Ingénieur en traitement de données biologiques

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1 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en traitement de données biologiques A2A21 Biologie et recherche médicale - IE Mission L'ingénieur en traitement de données biologiques organise la collecte et réalise la gestion et le traitement de données issues de la recherche en sciences du vivant. Tendances d'évolution Accroissement du volume et de la complexité des données Accroissement des exigences éthiques Mise en place de démarche qualité Activités principales Mettre en place les procédures de recueil et de contrôle des données issues des travaux de recherche dans le domaine des sciences de la vie. Réaliser le traitement des données Organiser la mise en forme, le stockage des données Assurer la maintenance des bases de données créées Assurer la veille scientifique et technique Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d étude à usage des communautés professionnelles et scientifiques. Activités associées Adapter les applications informatiques aux besoins du projet. Gérer et maintenir des outils informatiques partagés. Coordonner les moyens humains et financiers dédiés à la réalisation du projet Conseiller et former aux techniques et outils développés. Définir les procédures d assurance qualité et veiller à leur mise en œuvre. Assurer l application d un dispositif d hygiène et de sécurité Appliquer et faire appliquer les règles en vigueur de la déontologie, l éthique, les bonnes pratiques cliniques et épidémiologiques. Participer à des réseaux professionnels (surveillance épidémiologique, risques sanitaires) Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d activité Compétences principales Connaissance approfondie des différents types de protocoles expérimentaux biologiques. Connaissance approfondie des méthodes de recueil, d analyse et de traitement des données. Connaissance générale dans le domaine des sciences de la vie lié aux études. Savoirs sur l'environnement professionnel La déontologie, l éthique, la réglementation concernant son domaine de recherche (recherche biomédicale, épidémiologie, expérimentation animale ). Les réseaux professionnels dans lesquels sont mises en œuvre les études. Utiliser un ensemble cohérent d outils mathématiques, statistiques et informatiques adaptés au traitement des données. Conduire les différentes phases d'un protocole de recherche. Travailler en interaction avec les biologistes et les informaticiens. Garantir la qualité et la pertinence des outils d analyse et des résultats. Transférer son savoir-faire en interne et externe. Mettre en forme et présenter les résultats auprès des partenaires du projet. Anglais Compréhension écrite et orale : niveau 2 Expression écrite et orale : niveau 1 Compétences associées Appliquer les méthodes d essais cliniques et d enquêtes épidémiologiques Mettre en œuvre les techniques de recueil et de stockage des données Appliquer la démarche qualité.

2 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce au sein d un laboratoire de recherche Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence Formations et expérience professionnelle souhaitables Expérience souhaitable en : biométrie, bio statistiques, biomathématiques, bioinformatique, épidémiologie, ou santé publique.

3 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques A2A22 Biologie et recherche médicale - IE Mission L ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques développe et conduit en spécialiste une des approches méthodologiques de la biologie en réponse aux questions scientifiques posées par les utilisateurs du service. Tendance d évolution Mobilisation importante des plateformes pour intégrer et proposer des innovations technologiques Développement des activités de conseil et formation auprès des utilisateurs Mutualisation des technologies (équipements, savoirs, savoir-faire) pour différentes structures de recherche Activités principales : Choisir et adapter les technologies d analyse et d expérimentation en fonction des objectifs de recherche dans le cadre d une approche spécialisée (imagerie, protéomique, transgénèse ) Développer des techniques et des instruments adaptés à une approche méthodologique de la biologie (génie logiciel, optique ) Former et assurer un transfert technologique auprès des utilisateurs. Conseiller les utilisateurs sur les possibilités et limites des techniques, sur l interprétation des données Définir avec les utilisateurs une méthode d analyse des données et en assurer le suivi Rédiger des notes techniques et des tutoriaux sur les différents systèmes et approches expérimentales Activités associées Concevoir, en spécialiste, des expériences dans le cadre d un domaine d étude de la biologie : biochimie des protéines, biologie cellulaire, biologie du développement, transgénèse Gérer les moyens techniques, humains et financiers alloués aux expérimentations Organiser et contrôler l utilisation collective de l appareillage et des postes de travail Concevoir ou animer des actions de formation en interne et en externe Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d activité Assurer l application d un dispositif d hygiène et de sécurité Compétences principales Connaissance approfondie d une approche méthodologique appliquée à la biologie (imagerie, protéomique, transgénèse ) Connaissance générale de la biologie Les communautés scientifiques et technologiques du domaine Les réglementations du domaine en hygiène et sécurité Les principes éthiques et les réglementations afférentes Utiliser des instruments dédiés à l analyse et l expérimentation en biologie (RMN, spectroscopes, microscopes, cytomètre, séquenceur ) et en assurer la maintenance Mettre en œuvre des expériences dans le cadre d un domaine d étude de la biologie : biochimie des protéines, biologie cellulaire, biologie du développement, transgénèse Utiliser les outils informatiques et des logiciels dédiés au traitement de données (statistiques, modélisation) et au pilotage d expériences Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes Planifier les activités de l entité en tenant compte des contraintes et des échéances Mettre en œuvre une négociation en matière d achat Anglais : Compréhension écrite et orale : niveau 2 Expression écrite et orale : niveau 1 Compétences associées Notions de base sur les techniques des disciplines voisines (mathématiques, physique, chimie, informatique appliquée )

