Parcours Biodiversité et Ecologie

Transcription

1 Parcours Biodiversité et Ecologie Emmanuelle PORCHER, Biologie Vincent BANSAYE, Maths appliquées

2 Les sciences de l environnement, à la croisée de quatre champs disciplinaires Sciences humaines et sociales (Anthropologie, Economie, Sociologie) Economie écologique, Ethnobiologie Environnement Mathéma:ques Climatologie Biogéochimie Ecophysiologie Sciences de la ma:ère (Physique, Chimie) Ecologie évolu:ve Ecologie fonc:onnelle Ecologie Sciences de la vie (Biologie moléculaire, génomique, physiologie )

3 Objectifs Utiliser les concepts de la biologie, de l écologie scientifique et la modélisation pour comprendre la dynamique de la biodiversité Impact des activités humaines Politiques publiques, pratiques des entreprises Conséquences pour les sociétés humaines Services écosystémiques, santé, éthique

4 Cours Période 1 BIO 555 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes MAP 556 Une introduction aux modèles mathématiques pour l écologie et l environnement Période 2 ou BIO 562 Génétique, reproduction, clonage et évolution BIO 564 Genomes: diversity, environment and Human health MAP 563 Modèles aléatoires en Ecologie et Evolution Période 3 - Stage BIO Biologie et Ecologie MAP Modélisation probabiliste et statistique Etc. Lieux : Laboratoires de recherche ou entreprises - Nombreuses possibilités hors de France (USA, Nouvelle Zélande, Australie )

5 BIO 555 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Emmanuelle Porcher Objectifs : utiliser les concepts de l écologie scientifique pour comprendre les impacts de l Homme sur la nature et leurs conséquences pour les sociétés humaines. Pressions humaines (Destruction des habitats, changements climatiques, pollutions, surexploitations ) Biodiversité Fonctionnement des écosystèmes (cycles de matière et d énergie)

6 BIO 562 Génétique, reproduction, clonage, évolution Philippe Monget Maladies génétiques, clonage, transgenèse, évolution

7 BIO Genomes: Diversity, environment and human health Hannu Myllykallio Principal objective : describe how genomes are sequenced and how obtained sequence information can be used to answer fundamental and applied biological problems Topics to be covered: - Interac:ons of genomes with environment (metagenomics, adapta:on to high temperature, salinity and γ- radia:on) - Molecular mechanisms underlying prokaryo:c and eukaryo:c genome diversity - Genome reduc:on and expansion - Inven:on of novel biological func:ons - Synthe:c genomes and their applica:ons (e.g. biofuel) - Economic impact of plant genomes - Personal genomics and human health, history of humans - Modern technologies for manipula:on and sequencing of DNA Biotechnological and biomedical applica:ons (biofuel produc:on, agrogenomics, personal diagnos:cs, sequencing and resurrec:on of dis:nct organism) Bioenginee ring and synthetic biology A=ack DNA replicati on and repair (DNA degrada:on) Geno mes Environment (heat, salinity, g- radia:on)

8 Stages Recherche fondamentale Facilitation des niveaux trophiques supérieurs par les plantes : émergence de dynamiques complexes Recherche appliquée Utilisation d une biomasse développée sur des sites miniers contaminés comme catalyseurs naturels de transformations chimiques à haute valeur ajoutée Investissement maternel: perspectives en démographie et en évolution Théorie de la coalescence et inférence de la démographie de populations Effet de la diversité du régime alimentaire sur l immunocompétence des abeilles Fonctions microbiennes et potentialités de dégradation de la cellulose dans les bioprocédés de méthanisation de déchets Étude de l'introduction du mildiou de la Vigne en Europe par l analyse de données génétiques Epidémiologie génétique des facteurs modulant l'infection par Mycobacterium tuberculosis en zone de forte endémie tuberculeuse Etude de la sélection des microalgues dans un photobioréacteur

9 Débouchés du parcours Biodiversité et écologie S adresse aux élèves intéressés par Réponse aux besoins d expertise et de recherche scientifique dans le domaine environnement - biodiversité Définition des politiques publiques (ministère écologie, agriculture ) Stratégie des entreprises (EDF, Véolia, Total ) Modélisation des processus écologiques Scénarios de biodiversité Pluridisciplinarité : développement des connaissances aux frontières des disciplines Economie, climatologie, sciences humaines et sociales

10 Débouchés du parcours Biodiversité et écologie 4 e année Métiers de l ingénieur et corps de l état IPEF, Mines Ecoles d ingénieurs : AgroParisTech, ENSTA Recherche Master Ecologie, Biodiversité, Evolution (UPMC, UPS, ENS, AgroParisTech, MNHN) Formations à l étranger Master Mathématiques pour les sciences du vivant (X, UPS, ENS Cachan, FMJH) + nombreux autres masters en France

11 S appuie sur les chaires Développement durable et Modélisation mathématique et biodiversité Deux objectifs Encourager des recherches développant la modélisation mathématique, en Écologie, Biodiversité et Évolution Développer un profil d ingénieurs polytechniciens ouvert aux spécificités des métiers de l environnement Moyens pour faire des stages, thèses, post-docs, organisation de séminaires