Atlas de la ore vaudoise Saisie des données Version 1 (décembre 2015)
Table des matières 1. Introduction... 1 2. Méthode... 1 2.1. Outils de saisie... 1 2.2. Types de données et «projets»... 1 2.2.1. Définition d un projet... 1 2.2.2. Données dépendantes/indépendantes d un responsable de carré... 1 2.2.3. Confusion actuelle possible... 2 2.2.3.1. Saisie antérieure à septembre 2015... 2 2.2.3.2. Saisie via tablette ou smartphone... 3 2.2.4. Visualisation des données par un responsable de carré... 3 2.2.4.1. Vue dans le formulaire F1-espèces... 3 2.2.4.2. Export du formulaire F1-espèces... 3 2.2.4.3. Formulaire F2-notes détaillées et F1-espèces... 3 2.2.5. Stratégie de saisie de données... 3 2.3. Problèmes actuels liés à la saisie... 4 2.3.1. Petit piège à éviter : lien F1-localités/F1-espèces non permanent... 4 2.3.2. Bugs du navigateur... 4 2.3.3. Observation en groupe de plus de trois observateurs... 4 3. Remerciements... 4 4. Annexe... 5 4.1. Manuel de saisie spécifique à l'atlas : «Masque-CVB»... 5
1. Introduction L Atlas de la flore vaudoise est maintenant doté d un système de saisie spécifique au projet, via le carnet en ligne d Info Flora. Le présent document explique les divers moyens de saisir des données accumulées sur le terrain. Il distingue des méthodes différentes selon la nature des données et présente les aspects dynamiques de visualisation des saisies. Il n est pas en soi un manuel de saisie. Pour des questions liées au carnet en ligne d Info Flora un manuel d utilisateur est disponible sur le site (voir 2.1). Pour des questions spécifiques à la saisie de données Atlas, veuillez vous adresser aux responsables du projet via info@atlasflorevd.ch. 2. Méthode 2.1. Outils de saisie v Carnet en ligne d Info Flora : Ø Depuis un ordinateur : Nécessite une inscription au Carnet en ligne (gratuit) : https://obs.infoflora.ch ; plus d info : https://www.infoflora.ch/fr/mes-observations/carnet-en-ligne.html. Ø Depuis une tablette ou un smartphone : Nécessite une inscription au Carnet en ligne (voir ci-dessus) ; Nécessite de charger l application -App Info Flora- sur l appareil mobile (gratuit) ; Les utilisateurs de -App Flora Helvetica sont priés de nous contacter : info@atlasflorevd.ch ; plus d info : https://www.infoflora.ch/fr/mes-observations/app.html. v Tableaux Excel "Info Flora" : Ø Sauf pour des situations exceptionnelles, à partir de 2016, les données ne devront plus être transmises par l intermédiaire d un tableau Excel. 2.2. Types de données et «projets» 2.2.1. Définition d un projet Les données floristiques répertoriées dans la base de données d Info Flora sont ordonnées au sein de projets. Lors de la saisie d observations, la première étape est de sélectionner le projet dans lequel les données seront enregistrées. Par défaut, elles sont enregistrées dans votre projet personnel et ne font donc pas partie des données Atlas. 2.2.2. Données dépendantes/indépendantes d un responsable de carré Pour l Atlas de la flore vaudoise, on distingue deux grandes catégories de données. Celles qui sont dépendantes et celles qui sont indépendantes d un responsable de carré (si un responsable de carré enregistre des observations hors de son/ses carré/s, les données sont considérées comme indépendantes). En fonction de ces catégories de données, la saisie se fera dans des projets différents : v Projet Atlas : Ø Via le "Masque-CVB" (Figure 1A) : Données dépendantes d un responsable de carré ; Le projet est sélectionné automatiquement : Onglet «Masque» ; Sélectionner «CVB» à la place de «Standard» ; Donne accès aux formulaires spécifiques : Formulaire F1-localités ; 1
Formulaire F1-espèces ; Formulaire F2-notes détaillées. Ø Via le «Masque-Standard» : v Projet CVB : Données dépendantes d un responsable de carré ; Dans le principe, s utilise pour modifier des données qui sont déjà affiliées au projet Atlas : Exemple : rajouter une photo témoin ; Si utilisé pour de la saisie : La méthode est identique que celle des données indépendantes d un responsable de carré (Figure 1B), sauf qu à la place du projet «CVB», vous sélectionnez le projet «Atlas». Ø Via le "Masque-Standard" (Figure 1B) : Données indépendantes d un responsable de carré ; Le projet est sélectionné manuellement : Bouton «+» du masque standard (permet de saisir une nouvelle observation); Bouton «Projet» du formulaire de saisie ; Sélectionner : Cercle Vaudois de Botanique / Prénom Nom / Mes observations. NB : Pour le projet de l Atlas de la flore vaudoise, cette distinction de projet permet au responsable de carré de gérer plus facilement les données lors de l établissement des fréquences. Toutefois, il est clair que toutes les données du projet Cercle Vaudois de