SYLLABUS. MASTER Mention BIOCHIMIE-BIOTECHNOLOGIE (BBT)

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1 Université Paul Sabatier UNITE DE FORAMTION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT) Bâtiment IV R route de Narbonne Toulouse Cedex ou Resp.Adm. : MAJ : Juillet 2008 SYLLABUS MASTER Mention BIOCHIMIE-BIOTECHNOLOGIE (BBT) Année universitaire 2008/ UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 1

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3 SOMMAIRE Master Première Année. Page 05 Master 2 Recherche Biologie Structurale et Fonctionnelle. Page 33 Master 2 Professionnel Bioinformatique Page 34 Master 2 Professionnel Expression Génique et Protéines Recombinantes Page 35 Master 2 Professionnel Biochimie Structurale, Protéomique et Métabolomique Page 36 Master 2 professionnel «Propriété intellectuelle et Nouvelles Technologies» M2P co habilité avec l université des sciences sociales UT1,... Page 37 AVERTISSEMENT Les informations données dans le présent syllabus sont susceptibles d être modifiées sans préavis (mises à jour des coordonnées des enseignants responsables, corrections d erreurs, prise en compte d un changement d habilitation, ) En cas de doute, il est conseillé de consulter la dernière version du syllabus (disponible sur le site internet de l Université Paul Sabatier - à la page consacrée à l UFR SVT), de se rapprocher des enseignants responsables ou des secrétariats pédagogiques. En cas de constatation d erreurs, vous pouvez envoyer un mel à l adresse suivante : ressvt@adm.ups-tlse.fr. Merci de votre compréhension - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 3

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5 Université Paul Sabatier UNITE DE FORAMTION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT) Bâtiment IV R route de Narbonne Toulouse Cedex ou Resp.Adm. : Master 1 ère année Mention BIOCHIMIE BIOTECHNOLOGIES (BBT) - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 5

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7 Master 1 ère année : Biochimie Biotechnologies Enseignant Responsable : Alain VERCELLONE : IPBS/CNRS, 205 route de Narbonne Toulouse : : alain.vercellone@ipbs.fr Secrétariat pédagogique : : IBCG/CNRS, 118 route de Narbonne Toulouse : : secens@ibcg.biotoul.fr CONDITIONS D ADMISSION Accès de plein droit aux étudiants titulaires d'une Licence de Biochimie et Biologie moléculaire Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation (pré-inscription sur le site web de l'université : SCHEMA DES ETUDES : 3 parcours au choix SEMESTRE 7 UE obligatoires et communes aux 3 parcours 3M7BT02M Mémoire bibliographique 6 ECTS 3M7BT03M Bioanalyse 6 ECTS UE obligatoires selon parcours Parcours 1 3M7BT01M Initiation à la recherche 18 ECTS Parcours 2 3M7BT11M Biochimie et Physiologie microbienne 6 ECTS 3M7BT12M Structure et fonction des récepteurs 6 ECTS 3M7BTLIM UE scientifique à choix libre 6 ECTS Parcours 3 3M7BT10M Marketing, facteur de développement des entreprises de biotech 6 ECTS 3M7BT12M Structure et fonction des récepteurs 6 ECTS 3M7BTLIM UE scientifique à choix libre 6 ECTS SEMESTRE 8 UE obligatoires et communes aux 3 parcours 3M8BT04M Biotechnologies II 6 ECTS 3M8BTLVM Langues 3 ECTS 3M8BTOUM UE d Ouverture 3 ECTS 3M8BTLIM UE scientifique à choix libre 6 ECTS + 1 UE à choix restreint (Parcours 1 et 2) 3M8BT05M Analyse structurale des biomolécules 6 ECTS 3M8BT07M Relations structure/fonction des lipides et protéines dans les membranes biologiques 6 ECTS 3M8BT09M Bioinformatique 6 ECTS + 1 UE à choix restreint (Parcours 1 et 2) 3M8BT06M Biologie structurale des macromolécules 6 ECTS 3M8BT08M Du métabolisme au métabolome 6 ECTS 3M8G10M Bases moléculaires et cellulaires de l expression génique eucaryote 6 ECTS + 1 UE à choix restreint (Parcours 3) 3M8BT05M Analyse structurale des biomolécules 6 ECTS 3M8BT14M Biochimie analytique quantitative 6 ECTS 3M8BT18M Biotechnologie et ingénierie médicales 6 ECTS + 1 UE à choix restreint (Parcours 3) 3M8BT13M Projet de création d entreprise de biotechnologie 6 ECTS 3M8BT20M Introduction à la valorisation juridique de l innovation 6 ECTS Débouchés en deuxième année de Master à l'u.p.s. : M2 Recherche : Biologie structurale et fonctionnelle M2 Professionnel : Bioinformatique Biochimie structurale, protéomique, métabolomique Expression génique et protéines recombinantes Propriété intellectuelle et nouvelles technologie - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 7

