexes PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES Suavet F., J-L. Champion, L. Bartolini, M. Bernoud, J-P. Alzieu, R. Brudigou, S. Danartigues, G. Reynaud, C. Perrin, G. Adam, R. Thiery, V. Duquesne (215). First description of the circulation of Caprine herpesvirus 1 (CpHV-1) in goats in mainland France, isolation of the first French CpHV-1 strain. Pathogens (sous presse). PUBLICATIONS À DESTINATION DES PROFESSIONNELS Gache K., S. Memeteau, D. Ngwa-Mbot, S. Wendling, S. Valas, J. Vialard (215) Bilan de la surveillance réglementée et facultative de l IBR en France en 213-214 : une situation stable et de nouvelles perspectives. Bulletin épidémiologique Santé animale-alimentation. COMMUNICATIONS NATIONALES Valas S, S. Memeteau, J.-P Jacquemin (215). Interaction entre gestion et référence : exemple de l IBR. Journée technique de la référence professionnelle. Maisons-Alfort, Paris. 11