Botanique seront utilisées pour la réalisation de l Atlas. Figure 1A : Données dépendantes d un responsable de carré : Sélection projet Atlas-masque-CVB. Accés aux formulaires de l Atlas. Bouton pour ajouter, dupliquer, éditer, supprimer des saisies. Figure 1B : Données indépendantes d un responsable de carré : Masque standard. Bouton + pour saisir une observation. Onglet Projet de la fenêtre de saisie. Sélection du projet Cercle Vaudois de Botanique/Prénom Nom/Mes observations. Figure 1. Sélection des masques de saisie et des projets dans le Carnet en ligne d Info Flora. A. Masque CVB pour la saisie de données par des responsables de carré. B. Masque Standard pour la saisie de données indépendantes d un responsable de carré. 2.2.3. Confusion actuelle possible 2.2.3.1. Saisie antérieure à septembre 2015 Les données ayant été saisies avant ladite date sont stockées soit sur votre projet personnel, soit sous le projet CVB-Standard. Au cours de l hiver 2015-2016, toutes les données saisies par des responsables de carré et dans leur carré d étude seront basculées dans le projet Atlas. A partir de cette date de basculement, toutes les données 2
des responsables de carré faisant partie de leur zone d étude devront strictement être saisie sous le projet Atlas- Masque-CVB. 2.2.3.2. Saisie via tablette ou smartphone Actuellement toutes les données saisies sur des appareils mobiles sont stockées dans votre projet personnel (ou CVB-Standard si l utilisateur en a fait la demande) ; en effet, les versions actuelles des Apps Info Flora et Flora Helvetica ne permettent pas de choisir un projet. Dès avril 2016, ceci sera possible avec l App Info Flora. Vous pourrez donc choisir le projet dans lequel vous désirez enregistrer vos observations. Les utilisateurs de l App Flora Helvetica sont priés de prendre contact avec info@atlasflorevd.ch. 2.2.4. Visualisation des données par un responsable de carré 2.2.4.1. Vue dans le formulaire F1-espèces Actuellement un responsable de carré peut visualiser les données de son carré d étude par l intermédiaire du formulaire F1-espèces (Figure 2). Il peut distinguer les données saisies via un projet CVB-Standard carré avec croix, des données saisies via un projet Atlas-Masque-CVB carré plein noir. L affichage va prochainement évoluer, le responsable de carré pourra faire la distinction avec d autres sources de données et avec des données < 2012 ou > 2012. Visualisation des données CVB-Standard et Atlas-Masque-CVB: Formulaire F1-espèces. Figure 2. La vue sur le formulaire F1-espèces est interactive : des cases pleines apparaissent lors de la saisie de données du projet Atlas et des cases avec croix s affichent pour des données appartenant au projet du Cercle Vaudois de Botanique. 2.2.4.2. Export du formulaire F1-espèces Un export du formulaire F1-espèces sera également disponible en janvier 2016. Il se présentera sous la forme d un bouton qui permettra d exporter le formulaire au format PDF. 2.2.4.3. Formulaire F2-notes détaillées et F1-espèces Lors d une saisie de localité via le formulaire F1-localités, vous devez référez le numéro de la localité ID dans le formulaire F1-espèces pour la/les espèce/s correspondante/s. Par contre, une localité saisie via le formulaire F2-notes détaillées ne doit pas être saisie une deuxième fois dans le F1-localités ; dans ce cas de figure, aucun numéro de localité ID ne doit être référé dans le F1-espèces, seule la fréquence est à indiquer. Le petit carré noir des 3 èmes colonnes 1x1km et 5x5km du F1-espèces s insère automatiquement lors de la saisie d une espèce dans le F2-notes détaillées. 2.2.5. Stratégie de saisie de données Case avec croix pour les données CVB-Standard. Case pleine pour les données Atlas-Masque-CVB. Cas où la localité a été saisie via le F1-localités (sélection d un ID). Cas où la localité a été saisie via le F2-notes détaillées (pas de ID). La stratégie de saisie de données dépend fortement de vos préférences de travail sur le terrain. v Les responsables de carré qui travaillent sur le terrain avec des formulaires papier auront tendance à regrouper les espèces dans des localités définies (voir le Manuel de terrain pour une définition des localités au sens de l Atlas). La saisie de données se fera alors de manière privilégiée à l aide du F1-localités et du F1-espèces. v Les responsables de carré qui travaillent sur le terrain avec des smartphones/tablettes auront tendance à créer une nouvelle localité pour chaque espèce, du fait que la relation point GPS-espèce est facilitée. Dans ce cas 3