8 MODALITES DE CONTROLES DES CONNAISSANCES HABILITATION MCC DIPLOME ANNEE UNIVERSITAIRE 2008/2009 CODE APOGEE DU DIPLOME: 3MBBT0/71 RESPONSABLE: A. Vercellone INTITULE DU DIPLOME: M1 BIOCHIMIE et BIOTECHNOLOGIE (B.B.T.) Code Apogée Libellé Type UE Nom du ECTS Volume Horaire PREMIERE SESSION SECONDE SESSION UE Unité Enseignement (1) Responsable (2) CM TD TP CC (%) CP (%) CT (%) CTO (%) TOTAL CC (%) CP (%) CT (%) CTO(%) TOTAL SEMESTRE 7 3M7BT01M Initiation à la recherche Ob L. Niéto RS M7BT02M Mémoire de recherche en biochimie et biotechnologie Ob E. Clottes RS M7BT03M Bioanalyse Ob C. Mathé M7BT10M UE LIBRE Le marketing, facteur de développement des entreprises de biotechnologie Op M. Gayraud OR M7BT11M Biochimie et physilogie microbienne Op A. Vercellone TP+20OR TP+20OR M7BT12M Structure et fonction des récepteurs membranaires Op C. Lebrun RS M7BS15M Analyse et modélisation des données Bio. Op C. Jost 6 Voir syllabus Biologie-Santé 3M7MA5M Ingénierie moléculaire des microorganismes Op P.Ritzenthaler OR Voir syllabus MABS) HM7MM2M Méthodes d'analyse et contrôle de qualités des produits de santé Op JP Souchard coef. 2 coef. 6 coef. 2 (Consulter le détail des MCC dans le syllabus) SEMESTRE 8 3M8BT04M Biotechnologies II Ob L. Paquereau TP M8BTLVM Langues vivantes Ob E. Crosnier UE LIBRE / UE A CHOIX 3M8BT05M Analyse structurale des biomolécules Op V. Puech Pages TP RS20TP M8BT06M Biologie structurale des macromolécules Op J. Czaplicki TP RS20TP M8BT07M Relations structure fonction des lipides et des protéines dans les membranes biologiques Op L. Maveyraud TP RS20TP M8BT08M Du métabolisme au métabolome Op J-C. Portais TP M8BT09M Bioinformatique Op J. Czaplicki TP RS20TP M8BT13M Elaboration d'un projet de création d'entreprise Op J. Poque Ec25+Or RS M8BT14M Biochimie analytique quantitative Op J-D. Marty TP 20 OR M8BT15M Bases moléculaires de l'expression de la pathogénie bactérienne Op A. Vercellone TP M8BT20M Initiation à la valorisation juridique de l'innovation Op J. Fischer RS M8ELMM Ecotoxicologie Op 6 Voir syllabus Ecologie 3M8BS5M Bases moléculaires et cellulaires de l'expression génique eucaryote Op H. Prats 6 3M8BS13M Pharmacologie fondalentale Op B. Frances 6 3M8BS16M Immunophysiopathologie Op S. Valitutti 6 HM8MM2M Biotechnologie et ingéniérie médicales Op B. Couderc 6 HM8MM4M Concept et structure moléculaire Op V.Genisson Bardes 6 HM8MM5M Physiopathologie infectueuse Op 6 UE OUVERTURE Voir syllabus Biologie-Santé Consulter le détail des MCC dans le syllabus 3M8OVE3M Droit de l'environnement Op M.L. Lambert M8OVT1M Co-Evolution Op A. Vercellone M8OVT2M Introduction à la valorisation juridique de l'innovation Op J. Fischer CM8OV1M Activités physique Op SCUAPS 3 Remarques: (1) Obligatoire, Optionnel, Facultatif. (2) Les coefficients sont strictement proportionnels aux ECTS. Le responsable du diplôme : Alain VERCELLONE Le Président de l'université Paul Sabatier : Professeur Gilles FOURTANIER - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 8

9 3M7BT01M - INITIATION A LA RECHERCHE Enseignant Responsable : Laurence NIETO IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : Laurence.Nieto@ipbs.fr Enseignement de Semestre 7-18 ECTS CM Enseignement TD TP délocalisé Total 20h 20h 140h 180h Equipe pédagogique : L. Nieto, F. Couderc, L. Paquereau, I. Lajoie-Mazenc, F. Dumas, V. Ecochard, M. Tropis, V. Puech, A. Vercellone Objectif : Formation pratique approfondie des méthodes modernes de la biochimie et des biotechnologies ; Formation «à et par» la recherche. Suite à des enseignements généraux théoriques sur la recherche bibliographique, les bonnes pratiques de laboratoire, la biochimie et les biotechnologies, les étudiants effectuent un stage d un semestre dans un laboratoire de recherche. Ils y conduisent une activité de recherche, sous l encadrement étroit d un chercheur appartenant à une équipe de recherche reconnue par une Ecole Doctorale de l UPS, ainsi que sous l encadrement de l équipe pédagogique du module. Les étudiants présentent régulièrement devant l équipe pédagogique les avancées de leurs travaux, avec des points précis effectués sur les aspects bibliographiques et théoriques de leur sujet, sur les méthodes mises en œuvre, et sur les résultats (obtention et analyse de données). Ils assistent régulièrement à des conférences de recherche en français et en anglais ainsi qu à des cours complémentaires organisés par l équipe pédagogique. A l issue du module l étudiant rédigera un rapport écrit sur ses réalisations et les présentera oralement devant le jury du module. Ces deux épreuves seront notées. Par ailleurs, le correspondant de stage rédigera un rapport sur les qualités de l étudiant. Ces trois évaluations constitueront la base de la notation du module. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 9

10 3M7BT02M - MEMOIRE DE RECHERCHE EN BIOCHIMIE ET BIOTECHNOLOGIES Enseignant Responsable : Eric CLOTTES IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : clottes@ipbs.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP délocalisé 60h Total 60h Equipe pédagogique : F. Bardou, E. Clottes, F Lahkdar-Ghazal, F Letisse, L Paquereau, Y. Poquet, M. Tropis Objectif : A partir d un article rédigé en anglais sur un sujet scientifique d actualité, les étudiants de Master 1 parcours 2 de Biochimie-Biotechnologies effectueront une recherche bibliographique (sujet scientifique, techniques utilisées dans l étude, résultats obtenus, conclusions tirées), rédigeront un rapport synthétique présentant une analyse critique de la publication et exposeront ce travail oralement en un temps court devant un jury d enseignants-chercheurs. Au cours du semestre, les étudiants seront conviés à assister à 2 ou 3 conférences scientifiques sur le contenu desquelles ils seront également amenés à être évalués. Contenu et façon de travailler : Chaque enseignant de l équipe pédagogique participant au module proposera un sujet à un groupe de 4 ou 5 étudiants. Chaque étudiant devra alors analyser une publication scientifique se rapportant au sujet proposé au groupe, en effectuant sa propre recherche bibliographique, laquelle aboutira au terme du module à un rapport écrit et une présentation orale. Il s agira pour chaque étudiant, au terme de l analyse de la publication, de pouvoir répondre à un certain nombre de questions : quel est le sujet? quelle est la problématique explorée? quelles sont les techniques utilisées dans cette étude? etc Le travail est dirigé par l enseignant lors de réunions périodiques, où sont discutés, l avancement du travail, les choix à faire, et l analyse critique des sources bibliographiques. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 10

