Recherche d articles scientifiques: Pubmed et Cochrane FRÉDÉRIC BERGERON DOMINIQUE CARON MYRIAM DUPONT HIVER 2014

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1 Recherche d articles scientifiques: Pubmed et Cochrane FRÉDÉRIC BERGERON DOMINIQUE CARON MYRIAM DUPONT HIVER 2014

2 Objectifs de la présentation Apprendre à faire une recherche structurée dans les bases de données bibliographiques. Apprendre à utiliser correctement la syntaxe et à exploiter au maximum les thésaurus à l intérieur des bases de données Pubmed et Cochrane. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 2

3 Plan de la présentation Apprendre à faire une recherche structurée: Méthode 1 Méthode 2 Plan de concept Pubmed et Cochrane Exercices pratiques BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 3

4 Structurer sa recherche La recherche à l intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent: Méthode 1 Méthode 2 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 4

5 Méthode de recherche 1 Vocabulaire libre Utilisation du langage naturel ou de ses propres mots afin de repérer des documents sur le sujet d intérêt. Le choix et l orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche. Astuce : utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chaque concept afin de maximiser le repérage. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 5

6 Méthode de recherche 1 Exemple Je cherche des articles qui portent sur l obésité 1. Traduction Obésité -> Obesity 2. Synonymes et variantes orthographiques Body weight, body weights, body-weight, body fat distribution, fat tissue distribution, overweight, over weight, over eat, over eating, obesities, obese, visceral obesity, morbid obesity, morbid obesities, abdominal obesity, body fat, waist, body fat, fat load, body mass index, quetelet index, BMI BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 6

7 Outils - Dictionnaire en ligne Repérer un maximum de synonymes et de variantes orthographiques Portail Terminologique de Santé BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 7

8 Outils - Les symboles Pour gagner du temps et de la précision * " " Troncature : placée à la fin d un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme. Child* permet de repêcher child, children, childhood. Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d apparition. "Heart arrest" ou "Cardiac arrest" permet de repêcher ces mots tels qu ils apparaissent dans le texte. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 8

9 Méthode de recherche 2 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d un thésaurus Validation des mots dans un dictionnaire appelé thésaurus avant de les utiliser pour la recherche. Une seule appellation possible et une seule orthographe à utiliser pour l ensemble des variantes orthographiques. L appellation à utiliser et la manière de l écrire sont imposées par la base de données. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9

10 Méthode de recherche 2 Exemple Je cherche des articles qui parlent de l adhésion des patients à la prescription d un médicament. Synonymes et variantes orthographiques Patient cooperation, patient adherence, patient nonadherence, patient non adherence, patient non-adherence, patient compliance, patient noncompliance, patient non compliance, patient noncompliance BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 10

11 Les opérateurs booléens Pour lier les différents concepts ET OU SAUF Limite la recherche à l intersection des concepts Unit les différents concepts Exclut un ou plusieurs concepts non souhaités Précise la recherche, mais ATTENTION BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 11

12 Plan conceptuel Sujet: Vaccination des personnes âgées Méthode 1: Méthode 2: aged OR "older adult" OR elderl* OR senior* OR adult* Concept #1 AND vaccine* OR immunization* OR "Immunization program*" OR vaccination OR "active immunization" OR "Immunologic adjuvants" OR Immunoadjuvant* Concept #2 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 12

13 Recherche dans BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 13

14 Recherche simple Saisie de mots-clés à la Google Exemple Je cherche des articles qui portent sur l obésité chez les enfants. Recherche des mots effectuée dans tous les champs de la notice. Consulter la boîte Search Details Recherche moins précise et résultats nombreux. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 14

15 Recherche simple Saisie par champs Exemple Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants. La recherche est effectuée au sein du ou des champs spécifiés. Connaissance nécessaire des étiquettes de champs et de la syntaxe de recherche. La précision de la recherche est augmentée. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 15

16 Notice détaillée Informations bibliographiques: auteur[au], titre[ti], périodique[ta], année[dp]. Résumé [TIAB] Type de publication [PT] Vocabulaire contrôlé [MeSH] BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 16

