Gérer ses références bibliographiques avec Mendeley Pôle Formation IST Dominique Fournier, Inra, ERIST Montpellier Apérodoc IRD, 26 juin 2012 Objectifs de la présentation Découvrir les principales fonctionnalités du logiciel la collecte des références bibliographiques (import à partir de différentes sources et/ou autres logiciels, saisie manuelle, ) la gestion des références (dossier, tag, ) leur utilisation dans un document (citation, bibliographie, style) Le partage de références bibliographiques 2
Caractéristiques de Mendeley Projet créé en 2008 par des chercheurs et pour des chercheurs Ce n est pas un logiciel libre (open source), mais la version gratuite offre beaucoup de fonctionnalités Inspiré des outils collaboratifs 3 Un outil de : Mendeley, c est gestion de références bibliographiques et d aide à la publication lecture et annotation (pdf) découverte (plateforme web, papers, groups, tendance des disciplines, ) qui vous permet de : Ajouter et organiser les résultats de vos recherches bibliographiques (import de références bibliographiques et de pdf, liens avec EndNote, Zotero, JabRef) Collaborer avec des collègues en partageant des références et annotations Accéder à votre environnement de travail à partir de n importe où (accès web, mobile) 4
Mendeley, c est aussi Plateforme web de partage de références bibliographiques + de 30 millions de Papers (références bibliographiques avec lien vers le texte intégral et qqs OA). Possibilité de les sauvegarder vers Mendeley groupes thématiques publics (Groups) que l on peut suivre (RSS), rejoindre (Join, Follow) et interagir (ask a question or comment) profils de scientifiques (People) Données 28/10/11 Données 25/06/12 5 Une communauté très active Des développeurs qui répondent aux demandes des utilisateurs (votes, ): Support / Feedback Blog, Upcoming Events & Webinars, Advisors, Répartition des usagers et des formateurs http://mapmyfield.com/ http://www.mendeley.com/advisors/ 6
Avant 15/06/12 : 500 MB Shared Web Space Une version gratuite avec des limites 1 GB pour espace personnel sur le web (My Library) 100 MB pour les espaces partagés (Groupes) Avant 15/06/12 : 5 groupes privés avec 10 membres 7 Mendeley Institutional Edition http://www.swets.com/mendeley Nouveauté Pas encore testé à l IRD et à l Inra 8
Pour utiliser Mendeley Nécessité de se créer un compte ( People) Télécharger le logiciel Mendeley Desktop My Library Gestion basique des références Fonctionnalités plus complètes (doublons, annotations pdf, ), Lien vers le traitement de texte, Déclenchement de la synchronisation avec le serveur Paramétrage des transferts (pdf) Gestion basique des références (ajouts de références, création de dossiers et de groupes) Import direct des références à partir des sites web 9 Interface Mendeley Desktop Barre d outils Moteur de recherche Collections, listes de publications, collections partagées Liste des références (documents) Filtrage des références par année, auteurs, revues ou tags (= mots-clés) Détail du contenu des références (infos bibliographiques, tags, notes) Affichage des références sous forme de citations / tableau (View Library as citation / table) 10
Collecter des références Ajouts de documents Add File (ou glisser déposer) d un fichier pdf génération automatique de la référence bibliographique + PDF Add File d un fichier contenant plusieurs références bibliographiques (export RIS de ScienceDirect, Export EndNote XML, ) Add Folder (dossier contenant plusieurs pdf) Watch Folder (créer une référence dès que nouveau pdf dans le dossier «surveillé) Saisie manuelle assistée (index de termes existants, Mendeley 26/06/12 11 Importer à partir du Web Dans ce cas, les références sont sauvegardées dans My Library (synchroniser pour les retrouver en local DeskTop) Sauvegarder des références de la plateforme Mendeley (Papers, Groups) A partir d un site «compatible», cliquer sur barre de navigation personnelle Au préalable, Installer Web Importer Tools > Install web Importer Dashboard Mendeley 26/06/12 12
My library sur Mendeley Web Onglet My Library Dossiers permanents Possibilité de créer des dossiers (Folder) dans lesquels les références pourront être classées (multipositionnement possible). On retrouve le même contenu et le même classement que dans la version locale Références les + récentes Toutes les références de ma bibliothèque Références nécessitant une relecture Mes références que je préfère Mes publications (que je peux afficher dans mon profil) Dossiers personnels (Create Folders) 13 My library sur iphone, ipad et ipod Voir démo à la pause 14
Gérer les références Toutes les références ajoutées dans Mendeley sont dans All Documents Créer des Folders (dossiers, collections) Les références peuvent être supprimées du Folder (remove from collection) ou définitivement (Delete) Elles peuvent être multipositionnées dans plusieurs folders 15 Gérer les références (2) Détection de doublons (Tools > Chek duplicates) Recherche (par titre, mots clés, notes, revue) Recherche par filtre (auteurs, tags, mots clés, revues) 16
