Chapitre 10 Lire et écrire différents formats de fichiers de données dans Analyse. Temps estimé nécessaire à l acquisition.. 0 H 30 A la fin de ce chapitre, vous devez savoir page A10 - Faire l exercice : Import Export & Co...158 105. Lire (importer) un fichier Excel...159 106. Lire (importer) un fichier Dbase (.dbf)...160 107. Ecrire (exporter) un fichier Dbase (.dbf) à partir d une table d un projet....161 108. Lire (importer) une table en format HTML....162 109. Lire (importer) un fichier Epi Info 6...163 E10 - Faire l exercice d entraînement : Surveillance des infections nosocomiales en maternité Lire et écrire différents formats de fichiers de données dans Analyse..164 Malheureusement, bien des fichiers de données que vous souhaiteriez analyser avec EPI INFO 2002 ne sont pas des éléments d un projet EPI INFO. Il va donc falloir les importer. De la même façon, il est parfois nécessaire d analyser des données, qui sont gérées dans un projet EPI INFO 2002, avec des outils d analyse qui ne sont pas disponible dans EPI INFO 2002 (par exemple : analyse de séries chronologiques). Il conviendra alors d exporter ces données dans un format qui pourra être lu par l autre outil d analyse. Par exemple, si nous souhaitons faire l analyse des séries chronologiques avec SPSS, nous prendrons le format dbase pour échanger les données entre EPI INFO et SPSS. A10 - Faire l exercice : Import Export & Co Dans ce domaine, vous allez vous essayer à quelques gammes totalement inutiles, comme toutes les gammes, en dehors de leurs vertus d apprentissage. Vous allez donc importer et exporter des fichiers pour «la beauté du geste». Premiers pas dans Epi Info 2002 158 Louis AYZAC
105. Lire (importer) un fichier Excel. 1. Importez le fichier Excel «jamaicam.xls» qui se trouve dans le dossier contenant Epi Info (Il est livré avec pour apprendre!) sur le «Excel 8.0». Cliquez sur le fichier Excel à Choisissez la feuille de calcul qui vous intéresse. Il convient que vous connaissiez bien votre fichier Excel. Il faudra l ouvrir avec Excel (sans oublier de le refermer) avant de l importer. «OK». Cochez la case «First row contains fields names» si la prmière ligne de la feuille de calcul contient le nom des variables puis cliquez sur le bouton «OK» Premiers pas dans Epi Info 2002 159 Louis AYZAC
106. Lire (importer) un fichier Dbase (.dbf). 2.. Importez le fichier dbase «USState.dbf» qui se trouve dans le dossier contenant Epi Info (Révisez votre géographie américaine : il contient tous les états des USA avec leurs caractéristiques) sur «dbase IV». Cliquez sur le fichier.dbf à Cliquez sur le fichier Dbf à «OK». Premiers pas dans Epi Info 2002 160 Louis AYZAC
107. Ecrire (exporter) un fichier Dbase (.dbf) à partir d une table d un projet. 3. Exportez la vue «Smoke» du projet «Sample» dans un fichier dbase que vous nommerez «smoke.dbf». Commencez par ouvrir le projet dans «Analyse» si nécessaire. Si vous ne savez plus comment faire, Cliquez sur la commande «Write (Export» du générateur de commandes. Choisissez les variables à écrire («All» par défaut). Choisissez de remplacer le fichier s il existe déroulante «Output Formats». sur «dbase IV». déroulante «File Name». Choisissez le dossier de rangement de votre fichier dbase. Complétez le nom de votre fichier «Enregistrez». «OK». Premiers pas dans Epi Info 2002 161 Louis AYZAC
108. Lire (importer) une table en format HTML. 4. Importez le fichier HTML «ICD9 Cod.htm» qui se trouve dans le dossier contenant Epi Info (Il contient tous les codes et les libellés de la Classification des Maladies 9 révision de l OMS ; c est pas tout jeune!) sur «HTML». Cliquez sur le fichier HTML à Sélectionnez la vue «OK». «OK». Premiers pas dans Epi Info 2002 162 Louis AYZAC
109. Lire (importer) un fichier Epi Info 6. 5. Importez le fichier Epi Info 6 (la vieille version sous DOS) «Adress.rec» qui se trouve dans le dossier contenant Epi Info (Il est livré avec pour apprendre!) sur «Epi6». Cliquez sur le fichier.rec à Sélectionnez la vue «OK». Premiers pas dans Epi Info 2002 163 Louis AYZAC
E10 - Faire l exercice d entraînement : Surveillance des infections nosocomiales en maternité Lire et écrire différents formats de fichiers de données dans Analyse Temps estimé nécessaire à l entraînement 0 H 30 Objectifs à consolider visés 105. Lire (importer) un fichier Excel. 106. Lire (importer) un fichier Dbase (.dbf). 107. Ecrire (exporter) un fichier Dbase (.dbf) à partir d une table d un projet. 108. Lire (importer) une table en format HTML. 109. Lire (importer) un fichier Epi Info 6. Le réseau de surveillance des infections nosocomiales (IN) en Maternité, MATER Sud Est, coordonné par le C.CLIN Sud Est existe depuis le 1 janvier 1997. Il propose une méthodologie standardisée de surveillance des IN (acquises à l hôpital) dans les maternités Dans l exercice d entraînement E1, Vous avez créé l application EPI INFO 2002 conforme au dictionnaire de données et aux écrans fournis. Dans l exercice E2, vous avez saisi quelques données dans cette application. Dans l exercice E3, vous avez renforcé les règles de contrôle (contraintes d intégrité) de votre application en vous servant d une version plus complète du dictionnaire des données fourni page 21. Dans l exercice E5, vous avez mis en évidence un certain nombre d atteintes aux règles d intégrités parce que les règles de contrôle ont été introduites après la saisie des données. Dans l exercice E6, vous les avez corrigées, puis vous avez fusionné le contenu corrigé avec le contenu de la table «materplus». Ceci vous a donné un ensemble de données que nous estimons propre. Vous les avez analysé dans l exercice E7 et E8. puis illustré par dles graphiques à l exercice E9. Nous allons maintenant récupérer des données de l année 2001 à partir de différents type de fichiers REALISATION DE L EXERCICE Objectifs visés 1. Ouvrez le module «Analyse». 48 2. Importez le fichier «2001.xls» que nous vous fournissons. 105 3. Importez le fichier «2001.dbf» que nous vous fournissons. 106 4. Importez le fichier «2001.htm» que nous vous fournissons. 108 5. Importez le fichier «2001.rec» que nous vous fournissons. 109 6. Ouvrez le projet «MATER» original. 49 7. Exportez la vue vers le fichier «mater.dbf». 107 Premiers pas dans Epi Info 2002 164 Louis AYZAC