Assurance qualité et réglementation BPL. Le semestre 2. Maquette des enseignements

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1 SOM1BH07 Assurance qualité et réglementation BPL Cours 48 h Semestre 1 Organiser et mettre en œuvre les différentes procédures garantissant la qualité s produits. Contrôle s matières premières, s moyens production, s produits semi-finis et s produits finis. Participer à l amélioration s procédés fabrication, la production et s équipements productifs. Animer et diriger s équipes techniciens et cadres. Conseiller et assister la direction l entreprise pour la sécurité au travail, les conditions travail, et la protection l environnement. Passerelle MESC2A Responsable William Même william.meme@cnrs-orleans.fr Système management la qualité, contrôle qualité et assurance qualité (HACCP, Normes ISO, BRC, IFS). La réalisation du produit. La gestion la qualité. L accréditation et la certification. Les audits. Bonnes Pratiques Laboratoire (BPL). Risques physiques, chimiques et biologiques. Risques bio-industriels. Réglementation sur l utilisation confinée. ECTS 5 Première session : RNE et RSE : CT(E) 1h Secon session : RNE et RSE : CT(E) 1h Le semestre 2 Maquette s enseignements Intitulé ECTS Coeff. CM TD TP Commun BMC/MESC2A (18 ECTS) Anglais scientifique et communication Ouverture à l international : minicolloque Projet professionnel et connaissance l entreprise Stage Bioinformatique Immunologie Option BMC (12 ECTS) Relations structure-fonction Bases génomiques en physiopathologie Techniques expérimentales en biologie structurale Modèles expérimentaux en génétique et physiopathologie Outils développement technologique, économie d entreprise Statistiques appliquées aux bioindustries Spécialisation au choix (4 ECTS) Passerelle MESC2A (12 ECTS) Détail s enseignements 15 16

2 SOM2AG42 Anglais Scientifique et communication SOM2PR01 Connaissance l entreprise Durée i1 12 h TD 24 h Savoir communiquer à l oral sur sa spécialité en situation professionnelle. Anglais Responsable Lupka Mihajlovska lupka.mihajlovska@univ-orleans.fr Avoir suivi le module SOM1AG41. Travail axé sur la communication orale essentiellement : 1) Exposés avec diaporamas sur une thématique relevant la spécialité s étudiants. 2) Prise parole en situation professionnelle. Première session : RNE : CC(E/O) 1h30/15min ; RSE : CT(E) 1h30 Secon session : RNE et RSE : CT(O) 30 min Première session : RNE : 33% + Oral 66% ; RSE : 100% Secon session : Oral 100% TD 12 h faire réfléchir l étudiant sur ses motivations et ses ambitions professionnelles ; le faire se positionner par rapport à la continuation en thèse ou à l entrée dans la vie active ; sensibiliser les étudiants à la connaissance s métiers la recherche. Responsable Hervé Burdin herve.burdin@univ-orleans.fr Construction d un projet professionnel ; visites d entreprises, collectivités locales, organismes ; préparation CV, techniques recherche d emploi, informations sur les concours recrutement chercheurs et enseignants-chercheurs, ingénieurs..., table ron sur les exigences du milieu professionnel, avec participation représentants du publique et du privé. Connaissance l entreprise (grans fonctions, grands types d activités) ; connaissance s différents secteurs recherche (public et privé) ; notions d économie et gestion (éléments base) ; conférences et témoignages parcours professionnels ; contacts avec le milieu professionnel. Première session : RNE : CC(rapport) ; RSE : CT(E) 1h Secon session : RNE et RSE : Pas secon session SOM2IP00 Ouverture à l international : mini-colloque Durée i1 12 h SOM2ST01 Stage (spécialité BBMB) TD 12 h Pratiques s techniques l exposé scientifique oral en anglais. Anglais Responsables Domenico Morabito Olivier Richard Lucile Mollet Pratique écrite et orale l anglais courant et scientifique. domenico.morabito@univ-orleans.fr