Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPG/SM
Notices Agilent Technologies, Inc. 2012 Conformément ux lois interntionles reltives à l propriété intellectuelle, toute reproduction, tout stockge électronique et toute trduction de ce mnuel, totux ou prtiels, sous quelque forme et pr quelque moyen que ce soit, sont interdits suf consentement écrit prélle de l société Agilent Technologies, Inc. Référence du mnuel G3335-93147 Edition Révision A, novemre 2012 Imprimé ux Étts-Unis Agilent Technologies, Inc. 5301 Stevens Creek Blvd. Snt Clr, CA 95051, Etts-Unis Microsoft, Windows 7 et Excel sont des mrques déposées de Microsoft Corportion ux Étts-Unis et dns d'utres pys. Révision logicielle Ce mnuel s'pplique à l'édition B.06.00 et ux révisions ultérieures du progrmme Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive, jusqu'à ce qu'il soit remplcé. Grntie Les informtions contenues dns ce document sont fournies en l'étt et pourront fire l'ojet de modifictions sns prévis dns les éditions ultérieures. De plus, dns l mesure utorisée pr les lois pplicles, Agilent décline toute grntie expresse ou implicite en ce qui concerne ce mnuel et toute informtion qu'il contient y compris mis sns que cel soit limittif tout type de grntie implicite de vleur mrchnde et d'déqution à une ppliction prticulière. Agilent ne surit en ucun cs être tenu pour responsle des erreurs ou des dommges incidents ouconsécutifs, liés àl fourniture, àl'utilistion ou àl'exctitude de ce document ou ux performnces de tout produit Agilent uquel il se rpporte. Si Agilent et l'utilisteur ont pssé un contrt écrit distinct, stipulnt, pour le produit couvert pr ce document, des conditions de grntie qui entrent en conflit vec les présentes conditions, les conditions de grntie du contrt distinct remplcent les conditions énoncées dns le présent document. Licences technologiques Le mtériel et le logiciel décrits dns ce document sont protégés pr un ccord de licence et leur utilistion ou reproduction sont soumises ux termes et conditions de ldite licence. Limittion des droits Limittions des droits du Gouvernement des Etts-Unis Les droits s ppliqunt u logiciel et ux informtions techniques concédées u gouvernement fédérl incluent seulement les droits concédés hituellement ux clients utilisteurs. Agilent concède l licence commercile hituelle sur le logiciel et les informtions techniques suivnt les directives FAR 12.211 (informtions techniques) et 12.212 (logiciel informtique) et, pour le ministère de l Défense, selon les directives DFARS 252.227-7015 (informtions techniques rticles commerciux) et DFARS 227.7202-3 (droits s ppliqunt ux logiciels informtiques commerciux ou à l documenttion des logiciels informtiques commerciux). Signlistion de l sécurité ATTENTION L mention ATTENTION indique un risque. Si l mnœuvre ou l procédure correspondnte n'est ps exécutée correctement, il peut y voir un risque d'endommgement de l'ppreil ou de perte de données importntes. En présence de l mention ATTENTION, il convient de s'interrompre tnt que les conditions indiquées n'ont ps été prfitement comprises et stisfites. AVERTISSEMENT L mention AVERTISSEMENT signle un dnger pour l sécurité de l'opérteur. Si l mnœuvre ou l procédure correspondnte n'est ps exécutée correctement, il peut y voir un risque grve, voire mortel pour les personnes. En présence d'une mention AVERTISSEMENT, il convient de s'interrompre tnt que les conditions indiquées n'ont ps été prfitement comprises et stisfites. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPG/SM
À propos de ce mnuel... Le présent mnuel contient des informtions destinées à vous pprendre à utiliser le Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive vec des données CPG/SM. Avnt de commencer les exercices, lisez les instructions de l section «Avnt de commencer ces exercices...» à lpge5. Exercice 1 Exercice 2 Exercice 3 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Au cours de cet exercice, vous llez explorer certines des nomreuses fonctionnlités performntes du progrmme d'nlyse qulittive. Ces tâches sont importntes, quel que soit le type de données que vous utilisez. Détection et identifiction Au cours de ces deux ensemles de tâches, vous recherchez et identifiez les sses concentrtions en sulfmides u sein d une mtrice complexe et générez leurs formules pour les données TOF et Q-TOF. Vous effectuez églement une d extrction de motifs moléculires de Protein Digest vec des données TOF et Q-TOF. Ces tâches peuvent églement être effectuées vec des données Triple Qud. Utilistion des flux de trvux, exporttion et impression Au cours de ces tâches, vous llez pprendre comment configurer et exécuter toute méthode d nlyse qulittive. Vous pprendrez églement à éditer une méthode d utomtistion de l nlyse et/ou une identifiction du composé. Vous exécuterez ensuite les ctions dns l méthode utomtisée lorsque vous ouvrirez un fichier de données. Vous pprendrez églement à créer une méthode pour exécuter des ctions utomtisées vec une liste de tâches. Chcune de ces tâches est exécutée à l ide d un flux de trvux différent. Référence Dns ce chpitre, vous llez pprendre des principes de se du progrmme Qulittive Anlysis. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPG/SM 3
