Mycologie Généralités Physiopathologie DCEM1 Pr Stéphane Bretagne 19 janvier 2008
Les champignons Règne à part: Ni animal Ni végétal (pas de photosynthèse) Mais eucaryotes ( procaryotes) Plus de 2 millions d espèces et 100 000 variétés Vie libre: ne dépendent ni des hommes ni des animaux (à de rares mais importantes exceptions) Recyclage du carbone, de l azote Rôles positifs: comestibles, levures dans l industrie, pénicilline
Structure des champignons Membrane: ergostérol Paroi: chitine glycoprotéines ß-glucane Mitochondrie Noyau
Structure de la paroi fongique ß(1-6)-glucanes Chitine Glucanes Glycoprotéines Paroi GS Membrane plasmique ß(1-3)-glucanes Ergostérol
Définitions: 2 grands ensembles 1/ Champignons filamenteux (filamentation et fructification) 2/ Levures (reproduction par bourgeonnement) [NB: Champignons dimorphiques (forme levure pathogène, forme filamenteuse dans l environnement)]
Définitions: 2 grands ensembles Champignons de l environnement Moisissures Aspergillus Mucorales Levures Cryptocoques Commensaux peau et muqueuses levures
Champignons et maladies humaines < 200 espèces reconnues en pathologie humaine Très faible pouvoir pathogène dans l ensemble Tendance actuelle Émergence de mycoses rares ou nouvelles Augmentation de la mortalité et de la morbidité Apparition de résistances aux antifongiques
Facteurs influençant l infection fongique Champignons Hôte Environnement
Champignons filamenteux (Moisissures)
Développement des moisissures Spores Germination Croissance des filaments Fructifications (non synonyme de reproduction sexuée) Dissémination des spores «Tête» aspergillaire
Spectre des infections fongiques Mycoses endémiques Histoplasma capsulatum: Vallée du Mississippi, Guyane, Afrique Mycétomes (Afrique sahélienne) Signes cliniques De l infection bénigne, syndrome grippal, résolution sans traitement Cicatrices pulmonaires à la radiographie Augmentation d incidence, de la morbidité lors d immunodépression (VIH) Diagnostic en France chez les migrants et les DOM-TOM
Mycétome fongique du pied Afrique sahélienne
Infections opportunistes Agents identifiés Aspergillus spp Zygomycètes (mucorales) Fusarium spp Penicillium marneiffei : Asie du Sud Est + HIV Daematiae: champignons noirs
Défenses naturelles contre les moisissures
Physiopathologie de l aspergillose invasive
Analyse des facteurs de risques Respirer de l air ambiant (justification des chambre à flux laminaire) Altération de la clairance mucociliaire Infection bactériennes, virales Radiothérapies Altérations des fonctions immunitaires Neutropénie Corticoïdes
Levures Candida Cryptocoque
Développement des levures Par bourgeonnement Possibilité de filamentation (C. albicans) Pas de fructifications Identification sur des caractères morphologiques et physiologiques Possibilités de formes de résistance (chlamydospores)
Spectre des infections fongiques Mycoses endémiques Coccidioides immitis: Sud-Ouest des Etats-Unis et Mexique Blastomyces dermatitidis: Amérique centrale et du sud Signes cliniques De l infection bénigne, syndrome grippal, résolution sans traitement Cicatrices pulmonaires à la radiographie Augmentation d incidence, de la morbidité lors d immunodépression (VIH) Diagnostic en France chez les migrants et les DOM-TOM
Infections opportunistes Cryptocoque (Cryptococcus neoformans) Agent de méningites Lymphomes VIH (Afrique, <100 CD4/mm 3 ) quelques patients «immunocompétents» Levures du genre Candida
Candida et pathologie humaine Beaucoup de levures sont des germes commensaux C. albicans et C. glabrata: muqueuses digestives et vaginales C. parapsilosis: peau Moyens de défense contre les levures Intégrité de la peau et des muqueuses ph gastrique Flore bactérienne en compétition Agents opportunistes Pathologie iatrogène Pathologie nosocomiale (patient hospitalisé)
LA CANDIDOSE SYSTEMIQUE Colonisation (+++), biofilms Invasion Dissémination hématogène Extravasation, phase chronique
Facteurs de risque d infections à levures (1) Altérations des défenses locales Altérations muqueuses Ulcères Déplétion de la flore endogène = Antibiotiques Chimiothérapies Altérations cutanées Chirurgie, cathéters, eczéma, brûlures
Facteurs de risque d infections à levures (2) Altérations des défenses générales Immunodéficience acquise Induite par les traitements (iatrogène) Chimiothérapie, stéroïdes, agents immunosuppresseurs Générale ou virale Cancer, malnutrition, diabète, CMV, SIDA Fonction de l age Nouveaux-nés, personnes âgées, femmes enceintes Congénitale Maladies héréditaires
Levure =>Identification des patients «à risque» Type d immunodépression en fonction du traitement Durée de la neutropénie Intensité de la déplétion en CD4 Maladie sous-jacente, état général
Risque élevé Risque relatif Risque moyen >14 jours < 100 <14 jours Risque faible Risque faible <7 jours > 500 Risque moyen <500 Risque élevé Durée de la neutropénie CD4
Infection en fonction du temps Candida spp. Aspergillus spp. Pneumocystis jiroveci Cryptococcus neoformans Zygomycètes Histoplasma sp. Coccidioides sp. Blastomyces sp. 0-14 j 15-30 j 1-2 mois 3-6 mois >6 mois Hibberd PL, Rubin RH. Clin Infect Dis 1994
Principales thérapeutiques Membrane Polyènes (formes lipidiques) Paroi Echinocandines Synthèse d Ac. nucléiques analogues de pyrimidine Synthèse des stérols Azoles Allylamines
Spectres comparés des nouveaux antifongiques Espèces fongiques Candida albicans Candida tropicalis Candida parapsilosis Candida krusei Candida glabrata Cryptococcus neoformans Histoplasma capsulatum Blastomyces dermatitidis Coccidioides immitis Paracoccidioides brasiliensis Pneumocystis jiroveci Aspergillus fumigatus Mucor spp Rhizopus spp Fusarium spp AMB FCZ ITZ VRZ PSZ RVZ CF MF AF Polyene; AMB = AmBisome Azole; FCZ = Fluconazole; ITZ = Itraconazole; VRZ = Voriconazole; PSZ = Posaconazole; RVZ=Ravuconazole Echinocandin; CF = Caspofungin; MF = Micafungin; AF = Anidulafungin.
Stratégies thérapeutiques Réduire l exposition aux pathogènes Réduire la colonisation Limiter les procédures invasives Augmenter les défenses de l hôte Prophylaxies I aire ou II aire