HELIOS Observatoire des investissements de santé 26 juin 2013 Julia Lane, Valérie Thibaudeau Ghislaine Filliatreau
Les idées phares 1-disposer d éléments pour mesurer la performance et la compétitivité du système 2-une réponse de l INCa/Avisean avec un outil de visualisation de bases de données existantes 3-tirer les leçons de ce projet pour étendre la réflexion au niveau national
Les besoins Benchmark et études comparatives Transparence des dépenses publiques Mesures de l impact de la recherche biomédicale Communauté scientifique et Experts Forte attente du public Décideurs publics: performance et compétitivité Préparation Evaluation Plan cancer 2009-2013 Coût total Recherche sur la durée du Plan: 363 millions
Disposer d éléments pour préparer l évaluation Développer une approche globale des efforts engagés Partager les informations dans un outil interactif Exploiter et améliorer l information/les données existantes S appuyer sur l expérience et l expertise de partenaires et rechercher des initiatives internationales
Le projet HELIOS: les partenaires Ghislaine Filliatreau Plateforme interinstitutionnelle fondée et administrée par les acteurs majeurs du système français de recherche Au service des acteurs de la R&D depuis 20 ans Mission principale: concevoir et produire des indicateurs et des services pour l aide à la décision en matière de politique R&D AIR : American Institutes for Research Julia Lane, Senior Managing Economist Professeure en Economie, BETA Université de Strasbourg CNRS Chercheur Associée, Observatoire des Sciences et des Techniques, Paris Professeure, Melbourne Institute of Applied Economics and Social Research, University of Melbourne
Méthodologie HELIOS Démonstration du prototype Quelques exemples Prochaines étapes et perspectives
Vision classique de l effet des investissements
Approche centrée sur les individus: pour objectiver l effet des investissements Source: Ian Foster, University of Chicago
Différents profils de projets Rendre visible la diversité et la complexité Comparer des objets comparables Multi équipes Multi sites Multidisciplinaires Basic science/clinical science Collaboration public/privé Formation Collaborations internationales
Méthodes Décrire les investissements 2007-2012 Base de données(inca, DGOS, ITMO cancer) Qui? Avec qui? Quand? Où? Quoi? Décrire les publications 2000-2011 - Base de donnéeswos - Qui? Avec qui? Quand? Où? Quoi? Décrire les brevets 2000-2011 - Base de données Patstat - Qui? Avec qui? Quand? Où? Quoi?
Approche: le schéma de données QUOI QUOI Avec QUI Avec QUI QUI OÙ Avec QUI OÙ QUOI
Description des projets financés et des publications Topic modeling: une approche bottom-up
Etat d avancement construction bases de données Financement 2007-2012 1 290 projets financés, 504 M engagés (360 M 2009-2012) 2007: 295 (96 M ) 2008: 152 (48 M ) 2009: 164 (55 M ) 2010: 202 (72 M ) 2011: 229 (114 M ) 2012: 248 (119 M ) Plus de 2 750 chercheurs impliqués dans les projets (équipes associées si info existante dans la base) Publications 2000-2011 des chercheurs financés: Corpus de 100 000 publications (2/3 Pubs associées aux chercheurs financés) Brevets 2000-2011 des chercheurs financés: Près de 2 000 brevets (dont 700 brevets avec déposant entreprise)
Pourquoi un Prototype? 1. c est nouveau 2. Permet de mettre en évidence les points critiques pour les données de base 3. Permet de tester et développer différentes 3. Permet de tester et développer différentes approches de visualisation des données
DEMO
Exemples de questions illustrées Les domaines de recherche les plus financés Les domaines de recherche les plus publiés Les forces des centres de recherche Les domaines de recherche soutenus par de la formation Les domaines de recherche comparables et financés par les NIH
Rang Id Nbre Projets Topic Les domaines les plus financés 1 42 152 pathway mechanism target molecular model team therapeutic identify cellular cancer approach 2 144 130 trial arm patient phase randomized year treatment iii standard survival month rate experimental qual 3 158 116 molecular clinical analysis gene biomarker marker sample genomic profile identify signature prognost 4 5 97 patient month criteria year inclusion treatment secondary evaluation rate primary follow number week 5 148 64 chemotherapy response patient survival advanced treatment metastatic cancer rate gemcitabine cisplat 6 191 55 treatment therapy anti clinical therapeutic therapies agent efficacy targeted drug combination trial 7 177 52 cancer breast women invasive impact colon diagnosis increase determine diagnosed frequent analyze 8 150 52 aml leukemia acute myeloid leukemic cell blast prognosis flt leukaemia patient pim therapeutic lymph 9 24 48 cell immune tlr response responses mechanism effector dendritic system lymphocyte function innate 10 3 47 survival patient prognostic year recurrence free factor prognosis disease stage analysis outcome poo 11 64 46 radiation radiotherapy dose irradiation therapy doses local volume treatment toxicity irradiated ext 12 109 43 pathway kinase activation signaling phosphorylation activated protein akt inhibitor erk tyrosine inh 13 118 41 model human cell vivo vitro mice animal mouse line effect murine xenograft experimental tested nude 14 103 41 endothelial vegf angiogenesis hypoxia angiogenic factor vascular growth anti hif vessel cell effect
