PARAVIEW. Les fonctionnalités principales

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1 PARAVIEW Les fonctionnalités principales 09 juillet C. Bligny

2 PLAN Introduction Les données sources Prise en main, pipeline, views Principaux filtres Animation Sélection Scripts python et automatisation Lancement à distance, en parallèle Pluggins

3 INTRODUCTION ParaView : Logiciel de visualisation de données 3D, basé sur la librairie VTK Logiciels similaires : VisIt, MayaVi Architecture :

4 DONNEES SOURCES - STRUCTURE Image (Uniform Rectilinear Grid) Unstructured Grid Rectilinear Grid Polygonal Mesh Structured / Curvilinear Grid

5 DONNEES SOURCES - FORMATS Formats VTK ( Legacy vtk vs xml (utilitaire de conversion : vtk2xml.py) Binaire, ascii Collections : Time series, parallel Composite dataset : multiblock ou hierarchique (AMR) Beaucoup d autres formats lus (cf liste suivante)

6 Les readers - Liste des readers 1 AVS UCD Reader 1 2 BYU Reader 2 3 CML Molecule Reader 3 4 COSMO Reader 4 5 CSV Reader 5 6 DEM Reader 6 7 ENZO AMR Particles Reader 7 8 EnSight Master Server Reader 8 9 EnSight Reader 9 10 Enzo Reader ExodusIIReader FLASH AMR Particles Reader FacetReader Flash Reader Fluent Case Reader Gaussian Cube Reader Image Reader JPEG Series Reader LSDynaReader Legacy VTK Reader MFIXReader Meta File Series Reader NetCDF CAM reader NetCDF MPAS reader NetCDF POP reader NetCDF Reader Nrrd Reader OpenFOAMReader PDB Reader PLOT3D Meta-File Reader PLOT3D Reader PLY Reader PNG Series Reader PVD Reader Parallel NetCDF POP reader Particles Reader Partitioned Legacy VTK Reader Phasta Reader RTXMLPolyDataReader Restarted Sim Exodus Reader Restarted Sim Spy Plot Reader SESAME Reader SLAC Data Reader SLAC Particle Data Reader STL Reader Spy Plot Reader TIFF Reader TIFF Series Reader Tecplot Reader Unstructured NetCDF POP reader VPIC Reader VRML Reader Wavefront OBJ Reader WindBlade reader XDMF Reader XML Hierarchical Box Data reader XML Image Data Reader XML MultiBlock Data Reader XML Partitioned Image Data Reader XML Partitioned Polydata Reader XML Partitioned Rectilinear Grid Reader XML Partitioned Structured Grid Reader XML Partitioned Unstructured Grid Reader XML PolyData Reader XML Rectilinear Grid Reader XML Structured Grid Reader XML UniformGrid AMR Reader XML Unstructured Grid Reader XYZ Reader prostar (STARCD) Reader spcth history reader

7 PRISE EN MAIN Organisation de l espace Déplacer la caméra (reset : ) souris mac souris molette trackpad mac Zoom molette/bton gauche molette/bton gauche molette / cmd click Tourner autour bton droit bton droit click Pivoter maj + bton droit maj + bton droit maj + click Translation maj + bton gauche click molette/maj bton gauche maj + click 2 doigts Les différents modes d affichage Color map Principe du pipeline

8 FILTRES - Contour

9 FILTRES - Contour + Comparative View Contour par température

10 FILTRES - Clip, Slice Slice Clip Clip - Show Plane

11 FILTRES - Stream Tracer Stream Tracer + Extract Surface + Clip Stream Tracer + Mask Point + Glyph

12 FILTRES - Stream Tracer Stream Tracer + Tube Stream Tracer + Ribbon

13 FILTRES - Warp by scalar

14 FILTRES - Tensor

15 FILTRES - Autres Calculs à partir des données : Calculator, Python calculator Modifier la géométrie : Transform, Clean to Grid, Smooth, Delaunay 2D & 3D, Decimate/Subdivide Normal generation, Cell Data to Point Data, Programmable filter Plot over time/line, threshold

16 Animation Temporelle Mouvement caméra Slice, Contour, Glyph Création de films : paraview, ou utilitaire type memcoder

17 Sélection, exploration des données Pourquoi Vérifier des valeurs, explorer ses données Extraction Label Comment Sélection manuelle via la vue 3D (2D) Edit/Find Data (v)

18 Dans l interface client Save state Custom filters Macros python Automatisation & Python Lancer Paraview en ligne de cde (paraview --script=macro.py) Sans l interface client : pvpython et pvbatch Si besoin, mettre à jour la variable PATH et la variable DYLD_LIBRARY_PATH (lib python). Ex sous mac : export PATH=/Applications/paraview.app/Contents/bin:$PATH export PATH=/Applications/paraview.app/Contents/MacOS:$PATH

19 DONNEES VOLUMINEUSES Utiliser la visualisation à distance, // Exemple Depuis tetta : module load Paraview / pvserver Depuis syrah : module load paraview-4.0.1/ module load GNU-4.7.2/openmpi / pvserver En local, utiliser le client paraview (même version) pour se connecter au server distant. Lancer paraview en // Depuis syrah : oarsub -I -l/nodes=1/core=4 / module load paraview / mpirun -np 4 pvserver Attention, depuis le client se connecter à grenache. En local : Paraview/preferences : cocher use multi core. Utiliser les réglages du LOD.

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