Nouveutés de B.06.00 Vous pouvez réviser des composés dns l fenêtre Compound Detils View. Qutre fenêtres supplémentires sont disponiles dns Compound Detils View. Pour Compound Detils View, vous pouvez définir différentes définitions de ligne pour différents types de chromtogrmmes et spectres. L'lgorithme Find Compounds y Integrtion est disponile. Vous pouvez rechercher dns plusieurs iliothèques pour l'lgorithme Unit Mss Lirry Serch. Dns l'lgorithme Generte Formuls, vous pouvez choisir d'nnoter les pics de spectre frgment vec des formules. L'nnottion frgment sélectionne des spectres pour nnoter en fonction de l'lgorithme d'nlyse des composés. L'lgorithme Generte Formuls peut être exécuté sur des composés détectés pr l'lgorithme Find y Chromtogrm Deconvolution. L'lgorithme Generte Formul été modifié pour vous permettre d'entrer un nomre mximum d'éléments trouvés pour chque vecteur de chrge. Dns l'lgorithme Generte Formuls, vous pouvez grouper les éléments trouvés vec l même formule, mis vec différents vecteurs de chrge. Des composés peuvent être créés à prtir d'un spectre utilisteur. Dns ce cs, l'lgorithme d'nlyse des composés est Spectrum Extrction. Lorsque vous enregistrez des résultts vec un fichier de données, vous pouvez choisir d'enregistrer tous les résultts des composés vec un fichier de données ou un ensemle plus petit de résultts pour chque composé. Les chromtogrmmes utilisteur et les spectres utilisteur sont toujours enregistrés. Le formt du fichier CEF été modifié de fçon à ce que dvntge d'informtions soient incluses. Les informtions reltives u m/z et à l'espèce de l'ion sont disponiles dns le premier niveu du tleu Spectrum Identifiction Results. Le tleu Spectrum Identifiction été modifié. Vous pouvez jouter un filtre à une colonne et vous pouvez supprimer une ligne. Vous pouvez désormis lieller un pic vec Formul & Ion Species. 4 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion
Le chngement du spectre liellé Best dns l fenêtre Spectrum Identifiction Results lorsque vous disposez d'un grnd nomre d'entrées est désormis considérlement plus rpide. Vous pouvez spécifier le chevuchement des chromtogrmmes de composés dns Compound Report. Le modèle de rpport pr défut Formul Confirmtion été modifié pour inclure l colonne colorée Flgs (Tgt) et le tleu Frgment comporte l colonne colorée Flgs (FIs). Avnt de commencer ces exercices... Instllez le logiciel. Pour les instructions, reportez-vous u Guide d'instlltion. Copiez le dossier nommé Dt du disque d'instlltion u formt non compressé à l'emplcement de votre choix sur votre disque dur. Ce dossier contient tous les fichiers de données requis pour ces exercices. Il se peut que vous deviez extrire u prélle les fichiers de données de leur formt.zip. REMARQUE Ne réutilisez ps les fichiers de données exemples déjà présents sur votre système, à moins d'être sûr de les voir copiés à prtir des fichiers originux du disque et que vous êtes l seule personne à les utiliser. Si les fichiers de données exemples déjà présents sur le système ne correspondent ps exctement ux originux présents sur le disque, les résultts otenus pendnt les exercices ne correspondront ps ux illustrtions de ce mnuel. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPG/SM 5
6 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion
Tle des mtières Exercice 1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 9 Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive 10 Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM 13 Tâche 3. Zoom vnt et rrière sur le chromtogrmme 16 Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme 17 Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres 19 Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes 21 Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM 23 Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) 28 Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme 32 Tâche 10. Ajout d'nnottions 42 Tâche 11. Ajout d'un comps d'épisseur de msse 46 Exercice 2 Détection et identifiction 49 Tâche 12. Détection de composés pr déconvolution de chromtogrmme 50 Tâche 13. Identifiction de composés à l'ide de l'lgorithme de recherche en iliothèque 54 Tâche 14. Détection de composés pr MRM (MRM uniquement) 59 Tâche 15. Détection de composés pr intégrtion 63 Tâche 16. Génértion de formules et recherche en iliothèque pour des spectres de pic 66 Tâche 17. Enregistrement des résultts 72 Exercice 3 Utilistion des flux de trvux, exporttion et impression 77 Tâche 18. Configurtion et exécution d'une méthode d'nlyse qulittive à l'ide du flux de trvux générl 78 Tâche 19. Configurtion et exécution d'une méthode à l'ide du flux de trvux GC/Q-TOF Compound Screening 83 Tâche 20. Exporttion d'un fichier CEF 87 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 7
Tle des mtières Tâche 21. Impression d'un rpport d'nlyse 89 Tâche 22. Impression d'un rpport de composé 92 Référence 95 Utilistion des fenêtres 96 Utilistion des données de résultts dns Dt Nvigtor 99 Exécution d'opértions sur le chromtogrmme 100 Exécution d'opértions sur un spectre SM ou SM/SM 101 Utilistion de données chromtogrphiques visuelles 102 Utilistion de données spectrles visuelles 104 Flux de trvux 105 Personnlistion d'un modèle de rpport 109 8 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion 1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive 10 Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM 13 Tâche 3. Zoom vnt et rrière sur le chromtogrmme 16 Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme 17 Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres 19 Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes 21 Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM 23 Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) 28 Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme 32 Tâche 10. Ajout d'nnottions 42 Tâche 11. Ajout d'un comps d'épisseur de msse 46 Au cours de cet exercice, vous llez explorer certines des nomreuses fonctionnlités performntes du progrmme d'nlyse qulittive pour trviller vec des données de CPG/Q-TOF et CPG/QQQ. Chque exercice est présenté dns un tleu à trois colonnes: Étpes: utilisez ces instructions générles fin d'explorer le progrmme pr vous-même. Instructions détillées: utilisez-les si vous vez esoin d'ide ou si vous préférez suivre une méthode d'pprentissge ps à ps. Remrques: lisez-les pour otenir des stuces et des informtions supplémentires sur chque étpe de l'exercice. 9