11 3M7BT03M - BIOANALYSE Enseignant Responsable : Catherine MATHE Pôle de biotechnologies végétales UMR CNRS/UPS 5546 Surfaces cellulaires et signalisation chez les Végétaux 24 chemin de Borde-rouge BP Castanet Tolosan : : mathe@scsv.ups-tlse.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 22h 38h 60h Equipe pédagogique : C. Mathé, L. Maveyraud, J-C. Portais, J-L. Tichadou, S. Tranier Objectif : L objectif de ce module est d apporter un certain nombre d outils nécessaires à l analyse et l interprétation des données biologiques. L accent sera mis sur la mise en œuvre de ces outils en travaux dirigés. Le module se composera des domaines suivants : Analyse de données expérimentales : à partir d'exemples de situations expérimentales typiques de laboratoires de biochimie et de biotechnologie, être capable de poser les problèmes, choisir les méthodes appropriées d'analyse de données en fonction de leur nombre et de leur nature, mettre en oeuvre ces méthodes et interpréter leurs résultats. Analyse de séquences : présentation et interrogation des banques de données de séquences biologiques ; différents types d alignement de séquences (méthodes et intérêts de chacun) ; exemples d analyse de séquences nucléiques et protéiques en utilisant les principaux sites web et programmes de bioinformatique dédiés à l analyse des séquences. Structures des protéines : l'accent sera mis sur les déterminants de la structuration des protéines et les forces d'interaction en présence. Par ailleurs, les techniques de prédiction de structures basées sur les propriétés physico-chimiques de molécules seront abordées. L'introduction à la visualisation de molécules en 3D sera également présentée. Analyse du métabolome : différents niveaux d analyse du métabolome seront appréhendés (reconstruction métabolique, alignement de voies, recherche d étapes manquantes, etc ), et les outils disponibles (banques de données métaboliques, outils d analyse, etc.) seront présentés. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP 20 Ecrit Oral 20 Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 11

12 3M7BT10M - LE MARKETING FACTEUR DES ENTREPRISES DE BIOTECHNOLOGIES Enseignant Responsable : Maryse GAYRAUD : : maryse.gayraud@wanadoo.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP délocalisé Total 20h 20h 20h 60h Objectif : Comme toute organisation, l entreprise de biotechnologie est confrontée à son marché. La qualité d un produit est bien souvent insuffisante pour permettre à l entreprise de s imposer à sa concurrence. La maîtrise des techniques du marketing donne à l entrepreneur un savoir-faire réel dans l approche des marchés (en particulier des marchés industriels intéressés par la biotechnologie). De l étude de marché à la gestion des différentes variables du marketing, cet enseignement se propose de développer les connaissances en marketing nécessaires à une entreprise de biotechnologie mais également de transmettre la philosophie de cette discipline fondée sur l écoute du marché. Programme : Le concept de marketing et la démarche marketing Le diagnostic externe et interne Les études de marché - études documentaires - études quantitatives - études qualitatives Objectifs et stratégies Le mix - produit - prix - distribution - communication Le marketing à l export Les biotechnologies - panorama des entreprises de biotechnologies et difficultés des entreprises françaises - les aides aux entreprises de biotechnologies - protection de l innovation - le marketing dans la recherche et développement C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP 20 Ecrit Oral 20 Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 12

13 3M7BT11M - BIOCHIMIE ET PHYSIOLOGIE BACTERIENNE Enseignant Responsable : Alain VERCELLONE IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : alain.vercellone@ipbs.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 30h 14h 16h 60h Equipe pédagogique : F. Bardou, JC. Portais, A. Vercellone Objectif : Cet enseignement a pour objectif de comprendre les relations structure fonctions des principaux éléments de la physiologie bactérienne Cours : Structure, biosynthèse, organisation et rôles physiologiques des constituants bactériens. Organisation des systèmes métaboliques et croissance Travaux dirigés : Ils seront axés sur l analyse et la compréhension d expériences tirées de publications en relation avec les thèmes abordés en cours. Travaux Pratiques : Analyse structurale du peptidoglycane et du LPS d E. coli Mise en évidence de la répression catabolique par le glucose chez E. coli Utilisation des bases de données de métabolomique C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 13

14 3M7BT12M - STRUCTURE ET FONCTIONS DES RECEPTEURS Enseignant Responsable : Chantal LEBRUN IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : chantal.lebrun@ipbs.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 24h 24h 12h 60h Equipe pédagogique : N.Eynard, C.Lebrun, I.Muller, Y.Poquet. Objectif : L objectif de cet enseignement est de montrer les stratégies développées en recherche pour étudier, au niveau moléculaire, le fonctionnement de récepteurs membranaires et en particulier des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG). Ces systèmes biologiques permettent d aborder des questions telles que l interaction entre une protéine et son ligand, l interaction entre différentes protéines et le rôle de l environnement dans le mécanisme réactionnel de systèmes intégrés. On s attachera à faire le lien entre les méthodologies et l analyse des données pour répondre à des questions biologiques précises. Cet enseignement devrait ainsi permettre aux étudiants d appliquer les connaissances acquises à l étude d autres systèmes protéiques. Programme des cours Les différents types de récepteurs Etude structurale et fonctionnelle d une famille de récepteurs : les RCPG - Expression - purification - reconstitution - Structure - Interaction Récepteur- Ligand - Relation structure fonction Etude des partenaires de la signalisation : - Interaction protéine-protéine Oligomérisation - Dynamique Régulation fonctionnelle Pathologies Travaux Dirigés/Enseignements dirigés/: Exercices d analyses de données expérimentales. Mise en pratique des connaissances acquises en cours par la lecture, la compréhension et la présentation de publications scientifiques. Travaux pratiques: En exploitant des données de la littérature et du cours, les étudiants établiront un protocole expérimental et réaliseront les expériences choisies pour répondre à une question déterminée. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 14

