LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) Equipe AMES : «Approches Moléculaires, Environnement-Santé»

Transcription

1 LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) Equipe AMES : «Approches Moléculaires, Environnement-Santé» Responsable: Prof. Marianne GRABER Bâtiment Marie Curie, Avenue Michel Crépeau, La Rochelle cx1 Tel : , mgraber@univ-lr.fr, TUTELLES DU LABORATOIRE: Université de La Rochelle CNRS PERSONNELS PERMANENTS : (pour l équipe AMES) Nombre d enseignants-chercheurs 18, chercheurs 0, ingénieurs 1, techniciens 1 ENZYMES UTILISEES SOURCES TYPE DE REACTIONS APPLICATIONS osidases, estérases, lipases, déhalogénases,oxydoréductases commerciales santé, chimie fine,,cosmétique DOMAINE(s) DISCIPLINAIRE(s) chimie bioorganique, bioprocédés, biochimie, modélisation moléculaire THEMES DE RECHERCHE : Développement de nouvelles voies de synthèse «propres» de molécules d intérêt biologique, extraction de ces molécules à partir du milieu marin ou terrestre, compréhension des mécanismes d action de molécules bioactives (hydrolases, peptides). Les activités de l équipe peuvent se décomposer en deux axes : - L axe 1 : «Synthèse, Extraction, Modification», dans lequel on cherchera à obtenir des molécules d intérêt par des synthèses enzymatiques ou chimiques écocompatibles, ou par éco-extraction à partir de différentes niches marines (microalgues, mollusques, biofilm des vasières intertidales); - L axe 2 : «Mécanismes d Action et Dysfonctionnements» dans equel on visera à une meilleure compréhension des mécanismes par lesquels certaines biomolécules participent à la régulation de processus biologiques fondamentaux, dans des environnements cellulaires normaux ou pathologiques. EQUIPEMENTS : Microbiologie : PSM, incubateur CO2 Enzymologie : LC/MS, GC/MS, IGC, HPLC, GC, LC/MS haute résolution Biologie moléculaire : 4 thermocycleurs, 1 PCR quantitative Agilent, 1 séquenceur à plaque Li-Cor, 1 PFGE Bio-Rad, 1 système Western-blot Bioprocédés : réacteurs enzymatiques continus en milieu solide/gaz Modélisation moléculaire : suite logicielle Discovery Studio d Accelrys Synthèse organique : Parc de 7 fours micro-ondes, système de synthèse sur support solide, IR, polarimètre CONTRATS PUBLICS ANR Expenantio, Ligue contre le cancer CONTRATS INDUSTRIELS ET PRESTATIONS IDCaps (contrat Cifre), Seprosys (contrat Cifre), Contrats industriels LEA Nature,

2 PUBLICATIONS RECENTES Le Joubioux F, Ben Henda Y, Bridiau N, Achour O, Graber M, Maugard T (2013) The effect of substrate structure on the chemoselectivity of Candida antarctica lipase B-catalyzed acylation of amino-alcohols. J Mol Catal B: Enzym 85 86: Syren P-O, Le Joubioux F, Ben Henda Y, Maugard T, Hult K, Graber M (2013) Proton shuttle mechanism in the transition state of lipase catalyzed N-acylation of amino alcohols. ChemCatChem (accepted) Bridiau N, Maugard T (2012) Bacillus circulans β-galactosidase catalyses the synthesis of N- acetyl-lactosamine in hydro-organic media via a steady-state ordered Bi Bi reaction mechanism. J Mol Catal B : Enzym 77:24-31 Chaput L, Marton Z, Pineau P, Domon L, Tran V, Graber M, Enhancing the Enantioselectivity of CALB by substrate imprinting : a combined experimental and molecular dynamics simulation model study. J Mol Catal B : Enzym (DOI information : /j.molcatb ) Chaput L, Sanejouand YH, Balloumi A, Tran V, Graber M (2012) Contribution of both catalytic constant and Michaelis constant to CALB enantioselectivity ; use of FEP calculations for prediction studies, Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic 76 : Bridiau N, Maugard T (2011) A comparative study of the regioselectivity of the beta-galactosidases from Kluyveromyces lactis and Bacillus circulans in the enzymatic synthesis of N-Acetyllactosamine in aqueous media. Biotechnology Progress 27 : Goubet I, Maugard T, Lamare S, Graber M (2011) Biocatalyse solide/gaz. Techniques de l Ingénieur BIO : 1-12 Le Joubioux F, Achour O, Bridiau B, Graber M, Maugard T (2011) Kinetic study of 2-butanol O- acylation and sec-butylamine N-acylation catalyzed by Candida antarctica lipase B. J. Mol. Catal. B : Enzym. 70 :

