URFIST de LYON / avril 2011 / Frédérique Cohen-Adad

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1 URFIST de LYON / avril 2011 / Frédérique Cohen-Adad 1

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3 écrits à l origine (début des années 80) pour la communauté scientifique et plus largement pour toute personne utilisant une grande quantité de documents une histoire liée au développement du web et des accès aux sources : avec la multiplication des bases de données en ligne (années 70) et des catalogues électroniques, puis des journaux électroniques en ligne, l accès au texte intégral, les moteurs de recherche, aujourd hui les ressources du web 2.0 rendus indispensables par l essor de la production scientifique : explosion du nombre de documents disponibles, multiplicité des formats (texte, image, multimedia, ) publier, une activité vitale pour le chercheur 3

4 l essentiel : organiser ses documents sous forme de références bibliographiques dans une base de données personnelle alimenter automatiquement cette base de données avec les références bibliographiques trouvées sur le web intégrer ces références automatiquement dans un texte sous forme de citations et générer une liste bibliographique et les plus : le partage de références en ligne le texte intégral et la gestion des métadonnées la capture directe de pages web nomadisme, accès mobiles et tablettes synchronisation des données 4

5 une terminologie multiple : logiciels de gestion bibliographique, logiciels de gestion de références bibliographiques, logiciels bibliographiques, reference management so3ware, personal reference management so3ware, bibliographic management so3ware, bibliographic so3ware, une définition (Carole Zweifel dans la Revue électronique suisse de science de l'information (RESSI) n 7 mai 2008) : "Le logiciel de gestion de références bibliographiques permet de gérer des références bibliographiques au sein d une base de données : description de chaque référence (article, monographie, page web, thèse, ) à l aide d une grille de catalogage, importation des références depuis des bases bibliographiques en ligne (Medline, ArXiv, INSPEC, Citeseer ), recherches dans les références, regroupement selon plusieurs critères puis création automatique d une liste bibliographique selon les exigences de présentation spécifiques aux diverses publications scientifiques." C. Zweifel. Logiciels de gestion de références bibliographiques : citons le libre! RESSI, no 7, mai

6 les capacités de gestion et d organisation des références bibliographiques les fonctions d importation de ces références les fonctions d exportation 1) l édition dans les traitements de texte 2) l échange de références entre logiciels bibliographiques et les "plus" le logiciel en pratique les développements liés au web 2.0 6

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17 propriétaire ou libre? logiciel libre logiciel gratuit je choisis le logiciel libre (open source) et je suis prêt à investir un peu de temps pour comprendre le code source et le modifier selon mes propres besoins je rentre dans une communauté (développeurs et utilisateurs) avec le logiciel libre : pérennité, mises à jour? je choisis le logiciel gratuit en tenant compte qu il peut avoir des fonctionnalités limitées (choix temporaire : version d appel vers le logiciel propriétaire payant) 17

18 libre (open source) propriétaire Aigaion Bibdesk Bibus Connotea JabRef RefBase Wikindx Zotero gratuit 2collab CiteULike EndNote Web Mendeley WizFolio avec capacités limitées (version payante pour ) payant Biblioscape Citavi EndNote Papers Reference Manager RefWorks Sente WizFolio 18

19 disponibilité des références? je voyage beaucoup et souhaite avoir mes références accessibles en permanence je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous souhaitons partager des références dans un espace commun : logiciel orienté réseau social, logiciel avec intégration web " je gère les publications d un centre de recherche et les publie sur le web : logiciel avec un format d export html, interface web avec la gestion des droits d accès (public, privé) je suis conscient(e) qu il peut y avoir des difficultés d accès aux documents déposés sur un serveur : maintenance, débits de connexion, spams, 19

20 en ligne (sur serveur) indépendant de l OS 2collab Aigaion CiteULike Connotea EndNote Web RefBase Reference Manager RefWorks Wikindx WizFolio local (sur son poste) dépendant de l OS Bibus Bibdesk M Biblioscape W Citavi W EndNote JabRef Mendeley Papers M Reference Manager W Sente M Zotero + interface web W Windows uniquement M MacOS uniquement 20

