Atelier de l ared* Pubmed. Pubmed, littérature et communication médicale : des outils pour faire le tri
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- Ghislaine Poitras
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1 Atelier de l ared* Pubmed Pubmed, littérature et communication médicale : des outils pour faire le tri
2 Liens d intérêt Nous déclarons n avoir aucun conflit d intérêt 2
3 Rechercher sur Internet
4 Recherche documentaire Recherche rétrospective Choix des sources d information (Où chercher?) Période de recherche (Jusqu'à quand?) Recherche prospective Veille scientifique (flux rss, alertes, newsletter ) Actualisation 4
5 Objectifs de la recherche effectuer une recherche de littérature structurée et pertinente présenter la recherche de façon à être la plus explicite possible 5
6 Recherche documentaire Pour débuter une recherche Définir la question et les concepts principaux Rechercher le vocabulaire Lister les spécialités concernées Quelques sites utiles : Wikipédia (Attention informations non validées) Le grand dictionnaire terminologique 6
7 Où chercher? Information francophone Catalogue Cismef Recherche simple Recherche des recommandations Lemanissier Site institutionnels français Haute Autorité de santé Ministère de la santé Les dossiers / la santé de A à Z Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé Institut national du cancer (INCa) 7
8 Où chercher? Information francophone Autres sites Vidal Recos abonnement pour l accès intégral La documentation française Bibliothèque des rapports publics 8
9 Où chercher? Information francophone Sites Canadiens Santé Canada Agence canadienne des médicaments et des technologies de la santé (ACMTS) Institut national d excellence en santé et en services sociaux (INESSS) Sites Belges Centre fédéral d'expertise des soins de santé (KCE) G. FANELLI 9
10 Où chercher? Information anglophone Les bases de données The Cochrane Library (abonnement pour l accès intégral) 10
11 Où chercher? Information anglophone Les catalogues The Clearinghouse Disease / condition Recherche NHS Evidence - guidance Centre for Reviews and Dissemination Databases 11
12 Où chercher? Information anglophone Les sites institutionnels Agency for Healthcare Research and Quality (AHRQ) Clinical Information National Institute for Clinical Excellence (NICE) Scottish Intercollegiate Guidelines Network (SIGN) NIHR Coordinating Centre for Health Technology Assessment (NCCHTA) Medical Services Advisory Committee (MSAC) 12
13 Où chercher? Autres informations Juridique Légifrance Epidémiologie Bulletin Epidémiologique Hebdomadaire (BEH) Organisation Mondiale de la Santé (OMS) Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR) 13
14 Où chercher? Autres informations Santé publique Banque de données en santé publique (BDSP) Institut national de prévention et d'éducation pour la santé (INPES) Agence de Santé publique du Canada (ASPC) 14
15 Où chercher? Recherche libre Moteur de recherche généraliste Google Recherche avancée Google Scholar 15
16 Retrouver un article Sur internet Dans des bases de données PubMed Central Grace au moteur de recherche Google : Copier / coller le titre Recherche avancée (limite aux pdf) Google Scholar : Rechercher son article. Les gratuits sont clairement identifiés 16
17 Formation à la recherche documentaire Partie 2 Rechercher dans les bases de données
18 Sources d informations Medline : interface web PubMed (gratuit) ou par serveur (payant) Embase : interrogation par serveur (Dialog, Ovid, SciSearch ) ou BDSP (Banque de données en santé publique) Trip Database 18
19 Rechercher dans la base de données Préparer une recherche Equation de recherche : formulation de la question Extraire les concepts, trouver les synonymes Traduire en vocabulaire normalisé :Thésaurus et descripteur Rédiger l équation : les Opérateurs Booléens Bruit/ silence Nombre de réponses pertinentes 19
20 Rechercher dans la base de données Thésaurus et descripteurs Vocabulaire contrôlé et organisé : liste définie de termes (= descripteurs) hiérarchisés entre eux termes génériques termes spécifiques Permet l indexation et la recherche des articles Le Thésaurus de Medline : le MeSH (Medical Subject Headings) arborescence : environ descripteurs répartis entre 16 branches 20
21 Rechercher dans la base de données Majoration (descripteur majeur) Thésaurus et descripteurs Descripteur ou Mots-clés Limites (langue, date, type de publication ) Explosion Qualificatifs ou Subheadings 21
22 Rechercher dans la base de données Opérateurs booléens AND cancer peau Articles sur cancer et peau OR cancer peau Articles sur cancer (sein, prostate ) + Articles sur peau (allergie, pigmentation ) + Articles sur cancer et peau NOT cancer peau Articles sur cancer (sein, prostate ) - Articles sur cancer et peau 22
23 Medline : interface Pubmed Base de données bibliographiques National Library of Medecine (NLM) Tous les domaines biomédicaux Couverture internationale (80 pays représentés) Plus de 23 millions de documents 23
24 Lexique Descripteur : terme (= mot-clé) appartenant à un vocabulaire contrôlé, normalisé (=thésaurus); permet de décrire les sujets abordés dans l article Descripteur majoré : permet de décrire un point majeur discuté dans l article Explosion d un terme : l interrogation du descripteur (= terme générique) s étend à tous les descripteurs de niveau inférieur (=termes spécifiques) dans la hiérarchie. Sur PubMed l explosion est automatique Qualificatifs ou «Subheadings» : associé au descripteur, il «limite» ou spécifie la recherche de celui-ci à un aspect particulier (aspect thérapeutique, épidémiologie ) Opérateur Booléen : opérateur logique permettant d associer des notions entres elles Thésaurus : liste définie de termes ayant entre eux des relations hiérarchiques et synonymiques Bruit : documents retrouvés par la recherche et ne répondant pas à la question Silence : documents répondant à la question et non retrouvés par la recherche 24
25 MERCI Vous pouvez nous contacter : Philippe CANET p.canet@has-sante.fr Gaëlle FANELLI g.fanelli@has-sante.fr 25
26 Question 1 : Savez-vous rechercher un mot dans le champ Abstract? Question 2 : Avez-vous déjà utilisé le MeSH? Question 3 : Savez-vous utilisez l historique de recherche? Question 4 : Savez vous limiter votre recherche? Question 5 : Pouvez corriger cette recherche? (Neoplasms[MeSH] OR Cancer [Title/Abstract]) OR (Sun effects[title/abstract] AND Sun[Title]) 26
27 27
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