Recherche d articles scientifiques PubMed et Cochrane

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1 Recherche d articles scientifiques PubMed et Cochrane PHT-2008 Évaluation critique de la littérature scientifique Marie-Claude Laferrière Bibliothécaire-conseil en sciences de la santé 30 Janvier 2017 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 1

2 Plan de la présentation Les opérateurs booléens Méthodes de recherche > Vocabulaire libre ou vocabulaire contrôlé Interroger PubMed et Cochrane Library BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 2

3 Les opérateurs booléens BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 3

4 Les opérateurs booléens Rappel Définissent les relations entre les termes ou les groupes de termes. Très utiles afin de raffiner une requête : inclusion ou exclusion d éléments précis. AND OR NOT BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 4

5 Les opérateurs booléens Rappel AND (ET) Limite la recherche à l intersection des concepts Cancer Douleur OR (OU) Unit les différents concepts Exercices Activité physique NOT(SAUF) Exclut un ou plusieurs concepts non souhaités Précise la recherche, mais ATTENTION Adultes Personnes âgées BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 5

6 Méthodes de recherche Vocabulaire libre (Mots-clés) Vocabulaire contrôlé (Sujets) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 6

7 Recherche vocabulaire libre (mots-clés) Rappel Peut s effectuer dans tous les mots ou expressions de la notice d un article scientifique. Lors d une recherche vocabulaire libre (mots-clés), il est recommandé de limiter celle-ci au titre et au résumé. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 7

8 Recherche contrôlé (sujet ou par descripteurs) Rappel S effectue uniquement dans le champ Sujets de la notice d un article scientifique. Les termes ou les expressions présents dans le champ Sujets sont choisis à partir d une liste préétablie de termes (thésaurus).» Plusieurs descripteurs par référence.» Peu importe le vocabulaire utilisé par les auteurs, les descripteurs attribués pour les mêmes sujets sont identiques. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 8

9 Recherche contrôlé (sujet ou par descripteurs) Rappel La plupart des bases de données publient un thésaurus qui est intégré au logiciel de la base. Medline CINAHL Cochrane SPORTDiscus PsycINFO Embase MeSH (Medical Subject Headings) Descripteurs CINAHL MeSH (même que Medline) Sports Thesaurus Thesaurus (sous l onglet «Term Finder») Emtree BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9

10 Interroger PubMed et Cochrane Library BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 10

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12 Accès Cliquez sur PubMed BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 12

13 Medline Base de données bibliographiques Dépouille et indexe plus de revues biomédicales provenant d environ 80 pays pour un total de plus de 26 millions de références d articles. Références des années 1940 à aujourd hui. Documents principalement en anglais (environ 40 langues). Interrogation uniquement en anglais»titres, résumés et descripteurs toujours en anglais, même si l article est en langue étrangère. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 13

14 PubMed vs Medline PubMed Medline PubMed EBSCO Ovid Web of Knowledge Interface gratuite pour tous Contenu» Medline (Références avec MeSH) +» Articles en prépublication qui ne sont pas encore indexés ou publiés (PubMed in-process)» Articles datant d avant l acceptation du périodique dans Medline (As supplied by publisher)» Articles provenant de revues indexées sans toutefois couvrir un sujet en santé (ex. : astrophysique)» Articles provenant de revues faisant partie de PubMed Central, mais sans être inclus dans Medline BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 14

15 Trouver et traduire du vocabulaire Traduire les termes de recherches Dictionnaires gratuits en ligne HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF) Traduit le MeSH de Medline Grand dictionnaire terminologique (OQLF) TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada) Disponibles : Explorer par discipline > Physiothérapie> Atlas, dictionnaires et encyclopédies Dictionnaire et ressources sélectionnés > Sélection de dictionnaires et autres ressources > Dictionnaires, grammaires et encyclopédies en ligne Autres sources Notes de cours, manuels, articles scientifiques et vous! BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 15

16 Règles d écriture dans PubMed Par défaut, accentuations supprimées. Les opérateurs booléens en anglais et en majuscules.» Deux ou plusieurs termes séparés d une espace = AND.» Utiliser OR pour rechercher des synonymes et NOT pour exclure des termes. Expression exacte encadrée de guillemets anglais» Ex: «cystic fibrosis». Tronquer (*) un terme pour repérer l ensemble de ses variantes» Ex: child* child, children, childhood, etc. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 16

17 Raffiner la requête Grâce aux filters (à gauche de la liste de résultats) Date de publication Type d articles Langues Âge Genre Etc BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 17

