MEDLINE BANQUE DE DONNÉES EN MÉDECINE INTERFACE PUBMED INITIATION
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- Pierre-Antoine Larivière
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1 MEDLINE BANQUE DE DONNÉES EN MÉDECINE INTERFACE PUBMED INITIATION document préparé par : CSSS-IUGS SERVICE DE BIBLIOTHÈQUE Janvier 2008
2 INTRODUCTION Medline est une banque de données bibliographique produite par la National Library of Medicine des États-Unis. Cette banque se consacre à la littérature spécialisée en médecine, en sciences de la santé, sciences infirmières et sciences connexes. Sa couverture, bien qu internationale, demeure majoritairement américaine et anglophone. Le contenu de la banque de données Medline est rendu accessible par de nombreux fournisseurs d'information (OVID, par exemple) qui, moyennant des frais d abonnement, donnent accès à ces références bibliographiques grâce à différentes interfaces d'interrogation. Mais il est toutefois également possible d'interroger la banque de données Medline gratuitement sur l'internet, en utilisant l'interface développée par la National Library of Medicine : PubMed. Si l'interface est moins sophistiquée que celle d'ovid, PubMed offre toutefois un grand avantage par rapport aux autres interfaces : il permet d'expédier ses demandes d'articles directement à la bibliothèque, sans avoir à faire de saisie d'information supplémentaire, grâce à LoansomeDoc. Ce qui permet également d'accélérer le processus de demande d'articles et assure donc une réception plus rapide. Nous vous proposons donc de vous familiariser dans un premier temps avec PubMed, comme interface de recherche bibliographique dans la banque de données Medline. Pour les personnes intéressées, une fois les bases de la recherche sur PubMed bien assimilées, la bibliothèque propose une formation afin d'utiliser LoansomeDoc pour accélérer le processus de prêt-entre-bibliothèques à votre avantage.
3 A - PUBMED 1) L'ÉCRAN PRINCIPAL DE PUBMED Consultation de la banque Sélectionnez le lien Medline via PubMed sur le site de la bibliothèque, à l adresse Ou inscrivez l'adresse suivante : On inscrit les termes de la recherche dans cette fenêtre puis on clique sur ce bouton Aide et didacticiel en ligne Fonctions spéciales
4 2) LA RECHERCHE PAR SUJETS ET COMMENT CHOISIR DES TERMES Dans Medline, des descripteurs issus d un vocabulaire contrôlé (MeSH) sont attribués à chaque article. Pour se livrer à une recherche précise, il est donc préférable d utiliser ce vocabulaire. En sélectionnant «MESH Database» on accède à la fenêtre de recherche du vocabulaire. On y inscrit un terme de recherche, puis on clique sur «Go». Différents termes sont proposés. Il suffit de cliquer sur le plus pertinent pour les besoins de la recherche.
5 Sur l écran suivant, il est possible de raffiner la recherche par l utilisation de sous-vedettes («Subheadings»). Ces termes spécifient sous quel aspect particulier le descripteur principal est traité Pour restreindre les résultats de la recherche aux articles portant plus significativement sur un sujet, il est préférable de cocher l option «Restrict Search to Major Topic» Le MESH propose également des termes similaires et affiche une arborescence du terme sélectionné, comprenant les descripteurs plus généraux et plus spécifiques Par défaut, la recherche s opère sur le descripteur ainsi que tous les descripteurs qui lui sont subordonnés dans la hiérarchie C est la fonction «Explode» Descripteurs plus généraux Descripteur Descripteurs plus spécifiques Il est possible de désactiver la fonction "Explode" d'un terme en sélectionnant "Do not explode"
6 Une fois le terme de recherche sélectionné, cliquez sur la fonction «Send to Search Box with AND» Le terme sélectionné est alors ajouté à la «Boîte de recherche» Lancez la recherche
7 Lors de la sélection du terme de recherche, il est également possible de sélectionner plusieurs termes pour les combiner dans une première étape. Une fois le premier terme inscrit dans la boîte de recherche, il est possible de rechercher un second terme «MESH» dans la fenêtre «Search Mesh for» Après sélection du terme, il faut l'envoyer dans la boîte de recherche, en utilisant l opérateur booléen approprié Le nouveau terme apparaît alors dans la boîte de recherche pour former un énoncé de recherche, que l on pourra ensuite lancer dans PubMed
8 Il peut toutefois arriver que le terme recherché ne se retrouve pas dans la banque de données «MESH», et que les alternatives proposées ne vous conviennent pas : il peut s agir de concepts très récents, de termes très spécifiques, etc. En ce cas, vous pouvez faire une recherche en vocabulaire libre, en lançant la recherche non plus dans la banque de données MESH, mais dans l ensemble de PubMed Il suffit de changer l option «Search» du menu déroulant afin de passer de «MeSH» à «PubMed» puis de lancer la recherche NB : La troncature est possible dans ce type de recherche. Il suffit d ajouter un astérisque * à la fin du terme recherché
