Ateliers épidémiologiques

Transcription

1 Ateliers épidémiologiques Rencontres AcaDM, Caen 12 juin Rôles des Data Managers en épidémiologie Delphine Degré, Registre des Cancers de la Manche «tour de table pour faire connaissance» 2. Croisements et dédoublonnage 2.1. Noémie Lévêque-Morlais, GRECAN 2.2. Faïza Bessaoud, Registre des Cancers de l Hérault 3. Données du CépiDC Mireille Eb et Grégoire Rey, CépiDC 4. Structures de dépistage organisé Marie-Christine Quertier et Nathalie Thomas, IRIS et Mathilde

2 Ateliers épidémiologiques Rencontres AcaDM, Caen 13 juin Géocodage, études spatialisées Florence Poncet, Registre des Cancers de l Isère 6. Le Progiciel MoviBase Evelyne Fournier, Registre du Doubs et du territoire de Belfort Solenne Delacour, Registre de Loire-Atlantique et Vendée 7. Gestions de données longitudinales dans les études de cohortes Lyan Hoang, Centre Informatique IGR «Echange d expériences et débat d idées»

3 Ateliers épidémiologiques Rencontres AcaDM, Caen 2012 Rôles des Data Managers en épidémiologie Delphine Degré Registre des Cancers de la Manche Caen, les 12 et 13 juin 2012

4 ONISEP : administrateur(trice) de base de données ou Responsable de BDD Niveau d'accès : bac + 3 Secteur(s) professionnel(s) : Fonction publique, Informatique, Télécommunications Centre(s) d'intérêt : J'aime organiser, gérer, Je suis branché high tech Salaire débutant : 2800 Statut salarié Niveau: Bac+5 Master Pro (ex MIAGE, STIC) Nature du travail Mettre la base en place : L'administrateur de bases de données n'intervient jamais directement sur les informations, mais sur les logiciels. En amont, il prévoit les volumes de données et choisit les outils servant à construire et à exploiter les bases. Pour cela, il teste puis il met en place des progiciels SGBD (systèmes de gestion de bases de données), il modélise, il codifie et il met au point des dictionnaires de données, il conseille les développeurs... Faciliter l'utilisation de la base : Permettre aux utilisateurs d'accéder aux informations, à tout moment et simultanément : telle est son idée fixe. Il définit donc les normes et les paramètres d'utilisation des systèmes, gère les droits d'accès en attribuant des mots de passe. Il installe des procédures de sauvegarde et de restauration automatiques. Au besoin, il aide les utilisateurs dans leurs recherches. Ouvrir l'oeil et le bon : Enfin, il fait du tuning, c'est-à-dire de l'optimisation. Les données évoluant sans cesse, il effectue des mises à jour régulières. Pour éviter toute défaillance et anticiper les évolutions techniques, il établit un système de veille technologique quotidienne. Les aspects liés à la sécurité n'ont pas de secrets pour lui. Compétences requises Un bon bagage technique : L'administrateur de bases de données maîtrise, bien sûr, les outils spécialisés. Il connaît les principaux logiciels, les langages de programmation, ainsi que les questions de sécurité. Son expérience des systèmes d'information complexes facilite son travail. À l'écoute de l'entreprise : L'administrateur sait à quoi sert précisément chaque base de données. Il est familiarisé avec leur environnement de développement et d'exploitation. Au courant des activités de l'entreprise, il est à même d'anticiper les besoins et d'intervenir rapidement en cas de problème. Enfin, il se montre disponible et à l'écoute des utilisateurs et de sa direction. Réactif et méthodique : Doté d'un sens de l'organisation et de la planification, il fait preuve de rigueur, de synthèse et de méthode. Savoir prendre du recul, avoir une grande ouverture d'esprit et s'adapter rapidement : autant de qualités également requises. 4

