Rattachement recherche à I3M (Institut de Mathématiques et Modélisation de Montpellier) - Université Montpellier 2 (UMR CNRS 5149).

Transcription

1 Catherine TROTTIER Maître de Conférences - Classe Normale Université Paul Valéry - Montpellier 3 Section CNU : 26 Née le 10 avril 1971 à Tours (Indre-et-Loire) Nationalité française adresses professionnelles : Université Paul Valéry UFR4 - Département MIAp Route de Mende Montpellier cedex 5 Tél. : catherine.trottier@univ-montp3.fr trottier/ Déroulement de carrière : I3M - Université Montpellier 2 Case courrier Montpellier cedex Tél. : catherine.trottier@univ-montp2.fr Maître de conférences à l université Paul Valéry - Montpellier 3. Rattachement recherche à I3M (Institut de Mathématiques et Modélisation de Montpellier) - Université Montpellier 2 (UMR CNRS 5149) : Maître de conférences à l université Charles de Gaulle - Lille 3. Rattachement recherche au Gremars (Groupe de recherche : Modélisation appliquée à la Recherche en Sciences Sociales ) - Université Lille 3 (EA 2459) : Postdoctorat à l Inria Rhône-Alpes - Projet is2 (Inférence Statistique pour l Industrie et la Santé) sur un CERD avec EDF : 1994 : Doctorat de l Institut National Polytechnique de Grenoble - spécialité : mathématiques appliquées. Titre de la thèse : Estimation dans les modèles linéaires généralisés à effets aléatoires. Travail effectué au sein du Laboratoire de Modélisation et de Calcul (LMC - IMAG) et de l Inria Rhône-Alpes. Dir. : C. Lavergne Thèse soutenue le 2 Juillet 1998 à Grenoble. Jury : J.-L. Soler, M. Bonneu (rap.), J.-L. Foulley (rap.), A. Antoniadis. Financement bourse MESR ( ) puis contrat ATER ( ). Monitorat à l UJF (Université Joseph Fourier - Grenoble I), U.F.R. Informatique et Mathématiques Appliquées ( ). D.E.A. de Mathématiques Appliquées de l UJF - Department of Mathematics de l Imperial College à Londres. Diplôme d ingénieur ENSIMAG

2 Enseignement L1 psychologie Statistique descriptive univariée Cours en amphi depuis 2002 / sociologie / AES et TD Gestion d enseignement très gros effectif depuis 2005 (1400 étudiants en ) - Recrutement des vacataires Recrutement des vacataires Deug1 MASS Initiation aux probabilités Cours et TD de 2003 à 2005 Deug Misashs Statistique uni- et bi-variée Cours et TD de 2002 à 2004 Deug psychologie Statistique descriptive Cours en amphi de 1999 à 2002 et TD L2 psychologie Statistique bivariée TD de 2002 à 2010 L2 AES-misashs Initiation aux probabilités Cours et TD depuis 2010 L3 psychologie Initiation aux probabilités Cours en amphi depuis 2004 Gestion d enseignement gros effectif et TD (400 étudiants en ) L3 psychologie Inférence statistique Cours et TD depuis 2012 L3 AES-misashs Initiation au logiciel R Cours et TP depuis 2011 Licence psychologie Statistique inférentielle Cours en amphi de 1999 à 2002 et TD Maîtrise MASS Modèles linéaires Cours, TD, TP de 2002 à 2004 M1 IDS Statistique descriptive et inférentielle Cours, TD, TP de 2007 à 2009 sous excel École ENSIA-SIARC Statistique descriptive et inférentielle, Cours, TD, TP de 2005 à 2007 ingé. probabilités sous excel M2 SOI Statistique descriptive et inférentielle Cours, TD, TP sous R M2 Biostatistique Modèles linéaires mixtes Cours, TD, TP depuis 2010 Responsabilités administratives Responsable des sections 25 et 26 à l université Montpellier 3 : gestion des 2500 heqtd d enseignement, ventilation des services, recrutement vacataires, coordination (depuis 2008). Coordination des actions du plan Réussite en Licence pour l UFR 4 - université Montpellier 3 ( ). Participation aux commissions de spécialistes de l université Montpellier 3 (2007) et de l université d Aix-Marseille (2007) et au comité de sélection de l université Montpellier 1 (2013).