olivier.richard@univ-orleans.fr lucile.mollet@cnrs-orleans.fr A partir d un article scientifique type review, et avec l ai d un encadrant (enseignantchercheur ou chercheur), préparation d un résumé écrit et d un exposé soutenu oralement lors d un mini-colloque étudiant. Oral Coefficient 2 ECTS 1 Première session : RNE et RSE : CT(O) 15 min Secon session : Pas secon session Première session : Oral 100% Prise contact avec le mon professionnel la recherche ou l entreprise et le travail chercheur. Responsables Chantal Pichon William Même Fabienne Brulé chantal.pichon@cnrs-orleans.fr william.meme@cnrs-orleans.fr fabienne.brule-morabito@univ-orleans.fr Stage 2 mois en laboratoire recherche, ou en entreprise ou collectivité locale : participation à la construction d un protocole, réalisation d une expérience ou d un projet ; mise en forme s résultats ; traitement s données ; interprétation ; présentation orale et écrite. Première session : RNE et RSE : CT(rapport)+CT(soutenance orale) + Note maître stage Secon session : RNE et RSE : Pas secon session Première session : Rapport 30% + Soutenance 60% + Note MS 10% 17 18

3 SOM2BH07 Bioinformatique SOM2BH01 Immunologie 2 Spécialité BBMB et Passerelle MESC2A Spécialité BBMB et Passerelle MESC2A TD 48 h Former le chercheur main aux outils en ligne traitement données expérimentales (comparaison séquence, analyse structurale par utilisation d outil visualisation PyMOL). Responsable Stéphane Charpentier stephane.charpentier@cnrs-orleans.fr Connaissance base s biomolécules. Description et utilisation banques données. Analyse séquences nucléiques et protéiques. Prédiction l organisation gènes. Méthos prédictives structures secondaires. Visualisation structures tridimensionnelles. Comparaisons séquences (principes, matrices calcul, logiciels d alignement, recherche d homologies, intification motifs, alignements multiples). Modélisation s interactions moléculaires. Etu comparative la séquence s génomes. Phylogénie. Utilisation s logiciels graphiques visualisation et modélisation s bio-molécules. Modélisation comparative. ECTS 5 Première session : RNE et RSE : CT 2h Secon session : RNE et RSE : CT 2h Cours 12 h TP 12 h L objectif majeur ce module est permettre aux étudiants une compréhension aisée s mécanismes cellulaires et moléculaires les plus subtils du fonctionnement normal du système immunitaire et ses déficiences. Responsable François Erard francois.erard@cnrs-orleans.fr Notions base en immunologie. Immunité adaptative : Développement, fonctions et dysfonctions s lymphocytes. Homéostasie et mémoire immunologique. /TP Première session : RNE : CT(E) 1h + oral + Rapport TP ; RSE : CT(E) 1h + Oral Secon session : RNE et RSE : CT (E) 1h Première session : RNE : 25% + Oral 50% + TP 25% ; RSE : 50% + Oral 50% SOM2BH02 Relation structure-fonction Durée i1 44 h Spécialité BBMB Cours 44 h Responsable Richard Daniellou richard.daniellou@univ-orleans.fr connaissance la biochimie et la structure s protéines et s acis nucléiques. Interactions protéines-protéines à la jonction entre cellules endothéliales, agrégation protéines et neurodégénérescence, coordination s réseaux sanguins et nerveux, raaux lipidiques comme principe d organisation membranaire. De la structure s ARN à leurs fonctions. Interactions ligand-protéine : enzymologie et réceptologie moléculaires, mécanismes reconnaissance, allostérie, applications (docking, évolution dirigée, exemples tirés publications). Première session : RNE et RSE : CT(E) 2h + CT(O) 15 min Secon session : RNE et RSE : CT(E) 2h Première session : 66% + Oral 33 % 19 20