15 HM7MM2M METHODES D ANALYSE ET CONTROLE DE QUALITE DES PRODUITS DE SANTE Enseignant responsable : Jean-Pierre SOUCHARD (Pharmacie) IMRCP Bât. 2R1 UPS route de Narbonne souchard@chimie.ups-tlse.fr Secrétariat pédagogique : IBCG/CNRS 118 route de Narbonne secens@ibcg.biotoul.fr Enseignement de semestre 1 7 ECTS Cours TD TP 40 h 20 h 0 h Equipe pédagogique : C. Arellano, M. Bergon, J. Bernadou, B. Couderc, N. Fabre, V. Génisson, S. Girod, M.F. Malmary, F. Nepveu, P. Labat, C. Roques, P. Sies, J.-P. Souchard, M. Tafani Objectif de la formation : Cette UE s adresse aux étudiants des UFR SVT, Pharmacie, Médecine et Odontologie. L objectif de cet enseignement est de préciser les principaux concepts liés au contrôle de la qualité des médicaments à usage humain et vétérinaire, des produits diététiques et de développer les bases nécessaires à leur application dans les industries de santé, au quotidien et en développement scientifique. La pluridisciplinarité de l équipe pédagogique permet d aborder les contrôles de la majorité des produits de santé. Programme : 1- Contrôles physico-chimiques des matières premières et des produits finis - Méthodes physico-chimiques d analyse majeures - Identification et pureté des principes actifs et des excipients (Pharmacopée Européenne), des médicaments de synthèse, d hémisynthèse et d origine végétale - Contrôle qualité des produits diététiques 2- Nouvelles méthodes analytiques, choix des méthodes pour l analyse du médicament - Nouvelles méthodes d analyse spectrales (IR/FT, RMN basse résolution, temps de relaxation SNIF-RMN) - Méthodes de séparation des molécules chirales par chromatographie - Couplage des méthodes (GC-MS, CLHP-MS, ICP-MS, EC-MS) - Critère de choix d une méthode analytique, applications aux médicaments et aux produits diététiques 3- Contrôle radio-pharmaceutiques et galéniques - Utilisation et Contrôle de qualité de médicaments radio-pharmaceutiques en exploration fonctionnelle - Contrôles pharmaceutiques des formes galéniques (comprimés, pâteux, injectables) 4- Contrôles biochimiques, hématologiques et microbiologiques - Contrôle de pureté de médicaments d origine biotechnologique (vecteurs, gènes, protéines de l hôte) - Contrôle des produits dérivés du sang (approche sécuritaire, méthodes de réduction virale, pharmacovigilance) - Contrôle microbiologique (stérilité, pyrogènes et endotoxines, sécurité virale) 5- Statistique, validation statistique des résultats expérimentaux - Analyse statistique des résultats - validation des méthodes analytiques et application aux produits pharmaceutiques 6- Législation et réglementation, dossier d AMM et contrôle qualité - Textes européens et normes réglementaires en relation avec la partie analytique des dossiers d AMM - Les normes de qualité pharmaceutique, bonnes pratiques de fabrication, qualité ISO. Les travaux dirigés seront axés sur l analyse et la compréhension d expériences tirées de publications en relation avec les thèmes abordés en cours. Ecrit Oral Total Ne passent les oraux que les étudiants qui n ont pas eu la moyenne à l écrit. - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 15

16 3M7BT21M / 3M8BT21M - EXPERIENCE EN LABORATOIRE Enseignant Responsable : Alain VERCELLONE IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : alain.vercellone@ipbs.fr Equipe pédagogique : Objectif : Donner aux étudiants la possibilité d acquérir, hors cursus, une expérience en laboratoire. Celle-ci leur donnera la possibilité de parfaire leur formation pratique en biochimie et biotechnologies. Elle leur permettra également d être confrontés au monde du travail et aux exigences que celui-ci impose. - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 16

17 3M8BT04M - BIOTECHNOLOGIES II- LES STRATEGIES EN BIOLOGIE MOLECULAIRE Enseignant Responsable : Laurent PAQUEREAU IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : laurent.paquereau@ipbs.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 16h 32h 12h 60h Equipe pédagogique : B. Couderc, V. Ecochard, D. Fournier, I. Lajoie-Mazenc, L. Nieto. Objectif : Cours et TD : Approfondissement des techniques de biologie moléculaire vues les années précedentes, dans le but de rendre l étudiant capable de choisir les technologies appropriées et de monter une stratégie scientifique. Les différentes stratégies seront abordées soit directement soit à l aide d exemples illustrant des grands problèmes biologiques. Exemples de techniques abordées : Analyse de mutations et du polymorphisme Construction et modification de séquence La PCR Interuption de gènes (knock-out, RNA interference ) Exemples biologiques Interactions entre macromolécules Chaque unité d enseignement sera composé d un TD de 2h pendant lequel l étudiant cherchera les stratégies à mettre en œuvre pour résoudre un problème, d un cours de 2h pendant lequel seront développées les stratégies qui peuvent être mises en œuvre et d un TD de 2h pendant lequel l étudiant comparera les différentes stratégies. Travaux Pratiques : Typage moléculaire : Analyse du polymorphisme de l ADN (extraction d ADN, et amplification par PCR) Bioinformatique C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP 20 Ecrit Oral 20 Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 17