Rang Id Nbre Projets Topic Les domaines les plus financés 15 92 37 life quality patient questionnaire score health qol scale impact treatment assessment item data effe 16 112 36 cell stem differentiation culture proliferation progenitor csc vitro marker differentiated population 17 16 36 cost economic strategy analysis hospital effectiveness medical evaluation strategies medico year tec 18 142 35 exposure cancer occupational risk environmental control factor exposed cases population data lung wo 19 106 35 cancer data care social french population management characteristic health cases medical level regio 20 138 33 metastatic metastases primary metastasis treatment patient liver cancer chemotherapy disease colorec 21 48 33 hcc liver hepatocellular carcinoma cirrhosis patient transplantation hepatic cirrhotic criteria tace 22 79 32 treatment patient chemotherapy response rate complete survival cycle rituximab year therapy remission 23 73 31 lymphoma cell lymphomas large nhl dlbcl hodgkin diffuse lymphoid follicular cases aggressive subtype 24 41 30 pet fdg imaging scan patient tomography uptake emission recurrence positron mri diagnostic detection 25 23 29 transplantation donor graft transplant allogeneic gvhd recipient stem acute day cell disease blood c 26 59 28 cancer platform clinical axis program team international support therapeutic tumor develop 27 196 28 head neck carcinoma treatment oral squamous patient radiotherapy hnscc cancer carcinomas cavity lary 28 151 27 dna repair damage break strand dsb double parp protein cell end genome induced formation instability
Rang Id Nbre PUBLIS Topic Les domaines les plus publiés 1 169 4999 patient month year median follow range cases age method percent underwent occurred died time twenty 2 178 4965 binding domain structure protein site terminal interaction peptide residues structural acid complex 3 98 4884 case diagnosis cases report rare year pancreatic lesion examination duct revealed cyst man biliary w 4 153 4308 reaction compound derivative acid ring synthesis yield dot synthesized methyl step amino prepared bo 5 51 4116 expression gene mrna protein expressed level transcription regulation human regulated transcriptiona 6 132 3921 surgery surgical resection postoperative complication procedure morbidity patient laparoscopic opera 7 109 3891 pathway kinase activation signaling phosphorylation activated protein akt inhibitor erk tyrosine inh 8 91 3758 alpha tnf cytokine factor ifn production beta macrophage kappa inflammatory necrosis induced interle 9 0 3719 sequence gene region genome site element promoter human protein family conserved repeat transcriptio 10 17 3589 cd cell lymphocyte blood peripheral tcr subset ccr antigen expression expressed surface specific mol 11 21 3380 cell apoptosis death induced apoptotic caspase fas activation mediated induce effect dependent induc 12 83 3371 hiv infection virus infected viral human viruses immunodeficiency load antiretroviral aid count hhv 13 14 3348 ratio interval risk age confidence association regression analysis odd factor multivariate hazard ad
ratio interval risk age confidence association regression guideline practice clinical recommendation review expression gene mrna protein expressed level alpha tnf cytokine factor ifn production beta reaction compound derivative acid ring synthesis yield pathway kinase activation signaling phosphorylation binding domain structure protein site terminal surgery surgical resection postoperative complication case diagnosis cases report rare year pancreatic lesion patient month year median follow range cases age expression gene mrna protein expressed level case diagnosis cases report rare year pancreatic reaction compound derivative acid ring synthesis method values correlation measurement parameter binding domain structure protein site terminal guideline practice clinical recommendation review review recent system field discuss current discussed surgery surgical resection postoperative ratio interval risk age confidence association patient month year median follow range cases age Evolution des publications top topic des publications 2008 0 100 200 300 400 500 600 700 top topic des publications 2011 0 100 200 300 400 500 600 700 800
8 Evolution des publications pour cancer de la prostate et domaine "imaging" Nbre de publicatipns 7 6 5 4 3 2 1 0 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