17 Recherche avancée Plusieurs boîtes de recherche, accès disponible sur la page d accueil Là où il est possible de sélectionner ses champs pour la recherche quand l on ne connait pas la syntaxe. Connaissance de la syntaxe non nécessaire. Historique de recherche. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 17

18 Recherche avancée Exemple Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants. Sélection du ou des champs voulus et ajout des termes dans la boîte de recherche. Recherche plus précise et résultats moins nombreux. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 18

19 Recherche MeSH Recherche uniquement dans le champ MeSH. Utilise le vocabulaire contrôlé de la base de données. Recherche plus précise et les résultats plus pertinents. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 19

20 MeSH Définition Subdivisions (qualifier un MeSH) Transformation du MeSH en concept majeur Synonymes Explosion du MeSH par défaut Suggestions de MeSH BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 20

21 MeSH (suite) Structures arborescentes «explosées» Concepts plus généraux Concept plus spécifique Concepts plus généraux Concept plus spécifique BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 21

22 MeSH (suite) Cocher les options voulues et cliquer sur Add to search builder BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 22

23 MeSH et cie. Vocabulaire contrôlé MeSH -> Medical Subject Headings Terme suivant une barre oblique après un MeSH -> subdivision MeSH suivi d un astérisque -> Concept majeur BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 23

24 Syntaxe de recherche Concept[champ] AND Concept[champ] Exemple Les effets de la caféine sur l obésité (Caffeine[MH] OR Caffeine[TIAB])AND (Obesity[MH] OR Obesit*[TIAB]) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 24

25 Filtres cliniques Un ensemble de stratégies de recherche (équations de recherche réalisées par PubMed) pour les questions touchant le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et l'étiologie. Très utiles pour ceux qui ont besoin d'identifier des articles portant sur la médecine fondée sur des données probantes (Evidence-Based Medicine). BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 25

26 Filtres cliniques Préciser les critères de sensibilité et spécificité : Narrow / specific search : recherche étroite, seuls les articles les plus pertinents sont retenus OU Broad / sensitive search: recherche plus large, les articles pertinents et articles connexes BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 26

27 Obtenir le texte de l article Le bouton permet d accéder au document. Ce bouton est disponible seulement si vous accédez à Pubmed par l entremise de la bibliothèque. Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques au coût de 5$. Liens à suivre BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 27

28 Compte personnel NCBI Principaux avantages: Gratuit! Permet de sauvegarder vos recherches pendant 6 mois. Recevoir des alertes (Courriel, Fil RSS) lorsqu un nouvel article est publié sur un sujet (stratégie de recherche). BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 28

29 Recherche dans BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 29

30 Contenu Tableau des sept bases de données: Nom de la base Contenu Nombre d articles Cochrane Database of Systematic Reviews Les revues systématiques produites par un groupe Cochrane Database of Abstracts of Reviews of Effects Les revues systématiques autres que Cochrane (Surtout DARE) Cochrane Central Register of Controlled Trials Les études cliniques à la base des revues systématiques The Cochrane Methodology Register Les études sur les méthodologies employées pour les revues systématiques Health Technology Assessment Database The NHS Economic Evaluation Database Les études sur l évaluation de la technologie médicale. Les études sur le coût/bénéfices des interventions cliniques About The Cochrane Collaboration Les groupes COCHRANE 81 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 30

31 Modes de recherche Deux modes principaux La base de données générale: recherche simple et avancée Le répertoire : navigation par sujet BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 31

32 Accès au thésaurus BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 32

33 Thésaurus Subdivisions (qualifier un MeSH) Combinaison de recherches Définition Explosion du MeSH Résultats par base de données BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 33

34 Notice détaillée Titre :ti Tableaux :tb Résumé :ab MeSH :kw BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 34

35 Syntaxe de recherche Concept:champ AND Concept:champ Exemple Les effets de la caféine sur l obésité (Caffeine:kw OR Caffeine:ti OR Caffeine:ab) AND (Obesity:kw OR Obesit*:ti OR Obesit*:ab) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 35

36 Merci

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