4 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce au sein d un plateau technique ou d une plate forme technologique Astreintes et conditions d exercice L activité peut nécessiter l adaptation à des contraintes de service et d horaires ainsi que la connaissance de réglementations spécifiques (expérimentation animale...) Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence. Formation et expérience professionnelle souhaitables Formations recommandées : biologie, biochimie, biotechnologie, biologie appliquée,

5 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en techniques biologiques A2A23 Biologie et recherche médicale - IE Mission L ingénieur en techniques biologiques choisit, adapte et met en œuvre les techniques de biologie dans le cadre des projets scientifiques d une équipe de recherche. Tendances d'évolution Développement des exigences éthiques. Mise en place de démarche qualité Activités principales Choisir et adapter les protocoles de préparation et d analyse des échantillons biologiques dans le cadre d un ou plusieurs domaines d étude : biochimie, génétique, biologie moléculaire, biologie cellulaire et morphologique, physiologie animale ou humaine, transgénèse Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques (électrophorèse, techniques immunologiques, histologiques, de transgénèse, génotypage, clonage, séquençage, PCR, microscopies, cytométrie.) Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir la qualité Rédiger des rapports d expérience ou d étude, des notes techniques Activités associées Gérer les moyens techniques dans le cadre d un projet scientifique Conduire l appareillage dédié à l approche méthodologique et en assurer le fonctionnement Encadrer les personnels techniques et les stagiaires pour l élaboration et la conduite de protocoles expérimentaux Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l expérimentation en biologie ; encadrer les utilisateurs. Assurer l application d un dispositif d hygiène et de sécurité Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d activité Compétences principales. Connaissance approfondie d un domaine de la biologie Connaissance générale de la biologie. Savoirs sur l'environnement professionnel Les communautés technologiques du domaine Les réglementations du domaine en hygiène et sécurité Les principes éthiques et les réglementations afférentes Utiliser des instruments dédiés à l analyse et l expérimentation en biologie (RMN, spectroscopes, microscopes, cytomètre, séquenceur ) et en assurer la maintenance Mettre en œuvre des expériences dans le cadre d un domaine d étude de la biologie : biochimie des protéines, biologie cellulaire, biologie du développement, transgénèse Utiliser les outils informatiques et des logiciels dédiés au traitement de données (statistiques, modélisation) et au pilotage d expériences Situer son activité dans la thématique et les projets scientifiques de l unité Adapter les protocoles expérimentaux dans le cadre d un projet scientifique Maîtriser les techniques de présentations orales et écrites Anglais : Compréhension écrite et orale : niveau 2 Expression écrite et orale : niveau 1 Compétences associées Connaissance générale des disciplines voisines (mathématiques, physique, chimie ) Notions de base en informatique Utiliser les outils de recueil et traitement de données (statistiques, modélisation) Rédiger des rapports Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes.