18 3M8BT05M - ANALYSE STRUCTURALE DE BIOMOLECULES Enseignant Responsable : Virginie PUECH Pôle de biotechnologies végétales UMR CNRS/UPS 5546 Surfaces cellulaires et signalisation chez les Végétaux 24 chemin de Borde-rouge BP Castanet Tolosan : : virpuech@scsv.ups-tlse.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 22h 22h 16h 60h Equipe pédagogique : M. P. Bousquet, F. Couderc, J. Czaplicki, A. Lemassu, A. Milon, R. Poupot, J. Prandi, V. Puech Pagès, A. Savagnac, M. Tropis. Objectif : Cours/TD : - Analyse structurale par RMN - Protéomique et spectrométrie de masse (SM) appliquée aux petites molécules - Chimie des bio-molécules - Vision intégrée (SM, RMN..) TP : - analyse des MPT d une protéine par SM et interrogation des banques de données (3h) - interprétation de spectres RMN (3h) - traitement de données RMN (3h) - dosage d arômes en SM (7h) C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 18

19 3M8BT06M - BIOLOGIE STRUCTURALE DES MACROMOLECULES Enseignant Responsable : Jerzy CZAPLICKI IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : cgeorge@ipbs.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 46h 12h 12h 60h Equipe pédagogique : C. Bon, J.-P. Borges, V. Gervais, J. Czaplicki, A. Gonzalez, L. Maveyraud, S. Tranier, O. Saurel Objectif : Elucidation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques et de complexes supramoléculaires. Méthodes principales de la biologie structurale et exemples de complexes biologiques pour lesquels la connaissance de structures 3D a joué un rôle décisif dans la compréhension des phénomènes. Ceci comprend les domaines suivants : - Spectrométrie de masse et protéomique ; caractérisation de la structure primaire (y compris les modifications post-traductionnelles) de macromolécules biologiques naturelles et/ou recombinantes. - Utilisation de la bioinformatique dans le contexte de la détermination de structure 3D de macromolécules, de leur dynamique, de leurs interactions, que ce soit entre elles ou avec des ligands d intérêt pharmacologique. - Cristallographie et méthodes de diffusion/diffraction des rayonnements : fondements théoriques et applications pharmacologiques. - Résonance Magnétique Nucléaire : fondements théoriques et applications pharmacologiques. Les travaux pratiques seront réalisés en laboratoire de recherche, en utilisant les équipements utilisés à ce jour dans les laboratoires académiques et industriels : stations graphiques, diffractomètres, spectromètres de masse et de RMN récents. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 19

20 3M8BT07M - RELATIONS STRUCTURE FONCTION DES LIPIDES ET DES PROTEINES DANS LES MEMBRANES BIOLOGIQUES Enseignant Responsable : Laurent MAVEYRAUD IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : Laurent.Maveyraud@ipbs.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 22h 24h 14h 60h Equipe pédagogique : C. Lebrun, L. Maveyraud, P. Faller, A. Labrousse Objectif : Les membranes biologiques, outre leur rôle de compartimentation des cellules ou des organites, jouent un rôle central dans la cellule. En effet, de nombreux processus cellulaires (transduction de signal, transport de molécules, production d'énergie) se déroulent au niveau des membranes. Ces 10 dernières années la vision des membranes a fortement évolué, il est notamment de plus en plus évident que ce sont des structures subtilement structurées et très dynamiques. COURS : Le cours se partage en 2 grandes parties: I- Composition et dynamique des membranes biologiques - Structure des lipides et des protéines membranaires. - Dynamique latérale et transverse des lipides et des protéines - Synthèse et adressage des protéines membranaires - Systèmes intégrés: transmission des signaux à travers les membranes II Couplage énergétique - Transfert des électrons Chaîne respiratoire Système photosynthétique TRAVAUX DIRIGES : Ils seront axés sur la compréhension d expériences tirées de publications et la résolution d exercices en relation avec les différentes parties du cours. TRAVAUX PRATIQUES : - Etude de la perméabilité de membranes modèles par turbidimétrie - Etude de la perméabilité de membranes modèles par fluorescence - Analyse d articles C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral 20 Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 20

21 3M8BT08M - DU METABOLISME AU METABOLOME Enseignant Responsable : Jean-Charles PORTAIS Laboratoire Biotechnologie- Bioprocédés- INSA- DGBA- 135 avenue de Rangueil- Toulouse : : jean-charles.portais@insa-tlse.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 22h 20h 18h 60h Equipe pédagogique : Isabelle Muller, Fabien Létisse, Jean-Charles Portais Objectif : A l ère post-génomique, il est devenu essentiel de pouvoir caractériser le comportement (phénotype global) d un système vivant, qu il soit simple ou complexe. Parmi les approches émergentes, l analyse fonctionnelle du métabolome (ensemble des processus métaboliques d une cellule, d un organisme, etc.) occupe une place croissante car le comportement métabolique résulte directement de l interaction entre l expression du génome et l environnement. Ainsi, des modifications de l expression du génome ou de l environnement sont immédiatement perceptibles au niveau du métabolome. Les domaines d applications sont très larges et vont des biotechnologies à la santé. Dans ce cours, la notion de métabolome sera présentée, et l accent sera mis sur la compréhension de l organisation, de la mise en œuvre et du contrôle des systèmes métaboliques dans le contexte de la cellule vivante. L enseignement s articulera autour de trois thèmes : le métabolome, son analyse fonctionnelle, et les domaines d applications de l analyse du métabolome. Le métabolome : définitions. Organisation du métabolome : réseaux métaboliques, analyse topologique. Notion de contrôle des systèmes métaboliques. Principes généraux de l adaptation des systèmes métaboliques Analyse fonctionnelle du métabolome Métabolomique. Approches ciblées et approches globales. Principales méthodes d analyse : Fluxomique. Notion de flux métaboliques. Techniques de marquage isotopique (au 13 C) couplées à la RMN et à la spectrométrie de masse. Principes de l analyse des flux métaboliques. Domaines d applications Les principaux domaines d applications seront présentés, puis deux exemples seront détaillés : Biotechnologies microbiennes Santé : recherche de biomarqueurs Les thèmes traités en cours seront illustrés en TD (notamment par l analyse de données expérimentales de la littérature) et en TP. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP 20 Ecrit 60 Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 21

