Du 6 au 10 Octobre 2014 La Colle sur Loup (Alpes Maritimes)

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1 Du 6 au 10 Octobre 2014 La Colle sur Loup (Alpes Maritimes)

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3 Objet du réseau Statut du RFMF: association loi 1901 Dépôt des statuts à la Préfecture de Gironde le 12 juillet 2007 Publication le 4 Août 2007 Contribuer au développement de la M-F en France 1. Favoriser les échanges entre les chercheurs 2. Favoriser / structurer l'enseignement et la formation 3. Organiser ou soutenir l organisation de congrès/colloques 4. Favoriser la participation des jeunes chercheurs aux congrès

4 Animation scientifique & formation Depuis 2005: 8 Journées scientifiques Lyon en mai 2014 (260 personnes) Lille en mai ou juin 2015 Soutien de congrès /meeting 2013: 15 bourses 2014: 18 bourses Formation Actions pédagogiques au sein des universités Première Ecole chercheur en 2009 sur Métabolomique: Stratégie et aspects pratiques

5 6 JeConnaisUnPhotographe.com 9 èmes Journées Scientifiques Mai/Juin 2015 Villeneuve d'ascq (Lille) JeConnaisUnPhotographe.com JeConnaisUnPhotographe.com

6 8 Journées Scientifiques Lyon, mai 2014 Assemblée Générale Lille 2015 Renouvellement de tous les membres du CA Possibilité de changer de nom du RFMF Choix du nouveau logo Appel à candidature pour le CA et le secrétariat Ce sera le moment de passer d un statut de spectateur à un statut d acteur

7 En 2013: 136 messages ont été relayés sur la liste de diffusion RFMF dont 87 offres d'emploi et 3 stages masters 294 personnes inscrites Sur la mailing liste Procédure Envoyer un courriel à la liste de diffusion modérée : rfmf@listes.inra.fr pour atteindre tous les membres du RFMF ou spécifiquement à club-rfmf-junior@listes.inra.fr pour les membres du RFMF junior.

8 8 Journées Scientifiques Lyon, mai 2014 Assemblée Générale Création du RFMF Junior: 18 Décembre 2013 Objet du RFMF Junior Mettre en valeur les jeunes chercheurs Apprendre à diriger des projets Tisser un réseau de collaborations Favoriser des échanges scientifiques Faciliter la présentation des travaux de recherche

9 Fonctionnement de l association Conseil d administration (mandats de 3 ans sauf secrétaire, chargé de communication et trésorier: 5 ans) Bureau Président (D ROLIN, Bordeaux) Vice-Président (S AKOKA, Nantes) Communication (C DEBORDE, Bordeaux) Trésorier (JC MARTIN, Marseille) Secrétaire (ML LOMBARD, Bordeaux) 6 membres élus A BOUCHEREAU (Rennes) F COURANT (Montpellier) E GONTIER (Amiens) F JOURDAN (Toulouse) C JUNOT (Saclay) E PUJOS-GUILLOT (Clermont-Ferrand)

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14 Trois principales stratégies analytiques RMN, GC-MS et LC-MS Empreintes métaboliques ou profils métaboliques profils métaboliques RMN - Simple, non invasif - Rapide - Applicable à des biomatériaux intacts et aux grandes séries Mais : - Sensibilité limitée - Identification de composés inconnus GC-MS - Sensible - Reproductible - Bibliothèques de spectres de masse Modification chimique requise pour les composés non volatils - Composés non thermosensibles Séminaire Biotechnologies 9 et 10 février 2012 LC-MS - Accès à la masse moléculaire (identification) - Analyse des molécules thermolabiles - sensible Mais: peu reproductible

15 Fig. 1 The workflow of a nutritional metabolomics study: hypothesis, experimental design, sampling of biofluids, the analytical platform, the sample spectra, the multivariate data analysis and the biological interpretation. Francesco Savorani, Morten Arendt Rasmussen, Mette Skau Mikkelsen, Søren Balling Engelsen A primer to nutritional metabolomics by NMR spectroscopy and chemometrics Food Research International, Volume 54, Issue 1, 2013,

16 Lipidomics and the lipid world Metabolite identification and quantification Metabolic fingerprinting high density Biomarker identification Data Sample integration preparation data mining Infrared Biology technology Data expertise reduction Analytical INFORMATICS Robots Tools GC-MS BEFORE AFTER Expertises NMR Experimental LC-MS 1D-2D Statistic ti ti Design analysis alysis Metadata concept and database Network analysis and modeling Metabolomic flux quantification Using stable isotopes for metabolomics Séminaire Biotechnologies 9 et 10 février 2012

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18 Sources d ionisation possibles en spectrométrie de masse Multiplicité des analyseurs de masse (avantages et inconvénients selon la question posée) Couplages chromatographie gazeuse et liquide

19 Study Design et échantillonnage Travail en sous groupe Préparation de l échantillon Table ronde

20 Les différentes méthodes d'acquisition des données Table ronde Quizz

21 Le traitement des données : principes, étapes et outils suppression du bruit de fond, alignement des pics chromatographiques, intégration des pics, gestion des valeurs manquantes Les outils disponibles (constructeurs et free), faire un point important sur xcms off-line + xcms on-line Laboratoire MycSA INRA Bordeaux-Aquitaine

22 Les programmes intégrés de traitement des données Les travaux pratiques Unité de nutrition humaine INRA 'Metabolism Exploration Platform'

23 Pré-traitement des données et théorie statistique Les travaux pratiques CEA Saclay

24 Panorama global sur l'identification des métabolites Méthodes d'interprétation des résultats Travaux pratiques sur l'élucidation structurale

25 Les réseaux métaboliques UMR Toxalim INRA Réseaux métaboliques et system biology UMR BioMet INRA INSERM Univ. Aix Marseille

26 Les apports de l école Travail en sous groupe Table ronde

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29 Louvain 1 Rennes Fougères3 Mt Saignan 1 Paris 11 Angers-Tours 6 Dijon 1 Nancy 1 Nantes 1 Clermont-Fd 7 Lyon 3 Bordeaux 5 Avignon 2 Grenoble 1 Toulouse 4 Marseille 5 Nice 2 Toulon 1

30 Plante Santé Nutrition alimentation Environnement- biomarine Microbiologie biotechnologie 0 Axe des catégories

31 Debutants Utilisateurs Spécialistes Sans titre 1 16, ,5 0 Debutants Utilisateurs Spécialistes 49 réponses sur 54

32 20 Sans titre Post Doc TR-Ai Ens-Cher Doctorants Chercheurs Ingénieurs

33 40 Sans titre INRA CNRS Univ INSERM CEA Autres

34 Sans titre CEPIA AlimH PHASE SPE BAP MICA EA EFPA SA