Groupe(s) «Information Chimique» Montpellier

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1 Groupe(s) «Information Chimique» Montpellier ICGM s d'information Chimique Claude Laurenço Gilles Niel Régine Sola Philippe Jauffret Ahn-Kiet Tran-Minh Données Objets Composants pour les s Complexes Philippe Vismara Benoît Valéry LIRMM

2 Compétences et activités Compétences : Synthèse organique Modélisation de la chimie Bases de données chimiques s à bases de connaissance Algorithmique de graphes (chimiques) Fouille de données chimiques Formation : «information chimique» Cours ENSCM, UM2 Formation permanente Recherche Service : Chimiothèque Nationale Titane

3 Chimiothèque Nationale Chimiothèque Nationale Groupement De Service CNRS Directeur : Marcel HIBERT Création : organismes d Enseignement Supérieur Financement CNRS : ~45 K /an d information Réalisé et implanté à l ENSCM Responsable national : Philippe JAUFFRET 2 Ingénieurs CNRS Budget : 60 K HT Ouverture publique : 4/9/2005 Missions Fédérer les collections de substances produites dans les laboratoires académiques Valorisation scientifique et industrielle de ces collections au moyen d un système d information Réseaux de compétences Ateliers chimio-informatiques : «descripteurs moléculaires» «chimiothèque départementale» Bilan > produits de synthèse ~ extraits de substances naturelles Points forts : diversité, % de molécules «drug like» >100 projets de collaboration chimie - biologie > 100 criblages effectués, 100 touches validées > 30 publications, >15 brevets Perspectives Réseau européen «European Compound Library» dans le cadre du 7ème PCRD Promotion d une «ciblothèque nationale» Développement de nouveaux descripteurs pharmacophoriques

4 Un modèle circulaire de conception/développement de système d information chimique (synthèse) MODÉLISATION de la chimie Reconnaissance chimique algorithmes implantés dans les logiciels : - Resyn_Assistant : aide à la compréhension des problèmes de chimie organique - ALSAS : plate-forme de développement de logiciels pour la chimie DONNÉES formalisées ANALYSE des DONNÉES SYSTEMES D INFORMATION CHIMIQUE VALIDATION Réalisation de Prototypes SIIRCO d Information Intégré sur les réactions en Chimie Organique (cas des interchanges fonctionnels) COSYMA Aide à la conception de synthèses totales Meta-données connaissances FOUILLE de DONNÉES

5 Modélisation de la chimie : Analyse multi-points de vue multi-niveaux H O Point de vue fonctionnel H O OH Point de vue stéréochimique O ircianine Point de vue topologique Niveau micro Niveau méso C5 2,1 C6 1,0 C5 Cbr Ch3 C5 linéaire Niveau macro linéaire cyclique branché cyclique linéaire

6 Intérêt de l analyse multi-points de vue / multi-niveaux Verbalisation Compréhension Généralisation Classification Aide à la résolution de problèmes

7 Extraction de connaissances à partir de Bases de données réactionnelles : projet RESYN-MINING intérêt de la fouille de données : utiliser des méthodes générales pour détecter des régularités dans un ensemble de données interprétation évaluation Plate-forme CORON Resyn_Assistant prétraitement fouille de données modèles connaissances règles d'association données prétraitées sélection base de données données cibles OrgSyn2000: 5476 fiches Point de vue fonctionnel : ECBD engendre des règles d association : carbonyl détruit ET alcène créé phosphonate détruit. Pertinence mesurée par des paramètres statistiques

8 Intégré d Information Différents niveaux de requêtes (données factuelles et méta-données) meilleure aide à la résolution de problèmes

9 Collaborations LIRMM/D OC Philippe Vismara Benoît Valéry Projet RESYN/CORON Conception et exploitation de nouvelles techniques de fouille de graphes chimiques SIC Claude Laurenço Gilles Niel Régine Sola Philippe Jauffret Ahn-Kiet Tran-Minh LORIA/ORPAILLEUR Amedeo Napoli Laszlo Szathmary Frédéric Pennerath Projet Européen ELEGI Banc de test ENCORE LIRMM/KAYOU Stefano Cerri FUNDP/COS Alain Krief