18 Modes d interrogation Recherche simple» Recherche par termes ou expressions dans toute la notice (donne souvent beaucoup trop de résultats). Recherche avancée» Recherche par champ : auteur, journal, etc. Recherche par le MeSH Database» Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à chaque article. Clinical Queries» Interface spécialement désignée pour la recherche d études sur le pronostic et le diagnostic. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 18

19 Recherche simple Vous cherchez des articles sur l étourdissement chez les adolescents. Dans la boîte de recherche simple, écrire Dizziness et cliquer sur la limite Adolescent: years. Attention! Regardez en bas à droite la boîte Search Details BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 19

20 Recherche simple - Exercice Combien trouvez-vous de méta-analyses sur le syndrome du canal carpien? 62 Boîte de recherche : "carpal tunnel syndrome" Article types : meta-analysis BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 20

21 Recherche avancée Vous cherchez des articles de l auteur B.E. Gibson parus dans Physiotherapy Canada. Rechercher la revue Physiotherapy Canada dans le champ Journal et l auteur Gibson BE dans le champ Auteur. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 21

22 Recherche avancée - Exercice Combien trouvez-vous d articles publiés dans le Journal of bodywork and movement therapies en 2016? 122 Journal : Journal of bodywork and movement therapies AND Filter Publication Dates : From 2016/01/01 to 2016/12/31 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 22

23 Recherche MeSH Recherche uniquement dans le champ MeSH (vocabulaire contrôlé) Recherche plus précise et résultats plus pertinents. Accès au MeSH Exemple: Vous cherchez le MeSH pour la spondylose. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 23

24 Définition du MeSH Subdivisions Transformation du MeSH en concept majeur [MAJR] Explosion du MeSH BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 24

25 Synonymes du MeSH Autres MeSH connexes (Ne sont pas recherchés avec le MeSH) Concepts généraux (Ne sont pas recherchés avec le MeSH) Concepts spécifiques Termes spécifiques recherchés automatiquement dans PubMed. Pour l'empêcher, sélectionner Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 25

26 Recherche MeSH Vous cherchez des articles dont le sujet principal est la chirurgie de la spondylose BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 26

27 Dans la notice les MeSH s affichent: MeSH suivi d un astérisque Concept majeur Terme suivant une barre oblique après un MeSH subdivision BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 27

28 Recherche MeSH - Exercices Combien trouvez-vous de revues systématiques sur la chirurgie de l épicondylite latérale? 5 MeSH : Tennis Elbow Subheading : Surgery Article types : Systematic Reviews Combien trouvez-vous d articles dont le sujet est l utilisation de l électrothérapie pour traiter les douleurs abdominales? 55 MeSH : Abdominal Pain AND MeSH : Electric Stimulation Therapy BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 28

29 Clinical Queries Un ensemble de stratégies de recherche conçues par PubMed pour les questions touchant le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et l'étiologie. Très utile pour ceux qui ont besoin d'identifier des articles portant sur la médecine factuelle (Evidence- Based Medicine). BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 29

30 Clinical Queries Une seule recherche, trois listes de résultats BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 30

31 Clinical Queries Critères de sensibilité et spécificité : Narrow / specific search : recherche étroite, seuls les articles les plus pertinents sont retenus OU Broad / sensitive search: recherche plus large, les articles pertinents et articles connexes Équations de recherche (ou Filters) réalisées et utilisées par PubMed pour interroger la base selon la catégorie de recherche clinique désirée. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 31

32 Clinical Queries - Exemple Vous cherchez des articles (narrow) portant sur la thérapie des fractures du crâne. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 32

33 Clinical Queries - Exercice Combien trouvez-vous d articles (narrow) sur le diagnostic d une dislocation de l épaule? "shoulder dislocation" : 67 résultats shoulder dislocation : 78 résultats shoulder* AND dislocat* : 88 résultats Plus d une possibilité! BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 33

34 Obtenir le texte de l article Le bouton l Université Laval. permet de vérifier si un document est disponible à» Ce dernier est visible avec le Format : Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice. Si la Bibliothèque n est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l article est disponible gratuitement sur le Web. Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$. Vous pouvez configurer Google Scholar pour afficher un lien vers Obtenir@Ulaval Paramètres > liens vers les bibliothèques > rechercher et ajouter le lien et cliquer sur le bouton Enregistrer. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 34

35 Gestion des résultats Send to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:» File : enregistrer les notices sélectionnées» envoyer les notices par courriel» Clipboard : permets de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu à 500 notices (effacées après 8 heures d inactivité). Les options sont aussi disponibles dans le Clipboard. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 35