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive Au cours de cette tâche, vous llez ouvrir plusieurs fichiers de données à l'ide de l méthode hituelle. Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive vec plusieurs fichiers de données Étpes Instructions détillées Remrques 1 Ouvrir le progrmme d'nlyse qulittive. Ouvrez les fichiers de données Pest - 200 - Scn.d, Pest - STD 200 MRM.d, Pest Strw-01 SPIKED 1 pp - 1 ul inj.d et MSD_mix_4stds_DG_spl200_0 3.d dns le dossier \\MssHunter\Dt, ou dns le dossier dns lequel vous les vez copiés. Doule-cliquez sur l'icône Agilent MssHunter Qulittive Anlysis B.06.00. Le système ouvre l oîte de dilogue Open Dt Files. Accédez u dossier \\MssHunter\ Dt\GC ou u dossier dns lequel se trouvent les fichiers d'exemples. Le fichier Pest - 200 - Scn.d contient des données SM, tndis que les fichiers Pest - STD 200 MRM.d et Pest Strw-01 SPIKED 1 pp - 1 ul inj.d contiennent des données SM et SM/SM (CPG/QQQ). Le fichier MSD_mix_4stds_DG_spl200_03.d contient des données CPG/Q-TOF. Vous pouvez otenir de l'ide sur l pluprt des fenêtres, oîtes de dilogue et onglets en ppuynt sur l touche F1 lorsque l fenêtre est ctive. Assurez-vous que le outon Use current method est sélectionné. Vérifiez que l cse Lod result dt n'est ps cochée. Si cette cse n'est ps disponile, cel signifie qu'ucun résultt n' été enregistré dns le fichier de données. Pour svoir comment enregistrer des résultts, reportez-vous ux instructions de l «Tâche 17. Enregistrement des résultts», pge 72. Vérifiez que l cse Run File Open ctions from selected method n'est ps cochée. Figure 1 Ouvrir des fichiers de données lors de l'ouverture du logiciel 10 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive vec plusieurs fichiers de données (suite) Étpes Instructions détillées Remrques c d e Appuyez sur l touche Mj et mintenez-l enfoncée pendnt que vous cliquez sur Pest - 200 - Scn.d, Pest - STD 200 MRM.d, Pest Strw-01 SPIKED 1 pp - 1 ul inj.d et MSD_mix_4stds_DB_spl200_03.d. Cliquez sur Open. Les qutre fichiers de données pprissent dns l fenêtre Dt Nvigtor, et 1 à 3chromtogrmmes sont ffichés dns l fenêtre Chromtogrm Results. Cliquez sur l'icône List Mode dns l rre d'outils Chromtogrm Results. Si vous ppuyez sur l touche Ctrl, vous pouvez sélectionner des fichiers qui ne figurent ps directement l'un derrière l'utre dns l liste. Ce que vous pouvez voir dns l fenêtre principle à ce stde dépend de l méthode, de l'gencement, de l'ffichge et des prmètres de trcé utilisés vnt que vous n'ouvriez ces fichiers. Lorsque vous cliquez sur l'icône List Mode, l couleur de son fond chnge et devient ornge. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 11
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive Tâche 1. Ouverture du progrmme d'nlyse qulittive vec plusieurs fichiers de données (suite) Étpes Instructions détillées Remrques icône Mximum Numer of List Pnes indiqunt le nomre mximum de volets liste icône Disply Options (Options d'ffichge) Pour fermer l fenêtre, cliquez sur le outon X. Figure 2 Fenêtre principle de l'nlyse qulittive vec l'écrn GC/Q-TOF Compound Screening Workflow chrgé. 12 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM Dns cette tâche, vous pssez u flux de trvux générl (pour les clients CPG/QQQ) ou u flux de trvux de crilge des composés CPG/Q-TOF (pour les clients CPG/Q-TOF). Ces deux flux de trvux sont les seuls qui prennent en chrge l'nlyse des données CPG/SM. Ensuite, ouvrez l oîte de dilogue User Interfce Configurtion et cochez les cses ppropriées pour un système CPG/QQQ ou CPG/Q-TOF. Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG Étpes Instructions détillées Remrques 1 Si nécessire, ouvrir le progrmme d'nlyse qulittive. Doule-cliquez sur l'icône Agilent MssHunter Qulittive Anlysis. Le système ouvre l oîte de dilogue Open Dt Files. Cliquez sur Cncel dns l oîte de dilogue Open Dt Files. Vous pouvez otenir de l'ide sur n'importe quelle fenêtre, oîte de dilogue ou onglet en ppuynt sur l touche F1 lorsque l fenêtre est ctive. 2 Psser u flux de trvux générl ou u flux de trvux de crilge des composés CPG/Q-TOF. c d Si vous disposez d'un instrument CPG/QQQ, cliquez sur l'option Configurtion > Configure for Workflow > Generl. Si vous disposez d'un instrument CPG/Q-TOF, cliquez sur l'option Configurtion > Configure for Workflow > GC/Q-TOF Compound Screening. Cliquez sur le outon Lod workflow s defult method et le outon Lod workflow s defult lyout. Cliquez sur OK. Cliquez sur l'icône List Mode dns l rre d'outils Chromtogrm Results. Si le progrmme d'cquisition des données pour CPG/QQQ ou CPG/Q-TOF est instllé sur le même ordinteur, le logiciel configure utomtiquement l'interfce utilisteur. L section GC/Q-TOF Compound Screening peut être déjà disponile dns l fenêtre Method Explorer. Pr défut, les chromtogrmmes sont superposés. Pour ces exemples, les chromtogrmmes sont ffichés en Mode liste. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 13