3 Thèmes de recherche Modèles linéaires mixtes (L2M) et modèles linéaires généralisés mixtes (GL2M). Choix de modèle dans les GL2M. Modélisation par mélange de GL2M. Modèles linéaires généralisés mixtes multiphasiques. Données longitudinales de comptage. Régression PLS. Régression multivariée de données non gaussiennes sur composantes. Développements appliqués en modélisation de l architecture des plantes. Développements appliqués en sciences du langage. Encadrement Co-encadrement de thèse : Marie-José Martinez Modèles linéaires généralisés à effets aléatoires : contributions au choix de modèle et au modèle de mélange - Université Montpellier : Florence Chaubert Combinaisons markoviennes et semi-markoviennes de modèles de régression. Application à la croissance d arbres forestiers. - Université Montpellier : Jean Peyhardi Combinaisons markoviennes et semi-markoviennes de modèles linéaires généralisés mixtes appliquées à lanalyse de larchitecture des plantes en relation avec des facteurs génétiques et environnementaux - Université Montpellier : Participation à la thèse d Harold Andres Guerrero Lopez Caractérisation de la voix de l enfant sourd appareillé et implanté cochléaire : approches acoustique et perceptuelle et proposition de modélisation - Université Montpellier 3. Participation Comité de thèse : Carine Véra Modèles linéaires mixtes multiphasiques pour l analyse de données longitudinales - Application à la croissance des plantes - Université Montpellier 2 - Dir. de thèse : Y. Guédon (CIRAD) - C. Lavergne (I3M) : Ciré Elimane Sall Estimation de l apparentement génétique par la méthode du maximum de vraisemblance composite avec prise en compte de l information spatiale - Université Montpellier 2 - Dir. de thèse : F. Mortier (CIRAD) - A. Gannoun (CNAM) : Olivier Taugourdeau Réponses des arbres aux gradients environmentaux : étude de la plasticité architecturale en milieu méditerranéen - Dir. de thèse : Caraglio Y., Sabatier S. (CIRAD) : Caroline Mwongera Pertes de semences dans les systèmes agricoles traditionnels en lien avec l irrégularité des pluies au Kenya - Dir. de thèse : Leclerc C., Dosba F. Encadrement stages master 2 et fin d études d école d ingénieur 2004 : L. Gourari Méthodes d analyse de données longitudinales de comptage appliquées à des suivis de croissance de caféiers. (stage M2) 2005 : T. Pierre-Joseph Analyse de données de comptage. Modélisation de l effet de la pluviométrie sur la croissance des caféiers. (stage M2) 2006 : M. Zouch Modèle de Poisson pondéré pour des données longitudinales de comptage sous- et sur- dispersées : Application aux données de suivi de croissance des plantes. (stage ingénieur) 2007 : M. Zouch Loi de Poisson pondérée et famille exponentielle bidimensionnelle. (stage M2)