21 choix de logiciels représentatifs les plus anciens : EndNote et Reference Manager uniquement sur serveur : RefWorks et EndNote Web hybrides : Zotero, Mendeley et Papers uniquement réseaux sociaux : CiteULike et Connotea critères de comparaison la recherche de documents la gestion des références le partage des documents l édition synthèse des publications de Wikipedia. Comparison of reference management so3ware, décembre 2010 Fenner M. Reference manager overview, PLosBlogs, septembre 2010 Information Retrieval Services (IVS-BM), Max Planck Institute of Biochemistry. A Comparison of Bibliographic Management Systems. février 2010 Dell Orso. Bibliography Management So3ware, janvier 2010 et de tests personnels références complètes dia 33 21

22 recherche documentaire j utilise beaucoup de sources différentes et je veux intégrer facilement toutes les documents trouvés : logiciel avec des formats d importation en grand nombre, logiciel avec un plugin de type web import je veux interroger les catalogues de bibliothèques et importer les références automatiquement : logiciel capable d établir une connexion de type z39.50, logiciel avec collecte automatique depuis des sites compatibles je veux être à jour dans mes thématiques en permanence : logiciel avec des systèmes de veille automatique (fils RSS, alertes, ) 22

23 EndNote Reference Manager RefWorks EndNote Web Zotero Mendeley Papers CiteULike Connotea import depuis les BD web importer connexions Z plugin navigateur RefGrab-it + intégré avec Firefox + import to - + post to import PDF notices import DOI, ISBN capture de pages web fils RSS web modification/création filtres et connexions + add to

24 organisation - gestion des références j ai beaucoup de documents et je veux les retrouver et les trier facilement : logiciel offrant la possibilité d avoir plusieurs collections (bibliothèques), des groupes de références, une interface de recherche avancée j ai des documents pdf et je souhaite les référencer dans ma bibliothèque : logiciel acceptant les fichiers attachés, logiciel capable de générer des notices à partir des pdf je dois intégrer des données dans les références : logiciel avec des notices dont les champs sont facilement modifiables, possibilités de modifications en lot 24

25 EndNote Reference Manager RefWorks EndNote Web Zotero Mendeley Papers CiteULike Connotea nombre de bibliothèques ouverture/travail simultanés illimité illimité nombre max de documents illimité illimité illimité modification/création champs des notices et types de documents 100 Mo web 1 Go en version gratuite?? illimité groupes (5) groupes dynamiques gestion des doublons à l'import recherche avancée en local + en local - 5 champs au choix + à l'import - + à l'import + en local - syntaxe à connaître recherche texte intégral annotations PDF, capture web page web

26 disponibilité je voyage beaucoup et souhaite avoir mes références accessibles en permanence : logiciel avec intégration web et synchronisation des données, accès PDA et tablettes partage de références je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous souhaitons partager des références dans un espace commun : logiciel orienté réseau social, logiciel avec intégration web, possibilité de gestion des droits d accès et d écriture " je gère les publications d un centre de recherche et les publie sur le web : logiciel avec un format d export html, interface web avec la gestion des droits d accès (public, privé) compatibilité je travaille avec de nombreux collaborateurs qui utilisent différents logiciels clients (sur poste), nous voulons échanger facilement nos données : logiciel avec des formats d importation/ exportation en grand nombre 26

27 EndNote Reference Manager RefWorks EndNote Web Zotero Mendeley Papers CiteULike Connotea formats d import/export BibTeX, XML, RIS,MODS, groupes de références partagées sur le web gestion des droits lecture/écriture sur mobiles PDA, iphone, ipad ( ) ( ) ( ) - / + version réseau + version réseau réseau ordi ? -? synchronisation / - / / / / communauté d usagers forum thématique, liste de diffusion Livfe

28 écriture citations et listes bibliographiques j utilise LaTeX et importe mes documents au format BibTeX : logiciel capable de traiter ce format (importation/exportation des références) je souhaite utiliser des styles qui me sont propres : un logiciel ayant des formats d édition sur lesquels on peut intervenir (création/ modification) je veux un logiciel compatible avec mon traitement de texte pour insérer facilement les citations dans le texte et créer les listes bibliographiques automatiquement : logiciel avec plugins pour Microso3 Word, OpenOffice.org, NeoOffice, Pages 09, 28

