Marine Lorent, Yohann Foucher, Magali Giral. 13 Décembre 2012. Di at EA-4275



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Transcription:

Courbes ROC nettes dépendantes du temps : méthode d évaluation de la capacité d un marqueur à prédire la mortalité liée à l insuffisance rénale terminale chez des patients transplantés rénaux. Marine Lorent, Yohann Foucher, Magali Giral EA 4275, Université de Nantes, Nantes, France Institut de Transplantation, Urologie et Néphrologie (ITUN), CHU de Nantes, Inserm U1064, Centaure, Nantes, France 13 Décembre 2012 1 / 14

Intérêt d un score pronostique de mortalité en transplantation rénale : Identification des patients greffés à haut risque de décès Amélioration de la prise en charge thérapeutique Évaluation de la capacité pronostique d un score de mortalité : Méthode des courbes ROC dépendantes du temps 1 Aire sous la courbe : AUC 1. Heagerty et al., Biometrics, 2000. 2 / 14

et al. (1) (Transplantation, 2009) Objectif Score pronostique de mortalité (toutes causes confondues) au-delà de la première année post-transplantation chez des patients greffés du rein Méthode Score obtenu à partir d un modèle de Cox multivarié Score basé sur 8 variables Baseline : âge du patient, diabète et anticorps HCV Dans la 1 re année : diabète de novo, créatininémie, protéinurie et traitement par tacrolimus ou MMF 3 / 14

et al. (2) (Transplantation, 2009) Résultats du modèle de Cox Variables Coefficients Age (classe de référence : < 40 ans) 40-50 ans 0,80 50-60 ans 1,32 > 60 ans 1,91 Diabète pré-greffe 0,58 Anticorps HCV 0,44 Diabète de novo dans la 1ère année de greffe 0,45 Créatinine sérique à 1 an de greffe (mg.dl 1 ) 0,56 Protéinurie > à 1g à 1 an de greffe 0,99 Utilisation de tacrolimus -0,48 Utilisation de MMF -0,78 Score = 0, 80 (Age 40-50 ans) + 1, 32 (Age 50-60 ans) + 1, 91 (Age > 60 ans) + 0, 58 (Diabete pré-greffe) +... Rôle important de l âge du receveur et de la protéinurie à 1 an de greffe pour la prédiction de la mortalité globale Construction de la courbe ROC dépendante du temps 4 / 14

Courbes ROC dépendantes du temps sensitivity at 10 years 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 All cause ROC curve at 10 years (AUC=0.68) 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 1 specificity at 10 years Résultats Pronostique à 10 ans : AUC = 0.68, IC95%=[0.62, 0.74] Capacité pronostique de la mortalité acceptable 5 / 14

Limites Les receveurs les plus âgés sont plus à risque de décès que les patients plus jeunes Peu d intérêt pour les transplanteurs De plus En transplantation rénale : Une part importante de la mortalité n est pas liée directement à l insuffisance rénale terminale Impossible de déterminer individuellement la causalité des décès (Exemple : Cancer qui provoque le décès) Solution : distinguer la mortalité attendue et la mortalité en, à partir d un modèle de survie relative à risque additif 6 / 14

Modèle de survie à risque additif, application à la transplantation rénale (Estève et al., Stat in Med, 1990) Mortalité globale (toutes causes confondues) Expected Mortalité failure attendue risk (for a comparable (groupe "contrôle" "control" group) comparable) Excès de mortalité lié spécifiquement à la pathologie Transplantés rénaux Population générale Transplantés rénaux Objectif : Estimer la "survie nette" 7 / 14

Prédiction de la mortalité liée à l insuffisance rénale terminale Création d un score de mortalité en à partir d un modèle à risque additif Évaluation de la capacité d un score à prédire l de mortalité Aucune méthode dans la littérature Nouvelle méthode : Courbes ROC nettes dépendantes du temps 8 / 14

Modification du score de Prédiction de la mortalité liée à l insuffisance rénale terminale Utilisation de la cohorte DIVAT Nantes Conservation des 8 variables prises en compte dans le score de Estimation de nouveaux poids pour chacune des variables à partir d un modèle de survie à risque additif (pop. de référence = pop. générale) Description de l échantillon (n=1230) Age moyen : 49,0 ans (±13,8) 62,4% d hommes Temps de suivi médian : 4,9 ans 83 décès observés (toutes causes confondues) 9 / 14

Estimations des fonctions de survie nette et globale Patient survival 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 All cause survival (Kaplan Meier) Net survival (Pohar Perme) number of at risk patients 1091 969 828 708 587 482 390 283 214 150 99 56 19 0 2 4 6 8 10 12 A 10 ans post-greffe Time since the 1st anniversary (years) Survie globale = 87,8%, IC95%=[85,1-90,7] Survie nette = 93,0%, IC95%=[90,0-96,1] Parmi les décès observés 40% ne sont pas liés à la maladie 10 / 14

Score modifié Résultats du modèle à risque additif Variables Coef. Hern. Coef. modifiés Age (classe de référence : < 40 ans) 40-50 ans 0,80 1,00 50-60 ans 1,32 0,54 > 60 ans 1,91 0,99 Diabète pré-greffe 0,58 1,51 Anticorps HCV 0,44 1,35 Diabète de novo dans la 1ère année de greffe 0,45 1,53 Créatinine sérique à 1 an de greffe (mg.dl 1 ) 0,56 0,65 Protéinurie > à 1g à 1 an de greffe 0,99 0,66 Utilisation de tacrolimus -0,48 0,14 Utilisation de MMF -0,78 0,18 Diabète pré-greffe, Anticorps HCV et Diabète de novo rôle important pour la prédiction de la mortalité en Age rôle moins important pour la prédiction de la mortalité en que pour la prédiction de la mortalité globale 11 / 14

Courbes ROC nettes dépendantes du temps Résultats Pronostique à 10 ans, Score modifié : AUC nette = 0,73, IC95%=[0,64-0,80] : AUC nette = 0,65, IC95%=[0,56-0,72] sensitivity at 10 years 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 Net ROC curve score (AUC=0.650) Net ROC curve Modified score (AUC=0.733) 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 1 specificity at 10 years 12 / 14

Intérêt de la méthode Utile dans le cas où l identification de la cause de décès est impossible AUC nette au temps t interprétable : Pour 2 patients sélectionnés de manière aléatoire, probabilité que le patient qui décède de sa maladie le premier ait un score plus élevé que l autre patient possible pour d autre domaines de la médecine et de la biologie Perspective Prise en compte des patients dialysés comme population de référence 13 / 14

Merci pour votre attention! Remerciements Equipe EA 4275 plus particulièrement la cellule DIVAT Biostatistique : Magali Giral, Professeur Néphrologie Pascal Daguin, Informaticien Sandra Lefloch, ARC Philippe Tessier, Economiste de la santé Yohann Foucher, Maitre de conférences en Biostatistique Etienne Dantan, Maitre de conférences en Biostatistique Katy Trébern-Launay, Doctorante en Biostatistique Florence Gillaizeau, Doctorante en Biostatistique 14 / 14