36 Création d un compte NCBI Vous permet de : Sauvegarder des stratégies de recherche. Obtenir des alertes par courriel. Personnaliser l interface de PubMed. Service simple et gratuit, mais nécessité de s inscrire. Créez votre compte My NCBI BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 36

37 Pour plus d information sur PubMed! Tutoriel : Guide d utilisation :» PubMed : MeSH : PubMed help Guide exhaustif de la NLM BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 37

38 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 38

39 Accès Dans l onglet Articles BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 39

40 The Cochrane Library Ressource à privilégier dans la recherche de revues systématiques et de méta-analyses. Producteur : Initiative du groupe Cochrane» Regroupement de chercheurs provenant de partout dans le monde. Objectif : Aider les professionnels de la santé à prendre de bonnes décisions lors de leurs interventions cliniques. Contenu : Six bases de données différentes» La plus importante étant la Cochrane Database of Systematic Reviews (Cochrane Reviews).» Trois bases de données sur six sont encore actives. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 40

41 Contenu Nom de la base Contenu Nombre d articles Cochrane Database of Systematic Reviews Les revues systématiques produites par un groupe Cochrane (texte intégral) Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE) *Pas de nouveauté depuis avril 2015 Les revues systématiques autres que Cochrane Cochrane Central Register of Controlled Trials The Cochrane Methodology Register *Pas de nouveauté depuis juillet 2012 Health Technology Assessment Database The NHS Economic Evaluation Database *Pas de nouveauté depuis avril 2015 Les études cliniques à la base des revues systématiques. Les études sur les méthodologies employées pour les revues systématiques. Les études sur l évaluation de la technologie médicale. Les études sur le coût/avantage des interventions cliniques BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 41

42 Modes d interrogation Parcourir» Permet de bouquiner pour un article par sujet, par groupe Cochrane ou par base de données. Recherche simple» Recherche dans toutes les bases de données de la Cochrane Library. Recherche avancée (Advanced Search)» Recherche par auteur, titre, résumé, etc. Recherche MeSH» Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à chaque article. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 42

43 Parcourir Vous pouvez naviguer dans les menus pour trouver un article par sujet, par groupe Cochrane ou par base de données. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 43

44 Recherche simple Une boîte de recherche. Recherche dans toutes les bases de données Cochrane. Troncature et guillemets anglais fonctionnent. Écrire les termes en anglais. Exemple: Je cherche des articles sur l obésité chez les enfants. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 44

45 Recherche avancée Semblable à la recherche simple sauf qu il est possible de:» sélectionner un champ de recherche spécifique dans le menu déroulant;» ajouter des boîtes de recherche et de les relier avec les opérateurs booléens. Limitation selon la base de données se fait une fois les résultats obtenus, tout comme pour la recherche simple. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 45

46 Recherche MeSH Accès par la recherche avancée Le vocabulaire contrôlé est celui des MeSH, comme dans Medline. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 46

47 Recherche MeSH Combinaison de recherches Définition Liste de résultats de MeSH Explosion du MeSH Résultats par base de données BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 47

48 Search Manager L historique de recherche n est pas automatique dans Cochrane. Les recherches doivent être ajoutées au Search Manager (Add to Search Manager). Permet de combiner plusieurs recherches.» Ex: (#1 and (#2 OR #3)) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 48

49 Notice détaillée Vocabulaire contrôlé (MeSH) Titre Figures et Tableaux Résumé en plusieurs langues (variable) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 49

50 Recherche Cochrane - Exercices Est-ce que la physiothérapie est bonne pour les personnes souffrant de fatigue chronique? Est-ce que l utilisation d un programme de marche avec podomètre est rentable? Recherche: chronic fatigue physical therapy Référence: Exercise therapy for chronic fatigue syndrome, Février 2015 Réponse : «Les patients atteints de syndrome de fatigue chronique peuvent généralement bénéficier d'une thérapie par l'exercice et se sentir moins fatigués après celle-ci, et rien n'indique que la thérapie par l'exercice pourrait aggraver leurs résultats». Recherche : pedometer Référence: 'Pedometers cost buttons': the feasibility of implementing a pedometer based walking programme within the community, 2011 Réponse : The authors concluded that the walking interventions could be cost effective, but further research was needed, for example, on their long term impact on health, resource use, and quality of life. Trouvez un Cochrane Review. Trouvez une Economic Evaluation. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 50

51 Obtenir de l aide Marie-Claude Laferrière Bibliothécaire-conseil Bibliothèque, pavillon Alexandre-Vachon Bureau 1018-C , poste 7948 marie-claude.laferriere@bibl.ulaval.ca Service de clavardage Offert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche (Techniciennes en documentation)en documentation) > Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 51

52 Questions! BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 52