22 3M8BT09M - BIOINFORMATIQUE Enseignant Responsable : Jerzy CZAPLICKI IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : cgeorge@ipbs.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP délocalisé 20h 20h 20h 60h Equipe pédagogique : P. Arnaud, J.-P. Borges, J. Czaplicki, F. Rodriguez, L. Sanchou Objectif : Cet enseignement s'adresse aux étudiants possédant déjà une culture de base en bioinformatique, spécifiquement à ceux qui ont suivi le module de Bioanalyse (3M7B03M) ou qui ont validé d autres modules équivalents. Nous proposons un ensemble de thèmes qui couvrent les différents aspects de la bioinformatique et qui sont essentiels dans un contexte de recherche scientifique et industrielle moderne : Unix et Internet Cours dont l objectif est d apprendre la structure du système d'exploitation Unix et de savoir utiliser ses outils (notamment ceux qui permettent de gérer les fichiers, visualiser les données et de communiquer par réseau), en vue de besoins spécifiques liés à la Biochimie et la Biologie Moléculaire. Modélisation par homologie Nous présentons les principes d une approche empirique qui permet de déterminer la structure et la dynamique de molécules d intérêt biologique. La structure tridimensionnelle des protéines, dont seule la structure primaire est connue, peut être déterminée avec l aide d au moins une protéine de référence, dont la structure atomique est disponible. Les sujets abordés vont impliquer l alignement de séquences, identification de régions structurellement conservés, la notion d un champ de force et les techniques de minimisation d énergie. Applicatifs Bio en Python et Biopython La réalisation des tâches bioinformatiques exige souvent le recours à l aide d un ordinateur. La programmation en biologie ne nécessite pas de connaissance du langage machine ; il est suffisant et beaucoup plus simple de programmer en langage de haut niveau. Nous présenterons la création des applications bioinformatiques en Python. Python est maintenant utilisé en Bioinformatique à la fois comme langage de programmation d'applicatifs (par exemple pour la modélisation ou la visualisation de structures moléculaires) que comme langage de script ou de macros. Une raison de ce succès est certainement que Python a été à la fois conçu pour répondre aux besoins des débutants autant qu'à ceux de Bioinformaticiens expérimentés. Finalement, une bibliothèque de modules Python, de plus en plus importante, s'avère essentielle dans plusieurs domaines de la Bioinformatique. Un exemple, Biopython ( est une collaboration internationale pour collecter et produire des codes Bioinformatiques Open Source et est particulièrement efficace dans le cadre de manipulation de formats de fichiers spécialisés (séquences, structures biologiques), d'intégration de données et de ressources Biologiques. Total C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 22

23 3M8BT13M - ELABORATION D UN PROJET DE CREATION D ENTREPRISE EN BIOTECHNOLOGIE Enseignant Responsable : Josiane POQUE Bât. 3R2 - Gestion - UFR MIG 118 route de Narbonne Toulouse Cedex : : poque@cict.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM TD TP Enseignement délocalisé Total 36h 4h 20h 60h Equipe pédagogique : J. Poque, H. Dolgopoloff, F. Couderc, B. Couderc, Mme Gayraud Objectif : Le but de cet enseignement est de permettre aux étudiants de connaître les rouages de la valorisation de la recherche dans l'entreprise, ce qu'elle nécessite au niveau de la propriété industrielle, et de la gestion de produit, du financement de projet et du management d'entreprise. Ce module permettra à l'étudiant d'avoir une approche réaliste et pratique de l'entreprise et facilitera son insertion professionnelle ou une création d'entreprise. Il saura comment s'entourer de compétences complémentaires et possédera les notions lui permettant de faire avancer ses projets de valorisation de recherche. L'étudiant pourra cerner les divers enjeux et les répercussions dans l'entreprise d'un transfert de technologie au travers d'un projet de valorisation de recherches biotechnologiques. Cet enseignement s'adresse aussi bien à l'étudiant intéressé par son insertion immédiate dans la vie professionnelle qu'aux étudiants soucieux de réaliser une thèse de doctorat et de la possible valorisation de leur recherche. Cours I) Problématique du transfert de technologie Transfert de technologie, Propriété industrielle (les brevets) II) Gestion financière de l'entreprise Droits des contrats, des sociétés, Finance: comptabilité générale/ Analyse des documents de synthèse. III) L'entreprise comme système organisé- notion de stratégies et aspects structurels de l'entreprise Marketing international, Notions de ressources humaines, Lois sociales IV) Analyse des coûts et gestion de projet Analyse de coûts, Gestion prévisionnelle/ business plan V) Le financement de l'entreprise Investissements, Financement/rentabilité, Relation banque/entreprise: société de capital risque 1ère session Examen : Comptabilité et Business Plan 40 % Stratégie 10 % Contrôle Continu : Dossier 25 % Soutenance 25 % 2ème session Examen Comptabilité et Business Plan 40 % Stratégie 10 % Contrôle continu : ne se repasse pas en session 2 (notes de la session 1 conservées). C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit report Oral 25 report Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 23