6 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce au sein d un laboratoire de recherche et/ou d un service pédagogique Astreintes et conditions d exercice Contraintes de service dans certains contextes de travail (horaires décalés, fins de semaine...) Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence Formations et expérience professionnelle souhaitables Domaine de formation : biologie

7 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en techniques d expérimentation animale A2B24 Production et expérimentation animales - IE Mission L ingénieur en techniques d expérimentation animale met en œuvre des programmes et développe des techniques expérimentales dans le cadre de projets de recherche. Tendances d évolution Mutualisation des activités au sein des animaleries Développement des exigences éthiques et sociales Renforcement des règles et normes en matière d expérimentation animale Activités principales Développer et adapter des techniques d expérimentation aux modèles animaux Appliquer et faire appliquer les réglementations liées aux activités d expérimentation animales Organiser les moyens techniques et humains et gérer les budgets alloués aux activités d expérimentation Réaliser des interventions chirurgicales et assurer le suivi pré et post opératoire Analyser les données et mettre en forme les résultats pour leur présentation Rédiger des rapports d expérience ou d étude, des notes techniques Activités associées Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d activité Assurer l application d un dispositif d hygiène et de sécurité Transmettre ses connaissances et savoir-faire en expérimentation animale Animer des actions de formation en expérimentation animale Réaliser des expériences de culture cellulaire et de biologie moléculaire Compétences principales Connaissance approfondie en expérimentation et chirurgie animale Connaissance générale de la biologie animale (physiologie, anatomie, comportement, génétique, reproduction ) Les principes éthiques et les réglementations afférentes Les règles d hygiène et de sécurité liées à la manipulation des animaux (OGM ou non), des produits toxiques, des produits contaminants. Les communautés technologiques du domaine Adapter les protocoles et dispositifs expérimentaux aux problématiques de l unité Maîtriser les techniques opératoires et thérapeutiques sur l animal Exploiter les outils informatiques de recueil et de traitement de données Manipuler un animal (préhension, contention, tranquillisation ) Situer son niveau d intervention dans l activité de recherche de la structure Anglais Compréhension écrite et orale : niveau 2 Expression écrite et orale : niveau 1 Compétences associées Les normes qualité applicables dans le cadre de sa pratique professionnelle Animer une équipe en précisant les objectifs et le rôle de chacun Transmettre ses connaissances à des publics variés Maîtriser certaines techniques de biologie cellulaire et moléculaire

8 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce dans un laboratoire d enseignement et/ou recherche, une animalerie, une unité expérimentale, un milieu confiné ou une zone protégée. Astreintes et conditions d exercice Nécessite l adaptation aux contraintes de service et d horaires. Nécessité éventuelle d adaptation aux exigences du travail en milieu confiné ou en zone protégée Habilitation à l expérimentation animale de niveau 2 requise Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence Formation et expérience professionnelle souhaitables Domaine de formation : biologie animale

9 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en techniques d élevage et production animale A2B25 Production et expérimentation animales IE Mission L ingénieur en techniques d élevage et production animale met en œuvre et développe des programmes d élevage ou de maintenance de lignées d animaux. Tendances d évolution Mutualisation des activités au sein des structures d élevage et de production Développement des exigences éthiques et sociales Renforcement des règles et normes en matière d élevage Activités principales Organiser les moyens techniques et humains et gérer les budgets alloués aux activités d élevage et de production animale Adapter des techniques d élevage en fonction de l évolution des règles, normes, exigences éthiques et sociales Gérer des protocoles expérimentaux intégrés aux contraintes des élevages Organiser le maintien de lignées expérimentales Appliquer et faire appliquer les réglementations liées aux activités d élevage animal Analyser les données et mettre en forme les résultats pour leur présentation Rédiger des rapports d expérience ou de suivis d élevage Activités associées Organiser la surveillance de l état sanitaire des animaux et l administration des traitements nécessaires Assurer l application d un dispositif d hygiène et sécurité Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité Transmettre ses connaissances et savoir-faire en techniques d élevage Veiller à l état des lieux d hébergement des animaux et des espaces d élevage Réaliser de petites interventions chirurgicales Compétences principales Connaissance approfondie en agronomie et production animale Connaissance générale de la biologie animale (physiologie, anatomie, comportement, génétique, reproduction ) Les communautés technologiques du domaine Les règles d hygiène et de sécurité liées à la manipulation des animaux (OGM ou non), des produits toxiques, des produits contaminants. La réglementation en expérimentation animale Les règles d élimination des déchets (animaux, médicaments, litières, effluents, ) Animer une équipe en précisant les objectifs et le rôle de chacun Construire et élaborer le budget d une expérimentation, d une structure d élevage Maîtriser un ensemble de techniques d élevage animal Manipuler un animal (préhension, contention, tranquillisation ) Gérer une base de données et/ou une banque d échantillons Exploiter les outils informatiques adaptés Situer son niveau d intervention dans l activité de recherche de la structure Compétences associées Le maintien des conditions d élevage selon les normes en vigueur et les règles d éthique. Exploiter les résultats des contrôles sanitaires et initier les procédures adaptées Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes Transmettre ses connaissances à des publics variés Utiliser les outils de pilotage des installations. Maîtriser quelques techniques de petite chirurgie

