Méthode de tri et d'exportation des images issues de pièges photographiques

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1 Méthode de tri et d'exportation des images issues de pièges photographiques Ce document a pour but de définir la méthode la plus efficace et la plus rapide possible pour le tri des images issues de pièges photographiques. Ceci afin de conserver une trace sous la forme d'un tableur contenant l'ensemble des données et métadonnées utiles pour une étude de présence d'espèces animales et pour recenser chaque contact réalisé grâce à ces pièges. Cette méthode est utile pour la création de tables cartographiques notamment. Programmes requis - GeoSetter (licence libre) : pour la localisation GPS des images - XnView (licence libre) : pour le tri et l'exportation des données sur table Marche à suivre Classement Il est important tout d'abord de créer un répertoire structuré et cohérent afin de permettre une optimisation de l'espace et des données récoltées. Choisir en premier lieu un répertoire sur le disque dur qui accueillera les images, sur mon ordinateur personnel je l'ai nommé : C: > Nom Utilisateur > Images > Suivi Faune et Pièges Photo > Relevés Dans ce dossier "Relevés", j'ai ensuite identifié chaque dossier par la date du relevé, en commençant par l'année, puis le mois et enfin le jour, afin d'obtenir un ordre chronologique dans le classement. Voir l'image ci-dessous. Page 1 sur 6

2 Dans chaque dossier se trouvent des sous-dossiers nommés selon les différents pièges qui ont donc été relevés. Comme le montre l'image ci-dessous. Dans chacun de ces dossiers se trouvent enfin toutes les photographies prises par le piège portant le même nom. Géolocalisation Si le fichier image (.jpeg) ou vidéo (.avi) issu du piège n'est pas déjà géolocalisée par l'appareil, il faut inscrire dans les métadonnées du fichier, les coordonnées relevées à l'aide d'un GPS externe. L'utilisation de GeoSetter est plutôt simple. A l'ouverture du logiciel une interface permet de choisir le répertoire dans lequel se trouvent les images à géoréférencer. Quand le dossier est choisi, les fichiers apparaissent et il est alors possible de donner une référence géographique pour chaque fichier. Le dossier, portant le nom du piège, permet de trouver aisément les coordonnées de celui-ci, un traitement de groupe facilite alors la rentrée des coordonnées. Page 2 sur 6

3 Nous remarquons que chaque fichier est dépourvu de coordonnées. Pour les rentrer manuellement il faut double cliquer sur la zone vide dans la colonne "coordonnées". Une fenêtre s'ouvre alors où il est possible de rentrer manuellement les coordonnées du piège, relevé au préalable. Lorsque les coordonnées sont rentrées et vérifiées, il faut cliquer sur le bouton en bas à droite de la même fenêtre : "Enregistrer comme modèle " La fenêtre ci-dessous s'ouvre et il ne faut laisser cocher que : Coordonnées. Cliquer sur OK. Page 3 sur 6

4 Une autre petite fenêtre s'ouvre et il suffit d'y inscrire le nom du piège ou sa localisation nominale. Quitter les fenêtres de dialogue en cliquant sur OK puis sélectionner l'ensemble des images. Aller dans le menu Images > Modèles puis choisir le nom créé précédemment ou le nom correspondant aux bonnes coordonnées. Cliquer sur OK. Les coordonnées apparaissent alors sur tous les fichiers dans la colonne Coordonnées. Penser à enregistrer les nouvelles métadonnées en appuyant sur la disquette dans la barre d'outils. Un message d'erreur peut apparaitre, cliquer sur Continuer. On peut ensuite fermer le logiciel. Une copie des images est faite par ce logiciel dans le même répertoire, il est possible de supprimer les photos originales qui ne comportent pas les coordonnées GPS. Tri des images et export par XnView L'interface de navigation est encore plus simple que GeoSetter. Il suffit de choisir le répertoire contenant les images dans la fenêtre de gauche. La fenêtre du haut permet de visualiser les vignettes des images et la fenêtre du bas un agrandissement de chaque photo et les métadonnées. Il faut maintenant donner le nom de l'espèce pour chaque image rencontrée et ensuite exporter l'intégralité sous la forme d'une base de donnée écrite, sur un tableur, ici Excel. 1. Rentrer le nom des espèces Sélectionner toutes les images de la même espèce (Ctrl+clic), juste une série continue (MAJ+clic) ou une seule image (clic simple). Clic-droit sur la sélection > Editer les informations IPTC Onglet Mots-clés > écrire le nom de l'espèce dans la barre du haut (Ajouter) > puis cliquer sur Ajouter. Le nom descend alors dans la case blanche dessous. Cliquer sur le nom à cet emplacement. Une petite flèche noire apparait alors sous cette zone et permet de sauvegarder le mot clé afin d'éviter de le réécrire à chaque entrée de donnée. Cliquer dessus. Cliquer ensuite sur le bouton Ecrire tous, afin d'inscrire l'information sur l'intégralité des photos sélectionnées. Page 4 sur 6

5 Cliquer sur Fermer pour fermer la boite de dialogue. Répéter l'opération pour toutes les photos contenues dans le dossier. Quand toutes les photos comportent les informations requises, il est temps d'exporter les images pour intégrer les données dans un tableau Excel. 2. Exportation au format.csv Sélectionner au préalable l'intégralité des images. Aller ensuite dans l'onglet Edition > Méta-données > Exporter IPTC et EXIF Une fenêtre d'enregistrement s'ouvre. Sélectionner le répertoire où enregistrer le fichier (je conseille de le mettre au même endroit que les images). Changer le type de fichier en "Fichier CSV (*.csv)". Renommer en DATE (ANNEE/MOIS/JOUR) et nom du piège. Exemple : " LG3.csv" Le fichier est bien exporté. Il faut maintenant l'ouvrir sur Excel. 3. Importation sur tableur Excel Ouvrir un nouveau classeur Excel. Onglet DONNEES > Fichier texte Trouver le fichier.csv dans le bon répertoire et cliquer sur Importer. Une fenêtre de dialogue s'ouvre alors. Choisir le type de fichier en Délimité, Commencer l'importation à la ligne 1, et Origine du fichier, choisir Windows (ANSI) (deuxième choix en partant du haut. Cocher la case : Mes données ont des en-têtes. Page 5 sur 6

6 Cliquer sur Suivant > Cocher les cases Tabulation, Point-virgule, Virgule et Espace Se met automatiquement "Interpréter des séparateurs identiques consécutifs comme uniques" Avec Identificateur de texte : " Vérifier ces informations en rouge avant d'appuyer sur suivant! Appuyer sur suivant et choisir le format Standard et cliquer sur Terminer. Cliquer ensuite sur OK. Les données sont maintenant rentrées sur la feuille Excel! Il suffit de supprimer les colonnes inutiles, de corriger rapidement les erreurs au niveau des coordonnées, et de compléter le tableau. Il ne faut pas oublier d'enregistrer cette table au format.xls dans le même répertoire ou dans un autre à votre convenance. Page 6 sur 6