4 2008 : I. Nefzi Estimation dans les modèles linéaires mixtes et les modèles linéaires généralisés mixtes. Application sur les données de pommiers. (stage ingénieur) 2010 : J. Peyhardi Modèles markoviens à transitions régies par des modèles linéaires généralisés mixtes (stage M2) Participation à la vie scientifique Participation au groupe de travail MODEST : Modélisation et dépendance structurelle - I3M. Participation comme collaborateur extérieur à l équipe Inria Virtual Plants dont la responsabilité est assurée par C. Godin. C est dans ce projet que s inscrit la problématique de la modélisation de données longitudinales de croissance des plantes. Reviewer pour les revues : Biometrics, Statistics and Computing, Journal de la Société Française de Statistique. Séjour à Piracicaba - Université de Sao Paulo (Brésil) du 10 au 17 novembre cours pour chercheurs et doctorants sur les modèles mixtes en collaboration avec C. Demetrio (ESALQ - USP - Brésil) et F. Mortier (CIRAD). Invitation de C. Démetrio (ESALQ - USP - Brésil) à Montpellier pour un mois (juin 2011). Cours modèles mixtes du 21 au 28 juin cours pour chercheurs et doctorants du CIRAD avec C. Demetrio (ESALQ - USP - Brésil) et F. Mortier (CIRAD). Réalisation d une étude pour l ICV (Institut Coopératif du Vin) en À partir des données rassemblées par l ICV, nous avons proposé avec C. Lavergne une modélisation permettant d une part de comparer les performances des bentonites commerciales pour la stabilisation protéique des vins et d autre part d optimiser le choix de la dose de bentonite utilisée en cours ou après fermentation alcoolique. Les résultats de cette étude ont été présentés au congrès de l office international du vin. Réalisation d une contre-expertise scientifique dans le cadre des affaires juridiques de l INRA en novembre Publications Publications en statistique [1] Bry X., Trottier C., Verron T., Mortier F. Supervised Component Generalized Linear Regression using a PLS-extension of the Fisher scoring algorithm, Journal of Multivariate Analysis (2013), pp [2] Chaubert - Pereira F., Guédon Y., Lavergne C., Trottier C. Markov and Semi-Markov Switching Linear Mixed Models Used to Identify Forest Tree Growth Components. Biometrics (2010), 66(3), pp [3] Martinez M.-J., Lavergne C., Trottier C. A mixture model-based approach to the clustering of exponential repeated data. Journal of Multivariate Analysis (2009), 100(9), pp

5 [4] Lavergne C., Martinez M.-J., Trottier C. Empirical Model Selection in Generalized Linear Mixed Effects Models Computational Statistics (2008), 23(1), pp [5] Diebolt J., Garrido M., Trottier C. Improving extremal fit: a Bayesian regularization procedure. Reliability Engineering and System Safety (2003), 82, pp [6] Trottier C. A quasi-score marginal approach in generalized linear mixed models. Statistics (2000), 33(4), pp [7] Lavergne C., Trottier C. Sur l estimation dans les modèles linéaires généralisés mixtes. Revue de Statistiques Appliquées (2000), XLVIII (1), pp [8] Trottier C. Estimation dans les modèles linéaires généralisés à effets aléatoires. Thèse de doctorat de l Institut National Polytechnique de Grenoble - juillet 1998 Publications appliquées [1] Dambreville A., Lauri P.-E., Guédon Y., Trottier C., Normand F. Deciphering structural and temporal interplays during the architectural development of mango trees, Journal of Experimental Botany (2013), doi: /jxb/ert105 [2] Lauri P.-E., Gorza O., Cochard H., Martinez S., Celton J.-M., Ripetti V., Lartaud M., Bry X., Trottier C. and Costes E. Genetic determinism of anatomical and hydraulic traits within an apple progeny Plant, Cell and Environment (2011), 34, pp [3] Lauri P.-E., Kelner J. J., Trottier C., Costes E. Insights into secondary growth in perennial plants: its unequal spatial and temporal dynamics in the apple (Malus domestica) is driven by architectural position and fruit load. Annals of Botany (2010) (doi: /aob/mcq006). [4] Normand F., Pambo Bello A. K., Trottier C. and Lauri P.-E. Is axis position within tree architecture a determinant of axis morphology, branching, flowering and fruiting? An essay in mango. Annals of Botany (2009), 103, pp [5] Lauri P.-E., Bourdel G., Trottier C. and Cochard H. Apple shoot architecture: evidence for strong variability of bud size and composition and hydraulics within a branching zone. New Phytologist (2008), 178, pp [6] Han H.-Hee., Coutand C., Cochard H., Trottier C. and Lauri P.-E. Effects of shoot bending on lateral fate and hydraulics: invariant and changing traits across five apple genotypes. Journal of Experimental Botany (2007), 58(13), pp [7] Lauri P.-E., Maguylko K. and Trottier C. Architecture and size relations: an essay in the apple (Malus x domestica) tree. American Journal of Botany (2006), 93(3), pp [8] Lauri P.-E., Trottier C. Patterns of size and fate relationships of contiguous organs in the apple (Malus domestica) crown. New Phytologist (2004), 163, pp