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG Étpes Instructions détillées Remrques 3 Si vous disposez d'un CPG/QQQ, configurez l'interfce utilisteur fin que seules les fonctions CPG/QQQ s'ffichent. c d e f g h Cliquez sur Configurtion > User Interfce Configurtion. Sous Seprtion types, cochez uniquement l cse GC. Si vous disposez d'un instrument CPG/QQQ, sous Ioniztion type, cochez l cse EI or other hrd ioniztion technique et désélectionnez l cse CI, APCI, ESI, MADLDI or other soft ioniztion technique. Sous Mss ccurcy, désélectionnez l cse Accurte mss (TOF, Q-TOF). Cochez l cse Unit mss (Q, QQQ). Sous Optionl softwre fetures, désélectionnez les cses Peptide Sequence Editor et BioConfirm Softwre. Sous Non-MS detectors, désélectionnez les cses UV et ADC. Cochez l cse Show dvnced prmeters. Cliquez sur OK. L oîte de dilogue User Interfce Configurtion permet de chnger les options disponiles. Si une fonction n'est ps visile, elle étit prolement msquée lorsqu'une cse été désélectionnée dns l oîte de dilogue User Interfce Configurtion. Figure 3 Configurtion de l'interfce utilisteur à utiliser vec des données CPG/QQQ 14 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG/SM Tâche 2. Configurtion de l'interfce utilisteur pour des données CPG Étpes Instructions détillées Remrques 4 Si vous disposez d'un CPG/Q-TOF, configurez l'interfce utilisteur fin que seules les fonctions CPG/Q-TOF s'ffichent. c d e f g h i Cliquez sur Configurtion > User Interfce Configurtion. Sous Seprtion types, cochez uniquement l cse GC. Sous Ioniztion type, cochez les deux cses. Sous MS levels, cochez les deux cses. Sous Mss ccurcy, cochez l cse Accurte mss (TOF, Q-TOF). Désélectionnez l cse Unit mss (Q, QQQ). Sous Optionl softwre fetures, désélectionnez les cses Peptide Sequence Editor et BioConfirm Softwre. Sous Non-MS detectors, désélectionnez les cses UV et ADC. Cochez l cse Show dvnced prmeters. Cliquez sur OK. L oîte de dilogue User Interfce Configurtion permet de chnger les options disponiles. Si une fonction n'est ps visile, elle étit prolement msquée lorsqu'une cse été désélectionnée dns l oîte de dilogue User Interfce Configurtion. Figure 4 Configurtion de l'interfce utilisteur pour un CPG/Q-TOF Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 15
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 3. Zoom vnt et rrière sur le chromtogrmme Tâche 3. Zoom vnt et rrière sur le chromtogrmme Cette tâche vous permet de vous fmiliriser vec les fonctions de zoom vnt et rrière du progrmme d'nlyse qulittive. 16 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme Au cours de cette tâche, vous llez ncrer un chromtogrmme. Si vous ncrez un chromtogrmme, le chromtogrmme ncré reste ffiché en permnence pendnt que vous fites défiler les utres chromtogrmmes pour les fficher. Étpes Instructions détillées Remrques Ancrer un chromtogrmme. Afficher tous les chromtogrmmes. S'ssurer que l liste d'ffichge des chromtogrmmes est définie à 1. Dns l fenêtre Chromtogrm Results, sélectionnez le deuxième chromtogrmme de cournt ionique totl (CIT). Ancrer ce CIT. Fire défiler les chromtogrmmes. Supprimer l'ncrge. c d e f Dns l fenêtre Dt Nvigtor, cochez les cses correspondnt ux chromtogrmmes que vous vez msqués u cours de l précédente tâche. Assurez-vous que le nomre mximl de volets est défini à 1 dns l fenêtre Chromtogrm Results. Dns l fenêtre Chromtogrm Results, sélectionnez le deuxième chromtogrmme de cournt ionique totl (CIT). Cliquez vec le outon droit de l souris sur le chromtogrmme, puis cliquez sur Set Anchor. Utilisez l rre de défilement dns l fenêtre Chromtogrm Results pour fire défiler l liste de chromtogrmmes. Le deuxième CIT reste toujours visile comme le premier chromtogrmme. Cliquez sur Chromtogrms > Cler Anchor. Lorsque vous définissez un ncrge pour un chromtogrmme, une icône représentnt une ncre pprît dns l fenêtre Dt Nvigtor, en regrd du nom du chromtogrmme ncré. Deux chromtogrmmes pprissent dns l fenêtre Chromtogrm Results près que l'un d'eux it été ncré ien que l liste d'ffichge soit définie à 1. Ceci signifie que vous ffichez un chromtogrmme en plus du chromtogrmme ncré. Vous pouvez églement cliquer vec le outon droit de l souris sur le chromtogrmme, puis cliquer sur Cler Anchor dns le menu contextuel. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 17
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme Tâche 4. Ancrge d'un chromtogrmme (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Figure 5 CIT ncré dns l fenêtre Chromtogrm Results 18 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres Au cours de cette tâche, vous llez déplcer des fenêtres dns l vue principle et créer diverses présenttions des fenêtres. Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres Étpes Instructions détillées Remrques 1 Chnger l disposition des fenêtres: Chnger l tille des fenêtres. Enregistrer une disposition de fenêtres. Déverrouiller l disposition. Chnger l fenêtre Chromtogrm Results fin qu'elle devienne flottnte. Déplcer l fenêtre Chromtogrm Results. Afficher les outils pour repositionner les fenêtres. Pour chnger l tille d'une fenêtre, fites glisser l limite entre les fenêtres. Pour enregistrer une disposition de fenêtres, cliquez sur Configurtion > Window Lyouts > Sve Lyout. Pour déverrouiller une disposition, cliquez sur Configurtion > Window Lyouts > Lock Lyout. Pour rendre une fenêtre flottnte, cliquez vec le outon droit de l souris sur l rre de titre de l fenêtre et cliquez sur l'option Floting dns le menu contextuel. Pour déplcer une fenêtre, cliquez sur l rre de titre de l fenêtre et fites-l glisser à l'emplcement souhité. Pour fficher les outils de repositionnement, fites glisser l fenêtre sur l'une des utres fenêtres. Lorsque qu'une fenêtre est chevuchée pr une utre, le progrmme ffiche plusieurs outils de mise en pge, comme illustré à l Figure 6. Si l disposition est déverrouillée, le système n'ffiche ps de mrque en regrd du menu Lock Lyout. Vous ne pouvez utiliser les outils de repositionnement que si l disposition est déverrouillée. Vous pouvez églement rendre une fenêtre flottnte en doule-cliqunt sur l rre de titre de l fenêtre. Plusieurs présenttions différentes sont déjà créées dns le logiciel. Vous pouvez églement essyer de les chrger. Le logiciel comporte plusieurs flux de trvux différents. Chque flux de trvux chrge une présenttion différente. Le fit de psser à un utre flux de trvux chnge églement l présenttion. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 19
