Analyse et modélisation des données

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1 Analyse et modélisation des données Mention : Génétique et physiologie, bioinformatique Nature de la formation : Diplôme national de l'enseignement Supérieur Durée des études : 2ans Crédits ECTS : 120 Formation accessible en : Formation initiale Formation continue Lieu de formation : Campus des Cézeaux (Aubière).

2 Analyse et modélisation des données UFR Sciences et Technologies PRÉSENTATION Objectifs La mention Génétique, Physiologie et Bioinformatique La mention Génétique et Physiologie, Bioinformatique vise à promouvoir une vision intégrée du fonctionnement des êtres vivants pluricellulaires en s'appuyant sur des compétences en génétique, bioinformatique, endocrinologie, signalisation-oncologie et neurophysio-pharmacologie. Ainsi, la mention intègre à différents niveaux de complexité des aspects mécanistiques «ciblés» et des aspects systémiques depuis les échelles cellulaires jusqu'à l'échelle des organismes. Ces différentes notions sont abordées par des approches expérimentales et par l'exploitation de données issues des technologies de la génomique et de la post génomique. La formation inclut un stage de recherche ou un stage en entreprise de 6 mois. La mention se décline en deux spécialités : - La spécialité Génétique et Physiologie Recherche - La spécialité Professionnelle/Recherche Analyse et Modélisation des Données La spécialité Analyse et Modélisation des Données Il s'agit d'une formation interdisciplinaire qui s'appuie sur des compétences fortes en biologie, informatique et mathématique. Cette spécialité a pour objectif l'acquisition des fondamentaux en biologie (génétique et physiologie), en informatique et en statistiques, ainsi que la maîtrise des outils et des méthodes de la bioinformatique. Les étudiants devront acquérir un niveau d'expertise supérieur par l'étude des méthodes d'analyse et la conception d'outils bioinformatique, ainsi que leur mise en oeuvre dans le cadre de grand projets de génomique et de post-génomique. La formation offre une personnalisation sur des aspects spécifiques de la bioinformatique (réseaux biologiques, modélisation moléculaire ), de la biologie (génétique, physiologie) ou de l'informatique (systèmes d'information, grilles de calculs, fouille de données). Compétences visées Utiliser les bases de données et les logiciels de bioinformatique : annotation structurale et fonctionnelle de séquences biologiques, alignement de séquences, analyse phylogénétique Analyser les données post-génomiques : traitements statistiques, analyse de l'expression des gènes, fouille de données, analyse de réseaux de gènes Modéliser et traiter le signal biologique Concevoir des applications bioinformatique, des web-services Etablir des veilles technologiques et scientifiques Rédiger des rapports scientifiques. ADMISSION Conditions d'accès M1: Etudiants titulaires d'une licence de Biologie ou tout diplôme équivalent. M2: Etudiants titulaires d'un master 1 de Biologie ou tout diplôme équivalent. L'accès à la 2ème année de la spécialité est automatique pour les étudiants ayant validé la première année. Possibilité de mettre en place une procédure de validation des acquis (VAE / VAP) si vous n avez pas le niveau universitaire requis et/ou si vous souhaitez obtenir tout ou partie des modules qui constituent le diplôme. Pour cela, il faut justifier d au moins trois ans d expérience professionnelle dans le domaine. Inscription M1 : L'admission se fait sur dossier de candidature à télécharger sur le site web de l'université : 2

3 Les étudiants déjà inscrits en licence à l'ufr Sciences et Technologies recevront un dossier indiquant la procédure de réinscription en ligne. M2 : L'admission se fait sur dossier de candidature à télécharger sur le site web de l'université : (Service de Scolarité M1/M2 : ). ET APRÈS? Poursuite d'études Les diplômés peuvent postuler pour une poursuite d'études en doctorat au niveau local (Ecole doctorale Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement) ou national voire international. Débouchés professionnels Secteurs d'activités Entreprises industrielles, bureaux d'études et d'ingénierie, organismes de Recherche & Développement / Unités de recherche scientifique d'organismes publics ou parapublics, d'entreprises privées, de cabinets d'études et de conseil, en contact avec différents intervenants (collaborateurs interdisciplinaires, industriels, laboratoires, universitaires,...) / Sociétés de services, d'entreprises, en relation avec les clients. Types d'emplois accessibles Bioinformaticien en études, recherche et développement / Ingénieur d'études - recherche - développement en industrie / Ingénieur d'études en recherche fondamentale ou scientifique / Ingénieur d'étude en applications scientifiques informatiques / Ingénieur analyste en système d'information / Architecte de bases de données / Moniteur d'initiation à l'enseignement supérieur 3

4 Programme UE : Unités d'enseignement / CM : Cours Magistral / TD : Travaux Dirigés / TP : Travaux Pratiques SEMESTRE 1 / 3O Crédits ECTS UE / Anglais (5 Crédits) TD 50h Au choix Choix 1 option UE / Signalisation cellulaire (5 Crédits) CM 32h / TD 8h UE / Programmation en bio informatique (5 Crédits) CM 15h / TD 20h / TP 15h UE / Génomique et bioinformatique (5 Crédits) CM 20h / TD 8h / TP 12h UE / Contrôle de l'expression gènes eucaryotes (5 Crédits) CM 26h / TD 14h UE / Régulations épigénétiques (5 Crédits) CM 26h / TD 14h UE / Biostatistiques et programmation sous R (5 Crédits) CM 30h / TD 30h SEMESTRE 2 / 3O Crédits ECTS Au choix Choix 2 options UE / Contrôle moléculaire et intégré du développement (5 Crédits) UE / Dynamique du génome des eucaryotes (5 Crédits) UE / Contrôle de la prolifération, la survie, la mort CM 36h / TD 14h CM 24h / TD 16h (5 Crédits) CM 32h / TD 8h UE / Physiologie et génomique des microorganismes (5 Crédits) CM 34h / TD 16h UE / Infographie (5 Crédits) CM 16h / TP 24h UE / Post-génomique et analyse à haut débit (5 Crédits) CM 24h / TD 18h / TP 8h UE / Technologie du web et conduite de projet (5 Crédits) CM 24h / TD 8h / TP 18h UE / Bases et entrepôts de données (5 Crédits) CM 15h / TD 10h / TP 15h UE / S2 Stage (8 semaines) (5 Crédits) SEMESTRE 3 / 3O Crédits ECTS Au choix Choix 3 options UE / Analyse scientifique en langue anglaise (5 Crédits) UE / Modélisation moléculaire (5 Crédits) CM 24h / TD 10h / TP 6h UE / Stratégies d'analyses intégrées des génomes (5 Crédits) UE / Administration des bases de données (5 Crédits) UE / Datamining (5 Crédits) CM 24h CM 20h / TP 20h CM 20h / TD 20h / TP 10h UE / Grille de calcul et de données (5 Crédits) UE / Génomique comparative et séquençage CM 24h CM 20h (5 Crédits) 4 CM 16h / TD 24h

5 UE / Modèles de graphes pour réseaux biologiques (5 Crédits) UE / Stratégies d'analyses intégrées des génomes (5 Crédits) SEMESTRE 4 / 3O Crédits ECTS UE / Stage de six mois (30 Crédits) 5 CM 26h / TD 14h CM 24h

6 Notes

7 Notes

8 UFR Sciences et Technologies Campus des Cézeaux - 24 avenue des Landais AUBIERE CEDEX Responsable de M1 Gisèle BRONNER Responsable de M2 François ENAULT Scolarité Scolarité des Masters

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