Quiz 2. A. GAA GAA B. GT ATAC C. GGG CCC B and D D. CC ATGG E. TTAT AA

Transcription

1 Quiz 1 1. What volume of a 50X TBE solution would you need to add to 79ml of water to obtain a 1X solution? Ans.: 79/49=1.61ml 2. If 50X TBE contains 125g of TRIS per liter, what is the final percent concentration (w/v) in 1X TBE? Ans.: 12.5/50=0.25%

2 Quiz 1 1. Quel volume d une solution de 50X TBE devrait être ajouté à 79ml d eau afin d obtenir une solution de 1X? Rép.: 79/49=1.61ml 2. Si 50X TBE contient 125g de TRIS par litre, quelle est la concentration en pourcentage (m/v) dans 1X TBE? Rép.: 12.5/50=0.25%

3 Quiz 2 1. A DNA sample is at a concentration of 500ng/100μL. What would be the absorbance at 260nm of a 1/5 dilution of this DNA sample? Which two restriction sites from this list have compatible ends following their digestion? A. GAA GAA B. GT ATAC C. GGG CCC B and D D. CC ATGG E. TTAT AA

4 Quiz 2 1. Un échantillon d ADN est à une concentration de 500ng/100μL. Quelle serait l absorbance à 260nm d une dilution de 1/5 de cet échantillon d ADN? Quels deux sites de restrictions de cette liste possèdent des extrémités compatibles suite à leurs digestions? A. GAA GAA B. GT ATAC C. GGG CCC B et D D. CC ATGG E. TTAT AA

5 Quiz 3 1. What was the color, number, letter and name of the gene you are verifying the restriction map of? 2. Which primer pair would allow the exponential amplification of the boxed sequence? 3 AGGCTTAGTA AGCCCTGTTA 5 A. AGGCTTAGTA D. AGCCCTGTTA B. TACTAAGCCT E. ATTGTCCCGA C. TAACAGGGCT F. TCCGAATCAT E and F

6 Quiz 3 1. Quel est la couleur, le numéro, la lettre et le numéro du gène donc vous vérifiez la carte de restriction? 2. Quelle paire d amorces permettrait l amplification exponentielle de la région emboitée? 3 AGGCTTAGTA AGCCCTGTTA 5 A. AGGCTTAGTA D. AGCCCTGTTA B. TACTAAGCCT E. ATTGTCCCGA C. TAACAGGGCT F. TCCGAATCAT E et F

7 Quiz 4 Restriction digests of a recombinant puc19 plasmid. U Ba Ec P U : Uncut Plasmid Ba : Plasmid cut with BamH1 Ec : Plasmid cut with EcoR1 P : puc19 cut with EcoR1 1. How many times does EcoR1 cut the plasmid? 3X 2. How many times does EcoR1 cut the insert? 2X

8 Quiz 4 Digestion par enzymes de restriction d un plasmide recombinant de puc19. ND Ba Ec P ND: Plasmide non digéré Ba : Plasmide coupé avec BamH1 Ec : Plasmide coupé avec EcoR1 P : puc19 coupé avec EcoR1 1. Combien de fois est-ce que EcoR1 coupe le plasmide? 3X 2. Combien de fois est-ce que EcoR1 coupe dans l insertion? 2X

9 1000 Quiz 5 I I I 3'-GACGGGCCGCGGGC TGTGTGCTCGAGACACAC TATTTTATTAAAAT-5' 1. Primers GCCCGCGGCCCGTC and TAAAATTATTTTAT were used to amplify the above region which contains an XhoI site (underlined). Homozygous mutant mice which have an SNP G 2000 C have curly tails whereas homozygous normal or heterozygous mice have straight tails. What size fragments would be expected in each of the three cases following PCR and digestion? Homozygous normal: 1000 & 2000 Homozygous mutant: Heterozygous: 4000, 2000, and

10 1000 Quiz 5 I I I 3'-GACGGGCCGCGGGC TGTGTGCTCGAGACACAC TATTTTATTAAAAT-5' 1. Les amorces GCCCGCGGCCCGTC et TAAAATTATTTTAT ont été utilisées pour amplifier la région ci-dessus qui contient un site XhoI. Des souris homozygotes mutantes qui possèdent un SNP G 2000 C ont des queues tordues tandis que des homozygotes normales ou hétérozygotes ont des queues droites. Quelles tailles de fragments seraient attendues dans chacun des trois cas après une PCR et une digestion? Homozygote normal: 1000 et 2000 Homozygote mutant: Heterozygote: 1000, 2000 et

11 Quiz 6 1. A 0.5 ml DNA sample has an absorbance at 260nm of 0.5. What would be the corresponding absorbance if this had been RNA at the same concentration? 0.625

12 Quiz 6 1. Un échantillon de 0.5 ml d ADN a une absorbance à 260nm de 0.5. Quelle serait l absorbance correspondante si ceci était de l ARN a la même concentration? 0.625

13 Ct (Cycles) Quiz 7 What is the Ct of a Mel1 sample normalized to actin, if the normalized value is 0.5 and actin has a concentration of 0.9 µg/ml? Mel1 Standard Curve y = x Log 10 [Concentration (µg/ml)] Introduce log of 0.45 into formula and get ans.

14 Ct (Cycles) Quiz 7 Quel est le Ct d un échantillon d DNA normalisé a l actin, si la valeur normalisée est 0.5 et que actine a une concentration de 0.9 µg/ml? Courbe étalon de Mel1 y = x Log 10 [Concentration (µg/ml)] Mettre le log de 0.45 dans la formule et obtenir la réponse

15 Quiz 8 & 9 1. Under which condition would the sequence ATGCCACGT anneal to it s reverse sequence? Assume that each increment of 0.1M NaCl changes the Tm by 2 o C. A. 50 o C + 1M NaCl B. 45 o C + 0.5M NaCl C. 40 o C + 0.1M NaCl D. None of the above 2. CT values of a gene following a Q-PCR performed on the same amount of mrna isolated from two growth conditions, 1 & 2, were 5 and 18 respectively. Which conclusion is correct? A. The gene is more expressed under condition 2 B. The gene is less expressed under condition 1 C. The concentration of amplicon at each of the two respective CT values is the same D. None of these conclusions are correct

16 Quiz 8 & 9 1. Sous quelle condition la séquence ATGCCACGT pourrait-elle s apparier à sa séquence inverse? Présumez que chaque changement de 0.1M NaCl change le Tm par 2 o C. A. 50 o C + 1M NaCl B. 45 o C + 0.5M NaCl C. 40 o C + 0.1M NaCl D. Aucune de ces conditions 2. Les valeurs CT d un gène après des Q-PCR faites sur la même quantité d ARNm isolé de deux conditions de croissance, 1 & 2, étaient 5 et 18 respectivement. Quelle conclusion est correcte? A. Le gène est plus exprimé sous la condition 2 B. Le gène est moins exprimé sous la condition 1 C. La concentration d amplicon à chacun des deux CT respectifs est la même D. Aucune de ces conclusions n est correcte

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