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres Tâche 5. Chngement de disposition des fenêtres (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Figure 6 Outils de repositionnement des fenêtres 2 Repositionner l fenêtre Chromtogrm Results. Déplcer l fenêtre fin qu'elle se trouve u-dessus, à guche, à droite, puis en dessous des utres fenêtres. Déplcer deux fenêtres ensemle fin qu'elles se trouvent u-dessus d'une utre et disponiles uniquement pr l'intermédiire des onglets situés en s. Resturer l disposition pr défut. Si vous pssez le curseur sur l'une des petites icônes, l fenêtre que vous fites glisser ser plcée u-dessus, à droite, en dessous ou à guche de toutes les utres fenêtres. Fites glisser le curseur sur l grnde icône. L fenêtre peut être églement plcée u-dessus, à droite, en dessous ou à guche de l'utre fenêtre en fisnt glisser le curseur sur les côtés de l grnde icône. Pour épingler deux fenêtres ensemle, fites glisser le curseur u centre de l grnde icône. Vous verrez une version omrée des deux fenêtres épinglées ensemle. Cessez de fire glisser l souris. Les deux fenêtres sont épinglées ensemle. Cliquez sur Configurtion > Window Lyouts > Restore Defult Lyout. Le curseur doit se trouver sur l'une des flèches dns une oîte pour que le repositionnement it lieu. Le fit de cliquer sur Restore Defult Lyout resture l présenttion utilisée dns le flux de trvux générl et celui de crilge des composés CPG/Q-TOF. Si vous utilisez un utre flux de trvux, vous devez chrger l disposition utilisée vec celui-ci. 20 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes Au cours de cette tâche, vous llez extrite et fusionner des chromtogrmmes du CIT d'origine. Étpes Instructions détillées Remrques 1 Extrire et fire fusionner des chromtogrmmes d'ions extrits (CIE) de deux msses dns le fichier de données Pest - 200 Scn.d. Les vleurs m/z sont 129.0 et 414.2. Ne ps fusionner les pics de msses individuelles dns un chromtogrmme. c d e f Dns l fenêtre Dt Nvigtor, désélectionnez les cses à cocher des fichiers de données, excepté le fichier Pest - 200 Scn.d. Ouvrez l oîte de dilogue Extrct Chromtogrms, à l'ide de l'option ci-dessous ou de l'une des options de droite: Cliquez sur Chromtogrms > Extrct Chromtogrms. Dns l oîte List of opened dt files, cliquez sur Pest - 200 - Scn.d. Dns l zone de liste Type, sélectionnez EIC. Dns le chmp m/z vlue(s), sisissez 129.0, 414.2 Le cs échént, désélectionnez l cse Merge multiple msses into one chromtogrm pour fusionner les CIE. g Cliquez sur OK. h Définissez le nomre mximum de volets liste à 3 dns l rre d'outils Chromtogrm Results. Vous pouvez églement extrire des chromtogrmmes de l'une des mnières suivntes: Cliquez vec le outon droit de l souris sur le chromtogrmme, puis cliquez sur Extrct Chromtogrms. Dns Dt Nvigtor, sélectionnez TIC Scn pour sulfs_posms.d, puis cliquez vec le outon droit de l souris sur TIC Scn et cliquez sur Extrct Chromtogrms. Vous pouvez utiliser l vleur All ou MS pour MS level. Notez que vous pouvez églement choisir que le chromtogrmme extrit soit utomtiquement intégré près l'extrction. Vous pouvez églement extrire un chromtogrmme d'un spectre de msse. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 21
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes Tâche 6. Extrction de chromtogrmmes (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Figure 7 Boîte de dilogue Extrct Chromtogrms Figure 8 Chromtogrmmes d'ions extrits (CIE) fusionnés comprés u CIT d'origine 22 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Au cours de cette tâche, vous llez pprendre différentes fçons d'intégrer un chromtogrmme, de chnger les prmètres d'intégrtion pour modifier les résultts et clculer le rpport signl/ruit pour les pics intégrés de données SM/SM. Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (CPG/SM) Étpes Instructions détillées Remrques 1 Intégrer le chromtogrmme TIC Scn pour le fichier de données Pest - 200 - Scn.d, à l'ide de n'importe lquelle des options indiquées à droite. 2 Afficher uniquement deux chromtogrmmes à l fois. Sélectionnez le fichier de données Pest - 200 - Scn.D dns l fenêtre Dt Nvigtor. Sélectionnez le chromtogrmme TIC Scn et utilisez l'une des options suivntes: Dns l rre de menus, cliquez sur Chromtogrms > Integrte Chromtogrm. Cliquez vec le outon droit de l souris n'importe où dns l fenêtre du chromtogrmme, puis cliquez sur Integrte Chromtogrm. Dns l fenêtre Dt Nvigtor, sélectionnez Pest - 200 - Scn.D > User Chromtogrms > TIC Scn, puis cliquez vec le outon droit de l souris sur TIC Scn et cliquez sur Integrte Chromtogrm. Sélectionnez 2 comme nomre mximum de volets liste dns l rre d'outils Chromtogrm Results. Notez que le progrmme prtiquement intégré tous les pics dns le chromtogrmme. Utilisez l fenêtre Method Editor pour sélectionner l'intégrteur à utiliser pour les données SM, les données SM/SM et les données CPG. Ce chromtogrmme est un chromtogrmme SM, les vleurs définies dns l section Integrte (MS) de l fenêtre Method Editor sont donc utilisées lors de l'intégrtion de ce chromtogrmme. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 23