le transfert de données se fera de manière privilégiée vers le F2-notes détaillées. La gestion des données par l intermédiaire du CEL concernera principalement l insertion des fréquences dans le F1-espèces. 2.3. Problèmes actuels liés à la saisie 2.3.1. Petit piège à éviter : lien F1-localités/F1-espèces non permanent Une localité saisie via le formulaire F1-localités et reportée dans le formulaire F1-espèces, ne devrait pas être modifiée dans le F1-localités. En effet, une fois que la localité est reportée dans le F1-espèces le lien avec le F1- localités est perdu. Si vous faites une modification de la localité dans le F1-localités il faudra alors pour chaque «ID» de cette localité reporté dans le F1-espèces, supprimer l «ID», puis ressaisir le même «ID» correspondant à la localité modifiée. Cheminement : Ø Saisie d une localité dans F1-localités ; Ø Saisie de son identifiant «ID» dans le F1-espèces ; Ø Modification de la localité dans le F1-localités ; 2.3.2. Bugs du navigateur o Modification non reportée dans le F1-espèces pour cet «ID» ; o Obligation pour chaque espèce portant cet «ID» de supprimer l «ID» et de réinsérer le même «ID». Plusieurs utilisateurs nous ont reporté des bugs dans l affichage des boutons de saisies ; il arrive en effet que les boutons «Update, Chancel, Delete» disparaissent. Résolutions possibles : Ø Effectuer un rafraîchissement du navigateur : Ø Si le rafraîchissement du navigateur n apporte pas de résolution immédiate, vous pouvez utiliser les touches du clavier : «Enter» pour «Update» et «Esc» pour «Chancel» ; Ø A terme, installer et utiliser le navigateur «Mozilla Firefox». 2.3.3. Observation en groupe de plus de trois observateurs La saisie de plus de trois observateurs est pour le moment indisponible. Si des observations concernent plus de trois observateurs : Ø Pendant ou à la fin de votre saisie, retournez sur le masque standard, sur la fenêtre générale vos observations sont listées dans l ordre de saisie ; Ø Pour visualiser seulement vos observations dans la liste susmentionnée : cliquer sur le bouton filtre, puis sélectionner à souhait : le projet, l observateur, la/les date/s ; Ø Reportez les numéros de notes dans un tableau Excel, inscrivez les observateurs correspondants dans le tableau ; Ø Envoyer le tableau à info@atlasflorevd.ch. Bouton de rafraichissement du navigateur 3. Remerciements Nous remercions les bénévoles de l Atlas qui ont participé au document, soit par leur relecture soit par leurs manifestations lors de problèmes rencontrés pendant la saisie : David Van Dervort, Jean-Michel Bornand, Christian Clerc, Annelise Dutoit. 4
ore vaudo a fl Atlas de l ise 4. Annexe 4.1. Manuel de saisie spécifique à l'atlas : «Masque-CVB» Le document présenté ci-dessous a été produit pour les séances d introduction à l utilisation du «MasqueCVB». Atlas de la flore vaudoise Carnet en ligne Info Flora: formulaires de saisie en ligne Pense-bête 1. Carnet en ligne: https://obs.infoflora.ch/app/observations/fr/index.html 2. Dans le carnet en ligne, option «Masque»: choisir «CVB» Masque: menu déroulant > «CVB» 1 5
ore vaudo a fl Atlas de l ise 2. Dans le masque «F1 Localités»: choisir le carré à saisir D. C. A. B. A = Carré KM: menu déroulant de tous les carrés Atlas, avec vos carrés en bleu B = Carte centrée sur le premier de vos carrés dans la liste: carré 5x5 km et carré 1x1 km C = Le formulaire «F1 Localités» vide D = Accès aux 4 formulaires de saisie possibles: - Formulaire = formulaire standard de saisie du Carnet en ligne d Info Flora - F1- Localités - F1- Espèces - F2- Notes détaillées 2 3. Masque F1 Localités: saisir des localités = ajouter une localité > saisir les informations comme sur le formulaire papier, > puis valider avec «update» = dupliquer une localité = éditer: modifier une localité déjà saisie = supprimer une localité déjà saisie! les coordonnées doivent se situer dans le carré 5x5 km! les localités dans le 5x5 km s affichent en bleu 3 6
ore vaudo a fl Atlas de l ise 4. Masque F1 Espèces: introduire les n de localités et la fréquence Saisir les mêmes informations que sur le formulaire papier: 1. Double-cliquer sur la case à remplir: apparaît la liste des n de localités déjà saisies dans le F1-Localités 2. Choisir le n de localité 3. Procéder de même pour la fréquence: menu déroulant: /, /\ ou!! la station saisie apparaît en jaune sur la carte jointe! = permet de zoomer sur l observation sélectionnée 4 5. Formulaire F2 - Notes détaillées: saisir les observations particulières (espèces rares, néophytes) = ajouter une note > saisir les informations comme sur le formulaire papier (listes déroulantes), > puis valider avec «update» = dupliquer une note! la station saisie ou en cours de modification apparaît en jaune sur la carte = éditer: modifier une note déjà saisie = supprimer une note déjà saisie! 5 = permet de zoomer sur l observation 7