4 SOM2BH03 Techniques expérimentales en biologie structurale SOM2BO04 Modèles expérimentaux en génétique et physiopathologie Spécialité BBMB - Unité optionnelle Spécialité BBMB - Unité optionnelle Cours 15 h TP 33 h Connaissance pratique s techniques d analyse la structure s protéines et leurs interactions avec d autres protéines ou s acis nucléiques. SOM2BO03 Durée i1 42 h Cours 42 h Physiologie s systèmes intégrés s fonctions cérébrales, Mécanismes spéciation, différenciation et d intégration s cellules du système nerveux. Compréhension s mécanismes physiologie moléculaire en liaison avec les pathologies. Responsable Fabienne Brulé brule@cnrs-orleans.fr connaissance la biochimie et la structure s protéines et s acis nucléiques. Étus la structure s protéines par RMN, par spectrométrie fluorescence, par spectrométrie masse, par dichroïsme circulaire. Étus s interactions protéine-ligand. Imagerie par Résonance Magnétique. /TP Première session : RNE : CC(Rapports) ; RSE : CT (Oral) Secon session : RNE et RSE : CT(E) 2h Première session : RNE : 100% ; RSE : Oral 100% Bases génomiques en physiopathologies Spécialité BBMB Responsables Arnaud Menuet arnaud.menuet@cnrs-orleans.fr Jacques Pichon jacques.pichon@univ-orleans.fr Connaissance en physiologie, physiopathologie, 1- Une partie cet enseignement a pour but l étu s systèmes intégrés impliquant les mécanismes cellulaire et moléculaire au cours du développement et chez l adulte (cellules souches) dans le cadre s processus mnésique (mémoire & oubli), d apprentissage et plasticité cérébrale. 2- Une uxième partie (20h) sera consacrée à l étu pathologies humaines en mettant en relation la sémiologie et l étiologie la maladie : maladies neurodégénératives (Alzheimer ou Creutzfeldt-Jakob ou Huntington), cancers cérébraux, autisme et retard mental. L enseignement est assuré par s universitaires physiologistes et biologistes cellulaire et par s cliniciens du CHRO. Première session : RNE et RSE : CT 3h Secon session : RNE et RSE : CT 2h TD 4 h TP 44 h Permettre aux étudiants d appréhenr les outils génétiques les plus récents et leurs applications en particulier dans les domaines s pathologies humaines. Savoir appliquer les connaissances acquises au cours s modules théoriques et se confronter à l analyse résultats expérimentaux.. Responsables Céline Montécot Stéphane Mortaud Martine Decoville Connaissances en génétique et biologie moléculaire. celine.montecot-dubourg@univ-orleans.fr stephane.mortaud@univ-orleans.fr martine.coville@univ-orleans.fr 1- Approche expérimentale en génétique : étu d une maladie neurodégénérative humaine chez la drosophile, caractérisation du phénotype, recherche mutants enhancers ou suppresseurs, caractérisation par «plasmid rescue», séquençage et analyse banques données s gènes enhancers ou suppresseurs. 2- Culture et étu la spéciation in vitro cellules souches neurales 3- Traitement souris par un (s) xénobiotique(s) neuroactif(s) : conséquences comportementales et histologiques. Pathologies monogéniques : du défaut moléculaire à la physiopathologie. Plusieurs exemples maladies monogéniques communes seront développés. Obtention et utilisation s modèles animaux : souris, drosophile, C. elegans. Données obtenues à partir s modèles. La diversité s approches la cytogénétique et la génomique à haute résolution. Utilisation bases données (Ensembl, Omim,USCS,DGV...). Apport s génomes : Génomique comparative et le choix s modèles. Enseignement basé notamment sur s exemples pathologies du langage et la cognition. /TP/Oral Première session : RNE : CC(Rapports) ; RSE : CT(Oral) 15 min Secon session : RNE et RSE : CT(Oral) 30 min Première session : RNE : 100% ; RSE : Oral 100% Secon session : Oral 100% 21 22