24 3M8BT14M - BIOCHIMIE ANALYTIQUE QUANTITATIVE Enseignant Responsable : Jean-Daniel MARTY IMRCP UMR 5623-Bât. 2R1 3 ème étage 118 route de Narbonne Toulouse Cedex : : marty@chimie.ups-tlse.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 20h 14h 26h 60h Equipe pédagogique : Cécile Albenne, Jean-Noël Genthon, Jean-Daniel Marty, Françoise Nepveu, Arlette Savagnac Objectif : L'objectif de l'enseignement est de former l'étudiant à la démarche analytique telle qu'elle est mise en œuvre dans les départements d'analyse et de contrôles des industries des secteurs biotechnologique, pharmaceutique, agro-alimentaire et biochimique. PROGRAMME : Le programme des enseignements est centré autour de la biochimie analytique en respectant les phases de mise en place d'un protocole analytique en milieu industriel. - Bonnes pratiques de laboratoire et assurances de qualité - Validation des méthodes d'analyse - Analyse des données et validation des résultats analytiques - Mise en place des méthodologies d'analyse - Choix des méthodes - Préparation des échantillons - Spectroscopies moléculaires (UV-visible, fluorimétrie, infrarouge,...) - Techniques électrophorétiques et électrophorèse capillaire - Techniques chromatographiques et couplages - Spectrométrie de masse et couplages - Techniques électrochimiques et biocapteurs (titrateurs automatiques, coulométriques, ampérométriques,...) - Techniques d'émission et d'absorption moléculaire - Automates d'analyse, infralyseurs et analyses à distance ENSEIGNEMENTS PRATIQUES : - Utilisation de l électrochimie pour la chimie quantitative - Mini-projet analytique pour la détermination des acides organiques dans les vins (CE, HPLC, deux journées) C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 24

25 3M8BT15M - BASES MOLECULAIRES DE L EXPRESSION DE LA PATHOGENIE BACTERIENNE Enseignant Responsable : Alain VERCELLONE IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : alain.vercellone@ipbs.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 30h 14h 16h 60h Equipe pédagogique : F. Bardou, F. Dumas, G. Etienne, A. Vercellone Objectif : L enseignement a pour objectif de présenter les mécanismes moléculaires impliqués lors des différentes étapes d une infection bactérienne. Cet enseignement repose sur les connaissances acquises dans les domaines de la biologie cellulaire, de la biochimie, de la génétique, de l immunologie et de la microbiologie mais se veut accessible aux étudiants des maîtrises de biologie cellulaire et de biochimie. Cours : Les cours sont regroupés en trois thèmes : Bases moléculaires des interactions hôte-pathogène Modes d action des antibiotiques et mécanismes de résistance bactériens aux antibiotiques Acquisition et régulation de la virulence Travaux Dirigés : Ils seront axés sur l analyse et la compréhension d expériences tirées de publications en relation avec les différents thèmes abordés. Travaux Pratiques : Internalisation par des macrophages murins de Mycobactéries marquées au FITC. Suivi de l internalisation par spectrofluorimétrie. Mise en évidence de la résistance aux -lactames. Action d une toxine sur une membrane modèle. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 25

26 3M8BT20M - INTRODUCTION A LA VALORISATION JURIDIQUE DE L INNOVATION Enseignant Responsable : Jérôme FISCHER Université des sciences sociales de Toulouse-2 rue du Doyen-Gabriel-Marty Toulouse Cedex. Bureau SUIO Ancienne Faculté Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM 60h TD TP Enseignement délocalisé Total 60h Equipe pédagogique : J. Fischer Objectif : I : Initiation juridique aux notions de base : Organisation judiciaire Sources du droit en matière scientifique (Traités, Constitution, Loi, règlements, usages), L instrument contractuel et les principaux types de contrats II : La propriété intellectuelle: A : la propriété industrielle (brevets, modèles et dessins, semi-conducteurs, certificats végétaux) B : les droits d'auteurs (la protection du logiciel) C : les contrats de licence de brevet ou de marque. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 26

27 HM8MM2M - BIOTECHNOLOGIES ET INGENIERIE MEDICALES Enseignant Responsable : Bettina COUDERC : : couderc.bettina@claudiusregaud.fr Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 50h 10h 60h Equipe pédagogique : I. Berry (PR, UFR Medecine), H. BENOIST (PR, UFR Pharmacie), C. CLAVEL (UFR Medecine), B. COUDERC (PR, UFR Pharmacie), F. COUDERC (PR, UFR PCA), D. FOURNIER (PR, UFR SVT), JP GELUGNE (MCU, UFR SVT), G. Gregoire, (PR, UFR dentaire),i. LAJOIE MAZENC (MCU UFR Pharmacie), F. LEGAILLARD (PR, UFR Pharmacie), L. Liaubet (CR, INSA), A. PARINI (PR UFR Pharmacie), J. Pettenati (CR, CNRS), T. Pineau (CR INRA),, MP ROLS (CR CNRS), P. SIE (PR, UFR Pharmacie)D. TOVAR (MCU UFR Pharmacie) Objectif : L'objectif de l'enseignement est de former l'étudiant aux principales techniques utilisant des biotechnologies utilisées pour la synthèse et l¹utilisation de molécules thérapeutiques. Le programme des enseignements comporte les paragraphes suivants : génomes, thérapie génique, technologies des protéines recombinantes, ingéniérie et thérapie cellulaire, biotechnologies fongiques à visée pharmacologique, immunotechnologies, biomatériaux, animaux et plantes transgéniques, génomique fonctionnelle, traitement et visualisation des images numériques, isotopes radioactifs, système de protection industrielle et intellectuelle. COURS MAGISTRAUX : GENOMES THERAPIE GENIQUE TECHNOLOGIES DES PROTEINES RECOMBINANTES INGENIERIE ET THERAPIE CELLULAIRE BIOTECHNOLOGIES FONGIQUES À VISÉE PHARMACOLOGIQUE IMMUNOTECHNOLOGIES BIOMATÉRIAUX ANIMAUX TRANSGENIQUES PLANTES TRANSGENIQUES GENOMIQUE FONCTIONNELLE TRAITEMENT ET VISUALISATION DES IMAGES NUMERIQUES SYSTEME DE PROTECTION INDUSTRIELLE ET INTELLECTUELLE ENSEIGNEMENTS DIRIGES Préparation par groupe de 2 étudiants d une présentation synthétique PowerpPoint de 10 mn sur une technique originale de biotechnologies ou un sujet d actualité en biotechnologie. Présentation à l oral de contrôle continu et réponses à des questions sur le sujet. Le sujet de ce rapport sera choisi par le groupe d étudiant en accord avec un «tuteur» de l équipe pédagogique. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 27

