Les maladies émergentes de l oignon. Par Hervé Van der Heyden, M.Sc Phytodata Phytopathologie-Épidémiologie

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Arlette Ruel
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1 Les maladies émergentes de l oignon Par Hervé Van der Heyden, M.Sc Phytodata Phytopathologie-Épidémiologie

2 Au laboratoire Nombre d'échantillons reçus Québec Ontario Moyenne Ontario (107) Moyenne Québec(25) Année

3 Définition Maladie dont l incidence réelle augmente de manière significative dans une population donnée, d une région donnée et durant une période donnée, par rapport à la situation épidémiologique habituelle de cette maladie.

4 Aperçu 90% 80% 70% 60% 50% 78% 66% Avant 2010 Depuis % 30% 20% 10% 0% 32% 11% 11% 0% 0% 1% 0% 2% Bactéries Champignons Levures Virus Nématodes

5 Au champ % de pourriture bactérienne à la récolte Moyenne Max

6 Bactéries émergentes Espèce Avant 2010 Depuis 2010 Alternaria porri 2 3 Ascochyta sp. 1 0 Botrytis allii 2 0 Botrytis cinerea 11 0 Botrytis squamosa 0 0 Burkholderia cepaciae 3 4 Burkholderia gladioli 7 4 Cladosporium allii 0 1 Collectotrichum circinans 1 7 Enterobacter cloacae 0 5 Entyloma sp. 0 1 Fusarium moniliforme 7 2 Fusarium oxysporum Fusarium solani 4 4 Fusarium verticillioides 13 0 Levures 23 0 Meloidogyne sp. 0 2 Pantoea agglomerans 0 17 Pantoea anatis 0 1 Pectobacterium carotovorum 4 3 Penicillium sp Peronospora destructor 26 1 Phoma terrestris 0 1 Phytophthora cinnamomi 1 0 Phytoplasmes 0 1 Potyvirus 0 1 Pseudomonas fluorescens 2 1 Pseudomonas marginalis 4 0 Pseudomonas syringae 2 2 Pseudomonas viridiflava 1 1 Pyrenochaeta terrestris 2 0 Pythium irregulare 0 2 Pythium ultimum 3 0 Rhizoctonia solani 0 3 Serratia marcescens 0 1 Stemphylium botryosum Urocystis sp. 2 0 Xanthomonas campestris 0 1 Burkholderia sp. (gladioli + cepacia) 10 avant 2010, 8 après 2010 Pectobactérium carotovorum 4 avant 2010, 3 après 2010 Paontoea sp. (ananatis + agglomerans) Aucun cas avant cas après 2010 Enterobacter Cloacae Aucun cas avant cas après 2010

7 Burkholderia cepacia Vaquero

8 Burkholderia gladioli

9 Pectobacterium carotovorum

10 Enterobacter cloacae Première observation 1988 en Californie 2006 dans l état de Washington 2010 dans l état de New-York Haute température C Considéré comme opportuniste Bishop et al., 1990; Schroeder et al., 2010

11 Enterobacter cloacae

12 Pantoea ananatis Rapporté pour la première fois 1997 en Géorgie 2000 au Colorado 2008 au Michigan 2010 à New-York Capable d infecter les mono et dicotyledons Plusieurs plantes alternatives melon de miel, cantaloup, tomate

13 Pantoea ananatis - Lésions blanchâtres (discrètes) - Deviennent des stries qui peuvent descendre jusqu au bulbe feuilles symptomatiques au centre - Toutes les feuilles du cœur si les conditions sont favorables

14 Pantoea ananatis - Température C - Humidité relative élevée - Stade critique: initiation de la bulbaison - Tuniques brunissent, restent fermes Carr et al., 2013, Schwartz et al., 2003

15 Pantoea agglomerans Rapporté pour la première fois dans l oignon En 2006 en Géorgie En 2011 dans l état de New-York Pathogène émergent 2013 (MSU) Plusieurs plantes hôtes alternatives Betterave, riz, poires Humidité relative élevée Températures plus fraîches C

16 Pantoea agglomerans Redwing Vaquero

17 Pantoea agglomerans

18 Dispersion Peut-être présente Dans les sols Dans la semence Dans l eau Peu infecter par les feuilles Blessures Peu se déplacer dans la plante Des feuilles vers le bulbe

19 Dispersion Région de New-York Aucune bactérie isolée de la semence P. agglomerans dans les plants 78 échantillons de sol positifs pour P. agglomerans Répété le printemps suivant Sols principale source de contamination Beer et al., 2010

20 Carr et al., 2013 Pantoea sp.

21 Dutta et al., 2014 Pantoea sp.

22 Pantoea sp. % de récupération Période d acquisition (h) Dutta et al., 2014

23 Importance de savoir Variété Semencier B. cepacia B. gladioli E. cloacae Vaquero Nunhems USA 46.7 (2nd) 14.0 (2nd) 12.0 (1st) Ovation Sakata Seed 56.0 (3rd) 13.3 (1st) 12.7 (2nd) Ranchero Nunhems USA 53.6 (3rd) 13.7 (1st) 13.0 (2nd) Sedona Bejo Seeds, Inc (1st) 17.7 (3rd) 13.3 (2nd) Monarchos Seminis Vegetable Seeds 47.3 (2nd) 13.0 (1st) 13.7 (2nd) Swale Seminis Vegetable Seeds 51.4 (2nd) 12.3 (1st) 15.2 (3rd) Granero Nunhems USA 58.0 (3rd) 16.6 (2nd) 15.3 (3rd) Redwing Bejo Seeds, Inc (1st) 11.3 (1st) 5.0 (1st) Salsa Nunhems USA 63.3 (3rd) 13.3 (1st) 8.6 (1st) Ruby Ring American Takii 50.0 (2nd) 20.7 (3rd) 9.7 (1st)

24 Impacte de la fertilisation % de pourriture % de Ca dans le bulbe Srinivasan et al., 2002

25 Projet à venir Inventaire des bactéries de l oignon Développement d une nouvelle méthode d échantillonnage Déterminer s il existe une corrélation entre la sévérité des pourritures bactériennes et différents indicateurs de déséquilibre (ph, Brix, CE, Nitrate, Ca, Potassium)

26 Remerciements Mario Leblanc, MAPAQ Gérard Gilbert, Laboratoire de diagnostic Christy-anne Hoepting, Cornell university Syndicat des producteurs d oignons du Québec

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