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (CPG/SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques De nomreux petits pics sont Figure 9 Chromtogrmme TIC Scn intégré vec de nomreux petits pics 3 Chnger le seuil pour intégrer moins de pics. Chnger le seuil pour ne grder que les trois plus grnds pics. c d Dns l fenêtre Method Explorer, cliquez sur Chromtogrm > Integrte (MS) pour fficher l'onglet Integrte (MS). Sélectionnez l'intégrteur Agile. Cliquez sur l'onglet Pek Filters. Sous Mximum numer of peks, cochez Limit (y height) to the lrgest, et tpez 3. Notez le tringle leu qui s'ffiche lorsque vous chngez l vleur d'un prmètre suvegrdée dns l méthode en cours. Lorsque vous enregistrez l méthode, les tringles disprissent. Figure 10 Onglet Pek Filters vec l cse Limit (y height) to the lrgest cochée 24 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (CPG/SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques 4 Réintégrer le chromtogrmme. e Cliquez sur le outon dns l rre d'outils Method Editor pour effectuer l'intégrtion vec le nouveu prmètre. Notez que seuls les trois plus grnds pics sont désormis intégrés. Le pic 2,491 est plus hut que celui enregistré à 16,858minutes, il est donc sélectionné comme troisième pic. Figure 11 Chromtogrmme TIC Scn intégré lors de l réduction du nomre de pics 5 Intégrer le chromtogrmme TIC MRM pour le fichier de données Pest - STD 200 MRM.D. Dns l fenêtre Dt Nvigtor, sélectionnez TIC MRM pour le fichier de données Pest - STD 200 MRM.d. Utilisez l'une des options suivntes pour intégrer les chromtogrmmes. Dns l rre de menus, cliquez sur Chromtogrms > Integrte Chromtogrm. Cliquez vec le outon droit de l souris n'importe où dns l fenêtre du chromtogrmme, puis cliquez sur Integrte Chromtogrm. Dns l fenêtre Dt Nvigtor, cliquez vec le outon droit de l souris sur le chromtogrmme en surrillnce et cliquez sur Integrte Chromtogrm. c Effectuez un zoom vnt de 5,8 à 8,5 minutes. d Définissez le nomre mximum de volets liste à 2. Appuyez sur l touche Ctrl pour sélectionner plusieurs chromtogrmmes dns l fenêtre Dt Nvigtor. Notez que le progrmme prtiquement intégré tous les pics dns le chromtogrmme. Ces chromtogrmmes sont des chromtogrmmes SM/SM, les vleurs définies dns l section Integrte (MS/MS) de l fenêtre Method Editor sont donc utilisées lors de l'intégrtion de ce chromtogrmme. Vous pouvez sélectionner l'intégrteur à utiliser pour intégrer des chromtogrmmes SM et un utre intégrteur pour les chromtogrmmes SM/SM. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 25
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (CPG/SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Figure 12 Chromtogrmmes MRM intégrés 6 Sélectionnez l'intégrteur MS/MS (GC). Chnger le filtre pour n'ccepter que les pics ynt une huteur solue égle ou supérieure à 20000. c d e f Dns l fenêtre Method Explorer, sélectionnez Chromtogrm > Integrte (MS/MS). Sélectionnez MS/MS (GC) comme intégrteur. Cliquez sur l'onglet Pek Filters. Sous Filter on, cliquez sur Pek height. Sous Height filters, cochez l cse Asolute height. Tpez 60000 comme vleur de Asolute height. Notez le tringle leu qui s'ffiche lorsque vous chngez l vleur d'un prmètre suvegrdée dns l méthode en cours. Lorsque vous enregistrez l méthode, les tringles disprissent. Figure 13 Onglet Pek Filters vec cse Asolute height cochée 26 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme CPG/SM Tâche 7. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (CPG/SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques 7 Réintégrer le chromtogrmme. g Cliquez sur le outon dns l rre d'outils Method Editor. Notez que seuls les plus grnds pics sont désormis intégrés. Figure 14 Le petit pic situé à 5,8min n'est plus inclus dns les résultts d'intégrtion, cr l huteur solue de ce pic est inférieure à 60000points. Chromtogrmmes CIT et CIE SM/SM intégrés vec un prmètre de seuil plus élevé 8 Resturer les prmètres suvegrdés pour l méthode en cours et fermer l fenêtre Method Editor. Sélectionnez l section Chromtogrm > Integrte (MS/MS) dns Method Explorer. Cliquez sur l'icône dns Method Editor. c Sélectionnez l section Chromtogrm > Integrte (MS) dns Method Explorer. d Cliquez sur l'icône dns Method Editor. e Fermez l fenêtre Method Editor. Pour nnuler vos modifictions et resturer les vleurs de l méthode chrgée, cliquez sur l'icône Resturer les dernières vleurs enregistrées du fichier dns l rre d'outils Method Editor. 9 Supprimer tous les chromtogrmmes, excepté celui d'origine. Supprimer les résultts d'intégrtion du chromtogrmme d'origine. c d Sous User Chromtogrms dns l fenêtre Dt Nvigtor, sélectionnez tous les chromtogrmmes, excepté celui d'origine. Cliquez vec le outon droit de l souris sur les chromtogrmmes sélectionnés et cliquez sur Delete. Sélectionnez tous les chromtogrmmes CIT. Cliquez sur Chromtogrms > Cler Results. Si vous utilisez l'option Cler Results, les chromtogrmmes ne sont ps supprimés; mis les résultts liés ux chromtogrmmes le sont. Dns ce cs, les vleurs d'intégrtion sont effcées. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 27
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) Au cours de cette tâche, vous llez pprendre différentes fçons d'intégrer de mnière interctive un chromtogrmme, de chnger les prmètres d'intégrtion pour modifier les résultts et d'fficher le rpport signl/ruit pour chque pic. Vous pprendrez églement comment ctiver les clculs d'déqution du système. Tâche 8. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (SM) Étpes Instructions détillées Remrques 1 Intégrer les chromtogrmmes MSD_mix_4stds_DB_spl200_03.d et Pest - 200 - Scn.d à l'ide de l'une des options indiquées à droite. Cochez l cse en regrd du fichier de données MSD_mix_4stds_DB_spl200_03.d dns l fenêtre Dt Nvigtor. Cochez l cse en regrd du fichier de données Pest - 200 - Scn.d dns l fenêtre Dt Nvigtor. c Sélectionnez les deux CIT. d Intégrez le TIC Scn pour ces deux fichiers, à l'ide de l'une des options suivntes. Dns le menu principl, cliquez sur Chromtogrms > Integrte Chromtogrm. Sélectionnez le chromtogrmme. Ensuite, cliquez vec le outon droit de l souris sur le chromtogrmme, puis cliquez sur Integrte Chromtogrm. Dns Dt Nvigtor, sélectionnez TIC Scn pour les deux fichiers de données. Ensuite, cliquez vec le outon droit de l souris sur l'un des chromtogrmmes, puis cliquez sur Integrte Chromtogrm. Pour le flux de trvux générl, l'intégrtion utilise l'intégrteur Generl, cr il s'git de l'intégrteur sélectionné dns l méthode defult.m. Pour le flux de trvux de crilge des composés CPC/Q-TOF, l'intégrtion utilise l'intégrteur Agile. Vous pouvez chnger cette vleur dns l'onglet Chromtogrm > Integrte (MS) > Integrtor. Notez que l'intégrtion vec les prmètres pr défut détecte des pics très petits. 