29 EndNote Reference Manager RefWorks EndNote Web Zotero Mendeley Papers CiteULike Connotea nombre de styles 0 création/modification de styles plugin intégré dans le traitement de texte / Word / OpenOffice / NeoOffice / Pages / LaTeX/BibTeX / également modification/création : Bibus, Refbase également : plugin Word : WizFolio OpenOffice : Bibus, JabRef, WizFolio Pages 09 : Sente LaTeX/BibTeX : Bibdesk, Bibus, Citavi, JabRef, Refbase, Sente 29

30 des limites de plus en plus floues entre les logiciels : différences ou complémentarité? ainsi au sens strict, 2collab, CiteULike et Connotea ne sont pas totalement des logiciels de gestion de références bibliographiques car ils n ont pas de système d intégration de références dans un traitement de texte (même si 2collab et CiteULike peuvent générer une liste bibliographique). Cependant ils ont une vraie place dans le contexte de communautés fondées sur les échanges de bibliographies. ne pas oublier que ce sont des outils en perpétuel développement qui évoluent en permanence 30

31 dualité entre un logiciel simple d utilisation, tout en un, mais de ce fait aux fonctionnalités figées et non modulables un logiciel plus complexe au premier abord et nécessitant un temps d apprentissage, mais beaucoup plus configurable et d une grande souplesse d utilisation, en particulier pour l organisation des données et l édition bibliographique être attentif à intervenir le moins possible manuellement dans les notices un logiciel avec une grille de description de notices correcte pour tous les types de documents que l on utilise un logiciel avec les capacités d import correctes pour toutes ses propres sources d intérêt pas de données sensibles sur un serveur et sauvegardes régulières " 31

32 proposition choisir le logiciel avec les capacités d importation les meilleures en fonction des sources de documents d intérêt (BD, catalogues, pages web, sites d éditeurs, ) utiliser les fonctions d échanges de références (formats d export/ import) entre logiciel pour transférer les bibliothèques dans un logiciel ayant les meilleures capacités d édition des références avoir une bibliothèque principale contenant toutes les références dans un logiciel puissant en terme de gestion/organisation créer un groupe ouvert dans un logiciel en ligne pour partager ses thèmes d intérêt et échanger sa bibliographie avec d autres utilisateurs ou accepter un compromis! 32

33 Comparison of reference management so3ware. Wikipedia, décembre A Comparison of Bibliographic Management Systems. Max Planck Institute of Biochemistry, Information Retrieval Services (IVS-BM), février Reference manager overview. M Fenner, PLosBlogs, septembre Bibliography Management So3ware. with a Detailed Analysis of Some Packages: Bibus, EndNote Web, RefWorks, ProCite, EndNote, Reference Manager. Dell Orso, janvier PLUME. Zoom sur la gestion de références bibliographiques dans PLUME. janvier accès aux fiches logiciels de BibTeX-Bibus-JabRef-Wikindx- Zotero Evaluation et comparaison de logiciels de gestion de références bibliographiques. Projet ECLORE, Juin CiteUlike, Connotea, BibSonomy et 2collab. JP Lardy, URFIST de Lyon, mai ID_FICHE=198879&OBJET=0017&ID_FICHIER=31181 Introduction aux outils de gestion bibliographique. ML Malingre, URFIST de Rennes, mai 2009 avec une présentation de EndNote, Zotero, RefWorks et CiteULike 33

34 2collab Aigaion Biblioscape BibDesk BibTeX Bibus Citavi CiteULike Connotea EndNote EndNote Web JabRef Mendeley Papers refbase Reference Manager RefWorks Sente http: Wikindx WizFolio Zotero 34

35 EndNote 1988 propriétaire payant, sur poste Connotea 2004 gratuit, en ligne Zotero 2006 libre gratuit sur poste et en ligne EndNote Web 2006 propriétaire gratuit avec le WoK, en ligne Mendeley 2008 propriétaire gratuit/payant, sur poste et en ligne 35