28 HM8MM4M - CONCEPTION ET STRUCTURES DES MOLECULES D INTERET THERAPEUTIQUE Enseignant Responsable : Vania BERNARDES-GENISSON (Pharmacie) Fac de Pharmacie 35, Chemin des maraîchers Toulouse Cedex : : vaniabg@lcc-toulouse.fr Enseignement de Semestre 7-6 ECTS CM Enseignement TD TP Total délocalisé 47 h 3h 20h 70h Equipe pédagogique : Vania BERNARDES-GENISSON (pharmacie), Jean BERNADOU (pharmacie), Jean-Luc STIGLIANI (pharmacie), Cécile TOURNAIRE-ARELLANO (pharmacie), Claude MOULIS (pharmacie), Françoise, NEPVEU (pharmacie), Suzy FERY-FORGUES (CNRS), Yves GENISSON (CNRS), Geneviève PRATVIEL (CNRS) et Anne ROBERT (CNRS). Objectif : L objectif de cet enseignement est de présenter les bases moléculaires de la chimie médicinale permettant une bonne compréhension des différentes approches à mettre en œuvre dans la conception de nouvelles entités médicamenteuses. pour la conception principaux éléments de la physiologie bactérienne Cours : Différentes méthodes de découverte des médicaments (drug design, chimie combinatoire, criblage à haut débit, produits naturels), mécanisme d action des médicaments au niveau moléculaire, pharmacomodulation, relation structure-activité, stratégies de marquage, phototoxicité. Travaux dirigés : Ils seront axés sur l analyse et la compréhension d expériences tirées de publications en relation avec les thèmes abordés en cours. Travaux Pratiques : Etude de l influence des paramètres physico-chimiques (lipophilie et constante de ionisation pka) sur l activité antibactérienne d une famille de sulfamides. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 28

29 3M8OVT1M - CO-EVOLUTION : EXEMPLES DES INTERACTIONS HOTE-PATHOGENE Enseignant Responsable : Alain VERCELLONE IPBS/CNRS- 205 route de Narbonne Toulouse Cedex : : alain.vercellone@ipbs.fr Enseignement de semestre 8 3ECTS COURS TD TP 24h Equipe Pédagogique : A. VERCELLONE. Cours : L enseignement a pour objectif de montrer au niveau moléculaire comment les interactions entre organismes procaryotes et eucaryotes ont permis l évolution de ces organismes. Les différentes étapes de l infection de l homme par les bactéries pathogènes seront décrites (Pénétration, adhérence, invasion, résistance aux défenses de l hôte, création de dommages) au travers d exemples. Cet enseignement repose sur les connaissances acquises dans les domaines de la biologie cellulaire, de la biochimie, de la génétique, de l immunologie et de la microbiologie. C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 29

30 3M8OVT2M - INITIATION JURIDIQUE Enseignant Responsable : Jérôme FISCHER Université des sciences sociales de Toulouse-2 rue du Doyen-Gabriel-Marty Toulouse Cedex. Bureau SUIO Ancienne Faculté Enseignement de Semestre 8-6 ECTS CM Enseignement TD TP délocalisé Total 24 h 24 h Equipe pédagogique : J. Fischer Objectif : I : Initiation juridique aux notions de base : Organisation judiciaire Sources du droit en matière scientifique (Traités, Constitution, Loi, règlements, usages), L instrument contractuel et les principaux types de contrats C. C. C.P. C.T. C. C. C.P. C.T. TP Ecrit Oral Total UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 30

31 Université Paul Sabatier UNITE DE FORAMTION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT) Bâtiment IV R route de Narbonne Toulouse Cedex ou Resp.Adm. : SYLLABUS Mention BIOCHIMIE BIOTECHNOLOGIE Les spécialités des Masters 2 de la Mention Biochimie Biotechnologie (BBT) - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 31

32 - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 32

33 Enseignant Responsable : Germain PUZO Master 2 R : Biologie structurale et fonctionnelle : IPBS/CNRS, 205 route de Narbonne Toulouse : : Secrétariat pédagogique : : IBCG, 118 route de Narbonne Toulouse CONDITIONS D ADMISSION Accès après audition des étudiants ayant le M1 biochimie /biotechnologies, pharmaciens et élèves ingénieurs Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation (pré-inscription sur le site web de l'université : SCHEMA DES ETUDES : 3A9SF1M 15 ECTS Proteomique structurale et fonctionnelle/tronc commun 1 er semestre 15 ECTS Stage d immersion 1 er semestre 3AASF1M 15 ECTS Mécanismes moléculaires des fonctions du vivant 2 ème semestre 3A9SF2M 15 ECTS Stage de recherche 2 ème semestre Débouchés en deuxième année de Master à l'u.p.s. : Doctorats, Le Master recherche, au travers des spécificités de chaque option, éclaire les étudiants sur les possibilités d insertion professionnelle post-master dans le tissu socio-économique. Il s agit principalement de métiers à double compétence (contrôle qualité, brevets, technicocommercial, journalisme ). - UPS UFR SVT SYLLABUS Master STS Mention Biochimie Biotechnologies (BBT) (habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 33