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Bases de données et RefWorks Sylvain Fiset - Automne Bases de données et Refworks. Sylvain Fiset

Transcription:

quelques logiciels en pratique Présentation des interfaces 1- S'enregistrer en ligne : CiteULike http://www.citeulike.org/ 2- Installer le "web importer" dans la barre d'outils/barre personnelle du navigateur Firefox : CiteULike : onglet CiteULike à Browser button à Post to CiteULike 1

1- avec Firefox 2

2- S'enregistrer en ligne : serveur Zotero http://www.zotero.org 3- importer des références 3

4- importer des PDF 1- Mendeley Desktop 4

2- S'enregistrer en ligne : Mendeley web http://www.mendeley.com 3- importer des références Installer le "web importer" dans la barre d'outils/barre personnelle du navigateur Firefox : - soit depuis le Desktop à Tools à Install Web Importer - soit depuis l'interface serveur : 5

barre d'outils : 4- importer des PDF 6

1- EndNote Desktop 2- S'enregistrer en ligne : EndNote basic http://myendnoteweb.com 7

3- importer des références - sites web : Importation directe : un grand nombre de portails et de plus en plus d'éditeurs proposent depuis leurs bases de données un transfert automatique des références sélectionnées vers EndNote (Direct Export Helper) - depuis EndNote (ou EndNote basic / onglet Collect) : Online Search connexion directe aux bases de données et catalogues en ligne - avec le "web importer" (extension online) dans la barre d'outils/barre personnelle du navigateur Firefox : EndNote basic : onglet Options à Download Installers à Capture Reference 4- importer des PDF 8

Chercher et Importer 1- Comparer les systèmes d'importation des 4 logiciels : importer différents types de documents (articles de journaux, ouvrages, pages web, thèses, billets de blogs, vidéos) provenant de sources variées, par ex. : bases de données et portails PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ et/ou PubMed Central (PMC) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc revues.org http://www.revues.org webcast.in2p3 http://webcast.in2p3.fr catalogues Sudoc http://www.sudoc.abes.fr British Library http://explore.bl.uk/ moteur de recherche Google Books http://books.google.fr/ revue PNAS http://www.pnas.org blog Urfist Info http://urfistinfo.hypotheses.org/ Utiliser selon les logiciels le "web importer" (CiteULike, Mendeley, EndNote), l'icone de la barre d'outils de Firefox (zotero) et la recherche online (EndNote). Proposition de documents à importer Sanchez PE et al. Optimal neuroprotection by erythropoietin requires elevated expression of its receptor in neurons. Proc Natl Acad Sci USA 106(24): 9848-9853 (2009) Stambolic, V. Cancer: Precise control of localized signals. Nature (2015) Published online 27 May 2015 Eloy-Perrin L. Communication managériale et conduite du changement [ ] Thèse (2015) Aicardi J. Epilepsy in children. Raven (1994) Bezin L. Brain plasticity sustained by environmental enrichment: hopes for patients with epilepsy. Journées Inaugurales du Centre de Recherche en Neurosciences de Lyon (2012) 2- Tester la création automatique de notices avec l'importation de fichiers PDF dans EndNote, Mendeley et Zotero. Écrire 1- Installer les plugins de citations dans Word de Zotero et Mendeley : Zotero à Preferences/Citer Mendeley desktop à Tools L'installation est automatique avec EndNote à CWYW 2- Éditer dans le traitement de texte Word une liste bibliographique avec citations dans le texte ne propose qu'un export de liste bibliographique (TXT, RTF ou PDF) 9

Citations et Listes bibliographiques : plugin dans Word Organiser Comparer pour les différents logiciels : organisation des références (groupes, collections, tags) interface de recherche (mots clés, tags, champs) affichage et annotations de PDF 10

Partager ses collections en ligne / réseau social - chercher des groupes et/ou utilisateurs intéressés par les "altmetrics" - rejoindre un groupe (par ex. "reference manager" ou Reference Management Software" ou "Free Citation Tools"). Noter la présence d'un fil RSS - chercher des profils d'utilisateurs "Urfist" et des groupes "Urfist" - rejoindre le groupe "LGRB journée URFIST 2014" et intégrer dans sa bibliothèque personnelle quelques-unes des références de ce groupe public - Noter la présence d'un fil RSS - rejoindre le groupe "logiciels bibliographiques" et intégrer dans sa bibliothèque personnelle quelquesunes des références de ce groupe public. - noter les possibilités de partage sur les réseaux sociaux et le fil RSS - noter la fonction "Suggest" (recommandations) basée sur le contenu de sa bibliothèque - il est également possible de créer un widget intégrable dans un site web (affichage des x dernières références ajoutées) : dans Mendeley Desktop, sélectionner le groupe Overview Share this group Embed - les groupes partagés ne sont jamais publics 11

- communauté d'utilisateurs, partage de fichiers, questions/réponses, etc. : Connect Beta. Là encore, pas de visibilité publique, accès uniquement aux utilisateurs enregistrés. Dans un message du 5 mai 2016, Thomson Reuters annonce l arrêt de Connect le 24 mai 2016. Importer/Exporter entre logiciels et sauvegarde Formats d'export/import des logiciels pour échanger des références entre eux. Il faut toujours contrôler les données importées (en particulier tags, mots clés, liens, notes, fichiers attachés, etc.), au moins sur quelques documents de types différents (monographies, articles de revues, thèses, pages web, etc.) CiteULike Mendeley Zotero Endnote EndNote basic RefWorks CiteULike Mendeley Zotero EndNote intégré intégré intégré XML intégré XML EndNote basic intégré intégré RefWorks MyCiteULike à Import 12

File à Import Exporter/sauvegarder les bibliothèques de références CiteULike à Export my library Zotero à Exporter la bibliothèque/zotero RDF ou sauvegarde du répertoire complet Zotero dans l'ordinateur. Pour localiser ce répertoire : Préférences/Avancées/Fichiers et dossiers/emplacement du répertoire contenant les données Afficher le répertoire Mendeley à Help/Create Backup EndNote à File/Compressed Library 13