28 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) Tâche 8. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Figure 15 L'un des menus contextuels dns Dt Nvigtor et les chromtogrmmes intégrés 2 Activer les clculs d'déqution du système pour les chromtogrmmes SM. c d e f Dns l fenêtre Method Explorer, sélectionnez Chromtogrm > Integrte (MS) pour fficher l'onglet Integrtor. Cliquez sur l'onglet Suitility. Cochez l cse Enle system suitility clcultions. Sélectionnez United Sttes Phrmcopoei (USP). Dns l oîte Column void time, tpez 1. Dns l oîte Column length, tpez 3000. Notez le tringle leu qui s'ffiche lorsque vous chngez l vleur d'un prmètre suvegrdée dns l méthode en cours. Lorsque vous enregistrez l méthode, les tringles disprissent. Les lgorithmes utilisés pour définir plusieurs des colonnes de l liste Integrtion Pek List chngent en fonction de l phrmcopée sélectionnée. Pour plus d'informtions, consultez l'ide en ligne. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 29
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) Tâche 8. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques Les vleurs réelles de Column void time et Column length pour ces fichiers de données sont différentes de ces vleurs. Celles-ci ne sont utilisées qu'à titre d'exemple. Figure 16 Onglet Suitility de Chromtogrm > Integrte (MS) 3 Réintégrer le chromtogrmme. Cliquez sur l'icône Intégrer le chromtogrmme dns l rre d'outils Method Editor pour effectuer l'intégrtion vec le nouveu prmètre. 4 Afficher les clculs d'déqution du système. Ouvrir l fenêtre Integrtion Pek List. Réviser les vleurs de l zone de ruit et clculer le rpport signl/ruit pour les pics intégrés. c d Cliquez sur View > Integrtion Pek List. Cliquez vec le outon de l souris dns l'en-tête de l fenêtre Peks et cliquez sur Floting. Cliquez vec le outon droit de l souris dns l'en-tête d'une colonne que vous ne souhitez ps voir et cliquez sur Remove Column. Cliquez vec le outon droit de l souris dns l'en-tête d'une colonne et cliquez sur Add/Remove Columns pour chnger les colonnes visiles. Les clculs d'déqution du système sont inclus dns le tleu Integrtion Pek List. Les vleurs incluses sont notmment les suivntes: k, Tiling fctor, Pltes, Pltes/M et Symmetry. Vous pouvez églement ctiver les clculs d'déqution du système pour un chromtogrmme SM, SM/SM ou SPG. Figure 17 Tleu des pics intégrés vec vleurs d'déqution du système 30 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 8. Clculez les vleurs d'déqution du système (System Suitility) Tâche 8. Intégrtion interctive d'un chromtogrmme (SM) (suite) Étpes Instructions détillées Remrques 5 Resturer les prmètres de l méthode pr défut, fermer les fenêtres Method Editor et Integrtion Pek List. c d Pour nnuler vos modifictions et resturer les vleurs de l méthode pr défut, cliquez sur l'icône Resturer les dernières vleurs enregistrées du fichier dns l rre d'outils Method Editor. Fermez l fenêtre Method Editor. Cliquez vec le outon de l souris dns l fenêtre Integrtion Pek List et cliquez sur Floting. Cliquez sur View > Integrtion Pek List. Lorsque vous cliquez sur l'option Floting dns le menu contextuel pour l seconde fois, l fenêtre Integrtion Pek List est ncrée à son emplcement d'origine. Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 31
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Au cours de cette tâche, vous llez extrire un spectre exctement à l'endroit que vous spécifiez dns le chromtogrmme. Le progrmme d'nlyse qulittive extrit un spectre à prti d'un point de données spécifique ou extrit un spectre moyen d'une moyenne de plusieurs points ou plges de données. Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques 1 Prcourir un chromtogrmme pour fficher l'ion précurseur et l'ion produit pour les quelques derniers pics de Pest - STD 200 MRM.d. Effectuer un zoom vnt sur l zone comprise entre 13 et 16 minutes. Utiliser l'icône Wlk Chromtogrm. Réviser le spectre en commençnt environ à 13minutes et déplcer l flèche vers l droite. Sélectionnez l ligne Pest - 200 - MRM.D dns l fenêtre Dt Nvigtor. Fermez l fenêtre Method Editor. c Fermer l fenêtre MS Spectrum Results. d Cliquez sur le chromtogrmme TIC MRM dns l fenêtre Dt Nvigtor. e Cliquez sur l'icône Autoscle Y-xis during Zoom dns l rre d'outils Chromtogrm Results. f Sélectionnez 1 pour le nomre mximum de volets liste. g Pour effectuer un zoom vnt sur quelques pics, cliquez vec le outon droit de l souris u-dessus du pic à 13minutes et fites glisser le pointeur jusqu'à 16minutes, puis relâchez le outon de l souris. h Cliquez sur l'icône Wlk Chromtogrm dns l rre d'outils Chromtogrm Results. i Déplcez le curseur Wlk Chromtogrm jusqu'u dessus de l'xex à environ 13minutes et cliquez. j Pour nviguer d'un spectre à l'utre, utilisez les touches fléchées droite et guche de votre clvier. L'outil Wlk Chromtogrm est prticulièrement utile sur les données SM/SM pour identifier les ions précurseur et produit. Le spectre de chque point sur lequel vous cliquez dns l fenêtre Chromtogrm Results s'ffiche instntnément dns l fenêtre Spectrum Preview qui s'ouvre utomtiquement. Prfois, deux spectres sont ffichés dns l fenêtre Spectrum Preview. Pr exemple, deux spectres sont ffichés dns l fenêtre Spectrum Preview pour chcun des points sur lesquels vous cliquez près du pic situé à 13,431min. 32 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques Figure 18 Prcours du chromtogrmme pour visuliser les deux spectres MRM pour le pic situé à 13,43min Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 33