5 ONISEP : statisticien(ne) ou Chargé(e) d'études statistiques Niveau d'accès : bac + 2 Salaire débutant : 1800 Statut salarié Métiers : Actuaire, attaché(e) statisticien(ne) de l'insee, biostatisticien(ne), statisticien(ne) data manager, Statisticien web analytique Secteur(s) professionnel(s) : Banque - Assurances - Immobilier, Chimie - Plasturgie - Industrie pharmaceutique, Fonction publique Centre(s) d'intérêt : Enquêter, analyser l'information, je veux en faire mon travail,j'aime jongler avec les chiffres Niveau : bac + 2 (DUT statistique et informatique décisionnelle) ou bac + 3 (Licence en économie et gestion mention économétrie ou MASS), Licence pro spécialisée biostatistique, statistique décisionnelle, traitement de l'information géographique ou sondages et marketing ou bac + 5 (Master pro spécialisé en actuariat, bio-informatique, géomarketing, modélisation appliquées aux sciences sociales, etc.; 3 écoles de statistique : Ensae (École nationale supérieure de l'administration économique), Ensai (École nationale de la statistique et de l'analyse de l'information) ou Isup (Institut de statistique de l'université Pierre et Marie Curie) Nature du travail Collecte : Enquête marketing, sondage d'opinions, essai clinique ou thérapeutique, contrôle de la qualité de la peinture appliquée sur des voitures neuves, etc. Quel que soit son sujet d'étude, le statisticien commence par collecter les informations et les chiffres qui l'intéressent en établissant un questionnaire ou une grille d'évaluation. Encadrement : Il décide ensuite de la méthodologie à adopter (sondage par téléphone, par Internet, par courrier) et met en place une équipe composée d'assistants et d'enquêteurs. Des chiffres à faire parler : Une fois les informations recueillies, le statisticien doit les traiter. Pour ce faire, il utilise des logiciels informatiques très performants. À lui d'analyser ensuite les courbes ou graphiques obtenus, et d'effectuer un travail de synthèse. La dernière étape de son travail consiste à présenter ses résultats au commanditaire de l'étude afin de l'aider dans sa prise de décision. Compétences requises Les chiffres et les lettres : Le statisticien aime les chiffres, mais pas seulement! La multiplicité des domaines dans lesquels il est susceptible d'intervenir requiert une grande curiosité et ouverture d'esprit. Son esprit logique et sa faculté à synthétiser lui permettent par ailleurs d'élaborer des conclusions. Pédagogue : Mathématicien dans l'âme, capable de simplifier ses résultats afin de les mettre à la portée des non-initiés. C'est également un homme de contact qui apprécie le travail en équipe. Technicien : Il maîtrise l'outil informatique et les différents logiciels qui lui permettent de construire l'étude. Par ailleurs, il maîtrise l'anglais, et plus particulièrement l'anglais technique propre à son domaine. 5

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7 Qui sommes nous? Que faisons nous? Avec quels outils travaillons nous? 7

8 Différentes structures de recherche épidémiologique Organisations gouvernementales InVS, INCa, INSERM ARS, DRASS UF et équipes de recherche DIM, EPC Registres des cancers Centre épidémiologique des Causes de Décès Structures de dépistage organisé Et vous? (Nom, prénom, formation, structure-établissement-service, département) 8

9 Différentes tâches plus ou moins attribuées Conception, mise en place de BDD, évolutivité questionnaire ou fiche de recueil, tables, masque de saisie, requêtes de sorties, programmation Contrôle sécurité, confidentialité, traçabilité, déclaration CNIL Importation de données recueil, croisements, vidéo-codage, publipostage, pré-saisie automatique Contrôle qualité dédoublonnage, contrôle de cohérence, complétude, double saisie, marquage-recapture Disponibilité, pérennité, archivage, extractions Analyse descriptive, statistiques, modélisation Rédaction de rapports, articles, posters, bulletins d information Veille documentaire Encadrement de stagiaires Et vous? 9

10 Différents types d études et de données Données récoltées Cliniques Biologiques Etat civil Statut vital, causes de décès Comorbidités Traitements, médicaments Données socio-professionnelles Données environnementales, socio-démographiques Etudes Durée : <1 mois, <1an, <5 ans, + 5 ans Nb individus : <1.000, <10.000, < , Population : Patients, Profession, Cohorte Zone géographique : National, Régional, Local Et vous? 10

11 Différents outils de gestion et de traitement des données Logiciels de BDD clinique Capture system Macro OpenClinica Applications Microsoft Office Excel Access Logiciels de statistiques SAS STATA R, MySQL EpiInfo Logiciels de cartographie MapInfo, ARCGIS Et vous? Logiciels du SEER SEER Stat JoinPoint CanSurv Logiciels du CIRC DepEdits IarcTools CanReg5 Logiciels autres Maison MoviBase LateX Géocodage Vidéocodage 11

12 Qu attendez-vous de ces rencontres AcaDM? Quels thèmes souhaiteriez-vous voir abordés lors de prochaines sessions? Souhaiteriez-vous rencontrer d autres professionnels : Editeurs de logiciels? Formateurs? Seriez-vous prêts à animer un prochain atelier, à former ou informer vos collègues sur un point que vous maîtrisez? 12

13 Merci à tous 13