Personnaliser les références Favoris / à lire «Fiche de lecture» dans Notes «tags» : marqueurs personnels (classement, ) Annoter les pièces jointes (pdf) 17 Sauvegarde et échanges avec d autres applications Possibilité de sauvegarder toute la librairie ou collection(s) ou quelques documents sélectionnés File > Export Format : RIS, BibTex, EndNote XML Help > Create Backup Sauvegarde sur Mendeley Web par synchronisation Sélectionner le format d export RIS Zotero, EndNote BibTex JabRef EndNote XML EndNote X Mendeley - 23/03/12 18
Lien avec les traitements de texte Application compatible avec les différents traitements de texte Windows Word 2003, 2007, 2010 Mac Word 2008, 2011 Open Office 3,2 BibTex Installation d un plug-in Mendeley - 23/03/12 19 Citer les références dans un fichier word 2010 (1) L application Mendeley Desktop doit être ouverte La barre d outils Mendeley Cite-o-Matic est accessible dans l Onglet References de Word 2010 Insert Citation : pour sélectionner les références à insérer dans le texte Style : détermine le format pour la mise en forme de la citation et de la référence dans la bibliographie Mendeley - 23/03/12 Insert Bibliography : met en forme la bibliographie du document 20
Citer les références dans un fichier word 2010 (2) Cliquer sur l icône «Insert Citation» Recherche dans la base Mendeley (ou dans une collection spécifique) Aller dans Mendeley en cliquant sur «Go to Mendeley» ou en ouvrant l application Sélectionner la (ou les) référence(s) et cliquer sur «Send Citation to Word Processor» Pas de possibilité d insérer les références par un simple Glisser- Déposer ou Copier-Coller Mendeley - 23/03/12 21 Le partage de références avec Mendeley Création de groupes à partir de Mendeley Desktop ou de Mendeley web Create group Propriétés du groupe : Edit settings (Private, Public) Invitation des invités par mail : Edit settings > Members Droits des invités : admin (= owner), member, follower Les membres ont tous le droit d écriture et de lecture (travail collaboratif) Transfert du contenu des dossiers gérés localement avec Mendeley Desktop Settings > Synchronisation des pièces jointes Affichage de ses publis dans son profil personnel Mendeley (People): se fait automatiquement à partir de la collection «My Publications» 22
Création d un groupe Dans la version gratuite : possibilité de créer 1 seul groupe avec au maximum 3 membres (dont vous!) Public Groupe public bénéficiant d une grande visibilité sur Mendeley Web (et sur les moteurs de recherche) Private : Groupe privé dans lequel on peut partager des fichiers et dont le contenu n est visible qu aux personnes que vous avez invitées Adapté à un programme de recherche et un travail à distance. Groupe sur invitation : seuls les membres ont le droit d alimenter le contenu du groupe 23 Gestion des références d un groupe Les références du groupe peuvent être ajoutées par: un ajout de document (Add documents) à partir de Desktop ou My Library un simple glisser-déposer (Desktop) (1) 1 2 un déplacement à partir d un autre groupe (sélectionner la référence puis Add to) à partir de My Library (2) un import sur le web (avec le plug-in Import to Mendeley) et classer ensuite la référence Recently 24 Added dans le groupe
Accès aux références d un groupe Le contenu du groupe est accessible à partir de leur espace Mendeley sur le web (My library > Groups) et en local (Groups) Seuls les membres du groupe (member) peuvent y ajouter des références au groupe Les followers peuvent copier les références dans leurs dossiers personnels et les utiliser dans leur bibliographie Accès au groupe à partir de My Library (web) Accès au groupe à partir de Mendeley Desktop 25 Les options de Mendeley (Desktop) Tools > Options > General Indiquer vos identifiants Mendeley pour synchronisation Paramétrage des options pour synchronisation des pièces jointes des différents folders et groupes Visualisation de vos «espaces» alloués Espace x 10 par rapport à celui offert par Zotero Nombre de groupes et membres à inviter Mendeley 14/06/12 Espace comparable à celui offert par Zotero 26
Pour en savoir plus sur Mendeley Pour en savoir plus : http://www.mendeley.com/ Videos / Tutorials Pour se former http://www.mendeley.com/ Upcomings events & Webinars 27 Des questions? 28
Merci pour votre attention Support réalisé par Dominique Fournier, 25 juin 2012 Accessible avec les autres supports Apéro Doc https://www.mpl.ird.fr/documentation/formation_historique.html Comparatif Zotero, EndNote X4, JabRef et Zotero http://www.ist.agropolis.fr/images/pdf/grille-comparative-zotero-jabrefmendeley-endnote.pdf 29