5 SOM2SE02 Outils développement technologique, économie d entreprise SOM2MT02 Statistiques appliquées aux bio-industries Durée i1 60 h Passerelle MESC2A Durée i1 36 h Passerelle MESC2A Cours 60 h Sensibiliser aux problématiques gestion d une entreprise. Responsable Eline Nicolas eline.nicolas@univ-orleans.fr Introduction à la gestion et à l innovation dans les entreprises : l innovation au sein s PME, animée par Fabienne Ermel, actuellement directrice générale d une PME l agro-alimentaire dans la région Centre. Panorama s politiques d ai à l innovation en France. Les outils gestion au sein s entreprises : l objectif est montrer, à l ai d un exemple création d entreprise, comment la comptabilité et la finance aint à la prise décision et au pilotage d une entreprise (choix d investissements, calcul coûts, documents synthèse). Marketing : les étudiants vront présenter un projet marketing à partir d un thème donné par l enseignante, en utilisant la méthodologie marketing préalablement exposée ECTS 7 Première session : RNE : CT(E) 2h + CT(Oral) 30 min + CC (Rapport) ; RSE : CT(E) 3h Secon session : RNE et RSE : CT(E) 3h Première session : RNE : CC 66% + CT 33% ; RSE : CT 100% Secon session : CT 100% Cours 36 h Présentation méthos d analyse données et classification ; Savoir mettre en œuvre s plans d expériences et l analyse données brutes. Applications en biologie et procédés industriels. Traitement statistique sur ordinateur. Utilisation du langage R. Responsable Richard Emilion richard.emilion@univ-orleans.fr Calcul matriciel, la statistique scriptive (s rappels et compléments nécessaires sont dispensés). Analyse données : ACP, AFC, AFCM ; Classification : hiérarchies, Moyennes mobiles, arbres décision. Mini-projet présentant s applications dans les bio-industries. Plans d expériences ; Analyse données avec SAS et Excel. ECTS 5 Première session : RNE : CC ; RSE : CT(Oral) 30 min Secon session : RNE et RSE : CT oral Première session : RNE : CC 100% ; RSE : CT 100% Secon session : CT 100% 23 24

6 SOM3AG23 Anglais scientifique 2 Le semestre 3 et 4 Maquette s enseignements Intitulé ECTS Coeff. CM TD TP Semestre 3 Anglais scientifique Biostatistiques Synthèse documentaire et projet stage Filières professionnelles Immunologie Thérapies innovantes Bioimagerie Ateliers technologiques Aspects génétiques s pathologies Aspects stucturaux s pathologies Option BMC (6 ECTS) Option TBI (6 ECTS) Techniques expérimentales Biotechnologies végétales Semestre 4 Stage Détail s enseignements TD 24 h Semestre 3 Savoir présenter un rapport travail en anglais et commenter le déroulement d une expérimentation. Anglais SOM3BO01 Cours 24 h Semestre 3 Maîtrise s méthos spécialisées la statistique couramment utilisées dans les Sciences la vie. Initiation à la modélisation. Spécialités BBMB / BOPE Responsable Lupka Mihajlovska lupka.mihajlovska@univ-orleans.fr Bon niveau d ordre général pratique, orale et écrite, assez bonne connaissance la langue spécifique son domaine scientifique et technique. Faire un bilan du stage l année passée et résumer les visites d entreprises en anglais. Commenter le déroulement d un atelier technologique en anglais. Se préparer à s entretiens en anglais pour une embauche (thèse ou poste R&D). Première session : RNE et RSE : CC : DM + 15 min Oral + 1h30 Secon session : RNE et RSE : CT 1h30 Première session : 50% + Oral 50% Biostatistiques 2 : Modèle linéaire et analyses multivariées Spécialités BBMB / BOPE Responsable Franck Brignolas franck.brignolas@univ-orleans.fr UE Biométrie licence 3 (ou équivalent) et master 1. Intérêts du modèle linéaire : modèles et sous-modèles, méthos d estimations s paramètres du modèle linéaire. - Modèles linéaires ne comportant que s facteurs (ANOVA) : tests, interprétations et comparaisons multiples moyennes ; - Modèles linéaires ne comportant que s régresseurs : tests, interprétations, choix régresseurs ; - Modèles linéaires combinant facteurs et régresseurs ; - Analyses factorielles (analyse en composantes principales, analyse factorielle s correspondances, analyse discriminante). Première session : RNE et RSE : CT 1h Secon session : RNE et RSE : CT 1h 25 26