10 Anglais Compréhension écrite et orale Niveau 1 Expression écrite et orale Niveau 1 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce dans une unité expérimentale d élevage ou de production animale Astreintes et conditions d exercice Nécessite l adaptation aux contraintes de service et d horaires. Nécessité éventuelle d adaptation aux exigences du travail en milieu confiné ou en zone protégée Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence Formation et expérience professionnelle souhaitables Ecole d agronomie Formation scientifique ou technologique en biologie animale Formation à l expérimentation animale de niveau 2

11 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en techniques de production et expérimentation végétales A2C26 Production et expérimentation végétales IE Mission L ingénieur en techniques de production et expérimentation végétale met en œuvre et développe des techniques de production végétale ou programmes d expérimentation végétale. Tendances d évolution Mutualisation des activités au sein des structures scientifiques Développement des exigences éthiques et sociales Evolution constante des règles et normes en matière de production et d expérimentation végétale Activités principales Organiser les moyens techniques et humains et gérer les budgets alloués aux activités de production et d expérimentation végétale Adapter des techniques de production en fonction de l évolution des règles, normes, exigences éthiques et sociales Réaliser et faire réaliser des protocoles expérimentaux intégrés aux contraintes de production Appliquer et faire appliquer les réglementations liées aux activités de production végétale et/ou expérimentales Analyser les données et mettre en forme les résultats pour leur présentation Rédiger des rapports d expérience ou de suivis de production Activités associées Suivre ou organiser le suivi de l état sanitaire des plants et des cultures et prescrire, faire réaliser ou réaliser les traitements phytosanitaires Gérer des lignées végétales Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité Transmettre ses connaissances et savoir-faire en techniques de production et expérimentation végétale Organiser les opérations de maintien en l état des installations et du matériel Réaliser des analyses, des expériences de culture cellulaire et de biologie moléculaire Compétences principales Connaissance approfondie de l agronomie et de la production végétale Connaissance générale de la biologie végétale (physiologie, botanique, génétique, phytopathologie ) Les communautés technologiques du domaine Les règles d hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques, des produits contaminants et des plantes transgéniques (OGM). Animer une équipe en précisant les objectifs et le rôle de chacun Construire et élaborer le budget d une expérimentation, d une structure de production ou d expérimentation végétale Maîtriser un ensemble de techniques de production ou d expérimentation végétale Gérer une base de données et/ou une banque d échantillons Utiliser les outils informatiques de saisie, mise en forme de données et d enregistrement des données et de pilotage des installations. Exploiter les outils informatiques de recueil et de traitement des données Maîtriser les techniques de présentation écrite Situer son niveau d intervention dans l activité de recherche de la structure Compétences associées Les règles d hygiène et de sécurité Les normes qualité applicables dans le cadre de sa pratique professionnelle Déterminer, d après des symptômes, une maladie ou une attaque parasitaire Exploiter les résultats des contrôles sanitaires et initier les procédures adaptées Gérer les activités d une équipe technique en fonction des priorités de la structure