3 LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) Equipe AMES : «Approches Moléculaires, Environnement-Santé» Responsable: Prof. Marianne GRABER Bâtiment Marie Curie, Avenue Michel Crépeau, La Rochelle cx1 Tel : , mgraber@univ-lr.fr, SUPERVISION : University of La Rochelle - CNRS PERMANENT STAFF : (for the team AMES) Number of 18 teacher-researchers, engineer 1, technician 1 USED ENZYMES SOURCES TYPE OF REACTIONS APPLICATIONS osidases, esterases, lipases, dehalogenases,oxydoreductases commercial Health, fine chemistry, cosmetology DISCIPLINES : Bioorganic chemistry, bioprocess, biochemistry, molecular biology RESEARCH TOPICS : We are trying to develop new eco-aware paths for chemical or enzymatic synthesis as well as bioactive molecules eco-extraction methods. We also study the metabolic dysfunction observed in pathological cellular environments, with a particular focus on hydrolytic enzyme action mechanisms in these pathologies. EQUIPMENTS : Microbiology : PSM, incubator CO2 Enzymology : LC/MS, GC/MS, IGC, HPLC, GC, high resolution LC/MS Molecular Biology : 4 PCR, 1 quantitative PCR quantitative,1 system Western-blot Bioprocess : Continuous solid/gas enzymatic reactors Molecular modelling : software Discovery Studio (Accelrys) Organic synthesis : 7 micro-wave heaters, system for synthesis on solid support, IR, polarimeter PUBLIC GRANTS ANR Expenantio, Ligue contre le cancer INDUSTRIAL GRANTS IDCaps (contrat Cifre), Contrats industriels LEA Nature, 5 à 8 RECENT PUBLICATIONS Le Joubioux F, Ben Henda Y, Bridiau N, Achour O, Graber M, Maugard T (2013) The effect of substrate structure on the chemoselectivity of Candida antarctica lipase B-catalyzed acylation of amino-alcohols. J Mol Catal B: Enzym 85 86:

4 Syren P-O, Le Joubioux F, Ben Henda Y, Maugard T, Hult K, Graber M (2013) Proton shuttle mechanism in the transition state of lipase catalyzed N-acylation of amino alcohols. ChemCatChem (accepted) Bridiau N, Maugard T (2012) Bacillus circulans β-galactosidase catalyses the synthesis of N- acetyl-lactosamine in hydro-organic media via a steady-state ordered Bi Bi reaction mechanism. J Mol Catal B : Enzym 77:24-31 Chaput L, Marton Z, Pineau P, Domon L, Tran V, Graber M, Enhancing the Enantioselectivity of CALB by substrate imprinting : a combined experimental and molecular dynamics simulation model study. J Mol Catal B : Enzym (DOI information : /j.molcatb ) Chaput L, Sanejouand YH, Balloumi A, Tran V, Graber M (2012) Contribution of both catalytic constant and Michaelis constant to CALB enantioselectivity ; use of FEP calculations for prediction studies, Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic 76 : Bridiau N, Maugard T (2011) A comparative study of the regioselectivity of the beta-galactosidases from Kluyveromyces lactis and Bacillus circulans in the enzymatic synthesis of N-Acetyllactosamine in aqueous media. Biotechnology Progress 27 : Goubet I, Maugard T, Lamare S, Graber M (2011) Biocatalyse solide/gaz. Techniques de l Ingénieur BIO : 1-12 Le Joubioux F, Achour O, Bridiau B, Graber M, Maugard T (2011) Kinetic study of 2-butanol O- acylation and sec-butylamine N-acylation catalyzed by Candida antarctica lipase B. J. Mol. Catal. B : Enzym. 70 :

5