Outils de recherche et de gestion bibliographique

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1 Outils de recherche et de gestion bibliographique Pr. E. H. TAHRI Laboratoire de physiopathologie et Génétique Moléculaire Journée : Réflexion et Sensibilisation sur la Production Scientifique Universitaire FSBM, 21 Décembre 2010

2 Recherche bibliographique Comment rechercher un document? 1. Catalogues : Instrument permettant d'identifier et de localiser les documents d'une bibliothèque ou d un centre de documentation. Exemple :» SUDOC : pour les bibliothèques françaises de l'enseignement supérieur (WWW.SUDOC.abes.fr) ;» Toubkal : catalogue national des thèses et mémoires (http://toubkal.imist.ma/).

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5 Recherche bibliographique 2. Bases de données : Ensemble de données structuré, généralement en champs, organisé en vue de son utilisation par des programmes informatiques ; L'organisation (ou structuration) des données permet d'effectuer des recherches sur ces données Exemple :» PubMed (National Library of Medicine (NLM) du NIH) : Créée en 1836, plus de 7 millions de documents. Accès gratuit depuis Environ revues biomédicales sont indexées depuis La plupart (88 %) sont en Anglais; les périodiques français recouvrent à peu près 3 % des documents. PubMed contient plus de 16 millions de références bibliographiques, avec près de nouvelles chaque année.

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7 Recherche bibliographique 2. Bases de données : Exemple :» Hinari (OMS) : programme d'accès à la recherche en santé ; accès gratuit, ou à très bas prix, aux grands périodiques couvrant les domaines de la médecine biologique et des sciences sociales ; établissements publics et à but non lucratif dans les pays en voie de développement.

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9 Hinari : QUI EST ADMIS à PARTICIPER? Les établissements admis à participer et dont le personnel et les étudiants auront accès aux périodiques sont : les universités, les instituts de recherche de santé et de recherche médicale, les écoles de médecine, de soins, de santé publique, pharmacie et école dentaire; les hôpitaux universitaires les bureaux de gouvernement fonctionnant dans le secteur de la santé, et les bibliothèques médicales.

10 Hinari : COMMENT PARTICIPER? Les établissements dans les pays avec un RNB par habitant en-dessous de $1250 disposeront d'un accès gratuit à toutes les sources d'information. Les établissements dans les pays avec un RNB par habitant entre $1250 et $3500 disposeront d'un accès à prix réduit en payant une souscription annuelle de 1000 dollars. (Maroc)

11 Recherche bibliographique 2. Bases de données : Exemples :»CISMEF (catalogues et Index des sites médicaux en français)»sciencedirect (Elsevier) : Accès via Marwan»Scopus (Elsevier) : Accès via Marwan»RefDoc (Inist-CNRS)».

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13 Ressources et sites utiles : Infosphère, Apprendre à faire une recherche d'information efficace, Service des bibliothèques de l'uqam, CERISE, Conseils aux Etudiants pour une Recherche d'information Spécialisée Efficace, URFIST de Paris, SAPRISTI, des Sentiers d'accès et des Pistes de Recherche d'information Scientifiques et Techniques sur Internet, Doc'INSA, INSA de Lyon, Aeris, Aide aux étudiants pour la recherche d'information scientifique, Guide de méthodologie documentaire, Université Rennes 2, DILIWEB : le plus court chemin vers le Net Université du Havre,

14 Créer et gérer ses références bibliographiques Zotero PubMed EndNote BibTex

15 Les logiciels de gestion de références bibliographiques Permettent, à l'issue de la recherche documentaire dans les bases de données scientifiques, l'intégration des références depuis une publication et la création d une bibliographie. Plus de 70 logiciels

16 Une grande famille : Logiciel clients gratuits BiblioExpress BiblioPC10 Papyrus Logiciels open source Wikindx Refbase JabRef Bibus BiblioOpera BibTex Logiciels clients payants Biblioscape EndNote x4 Reference Manager Logiciels en ligne Cannotea (gratuit) HotReference (gratuit) RefWorks EndNote Web Logiciels inclus dans un navigateur Zotero (Firefox)

17 Zotero Zotero est un logiciel libre et gratuit vous permettant de gérer et partager vos références ou réaliser des bibliographies. Ce logiciel nécessite l'utilisation du navigateur Mozilla Firefox Une documentation complète et abondante existe en ligne.

18 Zotero Enregistrer des références 1. Créer manuellement une référence 2. Importer des références depuis une base de données 3. Organiser ses références Générer une bibliographie dans Word, OpenOffice, 1. Citer des références 2. Générer une bibliographie à partir des références citées dans le texte Fonctions avancées 1. Annoter ses références bibliographiques 2. Créer des collections dynamiques

19 Zotero : L interface

20 Zotero Lors d une recherche bibliographique dans un catalogue (type SUDOC) ou une base de données (Pubmed ), Zotero repère automatiquement les références : Sur la page d affichage des résultats, une icône apparaît dans la barre d adresse du navigateur ; l icône varie en fonction du type de document : La liste des catalogues et bases de données compatibles avec Zotero est disponible à l adresse suivante :

21 EndNote x4 (Version 14) C est un logiciel de gestion individuelle de références bibliographiques constituant des bases de données nommées Libraries (ou bibliothèques) 4 Fonctionnalités principales : 1. Importation de références ; 2. Constitution de bibliothèques et gestion de références ; 3. Exportation et édition ; 4. Il est possible de faire des recherches de références en ligne directement depuis EndNote.

22 EndNote x3

23 BibTex C est un logiciel et un format de fichier conçu par Oren Patashnik et Leslie Lamport en 1985 pour LaTeX. Il sert à gérer et traiter des bases bibliographiques.

24 Il faut créer un title = {le titre de la publi}, author = {liste des auteurs}, journal = {journal}, volume* = {volume}, year = {année}, pages* = {pages concernées} month = {mois} note* = {note} } author = {liste des auteurs}, title = {titre}, year = {année}, publisher= {éditeur}}

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