12 Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes Transmettre ses connaissances à des publics variés Utiliser les matériels agricoles Anglais compréhension écrite et orale Niveau 1 expression écrite et orale Niveau 1 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce dans une unité de production ou d expérimentation végétale, un jardin botanique Astreintes et conditions d exercice Nécessite l adaptation aux contraintes de service et d horaires. Nécessité éventuelle d adaptation aux exigences du travail en milieu confiné ou en zone protégée Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe Licence Formation et expérience professionnelle souhaitables Ecole d agronomie Formation scientifique ou technologique en biologie végétale

13 BAP A Sciences du vivant Ingénieur en techniques d étude des milieux naturels et ruraux A2D27 Milieux naturels et ruraux - IE Mission L ingénieur en techniques d étude des milieux naturels et ruraux développe, adapte et met en œuvre un ensemble de méthodes et techniques comprenant aussi l inventaire et de suivi des milieux naturels et ruraux. Tendances d évolution Utilisation croissante de systèmes d'informations géographiques, de stations d enregistrements automatiques de données et de techniques d analyses biologiques. Exigences éthiques et sociales croissantes Activités principales Mettre en œuvre et adapter des techniques d expérimentation, méthodes ou dispositifs d étude des milieux naturels et ruraux Gérer des bases de données Etablir des accords et des partenariats avec les acteurs de terrain (professionnels, institutionnels et scientifiques) Réaliser des campagnes de recueil de données de terrain ou enquêtes Analyser les données et mettre en forme les résultats pour leur présentation Rédiger des rapports d expérience, d étude ou des notes techniques Activités associées Organiser les moyens techniques et humains et gérer les budgets alloués Réaliser des inventaires des êtres vivants Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité Transmettre ses connaissances et savoir-faire par des activités d enseignement, de formation, d encadrement d étudiants et d expertise technique Assurer l application d un dispositif d hygiène et de sécurité Compétences principales Connaissance approfondie des méthodes et des outils d identification, et de la nomenclature d un domaine des milieux naturels Connaissance générale d un domaine des milieux naturels et ruraux : écologie, agronomie, systématique, génétique des populations, biologie animale et /ou végétale Connaissance générale des techniques d échantillonnage et de méthodes d analyses de données (modélisation, statistiques, indices de biodiversité et de qualité des milieux) Les réseaux professionnels de son domaine d'activité Les normes qualité applicables dans le cadre de sa pratique professionnelle Les contraintes et aléas du milieu étudié Les principes éthiques et la réglementation liée au domaine d'activité La législation en vigueur pour ce qui concerne la récolte, le transport, l utilisation et la protection des êtres vivants Maîtriser les techniques afférentes à la problématique du projet de recherche ou de l'étude : techniques de prélèvement d'échantillons, utilisation de clés de détermination, analyses en laboratoire, techniques d'enquêtes Adapter les protocoles et dispositifs expérimentaux en fonction des problématiques Exploiter les outils informatiques de recueil et de traitement de données Maîtriser les techniques de présentations écrites Situer son activité dans le projet de l unité Anglais compréhension écrite et orale Niveau 2 expression écrite et orale Niveau 1

14 Compétences associées Connaissance générale en gestion de bases de données Les communautés professionnelles, institutionnelles et scientifiques du domaine Les règles d hygiène et de sécurité Animer une équipe en précisant les objectifs et le rôle de chacun Élaborer des tableaux de bord, des fiches de suivi des budgets alloués Transmettre ses connaissances à des publics variés Autre langue vivante : Compréhension écrite et orale Niveau 2 Expression écrite et orale Niveau 1 Environnement professionnel Lieu d exercice L activité s exerce en milieu extérieur et en laboratoire de recherche et/ou d enseignement Astreintes ou conditions d exercice Une part du travail est réalisée en extérieur, éventuellement en terrain accidenté et peut nécessiter des interventions nocturnes. Déplacements fréquents et éventuellement de longue durée, dans des conditions parfois difficiles (milieu tropical, haute montagne.) Diplôme réglementaire exigé Pour le recrutement externe : Licence Formation et expérience professionnelle souhaitables Domaines de formation : écologie ou génétique des populations Ecole supérieure d agronomie