9 3) AUTRES TYPES DE RECHERCHE a- Recherche par auteur Il faut inscrire dans la fenêtre de recherche de PubMed, le nom de famille de l'auteur suivi de la première lettre de son prénom, sans aucun signe de ponctuation, puis de cliquer sur "Go" Le système procède à la recherche de ce nom et de ces variantes (ex : hebert rj, hebert rm) dans l index des auteurs. b- Recherche par périodiques inscrire dans la fenêtre de recherche, le titre du périodique au complet ou son abréviation, puis de cliquer sur "Go" OU c- Recherche d un article spécifique Pour localiser un article spécifique dans la banque PubMed, la meilleure façon consiste à saisir le nom de l auteur ainsi que quelques termes significatifs du titre. Ou on peut également utiliser la fonction «Single Citation Matcher»
10 4) LIMITER LES RÉSULTATS D'UNE RECHERCHE On peut raffiner sa recherche en utilisant des critères comme les années de publication, la langue... Sélectionnez la fonction «Limits» pour faire apparaître l interface des limites Une fois les limites sélectionnées, cliquez sur «Go» Il est possible de limiter la recherche par date de publications Pour chaque critère, on peut sélectionner plusieurs valeurs en cochant les cases appropriées NB : Les limites demeurent actives pour l ensemble des recherches de la session. Pour les désactiver, il faut décocher la case «Limits»
11 5) COMBINER LES TERMES D UNE RECHERCHE Des recherches complexes sont possibles avec l utilisation des opérateurs booléens, dont les deux principaux : AND : permet de spécifier une recherche, en retenant les références traitant de plusieurs concepts simultanément OR : permet d étendre une recherche à plusieurs concepts NB : Ces opérateurs doivent être inscrits en lettres majuscules. Sélectionnez la fonction «History» pour accéder à l historique de la recherche Pour combiner un autre énoncé de recherche au plus récente, cliquez sur le numéro de cet énoncé et sélectionnez l opérateur voulu Le nouvel énoncé apparaît dans la fenêtre de recherche. Lancez en cliquant sur «Go» On peut aussi opérer les combinaisons à l'intérieur de la fenêtre de recherche. Il faut précéder les numéros des énoncés par le symbole # et inscrire les opérateurs en majuscules.
12 6) CONSULTER LES RÉSULTATS DE LA RECHERCHE Suite à une recherche sur PubMed, la liste des résultats est affichée par défaut en format «Summary». La disponibilité du texte intégral des articles est indiquée par la présence d icônes spéciales. Icônes «Plein texte» Icône «Résumé». Le plein texte n est pas disponible Pour les articles accompagnés de l'icône "Plein texte", il faut cliquer sur la référence ou l icône. À l'écran suivant, une icône identifiée «Free full text» mène au plein texte de l article NB : Il arrive que des éditeurs proposent l accès au texte intégral gratuitement, mais à condition de s'enregistrer sur leur site. Vous pouvez éviter cela en transmettant votre demande à la bibliothèque En utilisant les onglets en tête des résultats, il est possible de rapidement consulter les articles disponibles à la bibliothèque sur le vieillissement en cliquant sur l'onglet "CSSS-IUGS" les articles disponibles gratuitement en plein texte avec l'onglet "Free full text"
13 Pour visualiser les résultats avec résumé, il faut sélectionner le format d affichage «Abstract» En affichage «Abstract», différentes icônes seront affichées Cet article est disponible à la bibliothèque sur le vieillissement du CSSS-IUGS. Nous demandons à la clientèle située au Pavillon D Youville de passer en faire la photocopie sur place. Le personnel des autres pavillons peut contacter la bibliothèque (poste 45237) pour obtenir cet article par télécopieur ou courrier interne L article est disponible gratuitement en ligne. En cliquant sur ce lien, vous aurez accès à cet article. Ce périodique est disponible à la bibliothèque de l Université de Sherbrooke : : Disponible en format électronique. À partir du réseau de l Université (au centre de recherche, par ex.), l accès est direct ; Sinon, les personnes autorisées, possédant un CIP et un mot de passe, peuvent accéder à ces articles en passant par la page des périodiques électroniques de l Université Disponible en version imprimée à l Université de Sherbrooke. Vous pouvez donc acheminer votre demande de documentation à la bibliothèque L article est disponible en ligne chez l éditeur, mais pas gratuitement. Ne tenez pas compte de cette icône et faites une demande de documentation à la bibliothèque Etc
14 7) IMPRIMER / SAUVEGARDER LES RÉSULTATS DE LA RECHERCHE Lors de la consultation des résultats, on sélectionne les articles pertinents en cochant les cases appropriées. Après avoir sélectionné les titres désirés, on peut soit les imprimer, les sauvegarder dans un fichier texte, dans un fichier temporaire, le temps de la recherche, et même les commander via le service LoansomeDoc, offert par la bibliothèque à sa clientèle. Sélectionnez le format d'affichage désiré Sélectionnez où vous désirez envoyer vos références : Sauvegarde dans un fichier Sauvegarde temporaire pour la durée de la recherche dans PubMed Affichage à l'écran pour impression Commande via service LoansomeDoc NB : EN CAS DE DIFFICULTÉS, N HÉSITEZ SURTOUT PAS À VOUS ADRESSER AU MEMBRE DU PERSONNEL DE LA BIBLIOTHÈQUE, AU POSTE OU 45237
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