Forces des centres de recherche Institut Gustave Roussy Top Topics trial arm patient phase randomized year treatment iii molecular clinical analysis gene biomarker marker sample chemotherapy response patient survival advanced cancer breast women invasive impact colon diagnosis patient month criteria year inclusion treatment secondary treatment therapy anti clinical therapeutic therapies agent pathway mechanism target molecular model team survival patient prognostic year recurrence free factor tumor growth cancer progression clinical solid therapeutic patient disease clinical treatment prospective receiving radiation radiotherapy dose irradiation therapy doses local head neck carcinoma treatment oral squamous patient egfr patient ctc treatment metastatic cancer line response metastatic metastases primary metastasis treatment treatment patient chemotherapy response rate complete day dose week patient toxicity efficacy daily cycle safety surgery surgical resection postoperative complication aml leukemia acute myeloid leukemic cell blast prognosis cost economic strategy analysis hospital effectiveness children adult age year young childhood pediatric 0 10 20 30 40 50 60
Forces des centres de recherche Institut Curie Top Topics cancer breast women invasive impact colon diagnosis trial arm patient phase randomized year treatment iii pathway mechanism target molecular model team molecular clinical analysis gene biomarker marker tumor growth cancer progression clinical solid patient month criteria year inclusion treatment clinical group oncology cancer doi online journal chemotherapy response patient survival advanced mitochondrial bcl apoptosis trail cell mitochondria chromosome genomic gene region alteration radiation radiotherapy dose irradiation therapy doses model human cell vivo vitro mice animal mouse line tumour progression molecular data pathway alteration cost economic strategy analysis hospital effectiveness sarcoma tissue sarcomas molecular soft fgfr specific cell immune tlr response responses mechanism effector patient disease clinical treatment prospective receiving egfr patient ctc treatment metastatic cancer line surgery surgical resection postoperative complication risk factor cases high history case control cohort 0 5 10 15 20 25 30
Domaines de recherche soutenus par la formation 35 Top topics des projets de formation 30 25 20 15 10 5 0
Prochaines étapes Finalisation prototype HELIOS Novembre Procéder à des analyses du contenu HELIOS
Les enjeux à l échelle nationale dans le domaine du cancer Collaborations Fondation ARC et Ligue en cours Objectif principal : construire un outil pour appréhender l impact du soutien à la formation
View by: CANCERPOLES Nord Ouest Ile-de-France Grand Ouest Grand Est Grand Sud Ouest Clara Paca Les enjeux à l échelle nationale dans le domaine du cancer View by: SIRIC SOCRATE CURIE CARPEM LYRIC OncoLille BRIC Bordeaux Montpellier Paca 06 07 08 09 10 11 12 13
Les enjeux à l échelle nationale pour l ensemble du domaine biomédical Tirer les leçons du prototype Helios pour envisager la mise en place d une plateforme commune Et disposer d un outil commun de visualisation des différents domaines et de leurs interfaces
Les enjeux à l échelle européenne EU Context: Horizon 2020 important to bring the research and innovation activities funded through Horizon 2020 to the attention of the general public, showing in particular the added value of Union level action. Information and communication measures as an integral part of Horizon 2020 implementation http://ec.europa.eu/research/science-society/document_library/pdf_06/open-accessin-horizon-2020_en.pdf The EIT the flagship for EU innovation highlights collaboration as the key mechanism whereby their investments will work http://eit.europa.eu/about-us/ J. Lane : lead evaluation expert to develop an EIT evaluation roadmap HELIOS being used as a flagship example of how to capture information about collaborations and display it. HELIOS highlighted by J. Lane in a recent presentation to the EU Parliament http://www.europarl.europa.eu/stoa/webdav/site/cms/shared/2_events/workshops/2 013/20130326/Lane.pptx
Les enjeux internationaux The HELIOS project is already influencing international thinking. For example, the DESCRIBE project http://www.exeter.ac.uk/research/excellence/impact (HELIOS methodology and approach cited on page 14) http://www.exeter.ac.uk/media/universityofexeter/research/ourresearchexcellence/ describeproject/pdfs/2013_06_04_describe_final_report_final.pdf For example, ICRP members https://www.icrpartnership.org/
Les enjeux internationaux The Austrian Office of Science and Technology has as its featured article in its quarterly newsletter http://www.ostina.org/index.php?option=com_mag azine&itemid=1889 (Helios is highlighted in the writeup) http://www.ostina.org/index.php?option=com_content&view=article &id=6035:new-approaches-to-describing-researchinvestments&catid=476:feature-articles&itemid=3377
Les idées phares 1-disposer d éléments pour mesurer la performance et la compétitivité du système 2-une réponse de l INCa/Avisean avec un outil de visualisation de bases de données existantes 3-tirer les leçons de ce projet pour étendre la réflexion au niveau national
Merci de votre attention vthibaudeau@institutcancer.fr