6 Communications [1] Peyhardi J., Trottier C., and Guédon Y. A unifying framework for specifying generalized linear models for categorical data, 28th International Workshop on Statistical Modeling, Italie (2013) [2] Peyhardi J., Costes E., Caraglio Y., Lauri P.-E., Trottier C., Guédon Y. Integrative models for analyzing jointly shoot growth and branching patterns, 7th International Workshop on Functional Structural Plant Models, Finlande (2013) [3] Bry X., Trottier C., Verron T., Mortier F. Supervised Component Generalized Linear Regression using a PLS-extension of the Fisher scoring algorithm, COMPSTAT 2012, Chypre (2012) [4] Trottier C., Bry X., Mortier F., Verron T. Component based Generalized Linear Regression using a PLS extended variant of the Fisher scoring algorithm, 57a Reunio anual da RBRAS, Brésil (2012) [5] Peyhardi J., Trottier C., and Guédon Y. GLM multinomial hiérarchique, 44èmes journées de statistique, Bruxelles, Belgique (2012) [6] Guerrero H., Mondain M., Amy De La Bretèque B., Serrafero P., Trottier C., Barkat-Defradas M. Etude comparative de la voix de l enfant implanté cochléaire et de l enfant sourd appareillé de 5 à 13 ans, ORPHEO, Campus orthophonique d été : Surdité et Orthophonie, La Grande Motte - France (2010) [7] Guerrero H., Mondain M., Amy De La Bretèque B., Serrafero P., Trottier C., Barkat-Defradas M. Identification et caractérisation acoustique et physiologique des troubles vocaux manifestés chez l enfant implanté cochléaire, 3 Journées de Phonétique Clinique, Aix en Provence - France (2009) [8] Trottier C., Lavergne C., Guédon Y., Zouch M. Weighted Poisson mixed model for underdispersed longitudinal count data, 40èmes jounées de statistique, Ottawa, Canada (2008) [9] Chaubert-Pereira F., Guédon Y., Lavergne C., Trottier C. Semi-Markov switching linear mixed model for analyzing forest tree development, International Biometric Conference (IBC), Irlande (2008) [10] Chaubert - Pereira F., Guédon Y., Lavergne C., Trottier C. Estimating Markov and semi-markov switching linear mixed models with individual-wise random effects COMPSTAT 2008, 18th Symposium of IASC, Volume II, pp (2008) [11] Chaubert F., Caraglio Y., Lavergne C., Trottier C., Guédon Y. A statistical model for analyzing jointly growth phases, the influence of environmental factors and interindividual heterogeneity. Applications to forest trees. 5th International Workshop on Functional-Structural Plant Models (2007), Napier, New Zealand, p. 43 [12] Chaubert F., Guédon Y., Lavergne C., Trottier C. Combinaison markovienne de modèles linéaires généralisés pour données structurées en phases. 39èmes Journées de Statistique (SFDS), Angers - France (2007)

7 [13] Martinez M.-J., Lavergne C. and Trottier C., Finite mixture model for exponential repeated data. International conference on Statistical Latent Variable Models in the Health Sciences, Perugia, Italie (2006) [14] Trottier C., Lavergne C. Une hétérogénéité dans les modèles linéaires généralisés mixtes, 30èmes journées de statistique, Rennes - France (1998) [15] Lavergne C. & Trottier C. From a conditionnal to a marginal point of view in GL2M in : Good Statistical Practice C.E.Minder & H. Friedl (editors) pp , Proceedings of the 12th International Workshop on Statistical Modelling - Suisse (1997) [16] Trottier C. Les modèles linéaires généralisés mixtes : extension de la méthode GAR, 29èmes journées de statistique, Carcassonne - France (1997) [17] Trottier C., Lavergne C. Estimation des composantes de la variance dans un GL2M, 28èmes journées de statistique, Canada (1996)