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques 2 Extrire les spectres à des points de données spécifiques pour le pic à 5,2min et celui à 14,3min du fichier de données Pest - STD 200 MRM.d. Extrire un spectre du pic situé à ou proche de 5,2min, puis l'un des creux, à l'ide de l'une des options décrites sous Comments. Extrire un spectre du pic situé à ou proche de 14,3minutes (ps le creux tout de suite). Chnger l'ffichge fin de visuliser u moins trois spectres. Cliquez sur l'icône Rnge Select dns l rre d'outils Chromtogrm Results. Fermez l fenêtre Spectrum Preview. c Cliquez sur l'icône Zoom Out dns l rre d'outils Chromtogrm Results. d Pour effectuer un zoom vnt sur le pic à 5,2min, cliquez vec le outon droit de l souris u-dessus du pic à 4,0min et fites glisser le pointeur jusqu'à 6,0min, puis relâchez le outon. e Sur un pic proche de 5,2min, extryez un spectre à l'ide de l'une des méthodes indiquées dns l colonne Remrques. f Sur un creux proche de 5,1min, extryez le spectre. g Cliquez sur l'icône Zoom Out dns l rre d'outils Chromtogrm Results. h i j Effectuez un zoom sur l zone comprise entre 14 et 15minutes. Sur un pic proche de 14,3min, extryez un spectre à l'ide de l'une des méthodes indiquées dns l colonne Remrques (n'extryez ps encore le spectre du creux). Si nécessire, sélectionnez 4 comme nomre mximum de volets liste dns l rre d'outils MS Spectrum Results. Lorsque vous effectuez le zoom, veillez à ce que l'icône AutoScle Y-xis during Zoom soit sélectionnée. Le fond de l'icône est ornge qund elle est ctive. Vous pouvez extrire un spectre de l'une des mnières suivntes: Doule-cliquez sur le point de données dns le chromtogrmme. Cliquez sur le point de données dns le chromtogrmme, puis cliquez vec le outon droit de l souris n'importe où dns le chromtogrmme. Cliquez sur Extrct MS Spectrum. L oîte de dilogue Extrct Spectrum s'ouvre. Assurez-vous que le fichier Pest - STD 200 MRM.d est sélectionné, puis cliquez sur Extrct dns l oîte de dilogue Extrct Spectrum. Notez que l première fois que vous extryez un spectre, l fenêtre MS Spectrum Results s'ffiche contennt le spectre. Le type du spectre et le temps de rétention figurent sous User Spectr. Tous les spectres extrits suivnts pprissent ux deux endroits églement. Lorsque vous extryez un spectre SM du pic proche de 14,3minutes, deux spectres sont extrits, cr deux trnsitions se produisent sur ce pic. 34 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques Figure 19 Fenêtre principle vec deux spectres MRM du pic situé à 5,2min et deux spectres MRM du pic situé à 14,3min Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 35
1 Apprendre les ses de l'nlyse qulittive Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques 3 Extrire un spectrems pour le creux situé à 14,35minutes du fichier de données Pest - STD 200 MRM.d. Ouvrir Spectrum Preview. Extrire un spectre du creux situé u TR 14,3min. Copier ce spectre dns le dossier User Spectr. Chnger l'ffichge pour montrer 6spectres. Fermer Spectrum Preview. c d e Cliquez sur l'icône Spectrum Preview. Extryez un spectre sur un creux proche de 14,3minutes. Cliquez vec le outon droit de l souris sur le spectre dns l fenêtre Spectrum Preview, puis cliquez sur Copy to User Spectr. Les spectres sont copiés dns l section User Spectr du nvigteur de données et s'ffichent dns l fenêtre MS Spectrum Results. Cliquez sur l flèche vers le s en regrd de l liste de spectres et sélectionnez 6. Fermez l fenêtre Spectrum Preview. Lorsque Spectrum Preview est ctivé, le système ffiche tous les spectres sélectionnés mnuellement dns l fenêtre Spectrum Preview, mis ps dns l section User Spectr de Dt Nvigtor. Avec Spectrum Preview ctivé, Qulittive Anlysis écrse le précédent spectre lorsque vous en extryez un nouveu. Le mode Spectrum Preview est utile si vous souhitez réviser rpidement les spectres dns votre chromtogrmme et n'en suvegrder que quelques-uns. Figure 20 Fenêtres Chromtogrm Results et MS Spectrum Results 36 Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM
Apprendre les ses de l'nlyse qulittive 1 Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Tâche 9. Extrction de spectres d'un chromtogrmme Étpes Instructions détillées Remrques 4 Extrire un spectre qui moyenne tous les points d'une plge spécifiée pour le pic de 14,3min pour le fichier de données Pest - STD 200 MRM.d: Effectuer un zoom rrière. Utiliser l'icône de sélection de l plge dns l rre d'outils du chromtogrmme. Définir l plge sur l totlité du pic. Extrire le spectre à l'ide de l'une des options indiquées. c d Cliquez sur l'icône Rnge Select dns l rre d'outils du chromtogrmme. Cliquez à guche de l se du pic à 14,3min et fites glisser le pointeur jusqu'à l droite de l se de ce même pic. Extryez le spectre moyen à l'ide de l'une des options indiquées à droite. Sélectionnez 2 comme nomre mximum de volets liste dns l fenêtre Chromtogrm Results. Vous pouvez extrire un spectre moyen en doule-cliqunt sur l plge sélectionnée dns le chromtogrmme. Ou, cliquez vec le outon droit de l souris n'importe où dns le chromtogrmme, puis cliquez sur Extrct MS Spectrum du menu contextuel. Notez que deux spectres MRM moyennés s'ffichent. Figure 21 Fenêtres Chromtogrm Results et MS Spectrum Results ffichnt deux spectres moyennés Logiciel pour le poste de trvil Agilent MssHunter Anlyse qulittive Guide de fmiliristion pour CPL/SM 37